Вставочные последовательности

Рис. 20.9. Наличие вставочной последовательности приводит к образованию дополнительных рестриктов в том случае, когда она содержит сайт рестрикции для специфического фермента.

РНК, приводящие к удалению вставочной последовательности [c.980]

Интрон. Вставочная последовательность в гене она транскрибируется, но вырезается до процесса трансляции. [c.1011]

Транспозоны и вставочные последовательности—это сходные-элементы в хромосомных ДНК бактерий, ДИК бактериофагов. и плазмид. В опытах с бактериями транспозоны используются [c.307]

Негомологичная рекомбинация. Рекомбинационные процессы, в которых участвуют сегменты ДНК, не обнаруживающие заметной генетической гомологии, называют негомологичной рекомбинацией. Так же как и сайт-специфическая рекомбинация, она представляет собой интеграционную форму рекомбинации, т.е. не обмен, а соединение ДНК. Негомологичная рекомбинация независима от гена гес А. К такой рекомбинации способны 1) вставочные последовательности (IS-эле-менты) 2) транспозоны (Тп) 3) бактериофаг ц (мю). Молекулярный механизм негомологичной рекомбинации еще не вполне выяснен. [c.455]

Вставочная последовательность (интрон) [c.250]

Рис. 4.38. Расположение на хромосоме (16р) и организация а-глобинового кластера человека. Т, псевдоген 1У8, интроны (вставочные последовательности, обозначенные белыми прямоугольниками). 31, 32, 99-число пар оснований в интронах [972].

Многие эукариотические гены (может быть, даже большинство их) обладают весьма загадочной структурной особенностью, которая состоит в том, что в их нуклеотидную последовательность вставлен участок ДНК, не кодирующий аминокислотную последовательность полипептидного продукта. Эти нетрансли-руемые вставки прерывают строго кол-линеарное соответствие между нуклеотидной последовательностью остальных участков гена и аминокислотной последовательностью полипептида, кодируемого этим геном (рис. 27-29). Такие не-транслируемые участки ДНК в генах называют вставочными последовательностями, или нитронами, тогда как участки гена, кодирующие аминокислотную последовательность полипептида, называют экзонами. Хорошо известным примером может служить ген, кодирующий единственную полипептидную цепь яичного белка,-овальбумина. На рис. 27-29 видно, что в этом гене присутствуют шесть интронов, которые разделяют ген овальбумина на семь экзонов. Видно также, что интроны в этом гене гораздо длиннее экзонов-суммарная длина всех интронов составляет 85% общей длины ДНК гена. За немногими исключениями, все изученные к настоящему времени эукариотические гены содержат интроны, которые различаются по числу, по месту расположения, а также по тому, какую часть общей длины гена они занимают. Например, ген сывороточного альбумина содержит 6 интронов, ген белка кональбумина куриных яиц -17 интронов, а ген коллагена-свыше 50 интронов. Исключение составляют гены гистонов, которые, по-видимому, не содержат интронов. [c.884]

Некоторые основные черты характерны для всех прерывистых генов. Порядок расположения участков в прерывистом гене совпадает с их расположением в зрелом РНК-продукте. Поэтому гены являются скорее расщепленными, чем разбросанными. Интроны ядерных генов во всех рамках считывания обычно имеют терминирующие кодоны и поэтому не могут кодировать полипептиды. Прерывистые гены сохраняют одинаковую структуру во всех тканях, включая половые и соматические клетки, где эти гены экспрессируются или не экспрессируются. Таким образом, наличие вставочной последовательности -постоянное свойство гена. [c.253]

IS. Это сокращение используется для обозначения инсерционной (вставочной) последовательности небольшого бакте- [c.521]

Клонирующий вектор М13 со вставочной последовательностью [c.115]

Бляшки фага М13, несущего вставочную последовательность [c.115]

В случае необходимости в качестве средства для закрытия карты можно прибегнуть к Я-клонам. Поскольку А,-клоны характеризуются литическим путем развития, мы ожидаем, что они окажутся менее чувствительны, чем космиды, к неблагоприятному биологическому воздействию некоторых вставочных последовательностей. Из работ Эндрю Спенса известно, что пропуск в 50 т. п. н. в космидной карте можно заполнить путем прогулки с помощью А,-клонов (личное сообщение). Однако для завершения таким способом карты, [c.50]

Таблица II 1.2. Вставочные последовательности в некоторых генах

В-третьих, как уже говорилось в 5.1, многие первичные транскрипты РНК эукариот содержат крупные вставочные последовательности — интроны. Их вырезание с воссоединением концов соседних экзонов в единую цепь является важным этапом созревания эукариотических РНК. [c.187]

Рис. 27-29. Вставочные последовательности (интроны) в двух эукариотичеетсих генах. Ген овальбумина содержит шесть интронов (они обозначены серым цветом и буквами А-Р) и, следовательно, разделен на семь участков, или экзонов (указаны красным цветом и цифрами

В результате мы имеем синтетическую кДНК, которая кодирует аминокислотную последовательность данного белка. Заметим, однако, что если эту синтетическую кДНК получали с эукариотической мРНК, то она не идентична природному гену этого белка, поскольку не содержит ни интронов, т. е. вставочных последовательностей, ни стартовых и терминирующих сигналов, присущих генам большинства эукариотических белков. [c.985]

UAA вызовет терминацию синтеза полипептида только в положении 334-336 прокариотической мРНК. В положениях 330-332 и 338-340 UAA не приведет к терминации, поскольку он будет находиться вне правильной рамки считывания. В эукариотической мРНК терминация произойдет в положении 334-336, если перед UAA нет вставочньк последовательностей. Если же UAA находится внутри вставочной последовательности, то он, вероятно, не окажет никакого влияния. Если UAA находит- [c.1006]

Наличие дополнительного сайта рестрикции в гене приводит к увеличению числа вносимых разрывов до трех вместо двух, обнаруживаемых в случае кДНК. Поэтому вместо фрагмента Л, образующегося при рестрикции кДНК, при рестрикции геномной ДНК получаются фрагменты А1 и А2. Суммарный размер А1 + А2 превышает размер А на длину вставочной последовательности. [c.250]

Очень важно установить, имеются ли в сыворотке иммунизированной мыши антитела к белкам, кодируемым вставочными последовательностями. Для этого используют ряд подходов в зависимости от того, насколько легко получить полноразмерный нативный продукт ОРС. Если известно, что ОРС экспрессируется в культивируемых клетках определенной линии или что ее продукт в достаточном количестве присутствует в определенной ткани, тогда можно определить активность сыворотки в отношении данных клеток или тканей с помощью иммуноци-тохимических методов, иммунопреципитации или вестерн-блот-анализа. По нашим данным, при работе с ОРС млекопитаю- [c.182]

У дрожжей для кодирования всех известных продуктов митохондриальных генов нужно менее 20% информации, которая может быть потенциально заключена в ДНК митохондрий, но все попытки найти в ней какие-то дополнительные гены не привели к успеху. Причина такого противоречия-то, что митохондриальная ДНК дрожжей содержит очень много некодирующих участков, которые можно разделить на три категории. Во-первых, в некоторых генах имеются длинные вставочные последовательности (интроны) например, гены цитохрома Ь и субъединицы I цитохромоксидазы почти в десять раз больше, чем можно было бы ожидать, исходя из размера кодируемых ими белков. Разные штаммы могут резко отличаться друг от друга по числу и длине таких интронов. Во-вторых, некоторые митохондриальные мРНК имеют некодирующие лидерные последовательности, которые намного длиннее кодирующих участков. В-третьих, около половины митохондриальной ДНК дрожжей состоит из сегментов, на 95% образо- [c.61]

Транспозоны — это образованные на основе IS-элементов (или их производных) сложные перемещающиеся структуры, которые содержат гены, определяющие функции, не имеющие отношение к транспозиции (Р. Б. Хесин, 1985 N. Kle kner, 1981). Все транспозоны фланкированы концевыми повторами. Часто ими являются известные IS-элементы, например, IS1, которые могут быть повторены на концах транспозона в пряк.ой или обратной ориентации. Некоторые транспозоны фланкированы другими IS-элементами. Существует также ряд транспозонов, таких как ТпЗ, которые имеют на концах лишь короткие инвертированные повторы (ITR). Предполагается, что они являются ост.атками полных вставочных последовательностей. Поскольку IS-элементы сами заканчиваются ITR, любой транспозон, даже фланкированный элементами IS в прямой ориентации, всегда имеет на концах инвертированные повторы (рис. 15). [c.105]

Подобные копии применяются для экспрессии в бактериях важных с медицинской точки зрения белков человека и животных, таких, как инсулин, ренин, гормон роста и др. В данном случае фрагменты генома нельзя использовать. Это связано с тем, что у эукариот отдельные части некоторых структурных генов разобщены кодирующие последовательности (экзоны) чередуются с некодирующими вставочными последовательностями (нитроны). Ген целиком транскрибируется с обра.зованием первичного транскрипта РНК, затем транскрипты нитронов выщепляются, а последовательности соответствующие экзонам, сши- [c.136]

Большая часть эукариотических генов, кодирующих полипептиды, содержит хотя бы одну вставочную последовательность, а у некоторых генов их гораздо больше (табл. III.2). Однако наличие интронов не является строго обязательным, и некоторые белок-кодирующие гены не содержат их вовсе. Гены, кодирующие молекулы функциональных РНК (например, транспортных или рибосомных РНК), также могут иметь вставочные последовательности, но в этих генах они встречаются реже. Как правило, на долю интронов приходится намного больше ДНК, чем на долю экзонов. Существование интронов и огромное разнообразие их числа и размеров объясняет некоторые особенности эукариотической ядерной РНК, а именно ее большую длину и гетерогенность. Гетерогенная ядерная РНК (гяРНК)-это смесь транскриптов многих ядерных генов. Некоторые из них являются первичными транскриптами и имеют такую же длину, как и гены, с которых они скопированы, другие-частично процессированы и утратили ряд интронов. Просто удивительно, что функциональные цитоплазматические мРНК образуются из такой сложной смеси предшественников. [c.7]

Клонируемые сегменты часто содержат не только определенный ген, но и протяженные участки примыкающей к нему ДНК. Если использовать в качестве зондов однокопийные фланкирующие фрагменты ДНК, то из геномной библиотеки можно выделить перекрывающиеся фрагменты. Это позволяет охватить протяженные области хромосомы и получить их детальные карты. В этих картах содержится информация и о структуре генов, и о их функции. Так, например, в виде перекрывающихся фрагментов был представлен сегмент ДНК человека размером 65 т. п. н., включающий пять генов Р-глобина человека, что позволило определить его нуклеотидную последовательность и локализовать кодирующие, регуляторные и вставочные последовательности. [c.11]

Смотреть страницы где упоминается термин Вставочные последовательности: [c.34] [c.891] [c.917] [c.980] [c.328] [c.246] [c.246] [c.253] [c.525] [c.86] [c.253] [c.134] [c.149] [c.76] [c.253] [c.104] [c.105] [c.107] [c.124] [c.7] [c.9]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология