Полимеризация фосфаты нуклеозидов

В ферментативную полимеризацию вводят смесь нуклеозид-5 -трцфосфатов (см. стр. 98), один из компонентов которой содержит радиоактивный фосфор. Образующийся полимер расщепляют далее до мононуклеотидов таким образом, что разрывается связь Р—О (О при С-5 ) для этой цели в случае ДНК используется гидролиз смесью ДНК-азы микрококков и фосфодиэстеразы змеиного яда, в случае РНК — гидролиз щелочью. После такого расщепления радиоактивный фосфат оказывается в составе нуклеозид-З -фосфата, остаток которого в полимерной цепи был соседним с остатком введенного меченого предшественника. Так, например, относительное содержание динуклеотидных последовательностей АрА, GpA, UpA и СрА можно определить, вводя в полимеризацию а- Ф-аденозин-5 -трифосфат и измеряя радиоактивность соответствующих нуклеозид-З -фосфатов после расщепления [c.63]

Подход, основанный на полимеризации защищенных дезокси-нуклеозид-З -фосфатов, был также исследован в этом случае получаются менее удовлетворительные результаты. [c.88]

Аналогично нуклеозид-2, З -циклофосфат был получен впервые из аденозин-2 (3 )-фосфата и дифенилхлорфосфата [30]. При последующей полимеризации образуются полиадениловые кислоты с разной длиной цепи, начиная от динуклеотида до полинуклеотидов. [c.491]

Полученные полимеры по своим свойствам напоминают природные олигонуклеотиды под действием кислот и щелочей они распадаются с образованием смеси 2 - и З -фосфатов нуклеозидов, под действием фермента змеиного яда дают 5 -фосфаты нуклеозидов. Однако их отношение к панкреатической рибонуклеазе, избирательно расщепляющей только З -фосфаты, отличает их от природных РНК- Этот фермент, как уже указывалось выше (стр. 249), полностью расщепляет природный полимер синтетические полимеры, напротив, расщепляются лишь частично и разбиваются на олигонуклеотиды с меньшей степенью полимеризации, уже не способные к расщеплению указанным ферментом, но подвергающиеся кислому и щелочному гидролизу. Этот результат вполне естествен и подтверждает, что в синтетическом полимере, в отличие от природных РНК, наряду с 3 -5 -связью (VHI) имеется и 2 -5 -связь (IX), не расщепляющаяся панкреатической риГонуклеазой. Образование последней происходит при раскрытии полимеряого циклического фосфата (VII) наряду с полимером, характеризующимся 3 -5 -связью. [c.250]

О превращении уридин-2, 3 -циклофосфата в 5 -0-мезилуридин-2, 3 -циклофосфат уже упоминалось в этом случае необходимо проводить реакцию в диоксане в присутствии три-н-бутиламина, так как в пиридине легко идет полимеризация фосфатов. В аналогичных условиях удалось провести мезилирование аденозин-2, 3 -цик-лофосфата . Сульфоэфиры широко применяются в синтетической химии нуклеозидов для получения производных с измененным углеводным остатком. [c.521]

В ряду рибонуклеотидов с целью полимеризации 2 - и З -фос-фаты нуклеозида были превращены в циклические фосфаты взаимодействием с 1 молем дифенилхлорфосфата. Второй моль 1ифенил-хлорфосфага вызывает полимеризацию в соответствии со схемой [c.114]

Природные нуклеозид-2, 3 -циклофосфаты легко получаются при обработке нуклеозид-2 (или 3 )-фосфата (или смеси 2 - и З -фосфатов) любым реагентом ангидридной природы, включая трифтор-уксусный ангидрид [51], тетрафенилпирофосфат и дифенилхлор-фосфат (еще лучще применять диэтилхлорфосфат, при действии которого не происходит дальнейшей полимеризации) [134, 135]. При этом образуется смешанный нуклеотидангидрид, а затем происходит быстрое внутримолекулярное фосфорилирование. [c.148]

Аналогично полиадениловая кислота расщепляется диэстеразой селезенки (или рибонуклеазой Т2) до смеси аденозин-З -фосфата и устойчивых к ферменту олигонуклеотидов, содержащих исключительно 2 —5 -межнуклеотидные связи. Синтетические гомополимеры инициируют ферментативную полимеризацию нуклеозид-5 -пирофосфатов под действием полинуклеотидфосфорилазы. Не [c.503]

Ангидрид, однако, не должен быть слишком активным, так как при обработке циклофосфата, например, тетра-л-нитрофенилпиро-фосфатом полимеризации не происходит, что, возможно, объясняется быстрой атакой нуклеозидциклофосфатом промежуточного Р -нук-леозид-2, 3 -цикло-Р -ди-/г-нитрофенилпирофосфата, в результате которой образуется Р , Р -ди (ну клеозид-2, 3 -цикло) пирофосфат. Такие соединения обычно очень трудно полимеризуются, но легко гидролизуются до нуклеозид-2, З -циклофосфата. (Вероятно, в этом и заключается механизм обрыва цепи в обычных реакциях полимеризации с использованием дифенилхлорфосфата). Аналогично реакциям анионного обмена, описанным выше (стр. 265), по-видимому, для успешного применения промежуточных ангидридов их реакционная способность должна быть не просто небольшой или значительной, а должна лежать в известных, вполне ограниченных пределах, определяемых относительной устойчивостью анионов, входящих в состав ангидрида. [c.511]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология