Тимидин дифосфат

При прямом фосфорилировании тимидина (или дезоксицитидина) избытком дибензилхлорфосфата с последующим гидрогенолизом с целью удаления бензильных групп образуется дезоксинуклеозид-3, 5 -дифосфат [22] наряду с небольшим количеством 5 -фосфата З -фосфата при этом не образуется, что указывает на некоторую избирательность фосфорилирования гидроксильной группы в положении 5 [145]. Пиримидиновое основание может оказывать значительное влияние на относительную реакционную способность гидроксильных групп сахара использование той же методики для [c.152]

Синтез всех четырех теоретически возможных простых нуклеотидов, являющихся производными дезоксицитидина и тимидина, был осуществлен фосфорилированием соответствующим образом защищенных нуклеозидных производных с последующим удалением защищающих групп [464]. Дезокси-цитидин-5 -фосфат и тимидин-5 -фосфат были выделены из энзиматических гидролизатов дезоксирибонуклеиновых кислот [465] 3, 5 -дифосфаты дезоксицитидина и тимидина были обнаружены в кислых гидролизатах и идентифицированы с помощью синтеза [466]. В этих гидролизатах был также найден 3, 5 -дифосфат 5-метилдезоксицитидина [466] Уид и Куртней [467] обнаружили 3, 5 -дифосфат 5-оксиметилдезоксицитидина в кислых гидролизатах нуклеиновой кислоты, полученной из бактериофага. [c.258]

Более подробно влияние лигандов тимидин-3,5-дифосфата (ТОР) и a " было изучено для нуклеазы Т, протеолитического производного нуклеазы стафилококка [94]. Константу равновесия системы нативная конформация — развернутая конформация можно [c.190]

Нуклеаза стафилококков является примером фосфодиэстеразы с малой субстратной специфичностью, поскольку она расщепляет ДНК, РНК и олигонуклеотиды до З -мононуклеотидов [31]. Нуклеаза стафилококков получена в кристаллическом виде определены ее аминокислотная последовательность и трехмерная структура. Необычность фермента заключается в том, что для проявления активности он нуждается в ионах кальция. Ион металла присоединяется к нуклеазе только в присутствии субстрата или ингибитора, например тимидин-3, 5 -дифосфата. Нуклеаза стафилококков действует как эндонуклеаза, но после того, как осуществлены разрывы цепи, она может действовать как экзонуклеаза. [c.145]

ОТ количества фосфатных остатков, связанных с углеводом. (Дезоксицитидин и тимидин значительно менее устойчивы, чем их фосфатные эфиры, особенно 3, 5 -дифосфаты.) В типичных условиях гидролиза динуклеотид (д)-ф5 ЦЗ ф5 Ц медленно распадается на цитозин [c.432]

РИС. 7-4. Схема, демонстрирующая образование водородных связей между ноиами гуанидииия остатков Агд-35 и Аге-87 нуклеазы стафилококков и 5 -фосфатной группой ингибитора—тимидин-3, 5 -дифосфата в комплексе Е-Ь1+Са + (по Коттону и др. [73]). [c.125]

Обычным методом кислотной деградации ДНК является нагревание ее 2%-ного раствора в 0,2 и. серной кислоте при 100° С в течение 35 мин 2 . При данном методе гидролиза эти условия являются оптимальными, так как они позволяют достичь достаточно полного расщепления фосфодиэфирных связей у дезоксирибозильных звеньев, образовавшихся в результате апуринизации ДНК (см. также стр. 500). Большая продолжительность реакции приводит к частичной апиримидипизации ДНК и расщеплению соответствующих фосфодиэфирных связей, как было показано при изучении кинетики кислотного гидролиза пиримидиновых олигонуклеотидов. При этом остаток цитозина отцепляется с большей скоростью, чем остаток тимина Так, при длительном нагревании динуклеотида р(1Тр(1С в 0,2 н. серной кислоте при 100° С протекает преимущественное отщепление цитозина и образование тимидин-3, 5 -дифосфата [c.574]

Необычным в случае нуклеазы стафилококка является то, что, несмотря на высокие концентрации Са(П), необходимые для оптимальной активности (вплоть до 0,01 М в зависимости от pH), в растворе в присутствии монофосфонуклеотидов связывается лишь 1 моль Са(И) на 1 моль фермента, тогда как в присутствии ингибитора — тимидин-3 5 -дифосфата (ТДФ)—связываются 2 моля [296]. Однако в отличие от исследований, проведенных для растворов, лишь один центр связывания Са(П) был идентифицирован при рентгеноструктурном исследовании тройного комплекса нуклеаза —Са(И) — ТДФ при разрешении 200 пм [33, 297]. Как указывали Коттон и Хазен [298], это различие может быть обусловлено неодинаковыми условиями рентгеноструктурных и химических исследований. Предполагается [297], что второй ион Са(И) связан между фосфатными группами кольца рибозы и что связыванию препятствует ближайшая боковая цепь соседней молекулы. В отсутствие субстрата ни один из ионов Са(П) с ферментом не связан [295, 296]. [c.115]

С помощью ионообменной хроматографии [22] из кислотных гидролизатов дезоксирибонуклеиновой кислоты были выделены родственные 3, 5 -дифосфаты тимидина, 2 -дезоксицитидина [22, 80— 83] и 5-метил-2 -дезоксицитидина. Образующийся при каталитическом гидрировании тимидин-3, 5 -дифосфата дигидротимидин-3, 5 -дифосфат подвергался кислотному гидролизу в мягких условиях, в результате которого были получены дигидротимин и обладающий восстановительными свойствами дифосфат сахара, что подтверждает установленное для этого соединения строение [80]. [c.138]

В статье использованы следующие сокращения УДФ — уридин-5 -дифосфат АДФ — аденозин-5 -дифосфат ГДФ — гуанозин-5 -дифосфат ЦДФ — цитидин-5 -дифосфат ТДФ — тимидин-5 -дифосфат НАД— никотинамидадениндинуклеотид НАДФ — никотинамидадениндинуклео-тидфосфат УДФГ — уридиндифосфатглюкоза. [c.177]

Смотреть страницы где упоминается термин Тимидин дифосфат: [c.163] [c.524] [c.101] [c.5] [c.359] [c.51] [c.524] [c.277] [c.492] [c.572] [c.411] [c.111] [c.152] [c.419] [c.422] [c.429] [c.432] [c.488] [c.47] [c.271] [c.289] [c.394]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология