Реакционная способность половины

Реакционная способность половины связывающ центров [c.194]

В. Отрицательная кооперативность и реакционная способность половины активных центров [8, 9] [c.260]

Наличие сильной отрицательной кооперативности. На первых этапах насыщения активных центров субстратом каталитическая активность быстро возрастает, а затем, при насыщении субстратом примерно 50% активных центров, резко замедляется, вследствие чего это явление и получило название реакционная способность половины от числа активных центров . Для таких ферментов характерно существование двух типов констант связывания субстрата активными центрами, с сильным и слабым сродством, а также низкое (<1) значение коэффициента Хилла. [c.107]

Одной из первых работ, посвященных обсуждению физической природы флип-флоп -механизма катализа, явилась статья Луизи и Зандоменеги [114], в которой димерный фермент рассматривается как система взаимодействующих осцилляторов, передающих друг другу энергию через слабое, эластичное сопряжение. Флип-флоп -механизм является в этом случае следствием попеременной миграции энергии между взаимодействующими субъединицами. Авторы приходят к выводу, что описанный процесс наиболее близко согласуется с механизмом возникновения асимметрии в результате конформационных изменений, вызванных ассоциацией субъединиц. Однако эта асимметрия является, по мысли авторов, динамической, поскольку флуктуационная энергия (и соответствующее конформационное состояние) непрерывно перетекает от одной субъединицы к другой. Эта асимметрия может быть заморожена только при реакции на одном из двух участков, что проявляется как реакционная способность половины от числа активных центров . Несовершенство этого подхода состоит в том, что отсутствует тесная связь между процессом переноса энергии между субъединицами и ролью этого переноса в осуществлении каталитического акта. Кроме того, в данной работе не развиты представления о том, по каким конкретным структурам и с помощью какого механизма эта энергия передается. [c.107]

Еще одной гипотезой, направленной на объяснение явления реакционной способности половины от числа активных центров , является представление о линиях коммуникации , связывающих активные центры олигомерного белка [58]. Это представление возникло при объяснении различной реактивности тиоловых групп в креатинкиназе. По мысли авторов, линии коммуникации представляют собой участки в структуре фермента, передающие конформационные изменения от одного активного центра к другому. Хотя вопрос об асимметрической организации линий коммуникации может быть оспорен, тем не менее, использование этого представления для объяснения наблюдаемых фактов (отрицательной кооперативности, реакционной способности половины от числа активных центров ), в целом оправданно и полезно. В то же время, в этой гипотезе отсутствует определенность в отношении конкретных механизмов и носителей, обеспечивающих канализован-ность конформационных переходов в процессе межсубъединичных взаимодействий. [c.108]

Лиазы. Шесть представителей этого класса ферментов осуществляют реакции негидролитического отщепления различных групп (декарбоксилирования, дегидратирования). Обращает на себя внимание наличие в этой группе ферментов с большим числом субъединиц — 12 у ацетоацетатдекарбокси-лазы (4.1.1.4), 8 — дегидратазы 5-аминолевулиновой кислоты (4.2.1.24), по 4 — у остальных ферментов. Тем не менее, в процессе инактивации различными реагентами эти ферменты ведут себя как функциональные димеры и проявляют реакционную способность половины от числа активных центров . [c.138]

Изомеразы. Этот класс ферментов является наименее изученным в отношении флип-флоп -механизма. В нашу таблицу включены лишь два его представителя. При этом необходимо отметить, что наличие реакционной способности половины от чнсла активных центров в Д -3-оксостероид-изомеразе, обнаруженное в работе [164], подвергается сомнению другой группой авторов [132]. В то же время, данные, полученные на ме-гилмалонил-КоА-мутазе, носят пока косвенный характер. В си-лу этого вопрос о флип-флоп -механизме в работе изомераз пока остается открытым. [c.138]

В этой связи необходимо отметить следующее. Возможность выявления случая реакционной способности половины связывающих центров зависит от того, известна ли концентрация центров связывания на ферменте, что в свою очередь зависит от точности определения концентрации белка и чистоты препарата. Негомогенный препарат, содержащий молекулы, обладающие разным сродством к лиганду, дает кривую связывания такого же вида, как и в случае отрицательной кооперативности, что может привести к ошибочному выводу о наличии взаимодействия между субъединицами. Еще одна ситуация, которую можно ошибочно интерпретировать как случай реакционной способности половины связывающих центров, имеет место в реакциях, катализируемых лактатдегидрогеназой, и обсуждается в гл. 12 из-за неблагоприятной константы равновесия между E.NAD+.La и E.NADH.Pyr не происходит полного накопления ферментсодержащего промежуточного соединения E.NADH.Pyr [схема (12.9)]. [c.261]

Исследование взаимодействий субъединиц в олигомерных ферментах — это область кристаллографии. Мы знаем структуру дезоксигемоглобина и его полнстью лигандированной формы, а также имеем четкое представление о причинах кооперативности при связывании лигандов. Однако нам не известна кинетика путей перехода между двумя состояниями и структура промежуточных соединений. Хорошо описаны такие явления, как реакционная способность половины активных центров и отрицательная кооперативность связывания лигандов. Однако их значение еще не осознано в полной мере. [c.414]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология