Комплементарность оснований стерическая

КОМПЛЕКСЫ м мн. 1. Сложные частицы, являющиеся промежуточными продуктами химических процессов. 2. см. комплексные СОЕДИНЕНИЯ. клешневидные К. см. внутрикомп.чексные СОЕДИНЕНИЯ. КОМПЛЕМЕНТАрность ж. Стерическое соответствие друг другу взаимодействующих молекул (фермента и субстрата, антигена и антитела, гетероцикличбских оснований в двойных спиралях нуклеиновых кислот и др.). КОМПОЗИТЫ м. ин. см. композиционные МАТЕРИАЛЫ. КОМПОНЁНТ м. Составная часть системы, включающая одно простое или сложное вещество. [c.201]

Исследовался небольшой фрагмент из 55 оснований рибосомальной РНК R17. По существу осуществлялся перебор всех комплементарных пар на этой последовательности, из которых формировались всевозможные спирали. В этой работе впервые подробно анализировались дефекты спиральных участков - различные типы петель - и обсуждались их стерические и энергетические характеристики. Для выбора наилучшего варианта использовался термодинамический критерий, который отражает существо процессов, происходящих при формировании вторичной структуры. [c.198]

Структура ДНК. ДНК — высокомолекулярный полимер, состоящий из сочетаний четырех нуклеотидов. Нуклеотиды ДНК включают пуриновое (аденин, гуанин) и пиримидиновое (цитозин, тимин) азотистые основания, сахар — дезоксирибозу и остатки фосфорной кислоты. Молекула ДНК представляет собой двойную спираль, состоящую из двух спирально закрученных полимерных цепей, в каждой из которых нуклеотиды ковалентно связаны через остатки фосфорной кислоты в 3 — 5 -положениях дезоксирибозы. Между собой две полинуклеотидные цепи взаимодействуют водородными связями, возникающими между повернутыми внутрь спирали пуриновыми и пиримидиновыми основаниями. При взаимодействии азотистых оснований аденин всегда взаимодействует с тимином, гуанин - с цитозином (5-метилцитозином). Таким образом, возможны четыре варианта пар оснований А-Т, Т-А, Г-Ц, Ц-Г. Это строго избирательное стерическое взаимодействие (комплементарность, или дополнительность) является важным принципом, лежащим в основе воспроизводства самой ДНК, ДНК-зависимых синтезов всех РНК и синтеза белков в клетке. В молекулах ДНК эукариот насчитывается 10 —10 пар оснований. [c.311]

Молекула ДНК представляет собой комплекс из двух полимерных цепочек, связанных между собой межмолекулярными силами (рис. 4.2). Каждая цепочка в комплексе образует правую спираль (точнее, винтовую линию) и состоит из сахаро-фосфатного хребта с присоединенными к нему азотистыми основаниями четырех сортов — аденина (А), гуанина (Г), тимина (Т) и цитозина (Ц). Повторяющийся элемент цепочки (азотистое основание + сахар + фосфат) называется нуклеотидом. Таким образом, ДНК состоит из двух закрученных относительно друг друга полинуклеотид-ных цепочек. Существенно, что если связи между нуклеотидами внутри каждой цепочки являются жесткими, ковалентными и имеют энергию около 60 ккал/моль (3 эВ), то связи между полинуклеотидными цепочками по крайней мере на порядок слабее. Существует строгое правило компле-ментарности (соответствия) этих цепочек. Именно, всегда против аденина находится ТИМИН, а против гуанина цитозин. Комплементарность определяется стерическим соответствием оснований. При этом комплементарные пары оснований стабилизированы водородными связями (изображенными на рис. 4.3 пунктиром), электростатическими и ван-дер-ваальсовыми силами. Существенное значение для стабильности ДНК имеет взаимодействие между соседними парами оснований в двойной спирали. Параметры структуры ДНК следующие диаметр молекулы 20 А, расстояние между соседними парами оснований 3,4 А на виток спирали приходится 10 пар оснований, так что соседние пары повернуты относительно друг друга на угол [c.71]

Известно, что расщепление фосфо-эфирной связи идет через промежуточное состояние, в котором пять ковалентных связей атома Р находятся в тригональной бипирамидальной кон фигурации. Поэтому реакцию присоединения нуклеотида можно представить двухстадийной схемой (рис. 9.7). Образование промежуточной системы II требует энергии напротив, выделение пирофосфата освобождает свободную энергию. Модель исходит из представления о перекрывании обеих стадий. Предполагается, что при раскручивании ДНК и возникновении гибридной двойной спирали ДНК — РНК матрица ДНК функционирует в А-, а не в обычной -форме, т. е. Л-форма стабилизуется в участке матрицы, примыкающем к активному центру системы. Это положение аргументировано рядом фактов [42]. Локальный переход В-формы в Л-форму во время действия полимеразы может индуцироваться удалением молекул воды из участка ДНК, связанного с ферментом, что благоприятствует поликонденсации нуклеотидов. Как показывает изучение молекулярных моделей, не г стерических препятствий для выхода основания в одной цепи ДНК из гликозидной выемки в Л-форме ДНК после разрыва водородных связей с основанием комплементарной цепи. При этом конформация второй цепи не меняется. [c.567]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология