Реакционная способность половины активных центров

В. Отрицательная кооперативность и реакционная способность половины активных центров [8, 9] [c.260]

В результате применения указанного подхода получили научное обоснование и объяснение ряд особенностей строения, функционирования и происхождения известных биоструктур. Так, при рассмотрении механизма передачи энергии по ССИВС авторы приходят к выводу об эффективности существования и преимуществах естественного отбора дуплицированных систем сопряженных связей, обладающих вращательной симметрией структур и оптической активностью составляющих их компонентов, а при рассмотрении возможного механизма действия ферментов с учетом принципа дупликации работающих структур ими объяснена причина известного явления половинной реакционной способности от общего числа активных центров ферментов. При построении модели биологических мембран обосновано происхождение их многоуровневого зонно-блочного строения с периодической повторяемостью блоков, с образованием каналов йереноса электронов и синхронного сдвига протонов по системам сопряженных ионно-водородных связей и с колебательным режимом их работы, согласующегося с известными свойствами мембран и рядом других фактов. Эффективным оказалось применение указанного подхода и при рассмотрении происхождения структурных особенностей и функционирования мультиферментных комплексов и метаболонов, объединяющих разные ферменты метаболических путей со структурными элементами клетки, в случае процессов гликолиза и цикла трикарбоновых кислот. Все это описано в работе хорошо, убедительно и представляет самостоятельную ценность. Очевидна также перспективность применения такого подхода для изучения связи особенностей строения и функционирования с происхождением и других типов надмолекулярных структур биообъектов и их эволюционных предшественников. [c.5]

Вопрос о том, обладают ли реакционной способностью все активные центры молекулы алкогольдегидрогеназы или половина их, остается открытым. Хотя этот фермент связывает два моля NAD+ с одинаковым сродством, считается, что в катализе участвует только один активный центр. [c.352]

Единого мнения о характере симметрии дегидрогеназы, кооперативности при связывании лигандов, а также о том, обладают ли реакционной способностью все активные центры или половина их, не существует [61—68]. Связывание ЫАО+ с ферментом является четко выраженным кооперативным процессом при связывании ЫАО+ с ферментом из мышц кролика и бактериальным ферментом обнаруживается сильная отрицательная кооперативность [61, 65], хотя при некоторых температурах [c.359]

Исследование взаимодействий субъединиц в олигомерных ферментах — это область кристаллографии. Мы знаем структуру дезоксигемоглобина и его полнстью лигандированной формы, а также имеем четкое представление о причинах кооперативности при связывании лигандов. Однако нам не известна кинетика путей перехода между двумя состояниями и структура промежуточных соединений. Хорошо описаны такие явления, как реакционная способность половины активных центров и отрицательная кооперативность связывания лигандов. Однако их значение еще не осознано в полной мере. [c.414]

Наличие сильной отрицательной кооперативности. На первых этапах насыщения активных центров субстратом каталитическая активность быстро возрастает, а затем, при насыщении субстратом примерно 50% активных центров, резко замедляется, вследствие чего это явление и получило название реакционная способность половины от числа активных центров . Для таких ферментов характерно существование двух типов констант связывания субстрата активными центрами, с сильным и слабым сродством, а также низкое (<1) значение коэффициента Хилла. [c.107]

Одной из первых работ, посвященных обсуждению физической природы флип-флоп -механизма катализа, явилась статья Луизи и Зандоменеги [114], в которой димерный фермент рассматривается как система взаимодействующих осцилляторов, передающих друг другу энергию через слабое, эластичное сопряжение. Флип-флоп -механизм является в этом случае следствием попеременной миграции энергии между взаимодействующими субъединицами. Авторы приходят к выводу, что описанный процесс наиболее близко согласуется с механизмом возникновения асимметрии в результате конформационных изменений, вызванных ассоциацией субъединиц. Однако эта асимметрия является, по мысли авторов, динамической, поскольку флуктуационная энергия (и соответствующее конформационное состояние) непрерывно перетекает от одной субъединицы к другой. Эта асимметрия может быть заморожена только при реакции на одном из двух участков, что проявляется как реакционная способность половины от числа активных центров . Несовершенство этого подхода состоит в том, что отсутствует тесная связь между процессом переноса энергии между субъединицами и ролью этого переноса в осуществлении каталитического акта. Кроме того, в данной работе не развиты представления о том, по каким конкретным структурам и с помощью какого механизма эта энергия передается. [c.107]

Еще одной гипотезой, направленной на объяснение явления реакционной способности половины от числа активных центров , является представление о линиях коммуникации , связывающих активные центры олигомерного белка [58]. Это представление возникло при объяснении различной реактивности тиоловых групп в креатинкиназе. По мысли авторов, линии коммуникации представляют собой участки в структуре фермента, передающие конформационные изменения от одного активного центра к другому. Хотя вопрос об асимметрической организации линий коммуникации может быть оспорен, тем не менее, использование этого представления для объяснения наблюдаемых фактов (отрицательной кооперативности, реакционной способности половины от числа активных центров ), в целом оправданно и полезно. В то же время, в этой гипотезе отсутствует определенность в отношении конкретных механизмов и носителей, обеспечивающих канализован-ность конформационных переходов в процессе межсубъединичных взаимодействий. [c.108]

Лиазы. Шесть представителей этого класса ферментов осуществляют реакции негидролитического отщепления различных групп (декарбоксилирования, дегидратирования). Обращает на себя внимание наличие в этой группе ферментов с большим числом субъединиц — 12 у ацетоацетатдекарбокси-лазы (4.1.1.4), 8 — дегидратазы 5-аминолевулиновой кислоты (4.2.1.24), по 4 — у остальных ферментов. Тем не менее, в процессе инактивации различными реагентами эти ферменты ведут себя как функциональные димеры и проявляют реакционную способность половины от числа активных центров . [c.138]

Изомеразы. Этот класс ферментов является наименее изученным в отношении флип-флоп -механизма. В нашу таблицу включены лишь два его представителя. При этом необходимо отметить, что наличие реакционной способности половины от чнсла активных центров в Д -3-оксостероид-изомеразе, обнаруженное в работе [164], подвергается сомнению другой группой авторов [132]. В то же время, данные, полученные на ме-гилмалонил-КоА-мутазе, носят пока косвенный характер. В си-лу этого вопрос о флип-флоп -механизме в работе изомераз пока остается открытым. [c.138]

Может ли увеличиться специфичность при связывании с ферментом, имеющим несколько центров связывания, более чем одной молекулы субстрата Такая возможность не исключается для систем in vitro, когда присутствует только один субстрат и анализируется абсолютная скорость, а не различие между субстратами. Однако в реальных биологических системах, где имеются специфические и конкурирующие субстраты, специфичность увеличиваться не может, поскольку в реакции участвуют смешанные комплексы, содержащие фермент и оба субстрата. Это можно показать с помощью формальных термодинамических выкладок. Рассмотрим случай, когда реакционной способностью обладает половина активных центров, и одна молекула субстрата, S, связывается с ферментом, но не претерпевает химических превращений с образованием продукта в отличие от [c.333]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология