Повторяющиеся последовательности

Главное различие между цепями белка и полиэтилена или полиэтилен-терефталата (дакрона) заключается в том, что в молекуле белка не все боковые группы одинаковы. У фибриллярных белков определенная повторяющаяся последовательность боковых групп придает конкретному белку-кератину или коллагену-вполне конкретные механические свойства. Глобулярные белки имеют еще более сложное строение. Эти молекулы обычно содержат от 100 до 500 аминокисло г, полимеризованных в одну длинную цепь, и полная последовательность аминокислотных остатков в каждой молекуле одного глобулярного белка одинакова. Эти остатки могут быть углеводородными, кислыми, основными, нейтральными или полярными. Свертывание белковой цепи в компактную глобулярную моле- [c.313]

Умеренно повторяющиеся последовательности 190 [c.351]

В гено.ме обнаруживаются также рассеянные или находящиеся в кластерах гены, кодирующие гомологичные белки со сходными функциями. Например, это гены для разных типов актина, тубули-на, белков оболочки яйца насекомых, гонадотропинов позвоночных. Перечисление этих генов показывает, что семейства таких генов могут выпатнять как общеклеточные, так и специализированные функции. Такие мультигенные семейства, включающие по 5—20 копий и кодирующие белки со сходными функциями, также можно отнести к фракции умеренно повторяющихся последовательностей [c.190]

Рис. 19. Линейная (u) и крестообразная (б) структуры участка плазмиды pBR322, содержащего обращенную повторяющуюся последовательность нуклеотидных пар, под-черкнутую на рисунке

Пунктиром показано положение пары, через которую проходит ось симметрии второго порядка поворот вокруг этой оси на ]80" в плоскости чертежа приводит к совмещению повторяющихся последовательностей [c.33]

Существенную часть генома эукариот (10—20 %) составляют повторяющиеся последовательности ДНК (см. гл. X), которые в основном представлены разными типами подвижных (мобильных) элементов. Критерием для отнесения фрагментов генома к числу подвижных часто служит лишь локализация по их флангам коротких прямых повторов, обычно включающих несколько нуклеотидных пар ДНК, что отражает молекулярные механизмы акта их внедрения в ДНК-мишень (см. гл. IV). Функциональная роль Подвижных элементов не ясна, но, во всяком случае, они в значи тельной степени определяют, как и у прокариот, изменчивость генома и, следовательно, могут играть большую роль в эволюции генома. Роль мобильных элементов в мутационном процессе, включая образование делеций н инверсий, уже была рассмотрена на примере прокариот (см. гл. VI). [c.221]

С другой стороны, в некоторых клетках процесс необратимой дифференцировки сопряжен с потерей части генома. Крайним выражением этой ситуации являются эритроциты человека, полностью утратившие ядро. В других клетках разрушаются отдельные хромосомы. Возможны и такие случаи, когда хромосома или ее часть необратимо инактивируется и остается в клетке в виде компактного образования — гетерохроматина. Этим термином обозначают интенсивно окрашивающиеся области клеточного ядра. Некоторые гетерохроматины содержат многократно повторяющиеся последовательности (гл. 15, разд. И, 1,6), но в отдельных гетерохроматиновых областях обнаруживаются группы инактивированных генов. Чрезвычайно интересен случай полной инактивации одной из двух Х-хромосом в клетках самок млекопитающих 1[181]. Вся хромосома при этом выглядит как гетерохроматин. Инактивация происходит на ранней стадии эмбрионального развития и захватывает ту или другую Х-хромосому по принципу случайности в одних клетках инактивируется материнская Х-хромосома, в других—отцовская. Однако при дальнейших клеточных делениях одна и та же хромосома остается инактивированной во всем клоне клеток. В результате в организме особей женского пола возникает мозаицизм по гетерозиготным генам Х-хромосом. [c.363]

Мол. масса двух связанных между собой полипептидных цепей фиброина составляет ок. 365 тыс. Они содержат большое кол-во остатков глицина, аланина и серина (ок. 87% от всех аминокислотных остатков каждый второй аминокислотный остаток - глицин) остатки цистеина и метионина отсутствуют. В полипептидной цепи преобладает повторяющаяся последовательность—01у—Ser—Gly— [c.372]

Т-области ограничены прямыми повторяющимися последовательностями, и любая ДНК, вставленная между этими повторами, будет принята за Т-область и перенесена в растительную клетку. [c.146]

В антипараллельных, прилегающих одна к другой полипептидных цепях преобладает повторяющаяся последовательность -01у-8ег-01у-А1а-01у-А1а-. Цепи образуют антипараллельную /3-структуру, стабилизированную оптимальным образованием водородных связей между СО- и ЫН-группами. Прн этом остатки глицина выступают с одной, а серина и аланина — с другой стороны складчатого листа. Расстояния между отдельными листами равны примерно 0,35 и 0,57 нм. [c.422]

Анализ этих последовательностей показывает почти достоверно существование повторяющихся последовательностей у всех глиадинов, начинающееся приблизительно после 12 аминокислотных остатков N-конца. Эти последовательности не идентичны а-, у- и ы-типам, но весьма близки, нередко соединяют три глутамина и один пролин. Ни в одном из глиадинов не была выявлена последовательность пролин — пролин, также как среди 25 N-концевых остатков не наблюдалось цистеинов. [c.192]

Первая область состоит из двух повторяющихся последовательностей одна образована шестью аминокислотами и повторена 6 раз, а другая образована девятью аминокислотами, повторена дважды. Эти два типа последовательностей весьма отличны друг от друга. Последовательность из шести аминокислот почти полностью представлена полярными кислотами (пять из шести) и богата глицином (две из шести). Последовательность из девяти аминокислот включает четыре неполярных остатка из девяти (два тирозина и два пролина). Эти повторяющиеся последовательности отличаются от повторностей, выявленных у N-концевой половины цепи глиадинов [115, 45]. Из 40 последних С-кон-цевых аминокислот 31 относится к полярным. Два конца полипептидной цепи имеют поэтому полярный характер, четко выраженный по отношению ко всей цепи. Это контрастирует с зеином (запасной белок кукурузы), где в N- и С-концевых последовательностях обнаружено столько же полярных остатков, сколько и неполярных [4]. [c.212]

Другой пример влияния сверхспирализации на структурные превращения двойной спирали ДНК — образование крестообразных структур. Практически любая ДНК содержит инвертированные, или палиндромные, повторяющиеся последовательности длиной от нескольких п. о. до многих тысяч п. о. Теоретически можно представить себе превращение линейной двуспиральной формы палиндрома в крестообразную (рис. 19). Для релаксированной ДНК вероятность такого превращения ничтожна. Поскольку в ДНК с отрицательными сверхвитками этот переход энергетически выгоден, крестообразные формы in vitro обнаруживаются у всех исследованных сверхспирализованных ДНК с нормальной плотностью сверхвитков. (Экспериментально крестообразные структуры фиксируют по наличию однотяжевых петель в вершине шпилек , которые расщепляются нуклеазами, специфичными к однотяжевой ДИКО Вопрос о существовании крестообразных структур ДНК ш vito остается открытым. Скорость их юбразования очень мала, и, может быть, именно поэтому в клетке их еще никому не удалось обнаружить. [c.33]

Обычно к этому классу относят последовательности, представлен-иые в геноме десятками или сотнями копий. Среди умеренно повторяющихся последовательностей можно выделить две структурно и функционально различающиеся геномные фракции. Первая включает семейства генов, построенные из сгруппированных тандемно повторяющихся копий. Они участвуют в осуществлении жизненно важных общеклеточных функций. Это гены гистонов, транспортных РНК и рибосомных РНК- В целом они составляют нескатько процентов от всей геномной ДНК- Число копии в составе одного семейства (например, генов гистонов) может варьировать от десяти до нескольких сотен у разных представителей эукарнот. [c.190]

Денатурацию чаш е всего осуществляют кратковременным нагреванием раствора ДНК в 0,12 М Ка-фосфатном буфере до 97°, ренатурацию — охлаждением до так называемой критической температуры , которая на 20—25° ниже температуры плавления данной ДНК. Эту операцию, по аналогии с технологией обработки стали, называют отжигом . В отсутствие денатурирующих добавок температура отжига обычно близка к 60° в случае высокого содержания в ДНК ГЦ-пар она может быть заметно выше. Степень ренатурации пропорциональна произведению исходной концентрации раствора ДНК и времени отжига, которое обозначают символом ozf. Перед денатурацией ДНК необходимо тем или иным способом раздробить на фрагменты длиной 400—500 нуклеотидных пар. Без такого дробления не только сильно замедлится процесс ренатурации, но и благодаря наличию разбросанных по длине ДНК одинаковых (повторяющихся) последовательностей нуклеотидов может образоваться пространственная сетка молекул ДНК. [c.241]

Чтобы рекомбинация произошла, гомологичные участки двух молекул ДНК (или в случае мейоза двух хроматид) должны приблизитьс5г друг к другу. Поскольку в ДНК встречаются повторяющиеся последовательности (случайно или вследствие какой-то причины), кроссинговер может иногда происходить между двумя участками не строго одинаковых двухцепочечных молекул. При таком неравном К россинго-вере одна из образующихся молекул удлиняется, а другая — укорачивается. Это явление, возможно, является очень важным факторои эволюции [232а]. [c.287]

Согласно другим данным, некоторые из повторяющихся последовательностей распределены по всему геному случайно. Об этом свидетельствует, например, тот факт, что при ренатурации фрагментов ДНК Дрозофилы образуются кольца ДНК, которые можно увидеть с помощью электронного микроскопа [278]. Кольца во время ренатурации могут образовываться в результате фрагментации внутри повторяющихся последовательностей. В хромосомах Хепориз может содержаться около -25% таких повторяющихся последовательностей. Данные, полученные при электронной микроскопии, свидетельствуют о том, что случайная реассоциация фрагментов ДНК приводит к образованию двухцепочечных участков, содержащих повторяющиеся нуклеотидные последовательности, с одноцепочечными хвостами . Последние обычно не спариваются, поскольку содержат уникальные последовательности, пришедшие из разных генов. У Хепори повторяющиеся фрагменты ДНК включают приблизительно 300 нуклеотидов, а неповторяющиеся, или уникальные, фрагменты, расположенные между ними, — приблизительно 800 нуклеотидов [275]. [c.298]

Бактериальный Г. содержит в осн. неповторяющиеся гены лишь немногие гены, напр, кодирующие рибосо-мальные РНК, присутствуют в бактериальном Г. в виде неск. копий. В Г. высших организмов по степени повторяемости выделяют три осн. типа нуклеотидных последовательностей высокоповторяющиеся (до 10 копий), умеренно повторяющиеся (10 -10 копий) и уникальные. Последние м.б. представлены одной или неск. копиями. В эту фракцию входит подавляющее число генов, кодирующих белки. Повторяющиеся последовательности обычно составляют в зависимости от вида организма 10-70% всего Г. Их, как правило, меньше у низкоорганизованных организмов и больше у высших. Выяснены ф-ции лишь очень малой части всех повторов. Особую фракцию Г. составляют мигрирующие генетические элементы. [c.519]

М. н. обнаружены практически во всех нуклеиновых к-тах. Наиб, высокое содержание М.н. наблюдается у эукариотич. транспортных РНК (тРНК), у к-рых доля М.н. достигает 20-25% от общего кол-ва нуклеозидов. Значительно меньше (1-2%) М. к. в рибосомных РНК (рРНК). У последних М. н. сосредоточены в огранич. числе мест. J3 отличие от РНК содерлсание М. и. в ДНК разных организмов сильно варьирует. Так, в ДНК насекомых М.н. достоверно не обнаружены, в ДНК позвоночных их содержится 1-2%, а у растений эта величина достигает 3-8%, М.н. находятся в ДНК обычно не в уникальных, а в повторяющихся последовательностях. [c.91]

Для измерения времени, характеризующего восстановление намагниченности вдоль оси г после действия 180°-им-пульса, используют повторяющуюся последовательность импульсов 180°-х-90°-х -180°, каждый раз увеличивая интервал т (постоянный интервал т т). Время Г, определяют по амплитуде сигналов спиновых эхо А(т) = Ао 1 — -2ехр(-2х/Г,)]. [c.402]

Тиофениевые ионы играют ключевую роль не только в приведенных выше реакциях электрофильного замещения, но и обеспечивают саму возможность некоторых реакций присоединения. Имеются в виду процессы ионного гидрирования производных тиофена, которые протекают как повторяющиеся последовательные реакции протонирования и присоединения гидрид-иона [28-31]. [c.31]

Набор из трех углов соответствует трем остаткам, образующим преобладающую в коллагене повторяющуюся последовательность (Pro-Gly-Pro) (Yonath А., Traub W., JMB, 43, 461—477, 1969.) [c.90]

Преобладание в белках какой-то одной аминокислоты — довольно редкое событие. Коллаген же содерн<ит 337о глицина, 21% приходится на пролин + оксипролии и 11% составляет аланин. Все дело в том, что крупные по размеру боковые группы не могут уместиться внутри тройной спирали. То н<е самое относится и к фиброину шелка, который состоит в основном из периодически повторяющейся последовательности [c.92]

Очевидно, что символы типа г, к, гк и т. д. не указывают число слоев, после которого вся последовательность повторяется, например 2 для г АВ...), 3 для к АВС...) и 4 для гк АВСВ...). Число слоев, повторяющих последовательность, легко определить, если вернуться к символам типа А, В, С л подставлять их вместо гик, начиная произвольно с АВ..., до тех пор, пока последовательность букв не станет повторяться [c.193]

Гонококки, экспрессирующие пилин (Р+), с заметной частотой прекращают синтез этого белка <Р ) за счет утраты активного гена в локусе pH Е. Утрата гена (или его части), видимо, про исходит за счет рекомбинации с участием высококонсервативных повторяющихся последовательностей в составе гена. Восстановление активного гена пилина происходит путем рекомбинационного взаимодействия остатков исходного гена с гомологичными последовательностями одной из молчащих копий, кодирующих другие варианты пилина и расположенных в локусе рИ 5] [c.102]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология