Инициирующий кодон для гена

Это позволяет начать трансляцию с другого гена-гена лизиса. Инициирующий кодон этого гена лежит впереди по ходу трансляции. Таким образом, терминация трансляции, связанная со сдвигом рамки считывания, необходима для последующего взаимодействия рибосомы с инициирующим кодоном гена, ответственного за лизис. Поэтому редко происходящие ошибки считывания на самом деле могут являться важным компонентом естественного процесса трансляции. [c.101]

Из кишечной палочки был выделен белок-репрессор, который очень прочно связывается с ДНК у самого начала определенного гена, между промотором и инициирующим кодоном, и не дает РНК-полимеразе считывать этот ген. Так реализовалось одно возможное объяснение. [c.50]

Рис. 1.10. Альтернативный сплайсинг при экспрессии гена кальцитонина крысы, с — кодирующий экзон —интрон > — инициирующий кодон, А — терминирующий кодон рА — терминатор транскрипции и сайт полиаденилирования

Данный регуляторный сайт получил название аттенуа-тор. Он локализован в пределах транскрибируемой лидерной последовательности из 162 нуклеотидов, которая предшествует инициирующему кодону гена trpE. [c.191]

Рис. 29-27. А. Регуляторные участки ia -onepo-на. САР-участок промотора способен связывать САР лишь в том случае, если он находится в комплексе с сАМР, РНК-полимераза мо,-жет попасть в участок первоначального связывания только при условии, если САР-участок занят. Репрессор взаимодействует с оператором лишь в отсутствие индуктора. Б. Три структурных гена Z, у и а ас-оперона транскрибируются при условии, что в среде нет глюкозы, а присутствует лактоза. В этом случае оператор свободен от репрессора и комплекс САР-сАМР соединяется с промотором, позволяя РНК-полимеразе попасть в участок первоначального связывания, спуститься к инициирующему кодону и начать транскрибировать три структурных гена. В. Если глюкозы в среде много, то сАМР не образуется и САР поэтому не в состоянии связаться с промотором. В этих условиях РНК-полимераза не может получить доступ к промотору и /ос-гены не транскрибируются.

Экспрессия этой транскрипционной единицы зависит от ориентации сегмента ДНК, сцепленного с ней. Сегмент имеет протяженность, равную 995 п. н., и ограничен повторами длиной 14 п.н. (IRE и IRR). Инициирующий кодон гена Н2 лежит на расстоянии 16 п.н. вправо от прилегающего инвертированного повтора. Сегмент ДНК между IRE и IRR содержит ген hin, продукт которого представляет собой тракс-действующий белок, способствующий инверсии всего сегмента путем реципрокной рекомбинации между инвертированными повторами (рис. 36.9). Мутации в hin-гене уменьшают частоту инверсии в 10" раз. [c.470]

В полученной серии плазмид pLG" трансляция химерного белка начинается с инициирующего кодона гена X. Причем в разных плазмидах расстояние между SD-участком и триплетом ATG не одинаюво, что обусловливает различия в уровне продукции химерного белка, которые легко выявить по ферментативной активности )3-галактозидазы в индивидуальных клонах плазмидосодержащих клеток. В вариантах гибридных плазмид pLG", обеспечивающих в клетках Е. соИ наибольшую активность )3-галактозидазы, осуществляют полную реконструкцию гена X. Получаемые плазмиды pLG " уже оптимизированы по трансляции мРНК, кодируемой последовательностью генаХ [c.152]

Последовательность оснований длиной 6 — 8 нуклеотидов, расположенная непосредственно перед инициирующим кодоном АУГ у Е. соИ, определяет эффективность процесса трансляции. Эта последовательность представляет собой участок связывания мРНК с рибосомой, и его сдвиг в ту или иную сторону способен уменьшать эффективность трансляции мРНК. По имени исследователей, идентифицировавших этот участок, он был назван последовательностью Шайн-Дальгарно. Обычно эту последовательность включают в состав самого вектора вместе с инициирующим кодоном на нужном расстоянии. При экспрессии векторов такого типа образуется гибридный белок, в котором несколько N-концевых аминокислотных остатков происходят от источника регуляторных элементов и инициирующего кодона прокариотического гена. Такие гибридные белки часто более стабильны обработка их химическим или ферментативным способом приводит к вьщелению эукариотической части белка. [c.123]

Именно таким образом получены штаммы Е. oli, продуцирующие гормон роста человека, интерфероны человека и другие белки, имеющие большое практическое значение. Присоединение к кодируюшей части гена инициирующего кодона необходимо для обеспечения инициации трансляции. Это приаодит к тому, что [c.438]

Триплет AUG неизменно кодирует метионин, независимо от того, расположен ли он в начале или внутри информационной РНК, хотя в двух этих случаях он узнается разными тРНК. Однако кодирующая способность триплета GUG зависит от его локализации. Когда он является инициирующим кодоном, то при инициации прочитывается как формилметионин. Когда же он расположен внутри гена, то узнается обычной валиновой тРНК, т.е. определяет включение валина в соответствии с генетическим кодом (рис. 4.5). [c.74]

Каждый из регуляторов является рибосомным белком, который связывается непосредственно с рРНК. Его влияние на трансляцию обусловлено способностью связываться также со своей собственной мРНК. В некоторых случаях были охарактеризованы сайты связывания. Например, в опероне L11 белок L1 связывается с сайтом, расположенным поблизости от инициирующего кодона первого гена. Это, по-видимому, подавляет связывание рибосом. Такое подавление влияет на трансляцию обоих генов оперона, вероятно, потому, что между генами L11 и L1 находится всего три нуклеотида. Следовательно, предположение, что гены могут быть транслированы только последовательно, вполне правдоподобно. [c.203]

МЕЖЦИСТРОННАЯ ОБЛАСТЬ. Расстояние между терминирующим кодоном одного гена и инициирующим кодоном следующего гена в полицистронной транскрипционной единице. [c.523]

М. Krystal и соавт. [39] секвенировали клонированные кДНК-копии гена НА B/Lee/40. Полная последовательность НА была получена при помощи двух клонов, один из которых простирался от синтетического олигонуклеотида, использованного в качестве праймера при синтезе кДНК, до 1336 основных пар. Второй клон начинался с нуклеотида 483 и простирался до 5 -конца вирионной РНК, что облегчило определение полной последовательпости. Общая длина составляет 1882 нуклеотида. Первый АУГ начинается в нуклеотиде 34, и в случае трансляции последовательности с этого инициирующего кодона предсказан белок из 584 аминокислот. N-терминальная последовательность начинается аминокислотой 16 [102]. Последовательность с 3-й по 15-ю аминокислоту неполярна и предположительно является сигнальным пептидом, как и у вирусов гриппа А [1, 22]. [c.276]

Для максимизации экспрессии существенным является соблюдение оптимального расстояния межд> SD-сайтом и инициирующим кодоном. Показано, что расстояние в 9 п. о. оптимально при экспресии лейкоцитарного оА (о2) и фибробластного интерферонов. Выход резко меняется при изменении расстояния. Так, для -интерферона выход составляет (%) 0.4 при расстоянии 2 п. о., 50 при 8, 1.6 при 15 п. о. (оптимум 100% — 9 п. о.). Вероятно, эти различия связаны с образованием вторичной структуры РНК ( шпильки ) и, следовательно, зависят от последовательностей клонированного гена, окружения SD-сайта и состава кодонов между SD и ATG. Таким образом, структура сайта связывания с рибосомами должна оптимизироваться для каждого нового гена индивидуально. В целом вариации структуры сайта связывания с рибосомами могут дать изменение экспрессии приблизительно в 10 раз. [c.195]

В гене А полностью располагаются гены А и В, частично — ген К (другая его часть находится в гене С) и оп-сайт начала синтеза положительной нити фаговой ДНК. Гены В к К транслируются в иной рамке по сравнению с трансляцией гена А, а ген А —ъ той же, но с другого инициирующего кодона. Строго говоря, ген С также перекрывается геном А, поскольку на их стыке имеется последовательность из четырех нуклеотидов АТСА. Три первых являются инициирующим кодоном для белка С, а три последних — терминирующим кодоном для белков А и А. Такая же последовательность нуклеотидов с аналогичной функцией имеется на стыке генов С и /), т. е. эти гены тоже перекрываются. Ген полностью располагается в гене В. Их концевые части устроены следующим образом [c.26]

Рис. 3 7. Строение ге.ч-локусов плазмид Р, Р1, р8С101 и К1 р — промотор (вертикальная штриховка) — ийА-6окс флажок — повтор, связывающий КерЕ- или КерА-белок (направление флажка указывает на ориентацию повтора) > — инициирующий кодон 4 — терминирующий кодон, АТ—АТ-богатый участок. Стрелки над промоторами и генами указывают на направление

Справочник химика 21

Химия и химическая технология