Использование полиморфных ДНК-маркеров

Использование многих тысяч разбросанных по всему геному полиморфных маркеров позволило определять как порядок расположения локусов, так и расстояния между ними на каждой хромосоме. Карта сцепления полиморфных участков оказывается неоценимой при локализации генов различных заболеваний. Для идентификации таких генов можно использовать зонды, специфичные в отношении последовательностей, которые фланкируют данный ген. [c.459]

Полиморфизм и болезнь. Некоторые высокополиморфные гены человека могут быть частью генетической компоненты дифференциальной подверженности заболеванию. В качестве примера можно привести зависимый от малярии полиморфизм HbS, Р Талассемию, недостаточность глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы (G6PD), а также антиген Даффи [1952]. Ассоциации аллелей HLA-системы с некоторыми заболеваниями часто представляют особый интерес и могут быть связаны с различиями в иммунном ответе на собственные антигены [48]. С патофизиологической точки зрения ассоциации различных заболеваний с группами крови АВО менее ясны [211]. Наиболее успешным подходом к использованию полиморфных маркерных генов будет тот, который ориентируется на маркеры, патофизиологически связанные с заболеванием. Случайные генетические маркеры, исследуемые при случайно выбранных заболеваниях, вряд ли приведут к получению значимых результатов. [c.299]

В перспективе можно ожидать, что оба направления - медицинская и этническая геномика - будут более тесно взаимосвязаны, так как предполагается разработка новых подходов к решению сложной проблемы выявления генетических основ мультифакториальных заболеваний, к которым относится большая часть наиболее распространенных болезней. Уже сейчас стало ясно, что эта работа потребует комбинированного использования методов и подходов, применяемых в обоих направлениях геномики. Предполагается анализ чрезвычайно большого количества полиморфных маркеров ДНК в значительных по численности группах больных и популяционных выборок здоровых лиц. Здесь будут важны данные о частотных характеристиках конкретных полиморфных маркеров в различных популяциях. Это позволит найти ассоциации между болезнью и нейтральными вариантами полиморфизма ДНК, расположенными вблизи генов, определяюпщх риск заболевания. [c.310]

Подлинный переворот в такого рода исследованиях произошел в связи с появлением нового инструмента в виде огромного числа полиморфных маркеров ДНК разного типа и значимости. Это - однонуклеотидные замены, инсерционно-делеционный полиморфизм, полиморфные мини- и микросателлиты. Однако на современном этапе необходима подробная характеристика как отдельных маркеров, так и их групп для того чтобы в дальнейшем осознанно их использовать для конкретных целей, для получения ответов на вопросы, связанные с различными временными и пространственными параметрами. Далее мы рассмотрим в качестве примеров конкретные полиморфные локусы, относящиеся к различным типам, а также продемонстрируем возможности, которые открываются при их суммарном использовании для анализа генофонда и закономерности его изменчивости. [c.334]

Методы обнаружения нуклеотидных замен в геномной ДНК позволили исследователям разобраться в природе многих наследственных болезней человека. Эти методы дают возможность идентифицировать специфические мутации, приводящие к заболеванию [1—6], а также полиморфные участки ДНК, используемые в качестве маркеров в генетическом анализе [7—11]. Благодаря развитию методов выявления нуклеотидных замен стала реальностью пренатальная диагностика многих наследственных болезней человека. Если ген, отвечающий за заболевание, известен, соответствующую мутацию можно обнаружить в геномной ДНК или в РНК при помощи блот-гибридизации с использованием меченых олигонуклеотидов в качестве гибридизационных зондов. В том случае, когда мутировавшая нуклеотидная последовательность неизвестна, замены нуклеотидов можно определить по полиморфизму длины рестрикционных фрагментов <ПДРФ) [7]. ПДРФ обнаруживается по наличию или отсутствию сайта рестрикции во фрагменте геномной ДНК при гибридизации меченого ДНК-зонда с обработанной рестриктазами геномной ДНК, расфракционированной по размеру в агарозном геле и перенесенной на мембранный фильтр. Этот метод оказался очень эффективным для выявления как значимых мутаций, так и нейтрального полиморфизма в геноме человека и других организмов. Однако большую часть мутаций и полиморфных участков генома не удается обнаружить с помощью анализа ПДРФ, поскольку вероятность того, что замена нуклеотида изменит именно сайт рестрикции, низка. Так, например, многие точковые мутации гена р-глобина человека, вызывающие талассемию, не изменяют сайтов рестрикции, а потому не могут быть непосред- [c.123]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология