Цинковый палец

Цинковый палец - фрагмент белка, содержащий около 20 аминокислотных остатков (рис. 1.12). [c.13]

Для изучения структуры цинковых пальцев использовали разные физические методы, в частности метод кругового дихроизма и ЯМР исследовали также трехмерную структуру пептида, содержащего один цинковый палец. Было показано, что атом цинка погружен в глубь молекулы и находится в окружении а-спиралей и других спиральных структур, связанных друг с другом при помощи р-слоев (рис. 8.100). [c.130]

Цинковый палец включает около 20 аминокислотных остатков, образующих петлю при участии цинка цинк соединен с двумя остатками цистеина и двумя остатками гистидина (могут быть также все четыре связи с цистеином). Эти элементы супервторичной структуры придают белкам геометрическую форму, [c.115]

Известны по крайней мере три типа цинковых пальцев. Они различаются числом и локализацией остатков цистеина и гистидина, координационно связанных с атомом цинка. Основное структурное свойство одного из типов цинковых пальцев (тип ТЕША) наличие петли, образующейся при координационном связывании атома цинка с парами остатков цистеина и гистидина, разделенных 12 аминокислотами (рис. 8.69). Цинковые пальцы второго типа характеризуются тем, что в координационном связывании участвует разное число остатков цистеина. Например, цинковый палец GAL4 содержит шесть цистеиновых остатков, из которых только четыре связаны с атомом цинка цинковые пальцы ДНК-связывающих доменов в рецепторах стероидных гормонов содержат четыре цистеина. У цинковых пальцев третьего типа в связывании с атомом цинка участвуют три остатка цистеина и один- гистидина. Но не исключено, что для образования цинкового пальца подходит любая комбинация остатков цистеина и гистидина. Вероятно, с этими остатками могут связываться и атомы других металлов, а когда имеется более четырех потенциаль- [c.130]

Механизм связывания цинковых пальцев с ДНК до конца не выяснен. Известно, что связывание происходит по главной бороздке ДНК, но остатки, которые определяют специфичность и прочность связывания, пока не установлены. В некоторых случаях за специфичность ответственны аминокислотные остатки пальца, образующие петлю. В рецепторе экстрогена определяющую роль в специфичности связывания ДНК играет один из двух пальцев более того, некоторые остатки, влияющие на специфичность связывания, находятся у основания пальца (разд. 8.3.е). Так, единственный цинковый палец в белке САЬ4 можно заменить на палец, кодируемый чужеродным геном, и модифицированный белок все равно будет связываться с иЛБоль- Итак, цинковые пальцы образуют структуру типа петли, что обеспечивает специфичность взаимодействия отдельных остатков с соответствующими сайтами связывания ДНК. Возможно, пальцы участвуют и в неспецифических взаимодействиях, стабилизирующих ДНК-белковый комплекс, т.е. играют роль, аналогичную роли второй спирали в элементе спираль-виток-спираль. [c.131]

Неинформативная зона транскриптона содержит регуляторные последовательности, с которыми взаимодействуют многочисленные (их открыто несколько десятков) регуляторные белковые факторы, ускоряющие или замедляющие процесс транскрипции. Они контактируют с определенными последовательностями нуклеотидных остатков в ДНК присущими им ДНК-связывающими доменами. Так, например, транскрипционный фактор ША из ооцитов шпорцевой лягушки содержит рр а—надвторичную структуру с атомом Zn в ее составе (см. рис. 41), так называемый цинковый палец, обеспечивающий прикрепление к ДНК. [c.257]

Четыре человека ...образуют друг с другом цепь, причем один прикасается пальцем к кончику языка соседа, другой таким же образом к поверхности глазного яблока своего другого соседа, а двое остальных держат мокрыми пальцами один за лапку, а другой за спипу свежепрепарованную... лягушку. Наконец, первый в ряду держит также в мокрой руке цинковую пластинку, а последний держит серебряную пластинку, и затем они приводят эти пластинки во взаимное соприкосновение. В тот же момент на верхушке языка, к которой прикасается человек, держащий в рукз цинк, появится ощущение кислого вкуса в глазу,, к которому прикасается палец соседа, появится ощущение вспышки света и в то же время лапки лягушки, находящиеся в двух руках, начнут сильно сокращаться . Все нервы, оказавшиеся на пути электрического флюида — нервы языка, нервы глаза, нервы лягушки,— являются просто очень чувствительными электрометрами, а металлы, от соприкосновения которых и возникает эффект, не простые проводники, а двигатели электричества. Таким образом, вместо того, чтобы говорить о животном электричестве, можно было бы с большим правом говорить о металлическом электричестве (Вольта, 1794 г.). Ведь если люди в той цепи из четырех человек не будут держать серебро и цинк, а просто коснутся руками друг друга, то ничего не произойдет. По Гальвани, разряд живой лейденской банки , которая находится в лягушке, должен произойти еще успешнее, ведь замыкающая цепь стала короче из нее убрали уча- [c.23]

Для специфичного связывания с HRE необходимы оба цинковых пальца. Однако если у разных рецепторов произвести взаимную замену любых цинковых пальцев, то химерные рецепторы будут иметь специфичность по отношению к гену-мишени, присущую цинковому пальцу 1 рецептора. Мутащш, затрагивающие последовательность, которая находится перед цинковым пальцем 1, или сам этот палец не влияют на специфичность связывания ДНК рецептором. Однако некоторые изменения последовательности, примыкаюшей к последнему цистеи-новому остатку цинкового пальца I рецептора эстрогенов, нарушают связывание этого рецептора с эстроген-акцепторным элементом, и он приобретает способность связываться с глюкокортикоид- [c.76]

Гены цинковых пальцев zin finger) называются так в связи с тем, что кодируемые ими аминокислотные последовательности (транскрипционные факторы) расположены между двумя отдельными цистеиновыми остатками, образующими комплекс с ионами цинка, похожий на палец. [c.63]

Рис. 9-10. Семейство сайт-специфических ДНК-связывающих белков типа цинковые пальцы А Упрощенная схема строения ДНК-связы-вающего домена кружочками обозначены отдельные аминокислоты. В настоящее время считается, что полипептидная цепь, образующая каждый палец , имеет сложную глобулярную структуру. В. Схема взаимодействия четьфех цинковых пальцев с последовательностью ДНК. Согласно этой модели, каждаш палец узнает определенную последовательность, состоящую примерно из пяти нуклеотидных п . (С изменениями

Справочник химика 21

Химия и химическая технология