Карта сцепления

Построение мультилокусной генетической карты (карты сцепления) хромосомы человека — непростая задача для ее решения используют специализированную комьютерную программу, позволяющую установить порядок расположения локусов, наилучшим образом согласующийся с данными по рекомбинациям. Проблема упорядочивания локусов усложняется по мере возрастания числа локусов, которые необходимо картировать. Для локусов сушествует М/2 возможных вариантов их расположения. Так, для 10 локусов их число равно 1 814 400. И хотя некоторые комбинации заведомо нереальны, даже если основываться на визуальной проверке данных, все же число возможных вариантов остается очень большим. Обычно сначала находят наиболее вероятное расположение нескольких сцепленных локусов, а затем комбинируют эти наилучшие варианты и строят статистически достоверную карту сцепления всех локусов. Критерием того, расположен ли один локус рядом с другим, является значение десятичного логарифма правдоподобия (лод-балла) если он равен или превышает +3,00, то ответ будет положительным. [c.459]

Построение генетической карты сцепления человека с помощью метода, основанного на полиморфизме длины рестрикционных фрагментов [c.458]

Рис. 1.11. Карта сцепления отражает физический размер хромосомы.

Использование многих тысяч разбросанных по всему геному полиморфных маркеров позволило определять как порядок расположения локусов, так и расстояния между ними на каждой хромосоме. Карта сцепления полиморфных участков оказывается неоценимой при локализации генов различных заболеваний. Для идентификации таких генов можно использовать зонды, специфичные в отношении последовательностей, которые фланкируют данный ген. [c.459]

Бурное развитие молекулярной генетики человека, начавшееся в 1980-х гг., стало возможным благодаря новаторским идеям Д. Ботштейна, Р. Уайта, М. Скол-ника и С. Дэвиса. Они обратили внимание, что полиморфизм длины рестрикционных фрагментов (ПДРФ) человека порождает полиморфные аллели (маркерные локусы), поддающиеся картированию. Как писали авторы в своей статье, мы хотим предложить новый способ построения генетической карты сцепления человека. В его основе лежит создание при помоши технологии рекомбинантных ДНК случайных однокопийных ДНК-зондов, способных выявлять полиморфные нуклеотидные последовательности при гибридизации с индивидуальными ДНК, обработанными рестриктазой . Более того, они осознали, что, используя сцепление гена того или иного заболевания с маркерным локусом, можно определить хро- [c.458]

Локализация гена заболевания на карте сцепления [c.460]

Таким же образом наследуются у плодовой мушки все другие признаки, развивающиеся под влиянием генов, локализованных в Х-хромосоме (см. карту сцепления на фиг. 33). [c.146]

А. Представлены все локусы. Б. Детальная карта сцепления участка между сОх и со . Здесь приведены мутанты трех групп (С,, Сз и Сз), которые можно различить по их фенотипическому эффекту / — участок хромосомы, контролирующий реакции иммунитета. Масштабы показывают величину участков на картах А и Б. соответствующих 1 и 0,1% рекомбинаций. [c.258]

Хотя такая точная карта сцепления на основе ПДРФ-маркеров пока недоступна, при существующих темпах прогресса ее удастся получить в ближайшие несколько лет. Поэтому сбор образцов ДНК больных детей от браков двоюродных и троюродных родственников представляется уже целесообразным. (Более далекое родство супругов оказывается менее информативным, так как требуется очень плотная карта ПДРФ-маркеров для выявления более коротких районов гомозиготности по происхождению , кроме того, при далеком родстве повышается вероятность того, что заболевание вызвано не гомозиготностью, а внедрением в родословную второго мутантного аллеля.) Генетики, интересующиеся картированием сцепления, должны проявить особый интерес к тем странам, где близкородственные браки все еще распространены. В качестве примера одна треть всех браков в индийском штате Андра — Прадеш заключается между дядей (со стороны матери) и племянницей [24]. [c.235]

Хромосома содержит длинную, непрерывную цепь ДНК, вдоль которой располагается множество генов. Мутации, вносящие изменения в последовательность пар оснований, позволяют распознавать различные участки генетического материала. На карте сцепления хромосом расстояния между мутациями представлены частотой их рекомбинации. [c.42]

Традиционные генетические методы не могли быть применены к наследованию таких признаков поэтому все, что можно было сказать, исходя из этих результатов,-это то, что, какой бы механизм их ни обусловливал, он не связан с хромосомами. Каждый такой ген необходимо было исследовать независимо, поскольку рекомбинации между признаками не наблюдалось соответственно было невозможно построить карты сцепления. Спорным был вопрос о том, какие механизмы, генетические или эпигенетические, определяли такое наследование. (Эпигенетические изменения-изменения, влияющие на фенотип клетки, но не затрагивающие ее генотипа например, стабильные изменения экспрессии гена.) [c.281]

Карта сцепления. Хромосомная карта, показывающая порядок линейного расположения генов на хромосоме. [c.308]

Для генома в целом оценка средней длины хромосомных сегментов, сохранившихся со времени расхождения предков людей и мышей, полученная, путем сравнения двух карт сцепления, составляет 8,1 сМ [1960]. Эта оценка была использована для определения числа хромосомных перестроек, зафиксированных в двух предковых популяциях за время, прошедшее после их разделения. [c.14]

Конечно, невозможно с высокой точностью распознавать гомозиготность по происхождению . Однако можно использовать плотную карту сцепления на основе ПДРФ для поиска района, в котором многие прилегающие ПДРФ-маркеры становятся гомозиготными. Эффективность этого метода будет зависеть от плотности используемых маркеров рестрикции и уровня их полиморфизма (т. е. вероятности того, что они будут гомозиготными в общей популяции). Рис. 6 показывает количество потомков от брака двоюродных и троюродных сибсов, необходимое для картирования гомогенного рецессивного заболевания. Если использовать карту ПДРФ с полиморфными локусами на каждые 5 сМ, для обнаружения сцепления понадобится менее 20 инбредных детей в таких браках. Для относительно редких рецессивных заболеваний метод гомозиготного картирования может оказаться лучшим. [c.235]

Однако данный подход имеет ряд недостатков. Во-первых, не всегда можно определить генотип деда, а следовательно, фаза, в которой находятся аллели у предположительно дигетерозиготной матери, остается неизвестной. Во-вторых, не все матери в большой выборке семей будут гетерозиготны по одним и тем же двум локусам. Несмотря на все усилия, до 1980-х гг. не удавалось построить достаточно протяженную однозначную карту сцепления Х-хромосомы человека, основанную на подсчете рекомбинантных и нерекомбинантных хромосом. В то время было известно всего [c.447]

Карты сцепления хромосом человека постоянно обновляются по мере идентификации дополнительных полиморфных локусов. С увеличением числа локусов повышается разрешение карты и уменьшается расстояние между локусами. К 1994 г. были определены генотипы членов СЕРН-семей примерно по 6000 полиморфным маркерам и с помощью мультилокусного картирования установлено положение примерно 1000 локусов по всему геному человека со средним расстоянием между локусами около 4 сМ. Задача широкомасштабных проектов картирования состоит в том, чтобы, используя дополнительные полиморфные маркеры, построить карту каждой хромосомы с расстоянием между локусами 1-2 сМ. [c.460]

A. Карта сцепления Drosophila, на которой показаны четыре группы сцепления (хромосомы). Б. Участок [c.479]

Рис. 6. Карта сцепления хромосом у томатов. Представлены наиболее изученные 11 групп сцепления (по С. D. layberg и др.. 1966).

Рис. 17.16. Соответствие генетической карты и карты хромосомы слюнных желез комплекса генов bithorax и непосредственно прилегающих к нему участков в правом плече третьей хромосомы D. melanogaster. Обозначенная непрерывной линией часть карты сцепления построена на основе изучения рекомбинации. Участок, отмеченный пунктиром, построен на основе цитогенетического изучения хромосомных перестроек расположение Uab относительно iab-2 и iab-3 точно не выяснено. Величина комплекса составляет

Генетика человека существенно продвинется вперед с появлением полной карты Сцепления. Такая карта будет состоять из маркеров ПДРФ, равномерно разбросанных по всем хромосомам, покрывая в целом около 3300 сантиморганид (сМ). [c.218]

Симультанный скрининг генома с использованием малых семей. Доступность полной карты сцепления ПДРФ человеческого генома делает возможным выявить сцепление, даже если в изучаемой популяции сегрегирует более чем один локус. Этот недавно разработанный метод [23], известный как симультанный скрининг, подводит к естественному обобщению стандартного метода картирования сцепления. [c.228]

Используя весь потенциал полной карты сцепления ПДРФ-маркеров человеческого генома, можно разработать альтернативные подходы, позволяющие преодолеть эти генетические затруднения. При настоящих темпах картирования ПДРФ надежда получить такую карту в ближайшие два года кажется оправданной. В будущем при планировании анализа сцеплений исследователи, рассматривая возможные пути преодоления генетических сложностей, могут рассчитывать на доступность кар- [c.236]

Таким образом, используя весь потенциал карты сцепления человеческого генома, построенной на основе ПДРФ, можно расширить область изучения наследственности человека, выйдя за раМ Ки набора признаков, наследуемых исключительно по законам Менделя. В ходе подобных исследований может быть разрешен широкий круг медицинских вопросов, а также достигнут общий прогресс в исследованиях в области биологии млекопитающих. [c.237]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология