Спейсер

Гены рРНК у эукариот представлены тандемно повторяющимися копиями (100- 00), служащими матрицами для образования транскриптов, подвергающихся процессингу (рис. 98). Транскрибируемые последовательности разделены спейсерами, также играющими большую роль в транскрипции рРНК и ее регуляции (см. гл. X, [c.165]

Тщательное изучение показало, что реакции с катализаторами, связанными с полимерами, имеют отчетливо выраженную кинетику псевдопервого порядка в тех случаях, когда каталитическая часть связана с матрицей длинной несущей цепью — спейсером — такой, чтобы до матрицы было 30—40 атомов. Наиболее ярко параллельный рост каталитической активности и длины цепи наблюдали при использовании в качестве растворителя н-гептана для аммониевых [860], фосфониевых [858] и краун-эфирных [858] каталитических групп. Эти данные позволяют предположить, что каталитическая активность зависит [c.98]

I. Нуклеотидные последовательности, соответствующие кодирующим частям генов, интронам, спейсерам, молекулам РНК. [c.41]

Эта цепь одновременно представляет собой гидрофильный и лишенный заряда спейсер. Она достаточно прочна, и подтекания лиганда в процесс использования сорбента не происходит. [c.356]

Как уже указывалось, для устранения стерических препятствий присоединению макромолекулярных лигандов между ними и матрицей бывает необходимо ввести молекулу спейсера . Чаще всего эту роль выполняют линейные алифатические цепи, содержащие 6—8 звеньев. [c.357]

Процедура посадки лигандов на активированные спейсеры описана ниже. [c.360]

Получены систематические ряды жестко-гибких полимеров, включающих синтезированные триады и спейсеры с различной длиной алифатической цепи. Проанализирована взаимосвязь структуры мезогенного фрагмента и способности полимера к переходу в жидко-кристаллическое состояние (формирование мезофазы). Введение в ме-зоген бензоильной детерминанты значительно понизило температуру образования мезофазы для полимера и сузило пределы ее существования. Выявлена зависимость способности макромолекулы к самоупорядочению от строения жесткого фрагмента, включающего активный структурный детерминант [3]. [c.105]

Модифицированный подход к синтезу аналогичных древовидных полиэфиров может быть основан на использовании исходных соединений с более длинным спейсером между точками ветвления, какв эфире 83 [17с], Реакция последнего с четырьмя эквива,тентами мономезилата 84 протека.1а гладко и приводила, после удаления тритильных защит к додекаолу 85 (схема 4.27), Можно рассчитывать на то, что для этой модели пространственное ингибирование роста молекулы обнаружится на более поздних стадиях, чем это имело место в случае системы, рассматривавшейся на схеме 4.26. [c.411]

Проиллюстрированная приведенными выше примерами дивергентная стратегия была широко использована при синтезе других звездообразных дендримеров с различными центральными корами, мономерными единицами и разными цепями спейсеров. Эффектный успех бьш достигнут с помощью аммиака или аминов в качестве начального кора и р-аланиновы>с единиц как мономеров [17d]. Типичный пример синтеза этих полиамидо-аминных дендримеров (РАМАМ) представлен на схеме 4,28. [c.411]

Образование кора 86 достигалось путем присоединения аммиака к метил-акрилату по Михаэлю с последующим аминолизом промежуточного полиэфира этилендиамином. Повторение тех же реакций с этим кором как с нуклеофилом приводило последовательно к дендримерам 1-, 2-го и т. д. поколений (87,88 и т. д.). Наличие более длинного спейсера, а также более низкий коэффициент разветвления (и = 3) обеспечивали этой модели гораздо более позднее по ходу синтеза появление существенных стерических препятствий, так что в этом случае оказа,тось возможным дойти таким итеративным путем до дендримера девятого поколения (Gen-9), Это соединение имеет мо-лекулярньгй вес 349 883, диаметр его молекулы составляет 100 Л, а на ее поверхности располагается 1536 аминофупп, Компьютерное моделирование дендримеров этого типа показало, что если Gen-3 по форме молекулы еще напоминает плоскую звезду, то начиная с Gen-5 форма молекулы последовательно приближается к шарообразной. [c.411]

Поэтому мы начнем изложение с краткой характеристикп используемых в настоящее время компонентов аффинных сорбентов матриц, лигандов и спейсеров. Одновременно рассмотрим способы соединения их между собой, ограничившись только теми немногими пз большого числа вариантов, испробованных и описанных в прошлом десятилетии, которые выдержали проверку временем. Впрочем, к ним имеет смысл добавить два-три только что предложенных способа, обещающих какие-то новые преимущества. Затем можно будет проанализировать более подробно параметры и характерные особенности процесса аффинной хроматографии и на основании этого анализа сформулировать некоторые рекомендации по практической постановке эксперимента. [c.342]

Различия в структуре спейсеров у близких видов очень велики, оэто.му спейсеры рассматривались как функционально нейтральные. Обнаружение важных регуляторных элементов в составе спей- ера позволило поставить под сомнение общее представление о то.м, что в процессе эволюции быстро меняются те районы ДНК, которые (функционально нейтральны. Напротив, можно предполагать, что здесь осуществлялась сравнитетьно быстрая совместная эволюция ( коэволюция ) функционально важных участков ДНК спейсера и белков, взаимодействующих с ни.ми. [c.209]

Особенность участков генов 5S РНК и тРНК, узнаваемых фак4 торами транскрипции и РНК-полимеразой и обеспечивающих инициацию транскрипции, состоит в том, что они локализованы непосредственно в транскрибируемом районе (или районах) гена. Так, район внутри генов 5S РНК лягушки, кодирующий нуклеотиды с 55-го по 80-й, необходим для инициации транскрипции (рис. 114). Размеры транскрипционного комплекса, включающего субъединицы полимеразы, достаточно велики, чтобы взаимодействовать с внутренними районами небольшого по размерам гена и одновременно инициировать транскрипцию. Сигналом терминации транскрипции служит последовательность из нескольких следующих друг за другом тимидиловых нуклеотидов. Роль спейсера в транскрипции, по крайней мере в опытах in vitro, пока не была обнаружена. Новообразованная 5S РНК, по-видимому, не подвергается модификации и процессингу. [c.210]

Накопление интегразы способствует переходу фаговой ДНК в состояние профага, а появление репрессора I подавляет активность почти всех фаговых генов. Последний эффект — результат присоединения репрессора I к левой и правой операторным зонам (О,, и Or). Каждая из этих зон включает по три близких по структуре несовершенных инвертированных повтора, разделенных короткими спейсерами (рис. 155). Лучше всего и прежде всего репрессор взаимодействует с самым правым участком (0, i) правой зоны и самым левым участком (Oli) левой зоны. Поскольку эти участки перекрываются с промоторами и Pl, присоединение репрессора инактивирует промоторы, [c.294]

При выборе спейсера, помимо длины, следует учесть степень его гидрофобности, поскольку от этого может зависеть неспецифпческая сорбция на матрице. Необходимо также выбрать химическую группу, которая окажется на свободном конце спейсера к этой группе должен присоединяться лиганд. Что касается присоединения спейсера к матрице, то здесь используются те же приемы, какие были описаны для присоединения лигандов к активированным матрицам, поэтому на ближайшем к матрице конце спейсера почти всегда располагается аминогруппа. [c.357]

Чаще всего в качестве спейсеров используют простейшие линейные молекулы 1,6-диаминогексан (гексаметилендпаыпн) и 6-амино- [c.357]

Иногда, наоборот, выгодно иметь в составе спейсера фенильный остаток, с тем чтобы биоспецифической посадке вещества на лиганд способствовало взаимодействие ароматических групп. Описано использование для образования спейсера п-фенилендиамина [Porath, Axen, 1976]. [c.358]

Шестичленные алифатические спейсеры не отличаются высокой степенью гидрофобности, и все же следует пметь в виду возможность различного рода нежелательных явлений, обусловленных такой гидрофобностью. Например, известны случаи ложной биоспецифичности связывания фермента с аффинным сорбентом, когда попытки очистки на таком же сорбенте фермента с такой же биологической специфичностью, но полученного из другого объекта кончались полной неудачей. Причина, как оказалось, состояла в различии гидрофобных свойств поверхностей белковых молекул вдали от активных центров этих ферментов, а связывание одного из них носило гидрофобный характер [О Сагга et al., 1974]. Те же авторы описали интересное яв- [c.358]

Фпрма Bio-Rad в своих гелях использует гидрофильные сией-серы. Так, агарозная матрица Affi-Gel 102 несет спейсеры с аминогруппой на конце [c.359]

Матрицы типа Affi-Gel 202 содержат более длинные гидрофильные спейсеры, оканчивающиеся карбоксильной группой. Они имеют в своей цепочке две пептпдные связп [c.359]

Содержание спейсерных групп в обеих матрицах составляет 15 мкмоль на 1 мл влажного геля. Эта же фирма выпускает и два геля для аффинной хроматографии на чпсто полиакриламидной основе с одинаковыми короткими спейсерами следующего вида —СО—NH—(СН2)2—NHj. Их торговые названия — Aminoethyl Bio-Gel Р2 и Aminoethyl Bio-Gel Р150 . Очевидно, эти гели отличаются друг от друга по своей пористости. [c.359]

Органический синтез. Наука и искусство (2001) -- [ c.411 , c.417 , c.493 ]

Органический синтез (2001) -- [ c.4 , c.417 , c.493 ]

Молекулярная биология клетки Т.3 Изд.2 (1994) -- [ c.162 ]

Химия привитых поверхностных соединений (2003) -- [ c.0 ]

Молекулярная биология клетки Т.3 Изд.2 (1994) -- [ c.162 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология