Участки, определяющие комплементарность

Гурский, Готтих и соавторы предложили код белково-нуклеинового узнавания, определяющий регуляцию транскрипции (1976). Предполагается, что участок регуляторного белка состоит из двух антипараллельных сегментов полипептидной цепи, образующих -структуру. Узнавание основано на комплементарности этой структуры и последовательности нуклеотидных нар ДНК. Важное свойство такой последовательности состоит в асимметричном распределении гуанинов между двумя нитями ДНК. В предлагаемом коде шесть аминокислотных остатков — Сер, Тре, Асп, Гис, Глн, Цис—и их последовательность в сте-реоспецифичном участке белка определяет последовательность пар оснований ДНК, с которой данный белок преимущественно связывается. Код, разработанный на основе стереохимии, подтвержден взаимодействием Лак-репрессора с Лак-опероном и другими примерами. [c.288]

К середине 60-х годов было показано, что белки антител не представляют никакого исключения из этого правила оказалось, что антитела против разных антигенов отличаются по последовательности аминокислот и что специфическая структура любого антитела четко определяется его аминокислотной последовательностью. Было показано, что молекула антитела обладает четвертичной структурой и состоит из двух пар одинаковых полипептидных цепей — пары легких цепей длиной примерно 200 аминокислот и пары тяжелых цепей длиной примерно 400 аминокислот (фиг. 254). Молекула антитела содержит два центра, комплементарных антигену, стерессиецифическая конформация этих центров обусловлена переплетением противолежащих участков одной тяжелой и одной легкой цепи. Анализ аминокислотных последовательностей молекул различных антител показал, что первые 100 аминокислотных остатков со стороны аминоконца как легких , так и тяжелых цепей составляют вариабельный участок, аминокислотная последовательность которого у различных антител различна. Остальные 100 аминокислот легких цепей и 300 аминокислот тяжелых цепей составляют постоянный участок мо- [c.519]

Рассмотрение молекулы НАД (рис. 3) позволяет оценить возможные точки, по которым происходит связывание с белком, и определить наиболее целесообразный путь поиска функциональных групп, ответственных за связывание и катализ. Остаток пирофосфорной кислоты обладает сильным анионным характером. Комплементарный ему положительно заряженный участок НАД-связывающей области скорее всего представлен аминогруппой лизина или гуанидиновой группой аргинина. Положительно заряженный атом азота пиридиниевого цикла связывается с соответствующим участком, в качестве которого могут выступать карбоксильные группы остатков дикарбоновых кислот адеркаптидная группа цистеина. На первой стадии связывания НАД в активном центре дегидрогеназ важную роль играют, по-видимому, именно силы электростатического взаимодействия, как наиболее дальнодействующие и прочные. Следует также учитывать перенос заряда с индольного кольца o taткa триптофана на никотинамидную компоненту НАД при рассмотрении механизма действия конкретных дегидрогеназ, [c.30]

В большинстве случаев возникает неопределенность, связанная с химической идентичностью двух концов линейной молекулы. Это эквивалентно неопределенности физического направления последовательности в кольцевой молекуле. Предположим, например, что картируется делеционная петля в середине цепи. В этом случае а priori неизвестно, является ли данный конец 3 - или 5 -концом цепи, которая несет участок, комплементарный пропущенному. Устранить эту неопределенность можно или с помощью генетических данных, или — более прямым путем — добавлением в среду специфических ферментов, вызывающих частичную деградацию цепи ДНК с определенного конца. Если гены картируются с помощью гибридов РНК — ДНК, иногда в распоряжении исследователя оказываются предшественники РНК, имеющие дополнительные основания или на 3 -, или на 5 -конце. В этих случаях можно определить физическое направление цепи. [c.167]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология