Связи межнуклеотидные

Было замечено, что использование оксимов для удаления защитных групп уменьшает расщепление межнуклеотидных связей [c.170]

Межнуклеотидная связь. Нуклеазы [c.11]

Из характера межнуклеотидной связи следует также, что нуклеиновые кислоты — это неразветвленные полимеры. Лишь в очень редких случаях (они относятся, как правило, к промежуточным продуктам биосинтеза РНК) 2 -гидроксильная группа нуклеотидных остатков может использоваться для образования дополнительной фосфодиэфирной связи (ем. гл. VIH, раздел 4). [c.11]

В клетке межнуклеотидные связи в ДНК и РНК расщепляются нуклеазами — обширным классом ферментов, представители которого различаются по механизму действия и специфичности (табл. 1), Среди нуклеаз, приведенных в таблице, нужно особо выделить эндонуклеазы рестрикции (рестриктазы). ферменты (их функции рассмотрены в гл. VI) узнают в молекулах ДНК не отдельные нуклеотидные остатки, а нуклеотидные последовательности из четырех, пяти или шести остатков и поэтому расщепляют любую ДНК на сравнительно небольшое число строго определенных фрагментов. [c.13]

Стрелками показаны расщепляемые межнуклеотидные связи-. [c.14]

Химики, занимавшиеся установлением структуры, долгое время сохраняли большую осторожность в суждении о наличии в ДНК исключительно 3 -> 5 -фосфатной связи. Они допускали, что химические методы могут потерпеть фиаско в определении небольшого числа, например, 5 5 - или З З -связей или даже присутствия случайных пирофосфатных групп. Эта осторожность, как оказалось, была излишней. В настоящее время нет оснований предполагать наличие в ДНК какой-либо иной межнуклеотидной связи, отличной от 3 5 -фосфодиэфирной. [c.42]

На соответствующих стадиях анализа полимерная структура ДНК была фактически сама собой очевидна. Однако для РНК приведенные выше данные о химическом строении мономерных звеньев совместимы с тремя возможными полимерными структурами, содержащими межнуклеотидную связь 5 3 или 5 ->-2 или содержащую эти два типа связи в различных пропорциях. Эта [c.57]

Наличие 2 -гидроксильной группы делает формально допустимым наличие разветвлений в структуре РНК. Однако не было представлено ни единого доказательства в поддержку этой возможности. РНК, подобно ДНК, является линейным полинуклеотидом с инвариантной 5 ->3 -межнуклеотидной связью. [c.59]

Установлено, что в образовании межнуклеотидной связи участвуют гидроксильные группы в 3 - и 5 -положениях остатков углевода. [c.105]

Обе цепи в молекуле ДНК имеют противоположную полярность. Это означает, что межнуклеотидная связь в одной цепи имеет направление 5 ->3, а в другой - 3 ->5. Подобная направленность цепей имеет важное биологическое значение при репликации и транскрипции молекулы ДНК. [c.109]

Наиболее высокоорганизованными являются ферменты, с помощью которых осуществляется синтез новых молекул биополимеров, белков и нуклеиновых кислот. Эти ферменты обладают способностью не только катализировать образование пептидных или межнуклеотидных связей, но и воспринимать информацию, поступающую в виде специальных информационных молекул — нуклеиновых кислот. На каждом этапе роста цени нуклеиновые кислоты программируют, какой из мономеров должен быть отобран ферментом и присоединен к растущей синтезируемой цепи. Такие информационные молекулы называют матрицами, а фер- [c.11]

Нежелательным побочным процессом, происходящим при полинуклеотидном синтезе триэфирным методом (т. е. при синтезе более длинных, чем динуклеотид, олигомеров), является расщепление межнуклеотидных связей. Оно наблюдается в значительной степени при удалении ароматических защитных групп обработкой щелочью либо фторид-ионом [c.169]

Реакция проводится в водном диоксане. Напомним, что благодаря а-эффекту альдоксимы — хорошие нуклеофилы. В последнее время стала применяться метильная группа, поскольку ее удаление вследствие алкильного расщепления при обработке сильными нуклеофилами (тиофеноксид, бутиламин) также уменьшает расщепление межнуклеотидной связи [365]. [c.170]

В нуклеиновых кислотах мономерные остатки связаны между собой фосфодиэфирными связями,. Как в ДНК, так и в РНК эта связь осуществляется только за счет З -ОН одного нуклеозндного сстат-ка и 5 -0Н другого (рис. 3). Поэтому межнуклеотидную связь называют 3 —5 -фосфодиэфирной. Отсюда следует, что лолинуклеотидные цепи ДНК л РНК полярны и их концевые остатки неравноценны если рассматривать нефосфорилированный по концам полинуклеотид, то на одном конце он будет содержать 5 -, а на другом конце — З -ОН. Эти концы называют 5 - и З -концами цепи, соответственно. [c.11]

Идентификация модифицированных нуклеотидных остатков в полинуклеотидной цепи РНК долгое время была задачей особой трудности. С появлением современных методов секвенирования нуклеиновых кислот она существенно упростилась. Модификацию РНК или ее расщепление ферментами ведут таким образом, чтобы (как и при секвенировании) было затронуто в среднем только одно звено на молекулу (в чем есть дополнительный смысл, так как множественная модификация РНК искажает ее структуру). Далее, если изучается РНК небольшого размера или сегмент РНК, примыкающий к одному из ее концов, то этот конец метят радиоактивной меткой и задача идентификации модифицированного основания (после расщепления соответствующего звена) или атакованной нуклеазой межнуклеотидной связи сводится, как и при секвенировании, к определению длины фрагмента по его подвижности в высокоразрешающем электрофорезе в геле. В том случае, когда анализируемый район удален от концов молекулы на расстояние больше 150—200 н. о., используют реакцию обратной транскрипции (см. гл. 13). Для этого синтезируют олигонуклеотид, комплементарный участку РНК, расположенному вблизи от анализируемого района с З -концевой стороны молекулы, и далее используют его как праймер для обратной траискриптазы. Так как этот фермент останавливается на модифицйрованных остатках матрицы (или в том месте, где расщеплена фосфодиэфирная связь), то вновь по длине образующегося фрагмента можно определить положение модифицированного звена в РНК. [c.40]

Тодд и Браун установили, что расщепление межнуклеотидной фосфодиэфирной связи в полирпбонуклеотидах идет таким образом, что фосфатна. группировка остается у З -гндроксильиой группы. Это объясняется каталитическим влиянием Чис-гликольной 2 -гидроксильной группы рибозного остатка.— Прим. ред. [c.734]

Межнуклеотидные связи в однотяжевых РНК, образованные З -фос-фатным остатком гуанозина и 5 -гидроксилом любого нуклеотида Двутяжевые участки РНК [c.14]

Полученная в результате этих экспериментов информация была дополнена демонстрацией того факта, что эти ферменты столь же хорошо способны гидролизовать бензилфосфатные эфиры З -нук-леотидов (48), но не действуют на соответствующие бензиловые эфиры 2 -нуклеотидов схема (9) . В результате стало очевидным, что в образовании межнуклеотидной связи участвует 3 -, а не 2 -гидроксильная группа рибозы. [c.58]

Доказательства использования 5 -положения в образовании межнуклеотидной связи вытекали из работ Гуланда и Джексона [c.58]

Химический синтез полимеров с заданной последовательностью мономерных звеньев может быть очень сильно облегчен присоединением одного конца растущей полимерной цепи к нерастворимой подложке. При этом очистка полимера после каждой стадии химической реакции может легко достигаться фильтрованием. Этот метод был очень популярен в области пептидов, при этом повторяющиеся стадии могут быть автоматизированы [88]. Твердофазный синтез полинуклеотидов не был столь успещен, как твердофазный синтез полипептидов, в основном из-за трудностей в достижении количественных выходов на последовательных стадиях синтеза. Наиболее полезными реагентами для создания межнуклеотидной связи являются аренсульфонилхлориды, хотя для достижения максимальных выходов необходимо обеспечение безводных условий. Полистирол и сщитые стирол-дивинилбензольные сополимеры, содержащие остатки 4-метокситритилхлорида, были использованы для присоединения первого нуклеозида, через его 5 -гидроксильную группу к твердой подложке схема (55) . [c.170]

Все эти процессы требуют затраты энергии, расходуемой прежде всего на образование химических связей — пептидных и межнуклеотидных. В то же время перемещение РНК-полимеразы вдоль цепи ДНК или перемещение рибосомы вдоль цепи мРНК — механические процессы, в которых химическая энергич превращается в механическую работу. Источником энергии для всех этих процессов служат макроэргические нуклеозидтрифос-фаты. [c.564]

Синтез РНК на матрице ДНК происходит с помощью РНК-иолимеразы. Большинство исследований проведено на РНК-по-лимеразе из Е. соИ или из бактерии Azotoba ter vinelandii. Эти ферменты являются своего рода молекулярными машинами — они имеют сложную четвертичную структуру и выполняют ряд функций узнавание начального локуса синтеза и специфическое связывание в этом локусе ДНК, инициацию синтеза РНК (образование первой межнуклеотидной связи), непосредственно синтез РНК и терминацию — обрыв синтезируемой цепи РНК в конце гена или линейной последовательности генов (при синтезе полицистронной РНК) и сваливание фермента с матрицы. [c.565]

Конденсация с дегидратацией. Икехара и Уно [171 показали, что комплекс ДД ФА — ОСЬ, можно использовать для образования 3, 5 -межнуклеотидной связи. [c.357]

Нуклеотиды. При детальном изучении различных агентов для образования 3, 5 -межнуклеотидной связи Якоб и Корана [261 при-Ц1. т к выводу, что наиболее эффективна комбинация ДЦК с -толуоле ульфох лор идом или мезитиленсульфохлоридом. [c.427]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология