Гипервариабельные петли

Интересно допустить, что заполнение пространства между петлями гипервариабельных участков удлиненной петлей одного из них, как бы выполняющей функцию лиганда, — более частое явление, чем наличие иммуноглобулинов (антител), содержащих полость, соответствующую активному центру. С энергетических позиций наличие полости невыгодно, так как в отсутствие лиганда структура недостаточно устойчива. Заполнение полости вклинившейся в нее петлей цепи существенно повышает устойчивость всей этой области, а следовательно, энергетически выгодно. [c.100]

Гипервариабельные области заштрихованы точками отмечены участки контакта с зеркально расположенной петлей Vl [c.100]

Существует шесть гипервариабельных сегментов, каждый из которых содержит от 5 до 10 остатков на центр связывания. Укладка цепей во всех вариабельных доменах иммуноглобулина New и иммуноглобулина МсРС 603, а также в других иммуноглобулинах очень сходна [540, 543, 544]. Структурные различия сосредоточены в основном в так называемых гипервариабельных петлях [619] — трех сегментах, содержащих от 5 до 10 остатков в обоих Vl - и Vh-доменах. Аминокислотные остатки, образующие место связывания, комплементарное данному лиганду, принадлежат этим шести гипер-вариабельным сегментам. [c.244]

Вариабельные домены уникальны в том отиошенни, что каждый из ннх имеет свой особенный набор из трех гипервариабельных областей, уложенных в трн гипервариабельные петли. Гипервариабельные петли Ь- и Н-ва-рнабельных доменов собраны в группы, образующие антиген-связываюпшй [c.35]

Результаты рентгеноструктурного анализа кристаллов с антигенной детерминантой (гаптеном), присоединенной к антиген-связывающим участкам, позволили установить, как именно (в ряде конкретных случаев) гипервариабельные петли Ь- и Н-вариабельных доменов кооперируются и образуют одну обширную антиген-связывающую поверхность. Размеры и форма каждого отдельного участка варьируют в зависимости от конформации полипептидной цепи в гипервариабельных петлях, которая в свою очередь зависит от последовательности боковых цепей аминокислот, содержащихся в этих петлях. Таким образом, хотя общие принципы структуры антител сейчас уже понятны и даже определена детальная структура нескольких антиген-связывающих участков, мы, вероятно, никогда не будем зиать конкретных деталей в миллионах других случаев. [c.36]

Атэтенсвязывающий участок (ян1Ягеиком6ишфуюший участок, активный центр антител) — N-концевой участок антител и антигенраспознающих peuoiTopoB, взаимодействующий с антигеном посредством прямого физического контакта образуется тремя гипервариабельными петлями V-доменов тяжелой и легкой цепей. [c.458]

Вариабельные домены уникальны в том отношении, что каждый из них имеет свой особенный набор из трех гипервариабельных областей, уложенных в три гипереариабельные петпи (см. рис. 18-28). Гип ер вариабельные петли L- и Н-вариабельных доменов собраны в группу и образуют антиген-связывающий участок, как это и было предсказано. Важный принцип, раскрытый в результате проведенных исследований, состоит в том, что вариабельная область молекулы антитела состоит из весьма консервативной жесткой структуры, к одному из концов которой прикреплены гипервариабельные петли. Поэтому огромное разнообразие антиген-связывающих участков может создаваться путем изменения одних только гипервариабельных петель - их длины и аминокислотной последовательности - без нарушения общей пространственной структуры, необходимой для функционирования антитела. [c.241]

Таким образом, минимальное количество митохондриальной ДНК в 1 мкл крови человека составляет 110 пг. Учитывая то, что для проведения сиквенс-анализа гипервариабельных регионов В-петли необходимо менее 100 молекул мтДНК, данного количества теоретически достаточно для постановки более чем 100 тысяч реакций ферментативной амплификации. [c.88]

DR s (сопфктеп1агНу deteimining n ns) — регионы иммуноглобулиновых рецепторов и Т-клеточных рецепторов, комплементарно взаимодействующие с антигеном и ф(фмирующие антигенсвязывающий участок этих рецепторов каждый регион конформационно представляет собой петлю, составленную из аминокислотных остатков гипервариабельного участка V-домена у иммуноглобулинов антигенсвязывающий участок строится из трех DR V-домена легкой цепи и трех DR V-домена тяжелой цепи аналогично построен антигенраспознающий участок Т-клеточного рецептора включающий по три DR от а- и р-цепей. [c.471]

Li, Ьз, Н(, и Нч — петли гипервариабельных районов легкой и тяжелой цепей. Два конденсированных шестичленных кольца (менадион) связаны вверху в неглубокой полости (1.6Х0.7Х Х0.6 нм ) фитиновый хвост гаптена расположен под остатком менадиона и продопжается дальше почти на всю длину полости антидетерминанты [c.96]

Далеко не всегда активный центр представляет собой отчетливо выраженную впадину или щель. Примером служит моноклональный белок Kol, для которого не известен специфический лиганд. Это представляется закономерным, поскольку со стороны тяжелой цепи в область молекулы, обычно занимаемо активным центром, вдается весьма длинная петля третьего гипервариабельного участка. Она длиннее на шесть остатков соответствующей петли иммуноглобулина, продуцируемого клетками миеломы М603, и на восемь остатков того же участка белка New (табл. 5). [c.98]

Дополнительный отрезок цепи скручен таким образом, что заполняет целиком пространство между петлями других гипервариабельных участков легкой и тяжелой цепн, т. е. гипотетическую полость активного центра. Активный центр в форме глубокой впадины появился бы в этом участке, если вырезать из третьего гипервариабельного участка лишний пептид, формирующий анти-параллельную -шпнльку. Другие. иммуноглобулины, подобные Kol, не изучали методами рентгеноструктурного анализа, однако они, несомненно, существуют. Например, иммуноглобулин мыши МИК Он не связывает каких-либо известных лигандов и характеризуется более длинным, чем у известных моноклональных антител, третьим гипервариабельным участком тяжелой цепи. Логично, что и в этом случае полость активного центра заполнена петлей этого длинного гипервариабельного участка. [c.100]

Легкая цепь иммуноглобулина стереотипно свертывается так, что ее прямолинейные полипептидные отрезки формируют два домена - вариабельный и константный. располагаясь в них параллельно продольной оси домена и образуя два слоя со взаимно противоположным направлением аминокислотной последовательности. В пространство между слоями обращены многочисленные гидрофобные боковые цепи аминокислот. Один из слоев в каждом домене сформирован четырьмя отрезками полипептидной цепи (отмечены белыми стрелками), другой - тремя (отмечены черными стрелками) эти два слоя соединены одной дисульфидной связью (красная полоса). Отрезки VL-дoмeнa уложены так, что гипервариабельные участки выступают на поверхность тремя отдельными (но пространственно сближенными) петлями. В каждом гипервариабельном участке указан номер позиции одного из аминокислотных остатков. [c.101]

Основной структурной характеристикой домена является антипарал-лельный слой бета-складчатости, который состоит из вытянутых сегментов полипептидных цепей, связанных изогнутыми частями (коленьями) цепи (рис. 6). Два таких слоя подобно сандвичу прилегают друг к другу с антипараллельным направлением сегментов цепи. Прилегающие сегменты связаны водородными связями. Один из слоев состоит из трех сегментов, а другой из четырех (см. рис. 6). Такая двухслойная структура особенно четко заметна у постоянного домена, где она носит более закономерный характер. У вариабельного домена отмечается дополнительная петля, содержащая вторую гипервариабельную область. [c.16]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология