Лидерный участок

Сигнальный пептид, сигнальная последовательность, лидерный пептид (Signal peptide) N-концевой участок белковой молекулы длиной 15—30 аминокислот, обеспечивающий секрецию белка (перенос через мембрану). После секреции этот участок отщепляется от белковой молекулы. [c.560]

Сигнальные пептиды (и способ переноса белков с их помощью) были открыты в начале 70-х гг. при изучении секреторных белков, которые перед переносом в аппарат Гольджи и выведением из клетки, попадают в ЭР. Суть эксперимента заключалась в следующем мРНК, кодирующую секреторный белок, транслировали в системе in vitro. Когда из этой бесклеточной системы исключали микросомы, синтезированный белок оказывался немного больше, чем нормальный секреторный продукт. Избыток длины можно было объяснить наличием N-концевого лидер-ного пептида. Однако в присутствии микросом, полученных из шероховатого эндоплазматического ретикулума, белок имел нормальный размф. Эти результаты были объяснены с помощью сигнальной гипотезы. Она постулирует, что лидерный участок служит сигнальным пептидом, который направляет секреторный белок к мембране ЭР и затем отре- [c.43]

Система генов, кодирующих легкие цепи Генный Ук-сегмент кодирует V-область легких цепей с 1 по 95 позицию, а JK-сегмент — остальную часть V-области (рис. 8.8). В геноме человека обнаружен лишь один ген константной области легких цепей к-типа и 76 VK-сегментов, из которых только 35 потенциально способны функционировать, 16 имеют минорные дефекты, а 25 представляют собой псевдогены. В результате рекомбинации ДНК в процессе дифференцировки лимфоидных клеток один из V-сегментов соединяется с одним из пяти J-сегментов. Впоследствии это может дать не менее 150 (т. е. 30 х 5) разных вариабельных областей к-цепей. Каждому V-сегменту предшествует участок ДНК, кодирующий короткий сигнальный (лидерный) пептид, который состоит из гидрофобных аминокислотных остатков и служит опознавательным знаком синтезируемой цепи для направления ее в эндоплазматический ретикулум, где лидерный [c.134]

Рис. 16.22. Организация последовательностей ДНК Х. -легких цепей в зародышевых и дифференцированных миеломных клетках мыыш. Пронумерованные стрелки указывают положения со К1-сайтов. мРНК, соответствующая легкой полипептидной цепи, состоит из лидерной последовательности (Ь), последовательности вариабельных участков (V и I) и последовательности константного участка (С). В ДНК присутствуют две промежуточные последовательности, и 1 , причем отделяет лидерный участок от ва-

Схематическое изображение аттенюации -оиерона Е.соИ. Когда триптофан имеется в избытке (А), лидерный участок (обозначен цифрой 1) i/77-мРНК полностью транслируется. Участок 2 взаимодействует с рибосомой, что позволяет основаниям участков 5 и [c.121]

Согласно другой модели, 408-субчастица сначала узнает 5 -концевой кэп и затем передвигается вдоль мРНК, пока не встретит инициирующий кодон AUG (см. рис. 6.7). Обычно, хотя и не всегда, это будет первый триплет AUG, который она встретит на своем пути. После этого связь стабилизируется и к 408-субчастице присоединяется 608-субчастица в том участке, который выявляется как защищенный рибосомой. В случаях длинной лидерной последовательности можно предположить, что вторая 408-субчастица узнает 5 -конец еще до того, как первая покинула инициаторный участок в результате на этом отрезке могла бы выстроиться целая очередь субъединиц. [c.127]

Для аденовируса показано (рис. 20.6), что 5 -конец поздней мРНК действительно образуется в результате объединения трех очень коротких последовательностей РНК, соответствующих далеко отстоящим участкам вирусного генома. В этом примере состоящий из трех частей 5 -участок соответствует нетранслируемой лидерной последовательности, в то время как кодирующая область представлена основной частью мРНК. На рис. 20.7 приведены данные электронной микроскопии по организации вирусного генома. Строение показанного там гибрида указывает на то, что при наличии нескольких промежуточных последовательностей структуры на микрофотографии становятся запутанными и сложными для интерпретации. [c.248]

Рис. 15.21. Нуклеотидная последовательность аттенуаторного лидерного транскрипта trp-one-рона Е. соИ. Отмечен участок связывания с рибосомой и участок, кодирующий 14-членный S

Большинство экспортируемых белков синтезируется в виде предшественников, содержащих на аминоконцевом участке сигнальный (или лидерный) пептид, который не обнаруживается в зрелых белках. Сигнальные пептиды из эукариотических и прокариотических организмов представляют собой последовательности из 15—30 аминокислотных остатков, которые имеют ряд общих признаков 1) на самом конце последовательности находится один или несколько положительно заряженных аминокислотных остатков 2) существует непрерывный участок, содержащий восемь (или более) гидрофобных или нейтральных остатков 3) имеется участок расщепления для сигнальной пептидазы, которому обычно предшествует консервативная последо вател ьность. [c.65]

Аналогично регулируется трипт о фановый оперон Е. соН, включающий пять структурных генов (рис. 16.8). При изучении этого оперона был найден еще один способ регуляции — аттенюация (или ослабление). Ч. Яновский, детально исследовавший трипто-фановый оперон Е. соИ, обнаружил мутанты-суперпродуценты ферментов, кодируемых этим опероном. Мутанты несли делеции в самом начале оперона — в так называемом лидерном участке, между оператором и инициирующим кодрном первого гена trpE. При этом терялась последовательность, содержащая сигнал прекращения транскрипции. Синтез иРНК обычно начинается с ли-дерной части, но только около 10% молекул иРНК полностью копируют гг/ -оперон. Преждевременное прекращение транскрипции обеспечивает аттенюатор — тот участок, который был потерян у делеционных мутантов-суперпродуцентов. [c.419]

Структура лидерного участка иРНК /гр-оперона Е. oli показана на рис. 16.8. Лидер содержит участок связывания рибосомы и кодирует пептид из 14 аминокислот, в котором повторяется (2 раза) остаток триптофана. Кроме того, лидерная иРНК содержит участок вторичной структуры, который, по-видимому, служит сигналом прерывания транскрипции. [c.419]

Выще функционального Уь-гена расположен участок ДНК, содержащий 25 нуклеотидных последовательностей, похожих на Уь, но лищенных лидерного экзона, промоторов и характерных, необходимых для У—J-peкoмбинauий, последовательностей гептамер—спейсер—наномер. Эти псевдогены не остаются неиспользованными они участвуют в генной конверсии, при которой происходит вставка фрагментов псевдогена в функциональный Уь-ген. Этот процесс протекает непрерывно, как многочисленные акты конверсии, на протяжении жизни В-клетки даже после того, как она покинет фабрициеву сумку. [c.141]

Единица транскрипции, которая представляет собой протяженный участок ДНК, кодирующий последовательность первичного транскрипта в нее входят а) последовательность, кодирующая либо зрелую РНК. либо белковый продукт б) интроны в) 5 -лидерная и З -трейлерная последовательности, которые присутствуют в зрелых мРНК, а также промежуточные последовательности (спейсеры), которые удаляются в ходе процессинга первичных транскриптов генов, кодирующих РНК. [c.24]

Б. В ходе развития В-клеток в костном мозге в каждом В-лимфоците случайно перестраиваются V-, D- и J-элементы тяжелой цепи, и появляется перестроенная последовательность вариабельной области VDJ, которая теперь называется соматической конфигурацией. Для Н-цепей на первом этапе перестройки происходит объединение DJ, за ним следует объединение с V-элементом, и образование VDJ. После перестройки обнаруживается, что вся ДНК между случайно выбранным V-элементом и использованным J-элементом удаляется из клетки. Таким образом, каждая успешная перестройка ДНК вариабельной области уникальна для каждой зрелой В-клетки. Обратите внимание, что перестроенный участок (VDJ) лежит выше (левее) экзона, кодирующего С-белок. Заметьте также, что в участке между VDJ и С, названном J- -интроном, лежит неиспользованный элемент (который в этом примере просто удаляется). Про-мРНК, содержащая вариабельный (VDJ) участок, присоединенный к С-участку, обраэуется в ядре. L-V и J- интроны (и интроны внутри С -участка) затем выреэаются, что приводит к экспорту зрелой РНК молекулы в цитоплазму, где она транслируется на рибосоме в последовательность аминокислот. Лидерный (сигнальный) пептид отрезается от белка, когда он выделяется из клетки (объяснения терминов см. также в табл. 3.1 и 5.1, на рис. 4.4 и в тексте). Соматическая конфигурация и конфигурация зародышевой линии генов L-цепей такая же, кроме того, что легкие цепи не содержат D-участков. [c.109]

В эмбриональных клетках мыши гены, кодирующие константные области ц,-, у а-тяжелых цепей (и обозначаемых соответственно Ц и J, расположены в ряд, один за другим (рис. 33.32). Как оказалось, существует четыре гена константных участков у-Цепей, что полностью соответствует данным генетического анализа, выявившего четыре подкласса IgG. Рядом с геном локализуется набор расположенных тандемно генов J, кодирующих последний гиперва-риабельный участок вариабельной области. Полный ген тяжелой цепи IgM образутся путем транслокации гена к гену (рис. 33.33). В результате этой транслокации гены Гн, /н и соединяются в функционально единый ген. Вставочные последовательности между лидерным отрезком и на- [c.253]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология