Пептидилтрансфераза

Использованию ферментов в качестве катализаторов для реакции соединения пептидов и в настоящее время уделяется большое внимание. Катализ образовании пептидов при биосинтезе белка осуществляет фермент перти-дилтрансфераза. Так как этот фермент взаимодействует с протеиногенными аминокислотами независимо от природы боковой цепи, теоретически он представляет собой идеальный катализатор для реакций целенаправленного синтеза пептидов. Пептидилтрансфераза в сложной рибосомной системе структурно тесно связана со всеми другими составляющими, кроме того, на стадии элонгации во время биосинтеза белка одновременно действуют также другие факторы. Поэтому вероятность того, что выделенный из естественной среды фермент вообще будет способен к катализу реакции синтеза пептидов, очень мала. Никакого выхода в практику пептидного синтеза не получил также изученный Липманном механизм биосинтеза пептидных антибиотиков, который проходит с участием определенных ферментов. [c.166]

В опытах по частичной разборке и реконструкции 50S субчастиц критичными для пептидилтрансферазной активнрсти были белки L6, L11 и L16 их добавление к производным 50S субчастицы, лишенным более трети исходных белков, восстанавливало активность. Однако позже выяснилось, что добавление только одного белка L16, но в большом избытке, тоже восстанавливает пептидилтрансферазную активность оказалось, что белки L6 и L11 лишь помогают белку L16 прочно встроиться в частицу. Далее были получены данные, еще более подтверждавшие ключевую роль белка L16 в организации пептидилтрансферазного центра химическая модификация его гистиди-нового остатка инактивировала пептидилтрансферазу. Тем не менее, [c.150]

Существует много специфических ингибиторов пептидилтрансферазной реакции, катализируемой как прокариотическими, так и эукариотическими рибосомами. Все они, как и можно было ожидать, действуют на большую (50S или 60S соответственно) субчастицу рибосомы и имеют к ней большее или меньшее сродство. Многие классические антибиотики, используемые для лечения бактериальных инфекций,— ингибиторы пептидилтрансферазы прокариотической 70S рибосомы. [c.188]

Хлорамфеникол. Самый известный ингибитор пептидилтрансферазы 70S рибосомы это, пожалуй, хлорамфеникол (хлоромицет ин) (рис. 103). Он является бактериостатическим антибиотиком широкого спектра действия. На эукариотические 80S рибосомы он не действует. В химическом отношении он представляет собой N-блокированный аминоспирт с ароматическим радикалом. Дихлор-метильная группа не обязательна для активности она может быть заменена на многие умеренно массивные радикалы. Ароматическая [c.188]

Транслокация выводит аминоацильный остаток, предшествующий С-концевому, из пептидилтрансферазного центра рибосомы, а дальнейшее добавление очередных остатков к С-концу все более отодвигает его и примыкающие к нему остатки от пептидилтрансферазы. Однако участок пептида длиной приблизительно 30—40 остатков, начиная от пептидилтрансферазного центра (т. е. от растущего С-конца), оказывается все еще закрытым рибосомой и не экспонированным в виде свободной цепи в окружающий раствор. В какой конформации пребывает этот примыкающий к С-концу участок растущего пептида и какое влияние оказывает на него рибосомное окружение— вопрос открытый. Кажется маловероятным, что пептид в рибосоме переходит в состояние вытянутой цепи или беспорядочного клубка. При каждом акте транспептидации и последующей транслокации пептид должен проталкиваться сквозь рибосому на один остаток, и необходимая для этого жесткость и векторность могли бы обеспечиваться его а -спиральной конформацией (т. е. сохранением исходной конформации, задаваемой пептидилтрансферазным центром). Имеется еще одно веское соображение спиральная конформация любого полипептида оказывается предпочтительной в канале или другом 272 [c.272]

ЕР—С. В трансляционном домене содержатся центры связывания фактора инициации цепи, расположенные в щели малой субъединицы, центры связывания мРНК—также в малой субъединице, и, кроме того, пептидилтрансфераза и 5 3 РНК, [c.274]

Так, актиномицин подавляет образование информационной РНК на матрице ДНК — клетка не получает соответствующего плана и синтез белка не идет. Тетрациклины препятствуют присоединению транспортных РНК к соответствующему месту полисомы. Сходным образом действует хлорамфеникол — он избирательно действует на 505-субъединицы рибосом, нарушая реакции, предшествующие построению на рибосоме полипептидной цепи. По-видимому, он ингибирует активность участвующих в этом процессе энзиматических систем (пептидилтрансфераз). [c.133]

Четвертая группа объединяет вещества, нарушающие нормальные процессы синтеза полимеров. Например, на белковый синтез действуют антибиотики стрептомицин и неомицин (подавляют связывание аминокислот между собой), эритромицин (нарушает функции 508-субъединицы рибосом), тетрациклин (препятствует связыванию аминоацил-тРНК с рибосомами), хлорамфеникол (подавляет функцию пептидилтрансферазы). Некоторые антибиотики подавляют синтез нуклеиновых кислот (митомицин С, акти-номицин Д, рифампицин). Пенициллин и ряд других антибиотиков подавляют синтез пептидогликана (рис. 70). [c.83]

Для биосинтеза белков требуется присутствие не только ферментов и мономеров (аминокислот), но и матрицы (молекулы иРНК), задающей последовательность присоединения аминокислот к растущей цепи, а также специфического переносчика для активирования мономера и отбора его в соответствии с заданным кодом (тРНК). Реакция образования новой пептидной связи происходит на рибосоме и катализируется ферментом пептидилтрансферазой. Полипептидная цепь растет в направлении от N- к С-концу. [c.224]

В результате взаимодействия аминогруппы вновь поступившей в рибосому аминокислоты с карбоксильной группой предьщущей аминокислоты образуется пептидная связь. Эта реакция протекает по механизму нуклеофршьного замещения (при этом вытесняется тРНК предьщущей аминокислоты) и катализируется ферментом пептидилтрансферазой, являющимся одним из белков 50-8-субъединицы рибосомы. [c.370]

Ингибируют пептидилтрансферазу большой субчастицы, препятствуя образованию пептидных связей. Хлорамфеникол действует только на системы бактерий, митохондрий и хлоропластов [c.61]

Действует как аналог аминоациладенозина, имитируя аминоацил-тРНК и непрочно связываясь с акцепторным участком. Когда пептидилтрансфераза переносит пептидильную группу от донорного участка на акцепторный, образующийся пептидил-пуромицин высвобождается из комплекса с рибосомой, и элонгация останавливается. [c.61]

Пептидилтрансферазная активность является функцией 50S- (или 60S-) субчастицы. Хотя активный центр фермента расположен полностью на больщой субчастице, обычно активность обнаруживается только тогда, когда субчастица входит в состав полной 70S- (или 80S-) рибосомы. Возможно, это ограничение необходимо для того, чтобы больщая субчастица, находясь в свободном состоянии, не могла беспорядочно образовывать связь между молекулами аминоацил-тРНК. Однако и у прокариот, и у эукариот пептидилтрансфераза больших субчастиц может быть активирована in vitro различными воздействиями, например такими, как добавление соответствующих количеств этанола. [c.82]

Некоторые мутационные изменения большой рРНК митохондриальных рибосом придают устойчивость к хлорамфениколу. Этот антибиотик останавливает синтез белка, осуществляемый бактериальными и митохондриальными рибосомами, блокируя пептидилтрансфераз-ную реакцию. При этом у бактериальных мутантов, устойчивых к хлорамфениколу, изменены белки 508-суб-частицы. В митохондриях мутации затрагивают единственное основание, находящееся на расстоянии 243 нуклеотидов от З -конца большой рРНК. [c.112]

UAA и UAG, а второй-кодоны UAA и UGA. У эукариот все три кодона узнает, по-видимому, один и тот же белок. Когда в А-участке оказывается терминаторный кодон, туда же подходит и терминирующий белок, который вынуждает пептидилтрансферазу сделать холостой шаг, в результате законченная полипептидная цепь высвобождается и отделяется от рибосомы (рис. 11.13). Рибосомные субъединицы в свою очередь диссоциируют, отделяются от мРНК и могут принять участие в синтезе следующей полипептидной цепи. [c.48]

Смотреть страницы где упоминается термин Пептидилтрансфераза: [c.675] [c.394] [c.395] [c.58] [c.148] [c.186] [c.268] [c.269] [c.425] [c.736] [c.738] [c.928] [c.940] [c.206] [c.316] [c.320] [c.51] [c.82] [c.82] [c.113] [c.63] [c.266] [c.267] [c.196] [c.102] [c.280]

Аминокислоты Пептиды Белки (1985) -- [ c.166 , c.395 ]

Молекулярная биология клетки Том5 (1987) -- [ c.19 , c.144 ]

Основы биохимии Т 1,2,3 (1985) -- [ c.940 ]

Ферменты Т.3 (1982) -- [ c.0 ]

Современная генетика Т.3 (1988) -- [ c.45 ]

Биохимия человека Т.2 (1993) -- [ c.102 ]

Биохимия человека Том 2 (1993) -- [ c.102 ]

Гены и геномы Т 2 (1998) -- [ c.150 ]

Молекулярная биология клетки Т.3 Изд.2 (1994) -- [ c.266 ]

Биохимия Т.3 Изд.2 (1985) -- [ c.104 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология