Число повторов

Другой тип полиморфизма ДНК заключается В различном числе тандемных повторов, имеющих общую центральную часть из 10-15 пар оснований ( мини-сателлиты ) [1795]. Участок хромосомы может нести различное количество таких повторов. Возникновение полиморфизма этого типа облегчается благодаря идентичности последовательностей нуклеотидов в повторах, что приводит к делециям и дупликациям, возникающим в результате неравного кроссинговера (рис. 6.6). Длина рестрикционных фрагментов зависит от числа повторов. Такие гипервариабельные участки ДНК расположены около гена, кодирующего инсулин, и вокруг комплекса Hb в хромосоме 11, встречаются они и в других хромосомах. Поскольку данный тип поли- [c.289]

Следовательно, электрон в атоме характеризуется четырьмя квантовыми числами. Повторим их. [c.48]

Измерение водного числа повторяют последовательно 4 раза. Если результаты определения отличаются от среднего арифметического пе более чем на 0,5 сек, то их можно принять для вычисления средней величины. Если водное число вискозиметра выходит за пределы 51 1 сек, то вискозиметр для работы не годен. [c.190]

Определение водного числа повторяют 2—3 раза до получения совпадающих результатов, так как точность определения водного числа в значительной степени определяет точность получаемых показателей плотности кокса. [c.111]

Рестриктазы расщепляют ДНК примерно через 250 нуклеотидов, исходя из формулы 4" (4 — нуклеотиды — А Г, Т, Ц, п — число повторов сайтов в ДНК) [c.192]

Если обозначить числа некоторого ряда, расположенные в порядке возрастания, буквами (всего имеется 27 чисел, из них а — наименьшее, ш - наибольшее. Некоторые числа повторяются, например ц), то можно представить такую картину (см. схему на стр. 16). [c.19]

Примечание. Если число повторяется, его нужно пропустить. [c.153]

Происхождение амплифицированных хромосомных копий объяснить значительно сложнее. HSR состоит из большего числа тандемно повторенных единиц. Одна из трудностей в объяснении их возникновения путем интеграции последовательностей двойных микрохромосом связана с тем, что число хромосомных повторов во много раз больше, чем число повторов в отдельных двойных микрохромосомах. Большое число интегрированных копий является также препятствием при создании моделей для строго внутрихромосомного события амплификации. [c.498]

Как видно из приведенных данных, для различных организмов характерны разные пороговые дозы токсичности одних и тех же соединений. Кроме того, точность результатов определений токсичности значительно уменьшается при увеличении значений а С р. Наоборот, при малых величинах а 50 наблюдается высокая смертность живых организмов, что дает более точную картину действительной токсичности. Результаты измерений несколько меняются в зависимости от условий определения, вида организмов, числа повторов. Поэтому токсичность определяют в опытах на живых организмах (биопроба) с применением статистических методов. [c.8]

Рис. 6.6. Вариант ДНК может возникнуть из-за различной длины тандемных повторяющихся последовательностей. Последовательности Л, Б, В и Г различаются на один повторяющийся сегмент таким образом, последовательность А имеет 6 повторов, а Г-3 повтора. Сайты рестрикции отмечены стрелками. Эти сайты не изменяются. Однако размер фрагментов ДНК варьирует в зависимости от числа повторов. Наименьшая хромосома Г будет двигаться быстрее различные размеры ДНК при гибридизации по Саузерну различаются по миграционной подвижности. Гетерозиготы по различным комбинациям показаны схематически (А/Б, Б/В и т. д.) [60].

Механизм действия ДНК-полимераз эукариот подобен таковому у прокариот. Отличия в процессе репликации заключаются в следующем хромосома эукариот имеет линейную структуру, на обеих цепях расположено множество репликонов и соответствующее количество терминаторов. Линейность ДНК эукариот является причиной проблем, которых не существует у прокариот, имеющих кольцевую ДНК. В отличие от лидирующей цепи, которая реплицируется полностью, праймер, находящийся у З -конца отстающей цепи, разрушается и не реплицируется при помощи ДНК-полимераз. Для предотвращения укорачивания цепи на концах хромосомы находятся теломеры — участки нереплицируемой ДНК. На этом участке ДНК может синтезироваться праймер, и полнота репликации сохранится. Теломера состоит из большого числа повторов, например у человека ТТАГГГ. Матрицей для теломеры является РНК, а специальный фермент теломераза, представляющий собой обратную транскриптазу, присоединяет эти фрагменты к З -концу для сохранения исходных размеров хромосомы. [c.453]

С увеличением числа повторов оценка приближается к истинной дисперсии, которая определяется уравнением (7.13) при [c.145]

Длина гена — 1839 п. н п — число повторов, / — длина повтора, к — число различающихся нуклеотидов в несовершенном повторе [c.492]

Исследования последнего десятилетия обнаружили, что в некоторых генах, связанных с развитием наследственных неврологических болезней, имеются участки, представляющие собой тандемно организованные триплетные повторы. В норме число тандемных повторов варьирует в определенных для каждого гена пределах, однако у каждого человека имеется два варианта таких повторов, полученных им от каждого из родителей. В некоторых случаях по пока еще не ясным причинам происходит резкое увеличение числа повторов в том или ином гене, выходящее далеко за пределы его нормальной вариабельности. Это явление получило название экспансии триплетных повторов или динамической мутации и с ним связано развитие того или иного неврологического заболевания. Впервые этот феномен был обнаружен в 1991 г. при синдроме ломкости Х-хромосомы. В табл. 3 приведены примеры болезней, связанных с экспансией триплетных повторов. Видно, что последовательность триплетов, участвующих в описываемом явлении, может различаться - но большая их часть представлена повторами типа СХС, где X - любой из четырех нуклеотидов. Было показано, что с увеличением размера блока триплетных повторов тяжесть заболевания обычно возрастает. [c.316]

Высокомолекулярными соединениями (ВМС) называют вещества, имеющие относительную молекулярную массу приблизитель ио от 10 000 до нескольких миллионов. Размеры макромолекул а вытянутом состоянии могут достигать до 1000 нм и более, т. е. оии соизмеримы с размерами частиц ультрамикрогетерогенных дисперсных систем. ВМС, состоящие из большого числа повторяю-нгихся одинаковых звеньев, называются полимерами. Однако часто под полимерами подразумеваются все ВМС. Большой молекулярной массой и гибкостью цепей макромолекул объясняются специфические свойства ВМС и нх растворов, такие, как способность образовывать волокна н пленки,эластичность, набухаемость. Твердые ВМС чаще имеют аморфную структуру, чем кристаллическую. Темиературы их разложения существенно ниже температур кинения, что объясняет невозможность перевода ВМС в газообразное состояние. По этой причине для ВМС характерны только твердое н жидкое состояния. [c.305]

GOMOL Осуществляет быстрый,поиск групп несовершенных повторов в последовательности, содержащей тысячи нуклеотидов. Производит статистические оценки ожидаемого числа повторов, границы 95 доверительного интервала и выявляет группы неслучайных повторов. [c.24]

Моделирование эволюции ПП с реальными значениямии параметров X, м, М и V затруднительно в связи с необходимостью использования больших обьемов оперативной памяти ЭВМ и значительным временем счета. Поэтому, указанные параметры, а teu же продолжительность периода эвожади Т и число повторов Alu в геноме N следует изменить при моделировании следующим образом. Значения х, м и v возрастают на 2 порядка, а Т, м и N уменьшаются на 2 порядка. [c.68]

В результате полного цикла моделирования за время Т будет получена симуляционная матрица размерности (N 5), где N-общее число повторов, возникших с самого качала работы модели. [c.69]

Процесс эволюции повторов Alu моделировался при одних тех же параметрах Т = 810 лет, t = 10 лет, S = 55, v = 2. замен на позицию в год. При этом значения М, х и варьировались в следующих диапозонах 6-10 < М < 3-10 10" < X < 10 , 10 < м < 2-10 Рассматривались тольк такие комбинации значений х и при которых число повторе после т лет составляло не менее 5-10 . Для оценки степен дивергенции повторов в модели анализировалось большое чкс. разных случайных выборок, содержащих последовательности повторов Alu модельного генома и полученные выборочные значения степени дивергенции усреднялись. [c.70]

Можно показать, что величина К от Л/ не зависит. Действительно, = од2. где 0 - число повтор оощи> ся звеньев в сегменте а -. характерный Л1ер повторяющегося звена = Со о (Со - коэф4 ициент трения для одного торяющсгося звена). Тогда [c.203]

Повторяющиеся элементы структуры строятся так 1) повторяющийся элемент определяется как G-rpynna (в этом слу- lae он может не включать нескольких альтернатив) 2) число повторов определяются с помощью команды REP. Например, в структуре R1—G1—R2 команда REP G1 (3—9)S определяет между R1 и R2 цепь из 3—9 атомов S. Если нужен нестандартный повторяющийся фрагмент, в команде REP указывается номер повторяющейся вершины в положении G-группы, например [c.130]

В ДНК эукариот помимо уникальных последовательностей нуклеотидов, встречающихся, как правило, один раз (большинство структурных генов, кодирующих мРНК), имеется огромное количество повторяющихся последовательностей — повторов (см. рис. 2.3). Число повторов колеблется от десятков и сотен (среднечастотные повторы) до 10 раз на ге-нрм (высокочастотные повторы). У высших растений доля уни- [c.310]

В общих чертах строение нетранскрибирующегося спейсера приведено на рис. 23.7, где в качестве примера показана его организация у X. laevis. Участки с постоянной длиной чередуются с участками, длина которых может варьировать. В состав каждого из трех повторяющихся участков входит разное число повторов довольно короткой последовательности (длиной менее 100 п. н.). Этим объясняются общие различия в длине таких участков. [c.294]

Белки встраиваются в мембрану разными способами (рис. 42.11) детали этого процесса во многих случаях еще не установлены. Для объяснения механизма встраивания предложены две модели сигнальная гипотеза и мембранная триггерная гипотеза. В сигнальной гипотезе предполагается, что белок включается в мембрану параллельно его трансляции на мРНК в полирибосомах это так называемое ко-трансляционное включение. Когда лидерная последовательность выходит из рибосомы, она выявляется некой сигнал-распознающей частицей (СРЧ), которая блокирует дальнейшую трансляцию на уровне примерно 70 аминокислот, 40 из которых остаются в большом рибосомном комплексе, а 30 экспонированы в среду (рис. 42.12). СРЧ содержит шесть белков, с ней ассоциирована 78-РНК, близко-родственная А1и-семейству последовательностей ДНК с большим числом повторов (см. гл. 38). Блокирование трансляции не снимается до тех пор, пока комплекс СРЧ-лидерная последовательность— рибосома не свяжется с так называемым отстригающим белком (рецептором для СРЧ) эндоплазматического ретикулума. В этот момент начинается котрансляционное встраивание белка в эндоплазматический ретикулум. В процессе элонгации оставшейся части белка он перемещается через липидный бислой, поскольку рибосома остается присоединенной к эндоплазматическому ретикулуму. Таким образом образуется шероховатый (усеянный рибосомами) эндоплазматический ретикулум. Рибосомы остаются прикрепленными к эндоплазматическому ретикулуму в течение всего времени синтеза мем- [c.136]

Прежде всего мы рассмотрим экспериментальные приложения уравнения (23.62), а за тем вернемся к нему, чтобы пояснить смысл константы Аг2 на молекулярном уровне Предположим, что АиВ получены из исходной ДНК (содержавшей Т пар оснований) фрагментированной для получения небольших сегментов. Исходная ДНК имела 2Т нукле отидов. Полную концентрацию нуклеотидов в растворе этой ДНК, Со. легко измерить Концентрация исходных молекул ДНК будет равна С ХГ. Такую же концентрацию будут иметь и все уникальные фрагменты, полученные после фрагментации исходной ДНК, при условии, что в последней нет повторяющихся последовательностей, что она гомогенна и что при нарезании получаются определенные, неперекрываюшиеся фрагменты. В обшем случае, однако, концентрация двухцепочечных фрагментов с определенной последовательностью будет равна = пС /ТГ, где п является мерой гетерогенности (< 1) и числа повторов (> 1) в исходной ДНК. [c.348]

В трубчатых ольфактометрах Соуэра учитывают или число насекомых, собравшихся в конце трубы, где находится приманка, или распределение их по секциям, на которые размечается Tpydia [284, 308]. В туннельных ольфактометрах, кроме показателей, упомянутых ранее, могут учитываться длительность разных элементов поведения, число повторов тех или иных действий, скорость движения и т.п. [c.246]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология