Миграция точек ветвления

МИГРАЦИЯ ТОЧЕК ВЕТВЛЕНИЯ [c.358]

Миграция точки ветвления [c.358]

Миграция одноцепочечных точек ветвления происходит, по-видимому, при вытеснении новосинтезированной РНК цепями ДНК в ходе транскрипции. Она наблюдалась экспериментально в ренатурировавших кольцевых ДНК с одноцепочечными разрывами, которые были образованы молекулами с циклически переставленными последовательностями. Точка ветвления в такой системе будет совершать случайные блуждания до тех пор, пока не произойдет разделения цепей или не образуется какая-то особенно стабильная промежуточная структура. Измерения показывают, что скорость миграции превышает 1000 пар оснований в секунду. [c.358]

До сих пор мы рассматривали лишь простейшие кинетические процессы, включаюшие спаривание онований и возникновение стэкинга. Известны, однако, более сложные структурные превращения, и один из таких процессов, который привлек к себе пристальное внимание, — это миграция точек ветвления (рис. 23.24). [c.358]

РИС. 23.24. Схематическое изображение моделей миграции точек ветвления. А. Миграция ояноце-почечных точек ветвления. Б. Миграция двухцепочечных точек ветвления Числа со штрихами и без штрихов соответствуют комплементарным последовательностям. [c.358]

Миграция двухцепочечных точек ветвления преяставляет собой более сложный процесс, поскольку при этом должны быть разорваны одновременно две изолированные пары оснований (пары 5 — 5и5 — 5 на рис. 23.24, ), чтобы смогли образоваться две другие пары (пары 5 —5и5 — 5 ). Скорость миграции двухцепочечных точек ветвления бы-па определена путем прямого электронно-микроскопического наблюдения за исчезновением крестообразных структур, образующихся как промежуточное неустойчивое состояние. Эти структуры были получены при низкой температуре, затем температуру повышали и следили за их релаксацией. Точка ветвления смещается случайным образом до тех пор, пока ие достигнет конца спирали и не произойдет необратимое разделение структуры на две двойные спирали. Хотя надежно зарегистрировать удается лишь последний процесс, эти измерения позволяют оценить скорость миграции точки ветвления путем машинного моделирования случайных блужданий. Бьшо найдено, что скорость смещения точки ветвления составляет 6(ХЮ элементарных смещений (на одну пару оснований) в секунду при 37°С и около 1 смещения в секунду при 0 С. Считается, что миграция двухцепочечных точек ветвления играет роль в процессе генетической рекомбинации. [c.359]

Белок гесА катализирует как начальный этап рекомбинации - спаривание, так и последующую миграцию ветвей у Е. соИ. Он способствует рекомбинации, связываясь с одноцепочечной ДНК и катализируя спаривание такой покрытой белком цепи с гомологичной двухцепочечной ДНК. Можно определить действие гесА по образованию кольцевых двухцепочечных ДНК в смеси из двухцепочечных линейных молекул ДНК и гомологичных им одноцепочечных кольцевых ДНК, как показано на рис. 5-27. Эта реакция протекает в два этапа сначала кольцевая ДНК спаривается с линейной молекулой на одном из ее концов, а затем точка ветвления продвигается по линейной двухцепочечной ДНК, пока от нее не отделится линейная одноцепочечная ДНК. [c.30]

В. Присутствие участка негомологичной ДНК, состоящего из 500 нуклеотидных пар, должно сильно подавлять миграцию точки 3 ветвления. Тем не менее белок гес А может катализировать мигра- [c.299]

После того как образование синапсиса произошло, короткий участок гетеродуплекса, в котором начали спариваться цепи, принадлежащие двум разным молекулам ДНК, увеличивается за счет направляемой белком миграции ветви, которая также катализируется белком гесА Миграция ветви может происходить в любой точке там, где две одинаковые по своей последовательности одиночные цепи ДНЕ пытаются спариться с одной и той же комплементарной цепью, неспаренный участок одной цепи выгесняет спаренный участок другой, смещая таким образом точку ветвления, хотя само число спаренных оснований при этом не изменяется. Спонтанно миграция ветви идет с равной вероятностью в обоих направлениях и потому трудно сжидать, чтобы она [c.306]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология