Апуринизация оснований

После действия ДHK-N-rликoзилaзы в ДНК остается АР-сайт. Репарация такого повреждения может идти одним из двух путей. У эукариот был обнаружен фермент ДНК-иксертаза, способный непосредственно пришивать к дезоксирибозе основание в соответствии с комплементарной цепью ДНК- Пока обнаружены лишь пуриновые инсертазы, видимо вследствие того, что апуринизация происходит значительно чаще, чем потеря пиримидинов- Второй путь репарации открывают ферменты, обнаруженные у всех организмов,— kV-эндонуклеазы. АР-эндонуклеазы разрывают саха- [c.76]

Существует несколько методов определения молярных процентов гуанина и цитозина (мол. % G + ) в ДНК, которые мы перечислим ниже 1) гидролиз и последующее разделение нуклеотидов или пуриновых ИЛИ пиримидиновых оснований 2) определение плавучей плотности 3) определение температуры плавления (денатурации) 4) бромирование [58] 5) апуринизация [37] 6) определение отношения Агео/Агао в буфере с низкой ионной силой при pH 3 [25] 7) жидкостная хроматография под высоким давлением нуклеотидов или свободных оснований [14,39]. Примесь РНК мешает определению всеми этими методами, за исключением методов, основанных на измерении плавучей плотности и температуры плавления Тт), поэтому последние стали наиболее популярными. [c.127]

Для ДНК, но не для РНК, легко осуществимо отщепление пуриновых оснований (апуринизация) без существенного расщепления фосфодиэфирных связей (табл. 8.8). [c.501]

Нуклеиновые кислоты тоже гидролизуют сильной кислотой. Например, нагревания в течение 1 ч при 100 °С в 12 н. хлорной кислоте достаточно для расщепления молекулы до составляющих ее оснований. В ДНК Ы-гликозидные связи более лабильны, чем в РНК, связи с пуринами более лабильны, чем с пиримидинами. Последнее обстоятельство позволяет провести весьма полезную операцию если оставить ДНК на ночь на холоду при pH 2, произойдет полная ее апуринизация. Образующийся полимер известен как апуриновая кислота (табл. 2-11). [c.166]

Б ДНК сравнительно часто и спонтанно происходят апуринизация и дезаминирование оснований. Масштабы апуринизации можно оценить по тому, что ДНК каждой клетки человеческого организма ежедневно теряет около 5000 пуринов. Результатом апуринизации является АР-сайт (англ. apurini -apyrimidini ) — дезоксирибоза, лишенная основания. [c.73]

Многие канцерогены алкилируют, например метилируют, основания ДНК. Наиболее частые продукты этих реакций —это 0 -ме-тилгуанин, 7-метилгуанин и 3-метил аденин. Первое из этих изменений мутагенно, а два других делают еще более лабильной Ы-глико-зидную связь между основанием и сахаром, т. е. способствуют апуринизации. [c.75]

Продуктом реакции является левулиновая кислота и, вероятно, альдегидные группы дезоксирибозных остатков, которые освобождаются в результате апуринизации, реагируют с дифениламином, образуя основания Шиффа. Последние отщепляют затем фосфо-рильный остаток из положения 5. Деградация апуриновой ДНК щелочью ведет к разрыву цепи, но этот метод менее удовлетворителен, чем кислотно-катализируемая реакция, описанная выше, поскольку при этом наблюдаются побочные реакции. Терминальное основание можно отщепить из молекулы РНК после ее катализируемой амином реакции с последующим повторным периодат-ным окислением схема (12) . Амин катализирует удаление модифицированного нуклеозида с З -конца РНК дальнейшее окисление [c.146]

Для количественкого отщепления пуринов из ДНК применяется обработка разбавленной соляной кислотой (pH 1,6 37°С, 24 ч) 67%-НОЙ муравьиной кислотой (37°С, 18 ч) 61,вг сульфокатио-нитами в Н+-формеб . Другим вариантом апуринизации является действие на ДНК тиольных соединений в присутствии кислот при этом в цепи на месте пуриновых оснований возникают тиоацеталь-ные группы. [c.502]

Применение этого метода к различным тринуклеотидам с защищенной ОН-группой на 5 -конце дало удовлетворительные результаты на каждой ступени деградации в качестве основного продукта было выделено ожидаемое гетероциклическое основание В настоящее время этот метод еще не может быть использован для деградации ДНК, так как в условиях, используемых для окисления и одновременного расщепления фосфодиэфирных связей в З -концевых звеньях, наблюдается заметная апуринизация кроме того, отщепление оснований из дезоксиолигонуклеотидов протекает неколичественно [c.593]

Эта шрёдингеровская дилемма вполне реальна. ДШС действительно претерпевает значительные изменения, связанные с тепловыми флуктуациями. Мы знаем, например, что ДШС каждой клетки человеческого организма теряет за сутки около 5000 пуриновых оснований (остатков аденина и гуанина) вследствие термального разрыва М-гликозидных связей между пурином и дезоксирибозой (процесс апуринизации). Аналогичный пример составляют спонтанно происходящие в ДШС реакции [c.280]

Способ, каким в процессе репарации осуществляется удаление поврежденного участка, зависит от типа повреждения. Например, при апуринизации (наиболее часто встречающемся повреждении ДНК) один из остатков дезоксирибозы лишается ранее находившегося при нем основания (см. рис. 5-31). Фермент АП-эндонуклеаза быстро распознает данный остаток дезоксирибозы и разрывает в этом измененном участке цепи фосфодиэфирную связь. После этого поврежденный нуклеотид удаляется и правильная последовательность нуклеотидов восстанавливается при помощи механизма, представленного нарис. 5-33. [c.283]

А. АР-эндонуклеазы узнают сайты, где произошла апуринизация или апиримидинизация, и гидролизуют фосфодиэфирную связь либо с 3 -, либо с 5 -стороны от этого сайта. Б. М-глико-зилазы осуществляют репарацию, гидролизуя гликозидную связь между модифицированным основанием и дезоксирибозой. [c.101]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология