Связь между нуклеотидами

Содержание и локализацию нуклеиновых кислот в клетке можно определить, используя основные красители в сочетании с обработкой срезов ферментами-нуклеазами, способными разрывать связи между нуклеотидами ДНК или РНК. [c.92]

С самого начала мы исходили из того, что молекулы ДНК содержат очень большое число нуклеотидов, соединенных в регулярную линейную цепь. И здесь наши рассуждения частично основывались на соображениях простоты. Хотя химики-органики в соседней лаборатории Александра Тодда считали, что именно таким и должно быть расположение нуклеотидной основы молекулы, они были еще далеки от того, чтобы химическим путем установить идентичность всех связей между нуклеотидами. Но если это не так, то как же в таком случае молекулы ДНК могут укладываться в кристаллические агрегаты, изучаемые Морисом Уилкинсом и Розалинд Фрэнклин Поэтому мы решили, пока не зайдем в тупик, считать строение сахаро-фосфатного остова весьма регулярным и искать такую спиральную пространственную конфигурацию, при которой все группы этого остова имели бы одинаковое химическое окружение. [c.37]

Положение усложнялось еще и тем, что в ДНК обнаружили четыре типа нуклеотидов. В этом смысле строение молекулы ДНК в высшей степени нерегулярно. Правда, эти четыре нуклеотида не очень отличаются друг от друга в каждом из них содержатся те же сахар и фосфат. Различия зависят лишь от азотистых оснований — либо пуриновых (аденина и гуанина), либо пиримидиновых (цитозина и тимина). Но поскольку в связях между нуклеотидами участвуют только фосфаты и сахара, наше предположение о том, что все нуклеотиды соединены в единое целое однотипными химическими связями, оставалось в силе. Поэтому при постройке моделей мы намеревались исходить из того, что [c.39]

НУКЛЕАЗЫ, ферменты класса гидролаз, катализирующие гидролиз фосфодиэфирных связей в нуклеиновых к-тах. Нек-рые из Ш1х катализируют гидролиз связей между нуклеотидами только в ДНК (дезоксирибонуклеазы), другие действуют только в РНК (рибонуклеазы). Третья группа Н., не проявляющая специфичности к хим. природе углеводного компонента нуклеиновой к-ты, катализирует расщепление фосфодиэфирных связей в ДНК и РНК (иногда термин Н. используют для назв. только этой группы ферментов). [c.296]

В столбцах п указаны числа водородных связей между нуклеотидами ху кодона и комплементарными им нуклеотидами х у антикодона. Дублеты ху первого п второго октетов резко различаются по составу. В первом октете А встречается лишь один раз, во втором — один раз — Ц. В первом октете и для х, и для г/ (Г-ЬЦ)/(А-ЬУ)=3, во втором - (Г-ЬЦ)/(А + У) =1/3. Значение и, которое можио назвать степенью комплементарности, [c.280]

Связь между нуклеотидами представляет собой фосфодиэфир-ную связь между гидроксильными группами сахаров, смежными с нуклеозидами. В зависимости от строения входящего в состав кислоты сахара различают два основных типа нуклеиновых кислот — дезоксирибонуклеиновую (ДНК) и рибонуклеиновую (РНК). Во всех живых клетках встречаются как ДНК, так и РНК- Экстракты нуклеиновых кислот в значительной степени неоднородны, особенно экстракты РНК. Отсутствие чистых препаратов гомогенной нуклеиновой кислоты препятствовало выяснению ее точного строения. [c.468]

Межнуклеотидные связи в РНК полностью идентичны таковым в ДНК и столь же строго однотипны. Во всех случаях связь между нуклеотидами в цепи главных валентностей идет за счет фосфатного мостика между третьим и пятым гидроксилами рибозных компонентов двух смежных нуклеотидных остатков. Цепь РНК, как и ДНК, является неразветвленной. [c.651]

Таким образом, синтез ДНК осуществлялся из соответствующих дезокситрифосфатов, и энергия, заключенная в макроэргических фосфатных связях, затрачивается на образование связей между нуклеотидами в цепи. [c.277]

Поскольку геном Т-четных фагов представляет собой одну молекулу ДНК, можно представить себе две молекулярные модели для вышеприведенной формальной структуры гетерозиготы. Первая из них, гетеродуплекс, представляет собой единую молекулу ДНК, образованную за счет ковалентных связей между нуклеотидами [c.294]

Связь между нуклеотидами [c.64]

B. В типе связи между нуклеотидами. [c.63]

Образование 2, Б -фосфодиэфирных связей между нуклеотидами, расположенными на значительном расстоянии друг от друга вдоль цепи. При связывании Б -фосфатной группы с 2 -гидроксильной группой нуклеотида, находящегося внутри цепи, образуется структура типа лассо. [c.109]

В последних столбцах левой и правой сторон таблицы приведены числа п водородных связей между нуклеотидами ху кодона и комплементарными нуклеотидами х у антикодона. Значения п (можно назвать эту величину степенью комплементар-ности) в первом октете равны 6 и 5, во втором 5 и 4. Можно думать, что при га = 6 взаимодействие 2 — 2 кодона и антикодона не имеет существенного значения, так как связь ху — х у достаточно прочна и обеспечивает необходимую комплементарность. Поэтому кодоны первого октета безразличны к г, В этом случае возможны 16 сочетаний кодон — антикодон, при которых одна и та же аминокислота включается в белковую цепь и отвечает любым 2 и 2 при фиксированных ху и, следовательно, х у. Если в первом октете га = 5, то возможно, что взаимодействие 2 —2 уже играет некоторую роль в обеспечении комплементарности, и число допустимых сочетаний кодон — антикодон может оказаться меньше 16, но больше 4. Из сказанного, конечно, не следует, что все мыслимые сочетания встречаются в природе. Было бы интересно экспериментально определить число различных антикодонов, т. е. различных тРИК, отвечающих данной аминокислоте, и, конечно, число соответствующих кодонов. Возможно, что опыт действительно покажет наличие большего числа антикодонов и кодонов для тех аминокислот первого октета, для которых га = 6, и меньшего их числа для га = 5. Мутационные замещения 2 в кодонах мРИК могут заметно отличаться по эффективности для га — 6 и га = 5, [c.593]

После образования нескольких пар оснований происходит отделение ст-субъединицы от транскрипционного комплекса, а кор-фермент продолжает процесс наращивания цепи РНК на матрице, которой является одна цепь ДНК. Открытый комплекс включает в себя всего 15—20 пар нуклеотидов, так как по мере движения фермента в направлении 5 3 водородные связи между нуклеотидами матрицы вновь восстанавливаются. У прокариот частично синтезированная мРНК уже взаимодействует с рибосомами и вовлекается в процесс синтеза белка. В клетках эукариот синтез РНК и белка разобщен, кроме того, новосинтезированные транскрипты подвергаются посттранскрипцион-ным модификациям. [c.459]

Ключевой стадией химического синтеза олигонуклеотидов является создание фосфодиэфирных связей между нуклеотидами. Можно выделить два основных подхода к решению этой задачи. Один из них использует в качестве источника фосфатной группы моноэтерифицированные фосфаты (фосфомоноэфиры), а другой — диэтерифииированные фосфаты (фосфодиэфиры). [c.354]

Молекула ДНК представляет собой комплекс из двух полимерных цепочек, связанных между собой межмолекулярными силами (рис. 4.2). Каждая цепочка в комплексе образует правую спираль (точнее, винтовую линию) и состоит из сахаро-фосфатного хребта с присоединенными к нему азотистыми основаниями четырех сортов — аденина (А), гуанина (Г), тимина (Т) и цитозина (Ц). Повторяющийся элемент цепочки (азотистое основание + сахар + фосфат) называется нуклеотидом. Таким образом, ДНК состоит из двух закрученных относительно друг друга полинуклеотид-ных цепочек. Существенно, что если связи между нуклеотидами внутри каждой цепочки являются жесткими, ковалентными и имеют энергию около 60 ккал/моль (3 эВ), то связи между полинуклеотидными цепочками по крайней мере на порядок слабее. Существует строгое правило компле-ментарности (соответствия) этих цепочек. Именно, всегда против аденина находится ТИМИН, а против гуанина цитозин. Комплементарность определяется стерическим соответствием оснований. При этом комплементарные пары оснований стабилизированы водородными связями (изображенными на рис. 4.3 пунктиром), электростатическими и ван-дер-ваальсовыми силами. Существенное значение для стабильности ДНК имеет взаимодействие между соседними парами оснований в двойной спирали. Параметры структуры ДНК следующие диаметр молекулы 20 А, расстояние между соседними парами оснований 3,4 А на виток спирали приходится 10 пар оснований, так что соседние пары повернуты относительно друг друга на угол [c.71]

В конечном счете перед нами два варианта скачкообразности. Один — при индукции мутаций по доступным анализу физико-химическим свойствам и химическому строению, содержащим предпосылку известного статистического взаимодействия с геном, которое составляет у основных мутагенов положительную, хотя и неодинаковую величину в зависимости от стадци митоза. Другой — при действии нуклеотид-аналогов, когда сначала происходит почти без мутаций включение, а основной мутационный процесс развертывается через поколения — в последующих актах аутокатализа и является в целом вторичным. Аналогам недоступно непосредственное измерение состояния нормальных нуклеотидов, а значит и положение надежного пробного тела , так как они возмущаются в сторону упорядочения, близко к тому, как это делают нормальные матричные нуклеотиды. Взаимодействие с включенными аналогами, которое завершается во вторичном порядке транзициями и трансверсиями, открывает связи между нуклеотидами и известными аналогами, но в остальном не в состоянии открыть участвующих во включен1ш сил. [c.20]

Взаимодействие между сильным генетическим полем и несравненно более слабым, но содержащим малый сгусток тождества полем основного мутагена приводит к формированию валентной связи между нуклеотидом и нормальным мутагеном. В следующее мгновение нуклеотид, загрязненный возросшим химическим весом слившегося с ним мутагена, выбрасывается, подвергаясь хемостракизму. Устойчивое состояние возобновляется лишь с видоизмененным или повторяющим прежнее заполнением бреши, или ликвидацией ее путем склеивания. [c.27]

РНК-аза поджелудочной железы разрывает не все связи между нуклеотидами, входящими в состав РНК она катализирует распад некоторых определенных межнуклеотидных связей, т. е. между фосфорным остатком в положении З -пиримидиновых нуклеотидов и 5 -гидроксилов соседних пуриновых и пиримидиновых нуклеотидов. После исчерпывающего расщепления рибонуклеа- [c.296]

Естественный отбор зависит от условий среды. Для реплицирующейся молекулы РНК критическим компонентом среды является набор других молекул РНК в растворе. Кроме того, что эти молекулы служат матрипами при собственной репликапии. они могут катализировать разрушение и образование ковалентных связей, в том числе и связей между нуклеотидами. Некоторые специализированные молекулы РНК могут катализировать изменения в других молекулах РНК, разрезая нуклеотидную последовательность в определенной точке, другие типы молекул РНК способны вырезать часть своей собственной нуклеотидной последовательности и соединять отрезанные концы (процесс, называемый самосплайсингом). Каждая реакция, катализируемая РНК, зависит от специфического расположения атомов на поверхности каталитической молекулы РНК. которое приводит к тому, что один или несколько ее нуклеотидов становятся высокоактивными [c.16]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология