Лидерная последовательность

Рис. 9.12. Лидерные последовательности используются белками для узнавания поверхностей митохондрий и хлоропластов.

Для многих мембранных белков первичная последовательность зрелого полипептида сама по себе недостаточна для встраивания белка в мембрану. Для этого необходима дополнительная информация, которая в большинстве случаев представлена в форме лидерной последовательности, локализованной на N-конце белка. Белок, имеющий лидерную последовательность, называется пре-белком. Это промежуточная стадия, которую проходит белок в процессе созревания, так как лидерная последовательность отщепляется в процессе встраивания белка в мембрану. [c.128]

Прикреплении рибосом к мембране происходит благодаря N-концевой лидерной последовательности образующегося полипептида [c.129]

Известно, что некоторые белки не имеют лидерных последовательностей, но тем не менее встраиваются в мембраны. Вероятно, какая-то другая последовательность обеспечивает этот перенос, происходящий одновременно с трансляцией, хотя в данном случае отщепления сигнальной последовательности не происходит. [c.130]

Рис. 15.6. Лидерная последовательность trp-генов кодирует короткий пептид.

При экспрессии поздних генов аденовируса одна и та же лидерная последовательность в результате сплайсинга может быть соединена с одной из нескольких различных кодирующих последовательностей. Происходящие при этом события схематично представлены на рис. 20.20. Здесь имеется одна единица транскрипции, экспрессия которой инициируется в одной-единственной точке. В начальной части транскрипционной единицы присутствуют три последовательности, которые при сплайсинге соединяются вместе, образуя нетранслируемую лидерную последовательность. (Такая ситуация показана на рис. 20.6 и 20.7.) Компоненты лидерной последовательности имеют небольщую длину и обозначены как лидерные экзоны 1, 2 и 3. Правее этих последовательностей находится несколько кодирующих участков, каждый из которых соответствует позднему белку вируса. Эти участки обозначены как кодирующие экзоны А, В, С и т. д. Для каждого первичного продукта транскрипции лидерная последовательность, состоящая из трех частей и образовавшаяся в результате первых двух этапов сплайсинга, затем может быть присоединена к одному из трех кодирующих участков. [c.257]

Рис. 9-77. Транскрибируемая часть гена р-глобина человека. Приведена последовательность той цепи ДНК, которая соответствует последовательности мРНК Первичный транскрипт РНК обведен цветной линией, а нуклеотиды, входящие в состав трех кодирующих областей (экзонов), выделены цветом. Следует отметить, что экзон 1 содержит 5 -лидерную последовательность а экзон У включает в себя У -трейлерную (дополнительную) последовательность Хотя эти последовательности и входят в состав мРПК. они не кодируют аминокислоты Высококонсервативные нуклеотиды ОТ и АО на концах каждого интрона обведены (см. рис. 9-79) обведены также сигналы разрезания и полиаденилирования вблизи З -конца гена (ААТААА, см. рис. 9-75).

Второй экспериментальный подход предполагал создание с помощью направленного мутагенеза рестрикционного са> та в лидерной последовательности так, чтобы он находился на достаточном удалении от места, соответствующего стыку лидерной и структурной частей секретируемой белковой молекулы (ближе к началу гена), чтобы элиминировать повторы Glu-Ala, но в [c.217]

Имеется еще один механизм регуляции, связанный со снижением скорости транскрипции, так называемая аттенуация. В клетках Е. соИ, как и в других бактериях, между первым структурным геном и геном-оператором расположена лидерная последовательность порядка 140—150 нуклеотидов, так называемый аттенуатор. Даже небольшой избыток конечного продукта того же триптофана приводит к тому, что РНК-полимераза, достигнув аттенуатора, перестает транскрибировать оперон. Уменьшение конечного продукта вновь включает транскрипцию. [c.473]

Согласно другой модели, 408-субчастица сначала узнает 5 -концевой кэп и затем передвигается вдоль мРНК, пока не встретит инициирующий кодон AUG (см. рис. 6.7). Обычно, хотя и не всегда, это будет первый триплет AUG, который она встретит на своем пути. После этого связь стабилизируется и к 408-субчастице присоединяется 608-субчастица в том участке, который выявляется как защищенный рибосомой. В случаях длинной лидерной последовательности можно предположить, что вторая 408-субчастица узнает 5 -конец еще до того, как первая покинула инициаторный участок в результате на этом отрезке могла бы выстроиться целая очередь субъединиц. [c.127]

Лидерная последовательность вьшолняет разные функции при различных условиях. Белки, образующиеся в цитоплазме, но предназначенные для функционирования в хлоропластах или митохондриях, синтезируются в виде предшественников с мол. массой 5000 даль- тон (около 45 аминокислот), превышающей молекулярную массу зрелого продукта. В таком виде предшественник выходит из полисом. Будучи добавлен in vitro, он мо- [c.128]

Модель, объясняющая механизм встраивания в мембрану, была предложена на основе работ с эукариотическими системами микросом (содержащими рибосомы и эндоплазматический ретикулум). Эти системы способны упаковывать новосинтезированные белки в мембраны, но не функционируют в случае добавления уже выделенного п репротеина. В свое время была выдвинута гипотеза сигнальной последовательности, согласно которой наличие лидерной последовательности почти во всех секрети-руемых белках служит своего рода сигналом, присутствие [c.128]

По мере продолжения трансляции растущая полипептидная цепь проходит иероз мембрану и лидерная последовательность отщепляется [c.129]

Гипотеза сигнальной последовательности, первоначально предложенная для эукариотических клеток, применима и к бактериям. Мутации в N-концевой лидерной последовательности могут нарушить секрецию. Однако их можно супрессировать мутациями в других генах, в число которых входит по крайней мере один из генов рибосомных белков. Таким образом, сама рибосома каким-то образом участвует в механизме прикрепления к мембране. Это означает, что сигнальная последовательность взаимодействует не только с мембраной и что при этом должны существовать другие белок-белковые контакты с рибосомой. Как и в случае эукариот, у бактерий могут существовать дополнительные сигналы, необходимые для правильной локализации белка после его проникновения в мембрану. Например, С-концевая область Р-лактамазы Е. соИ нужна для того, чтобы белок вышел из мембраны и поступил в переплазматическое пространство. [c.130]

Данный регуляторный сайт получил название аттенуа-тор. Он локализован в пределах транскрибируемой лидерной последовательности из 162 нуклеотидов, которая предшествует инициирующему кодону гена trpE. [c.191]

Лидерная последовательность может быть представлена в виде альтернативных структур, образуемых спаренными основаниями. Способность рибосомы проходить через лидерную область может регулироваться переходом из одной структуры в другую. Именно от этой структуры зависит, обеспечит ли мРНК условия, необходимые для терминации. [c.192]

Критическое значение для чувствительности механизма имеет положение кодонов триптофана в лидерной области относительно локализации аттенуатора. Деталью, необходимой для правильной согласованности всех событий, является наличие сайта, вызывающего остановку РНК-полимеразы в положении, соответствующем 90-му основанию лидерной последовательности. Остановка РНК-полимеразы обеспечивает возможность [c.193]

Отдельные лидерные последовательности значительно длиннее лидера trp-onepona, а области, в которых может происходить задержка рибосом, вызывающая дерепрес- [c.196]

Для аденовируса показано (рис. 20.6), что 5 -конец поздней мРНК действительно образуется в результате объединения трех очень коротких последовательностей РНК, соответствующих далеко отстоящим участкам вирусного генома. В этом примере состоящий из трех частей 5 -участок соответствует нетранслируемой лидерной последовательности, в то время как кодирующая область представлена основной частью мРНК. На рис. 20.7 приведены данные электронной микроскопии по организации вирусного генома. Строение показанного там гибрида указывает на то, что при наличии нескольких промежуточных последовательностей структуры на микрофотографии становятся запутанными и сложными для интерпретации. [c.248]

Рис. 20.20. При экспрессии поздних генов аденовируса одна и та же лидерная последовательность может быть присоединена к различным кодирующим участкам мРНК. На рисунке показаны только три кодирующих экзона, однако в действительно-

Рис. 16.22. Организация последовательностей ДНК Х. -легких цепей в зародышевых и дифференцированных миеломных клетках мыыш. Пронумерованные стрелки указывают положения со К1-сайтов. мРНК, соответствующая легкой полипептидной цепи, состоит из лидерной последовательности (Ь), последовательности вариабельных участков (V и I) и последовательности константного участка (С). В ДНК присутствуют две промежуточные последовательности, и 1 , причем отделяет лидерный участок от ва-

Гибридные гены можно конструировать таким образом, что детерминируемые ими чужеродные белки будут локализоваться в цитоплазме клеток Е. oli либо, если лидерную последовательность встроить перед кодирующей, будут секретироваться наружу через клеточную мембрану. Как правило, когда рекомбинантные полипептиды остаются в клетке, они накапливаются в больших количествах (до 25% от суммарного белка клетки), чем когда они секретируются клеткой (менее 1 % суммарного белка клетки). Однако многие полипептиды, экспрессируемые в цитоплазму, образуют малорастворимые агрегаты [1J, и в этом случае для работы с ними требуются специальные методы их перевода в растворимое состояние. [c.95]

Нуклеотидная и соответствующая аминокислотная последовательности лидерной зоны альфа-фактора и непосредственно примыкающая к ней 5 -промоторная последовательность гена показаны на рис. 7.3. Основные подходы к использованию лидерной последовательности альфа-фактора дрожжей для осуществления секреции гетерологичных генов описали Брейк и др. [23]. В структурном гене МРа-1 локализован Ятс П1-сайт, который в сайте процессинга молекулы-предшественника захватывает первый из двух повторов, соответствующих 01и-А1а. Это открывает традиционный, относительно несложный путь присоединения зрелых гетерологичных полипептидов к сигнальному пептиду альфа-фактора. Однако использование природного Я1П(11П-сайта может привести к внеклеточной секреции продукта, гетерогенного по Ы-концу большая часть молекул будет нести один или два дополнительных Ы-концевых дипептида С1и-А1а. Обусловлено это недостаточностью фермента дипептидил-аминопептидазы - продукта гена 51с13. Фермент этот элиминирует повторы С1и-А1а после того, как под действием продукта гена кех2 произойдет первичное эндопептидазное расщепление, полипептидной цепи предшественника за димером Ьуз-Аг . [c.216]

Рис. 7.3. Лидерная последовательность альфа-фактора и прилежащая 5 -про-моторная последовательность. Введение направленной толковой мутации (обозначенной значком А ) приводит к появлению внутри промотора Hindlll-сайта, который используется для замещения лидерной последовательности альфа-фактора желаемой гетерологичной последовательностью. В качестве альтернативного варианта промотор можно использовать для цитоплазматической экспрессии. Направленный мутагенез по сайту, обозначенному АА А позволяет получать составные белки, в которых отсутствуют повторы Glu-A a. Для этой цели можно также изменять последовательности, непосредственно предшествующие природному Яi/гdIII- aйтy.

Смотреть страницы где упоминается термин Лидерная последовательность: [c.113] [c.127] [c.552] [c.216] [c.236] [c.126] [c.128] [c.129] [c.129] [c.130] [c.190] [c.256] [c.257] [c.292] [c.292] [c.335] [c.195] [c.198] [c.198] [c.203] [c.224] [c.229] [c.16] [c.216] [c.218]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология