Упорядоченное присоединение субстратов

Уравнения скорости для механизма типа пинг-понг напоминают по форме уравнения скорости для бимолекулярной реакции с упорядоченным присоединением субстратов (6-35а) и (6-356), однако каждое из них содержит на один член меньше ) [c.22]

Соответственно из кинетических данных получают в этом случае на один кинетический параметр меньше, чем для реакций с упорядоченным присоединением субстратов. Кинетическая схема (6-37) для ферментативной реакции, протекающей по механизму типа пинг-понг, содержит 12 кинетических констант. Это соответствует минимальному числу стадий, которые необходимо рассмотреть, чтобы описать кинетические свойства фермента, функционирующего согласно механизму типа пинг-понг. Ясно, что из данных стационарной кинетики можно определить только часть этих констант для оценки всех их необходимо использовать другие подходы. [c.22]

Механизм с замещением фермента является одновременно механизмом с упорядоченным присоединением субстратов. Однако это обстоятельство не имеет здесь такого значения, как для механизмов с образованием тройного комплекса, поскольку для механизмов с замещением фермента существует единственно возможный порядок присоединения субстратов и альтернативный вариант с неупорядоченным связыванием субстратов исключен хотя Е часто может связывать X или Y, образующиеся комплексы не способны к каталитическому распаду с образованием GX или GY. / [c.108]

СМЫСЛ КИНЕТИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ ДВУХ ОСНОВНЫХ МЕХАНИЗМОВ С УПОРЯДОЧЕННЫМ ПРИСОЕДИНЕНИЕМ СУБСТРАТОВ [c.116]

Если стадии протонирования не являются равновесными, то для рассматриваемого механизма, представляющего собой простой механизм с образованием тройного комплекса и упорядоченным присоединением субстратов и с водородными ионами в качестве как первого субстрата, так и первого продукта, уравнение скорости имеет еще не очень сложный вид. Так, можно воспользоваться выведенным для подобного механизма уравнением (5.2), изменив соответствующим образом обозначения. Строгий анализ показывает, что зависимость параметра V (так же как и У/Лм) представляется графически колоколообразной кривой. [c.156]

Ингибирование продуктом реакции (разд. А, 9) также дает ценную-информацию о механизме ферментатив ного процесса. Например, если построить графики зависимостей 1/v от 1/[А], то в случае выполнения механизма с упорядоченным присоединением субстратов (6-34) мы обнаружим. что продукт конкурирует с А, и получим семейство прямых,, характерное для конкурентного ингибирования. В то же время зависи-иости l/t от 1/[В] в отсутствие и в присутствии продукта Q будут иметь [c.31]

Рис. 5.2. Механизм с образованием тройного комплекса и упорядоченным присоединением субстратов к ферменту и упорядоченным отщеплением продуктов для двухсубстратной-двухйродуктной реакции. Прерполагается, что упорядоченный характер связывания субстратов возникает вследствие того, что связывающий центр для второго субстрата формируется только после соответствующего изменения конформации, вызванного связыванием первого субстрата. Непродуктивный комплекс ЕХ является, по-видимому, кинетически значимым только при высоких концентрациях как X, так и V и в простых методах анализа механизма часто не принимается во внимание.

Предложенное Уоыгом и Хейнсом схематическое изображение реакций переноса групп с использованием обозначений X, и С особенно полезно для качественного обсуждения механизмов, проведенного в данном разделе, поскольку оно позволяет наглядно представить каждый выделенный механизм. Однако для количественного описания кинетики действия ферментов подобный подход оказывается непригодным, потому что в нем не проводится четкого разграничения между субстратами и продуктами кроме того, этот подход не позволяет обозначить концентрации реагентов простыми символами. Далее в этой главе мы вернемся поэтому к способу представления реагентов при помощи отдельных букв А, В,. .., Р, р.... В механизмах с образованием тройного комплекса и упорядоченным присоединением субстратов через А и Р обозначаются реагенты, которые связываются со свободным ферментом в механизме с неупорядоченным связыванием субстратов реагенты обозначаются произвольно в механизмах с замещением фермента принимается, что к Е присоединяются А и Р,акЕ — ВиР, хотя направление пути, связывающего Е с Е, выбирается произвольно. Эти правила можно легко обобщить на случай реакций, включающих более двух субстратов или продуктов. [c.111]

Клеланд 130] предложил следующий способ представления механизмов ферментативных реакций различные формы фермента записывают ниже горизонтальной линии, а стрелками обозначают присоединение субстратов и отщепление продуктов. Так, механизм с образованием тройного комплекса и упорядоченным присоединением субстратов и упорядоченным отщеплением продуктов представляется следующим образом [c.112]

Идя вдоль схемы слева направо и придерживаясь указанного направления стрелок, получаем прямую реакцию. Обратной реакции соответствует обратный порядок образования ферментсодержащих комплексов и обратное направление стрелок. Подход Клеланда позволяет представлять механизмы ферментативных реакций в компактной форме и особенно удобен для представления простых механизмов с упорядоченным присоединением субстратов. Однако для механизмов, включающих неупорядоченные стадии или стадии взаимодействия с ингибитором, он менее удобен и не позволяет простым путем ввести константы скорости. [c.112]

Рис. 9.8. Неупорядоченное и упорядоченное присоединение субстратов А и В к фермецту и высвобождение продуктов Р и О из комплекса с ферментом Е.