Перекрывающийся код

Бубновый код перекрывающийся. Так как в каждый ромб входят нуклеотиды из трех последовательных пар, два нуклеотида, находящихся на одной стороне ромба, являются общими для двух соседних ромбов. Тем самым возникает корреляция между двумя соседними аминокислотными остатками. За данным остатком может следовать не любой из 20, но лишь некоторые. Однако дальнейшие исследования показали, что перекрывающийся код нельзя согласовать с опытом, так как любой аминокислотный остаток может следовать за любым. Отсутствие корреляции делает невозможной теоретическую, умозрительную расшифровку кода. [c.259]

Невозможность перекрывающегося кода следуе также из отсутствия мутационных замещений двух соседних аминокислотных остатков в белке. Мутация нуклеотида, общего для двух соседних остатков, должна приводить к такому двойному замещению. [c.259]

Гамов попытался проверить правильность своего кода, сопоставив возможность сочетания ромбов с известной первичной структурой инсулина и адренокортикотропина. При этом возникли неразрешимые противоречия. Дальнейшие исследования показали, что никакие перекрывающиеся коды нельзя согласовать с опытом. Наличие перекрытий в кодонах может выражаться в корреляциях между соседними аминокислотными остатками. Иными словами, некоторые парные сочетания остатков должны быть запрещены. Анализ первичных структур белкои показал, что таких корреляций нет —любой остаток может следовать за любым, хотя разные остатки встречаются с различными частотами [4, 5]. Можно, однако, представить себе перекрывающиеся нуклеотидные коды, допускающие любую последовательность аминокислот [6]. [c.555]

Отсутствие корреляций в полипептидных цепях, таким образом, нельзя считать решающим аргументом против перекрывающихся кодов. Но отсутствие корреляций делает невозможной умозрительную расшифровку кода. [c.555]

Перекрывающийся код, т. е. код, при котором одно основание кодирует две соседние аминокислоты или даже несколько аминокислот, маловероятен, так как обнаружено, что у некоторых мутантов ВТМ изменена одна-единственная аминокислота. Не-перекрывающийся код допустим, если предположение об участии молекул-адаптеров в синтезе белка является правильным, поскольку в этом случае необходимость прямого контакта между аминокислотами и кодирующими их основаниями исключается. Тщательный анализ мутаций бактериофага Т4 позволил сделать [c.375]

Далее, триплетный код мог бы быть либо перекрывающимся, когда один и тот же нуклеотид участвует в трех (сильно перекрывающихся) й двух (менее перекрывающихся) кодирующих триплетах, либо непе-рекрывающимся, когда в цепи нуклеиновой кислоты независимые кодирующие триплеты примыкают друг к другу или даже разделены некодирующими нуклеотидами. Однако тот факт, что точечная мутация (изменение одного нуклеотида в цепи нуклеиновой кислоты) приводит, как правило, к замене только одной аминокислоты в белке, говорил против идеи перекрывающегося кода. Кроме того, перекрывающийся код неизбежно влек бы за собой ограничения в возможных аминокислотных соседях вдоль полипептидной цепи, чего не [c.11]

Другая возможность теоретической расшифровки существовала бы, если бы имелась корреляция, закономерное соотношение между буквами белкового текста. В русском тексте гласные чаще следуют за согласными, чем друг за другом. Если бы это было так, то мог бы существовать код, в котором некоторые последовательности нуклеотидов оказывались бы исключенными. Скажем, перекрывающийся код. Было предложено несколько моделей таких кодов, в которых одни и те же нуклеотиды соседних троек кодируют две аминокислоты. Например, если в последовательности. ..АГЦУ... АГЦ кодирует аминокислоту aj, а ГЦУ — аминокислоту аг, то код перекрывающийся, и за ai не может следовать любая аг, но лишь некоторые вполне определенные. Такая возможность, постулированная Гамовым, однако, не реализуется в первичных структурах белков практически нет никаких закономерных корреляций между соседними аминокислотами. Расшифровка кода по методу, приме- [c.281]

Таблица 29 Соседние симиолы в перекрывающемся коде а, е, I, о могут соседствовать с а, й, е, /, , 1, г, I, т, п, о, р, и, V, й, g, к, п с

Бреннером была доказана принципиальная невозможность триплет-ных кодов с перекрытиями Число перекрывающихся кодов равно 64. Оказывается, однако, что 64 триплетов недостаточно для кодирования известных последовательностей. Если следующие друг за другом триплеты имеют два общих нуклеотида, любой данный триплет может следовать только за четырьмя различными триплетами и предшествовать только четырем различным триплетам в последовательности. В последовательности аминокислот 1к1 назовем I -соседом и I О-сосе-дом аминокислоты к. Для каждых четырех различных Ь-соседей (или /)-соседей) или их части к должна иметь один триплет, их определяющий. Таким образом, минималь- [c.236]

Как указывает Бреннер, отсюда вытекает важный физический вывод. Формулировки перекрывающихся кодов исходят из близости межнуклеотидных расстояний в ДНК и расстояний между аминокислотами в белковых цепях. Изложенные результаты указывают на то, что каждая аминокислота стереохимически связана по крайней мере с двумя, если не тремя, нуклеотидами. Если считать, что последовательность аминокислот находится в контакте с цепью ДНК только в одном пункте роста, то отпадают трудности, связанные с выбором кода, но оказывается невозможным провести расшифровку, руководствуясь ограничениями в последовательностях. Из неперекрывания триплетов следует возможность выделения кодирующих и некодирующих триплетов в последовательности. Такая возможность рассмотрена в коде без запятых Крика, Гриффита и Оргела [ ]. [c.236]

А. Перекрывающийся код, в котором каждый нуклеотид принимает участие в детерминировании трех аминокислот. Кодовое отношение, или отношение числа нуклеотидов в участке ДНК к числу аминокислот в полипептидной цепи, кодируемой этим сегментом, равно 1 1. [c.186]

Такой перекрывающийся код накладывает серьезные ограничения на характер возможных в природе последовательностей аминокислот. Например, в любом полипептиде аминокислота, кодируемая АТТ, не могла бы соседствовать с аминокислотой, кодируемой АЦЦ. Если бы такой тип кода действительно существовал, то можно было бы его разорвать с помощью чисто криптографических методов — установив ограничения на соседство среди обнаруженных в белках аминокислот. Используя известные к 1957 г. аминокислотные последовательности, Бреннер показал, однако, что для соседствования аминокислот не существует подобного [c.186]

Можно представить себе несколько способов построения триплетного кода. Код мог бы быть перекрывающимся (рис. 12.1), однако функциональная особенность перекрывающегося кода заключается в том, что точечная мутация, приводящая к замене одной пары оснований, вызывала бы изменение двух или трех соседних аминокислот в последовательности мутантного белка. В то же время определение аминокислотной последовательности ряда мутантных белков показало, что замена одного нуклеотида соответствует замене только одной аминокислоты. Гипотеза перекрывающегося кода должна также накладывать ограничения на то, какие аминокислоты в белке могут оказаться соседними. Анализ же реальных белковых последовательностей показывает, что таких ограничений нет и рядом могут находиться две произвольные аминокислоты. Эти наблюдения заставляют отказаться от представления о перекрывающемся коде и тем самым свидетельствуют о том, что генетический код в действительности является неперекрывающимся. [c.68]

Эту дилемму удалось решить путем определения последовательности аминокислот в мутантах. Предположим, что основание В мутировало в В. Если код не перекрывается, изменится только одна аминокислота. При полностью перекрывающемся коде мутация В в В приведет к изменению аминокислот 1, 2 и 3. Изучение последовательности аминокислот белка оболочки мутантов вируса табачной мозаики показало, что у этих мутантов измененной обычно оказывалась только одна аминокислота. Напомним также, что как уже говорилось при обсуждении аномальных гемоглобипов в гл. 5, и в этом случае у большинства мутантов происходило изменение только одной аминокислоты. Отсюда был сделан вывод, что генетический код не перекрывается [c.69]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология