Обобщенные последовательности

В качестве критерия дискриминации предлагается использовать обобщенный последовательный критерий отношения вероятностей, отдающий приоритет тем условиям проведения эксперимента, которые максимизируют прирост логарифма обобщенного отношения правдоподобия AL, т. е. К2 (х) = AL. [c.198]

В ОСНОВНОМ симметрично на двухцепочечной ДНК и занимают область между нуклеотидами — 23 и — 3. Оператор содержит область двойной симметрии, которая включает обобщенную последовательность промотора в положении — 10. [c.191]

Рис. 24.7. Наличие полной канонической (обобщенной) последовательности можно показать, записав нуклеотидный состав сателлитной ДНК в виде повторяющихся фрагментов размером 9 п. н.

ТпЮ-необычный элемент, имеющий специфическую последовательность в сайте-мишени. Прямые фланкирующие повторы из 9 пар оснований, которые образуются при транспозиции, обнаруживают обобщенную последовательность из 6 нуклеотидных пар, симметрично расположенную в сайте-мишени. Так, повторы с каждой [c.462]

Приведена обобщенная последовательность участков сплайсинга. Эта последовательность выведена на основании сравнительного анализа 38 различных последовательностей на границах между экзонами и нитронами (данные приведены внизу рисунка). [c.217]

Организм Ген Регуляция Обобщенная последовательность % гомологии с обобщенной последовательностью Положения [c.225]

Системы с мультипликативным коэффициентом эффективности. Существуют системы, которые можно считать определенным обобщением последовательных систем. Эти системы состоят из ряда подсистем, для каждой из которых может быть найден свой показатель эффективности, а показатель эффективности системы в целом представляется при этом как произведение показателей эффективности этих подсистем. В общем случае состояние каждой подсистемы (т. е. принимаемое значение показателя эффективности для каждой подсистемы) может оказывать влияние на показатель эффективности других подсистем системы. Однако если этого не происходит, то [c.123]

Б. Элементы ARS у дрожжей содержат, по-видимому, многочисленные копии АТ-богатой консенсус-последовательности (обобщенной последовательности) в пределах участка размером 100 нуклеотидов. [c.141]

А. В составе РНК-полимеразы Е. соИ всегда есть факторы инициации и элонгации, что позволяет ей узнавать обобщенные последовательности промотора и наращивать цепь РНК. [c.147]

Ж. , связывающийся с обобщенной последовательностью [c.163]

Рис. 12-18. Частота встречаемости О, С, А и Т в каждом из положений связывающихся последовательностей (ответ 12-11). Звездочкой ( ) отмечены нуклеотиды, встречающиеся в 10 и более последовательностях. В первой обобщенной последовательности показаны те основания, которые представлены в данном положении более чем в половине из 11 последовательностей данного набора там, где указаны два основания, нижнее тоже часто встречается в данном положении.

Для устранения указанных недостгтков предлагается для практических применений новый обобщенный последовательный метод отношения вероятностей, который представляет собой последовательную процедуру и состоит из следующих этапов 1) определяют условия проведения (п 1)-го эксперимента, максимизирующего прирост логарифма обобщенного отношения правдоподобия АЬ 2) проводят (п -Ь 1)-й эксперимент 3) вычисляют величины обобщенного отношения правдоподобия 7 (Л ) и останавливающих границ А [9]. [c.197]

Практическое применение обобщенного последовательного метода отношения вероятностей для определения наиболее вероятного механизма реакции этинилирования ацетона в среде жидкого аммиака для условий дискриминирующих экспериментов показало, что в целом он приводит к тем же конечным результатам, как и энтропийный метод Бокса—Хилла. Причем по методу Бокса—Хилла оказалось достаточным поставить шесть контрольных опытов, чтобы модель 6 (механизм Тедеши) прошла испытания. В то же время но обобщенному методу отношения вероятностей модель 6 прошла испытания после четырех контрольных опытов. Такая ситуация на практике встречается достаточно часто, так как обобщенный метод отношения вероятностей использует в процедуре принятия решений всю имеющуюся экспериментальную информацию, в том числе и результаты стартовых опытов. Последнее позволяет делать достаточно надежные выводы о наилучшей математической модели. [c.197]

Начиная с 9-й или 10-й аминокислоты, эта обобщенная последовательность напоминает о повторах, которые встречаются в блоках у а-, у- и uJ-глиадинов, где связаны 3 или 4 глутамина и один пролин. Однако рассматриваемая в совокупности, N-koh-цевая последовательность субъединиц глиадинов с высокой молекулярной массой не идентична ни одной из N-концевых последовательностей известных глиадинов. Глиадины с высокой молеку- [c.209]

Реаультаты проверки кинетических моделей 1—6 с использованием обобщенного последовательного критерия отношения вероятносте [c.149]

Отдельные члены Alu-семейств не идентичны, но сходны друг с другом. По-видимому, в семействе каждого вида организмов существует общая для всех членов семейства каноническая (усредненная, универсальная, обобщенная) последовательность. У десяти членов А1и-се-мейства человека имеется каноническая последовательность, состоящая из тандемно дуплицировавщего участка размером 130 п. н. и последовательности размером [c.299]

На ранних этапах сплайсинга аденовирусной гяРНК происходит процессинг по участкам соединения интрон-экзон и экзон-интрон, которые соответствуют структуре обобщенной последовательности, показанной на рис. 16.8. Характерно, что 5 -концевая последовательность мяРНК U1 комплементарна обобщенным 5 - и З -концевым последовательностям интронов. Это означает, что за счет комплементарного связывания соответствующих участков интронов и мяРНК U1 может достигаться сближение концевых последовательностей данного интрона, обеспечивающее их взаимную ориентацию, необходимую для правильного сплайсинга (рис. 16.10, Л). Более того, оказалось, что мяРНК U2 содержит участок, комплементарный концевым последовательностям некоторых экзонов, соединение которых в ряде мРНК происходит после удаления соответствующих интронов (рис. 16.10, Б). Это свидетельствует о том, что мяРНП представляет собой по крайней мере часть молекулярного аппарата сплайсинга. [c.218]

Мутации, нарушающие процессинг РНК. Процессинг РНК заключается в вырезании интронов и сплайсинге (сращивании) экзонов с образованием функциональной мРНК (рис. 4.40, 4.52). Описано много различных мутаций, нарушающих этот процесс. Например, известна целая группа мутаций, изменяющих динуклеотид ОТ (или АО) в донорном (или акцепторном) участке сплайсинга. Эти динуклеотиды входят в состав так называемых канонических (обобщенных) последовательностей, которые включают еще несколько нуклеотидов и играют центральную роль в нормальном сплайсинге. В результате одиночных замен в этих сайтах сплайсинг нарушается, что приводит к р°- или -талассемии. В некоторых случаях мутации активируют так называемые криптические сайты с динуклеотидами ОТ и АО. В норме, вероятно, эти сайты в сплайсинге не участвуют. В результате образование нормальной мРНК нарушается. [c.91]

Области Т-ДНК как у А. tumefa iens, так и у Л. rhizogenes фланкированы прямыми повторами длиной 25 пар нуклеотидов (п. н.) (см. рис. 1.1), и концы Т-ДНК, интегрированной в растительный геном, обнаруживаются вблизи этих последовательностей. Обобщенную последовательность границы Т-ДНК можно представить следующим образом [c.15]

Б. В опыте был использован экстракт из клеток человека, поэтому удивило, что олигонуклеотид, содержащий консервативную поел довательность человека, не подавлял процессинг, а олигонуклеот ды, содержащие консервативную последовательность мыши обобщенную последовательность, ингибировали его. Какое обы нение вы можете предложить [c.154]

Б. На рисунке 12-5 приведены одиннадцать последовательностей MMTV (некоторые из них входят в состав LTR), связывающихся с рецептором глюкокортикоидов. Можете ли вы найти в них обобщенную последовательность (консенсус-последовательность), с которой связывается рецептор [c.221]

Б. Обобщенную последовательность для связывания рецептора глюкокортикоидов можно вычислить , сравнив частоты появления G, С, А и Т в каждом положении связывающихся последовательностей, как это показано на рис. 12-18. Индивидуальные нуклеотиды, присутствующие на данном месте более чем в половине последовательностей, приведены сразу под частотами. В литературе сообщалось о двух обобщенных последовательностях, связывающихся с рецептором глюкокортикоидов (AGAA/T AGT/A и AGAA A). [c.457]

Сверху приведены обобщенные последовательности областей -35 и -10 вегетативных промоторов В. subtilis. Соответствующие области в представленных промоторах подчеркнуты [c.263]

Рис. 12.15. Структура хроматина в области центромеры (а) и обобщенная последовательность центромерной ДНК хромосом S. erevisiae (б).

Справочник химика 21

Химия и химическая технология