Промоторы сайты инициации транскрипции

Промоторы сайты инициации транскрипции [c.139]

ПРОМОТОРЫ САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ [c.139]

Инициация и регуляция транскрипции ДНК у эукариот с участием РНК-полимеразы в большей степени, чем у прокариот, зависит от множества других белков — факторов транскрипции, взаимодействующих с дискретными участками ДНК, образующих сложный эукариотический про.мотор. В районе промотора, прилегающего к сайту инициации транскрипции (кзп-сайту), обнаружены участки с характерными нуклеотидными последовательностями (мотивами), которые оказывают цис-действие на экспрессию близлежащего гена. Эти элементы могут взаимодействовать с РНК-полимеразой и другими белками-факторами транскрипции. Разные ядерные белковые факторы транскрипции, представляющие собой регуляторные белки, способны связываться с теми или иными нуклеотидными последовательностями ДНК, оказывая тем самым влияние На экспрессию разных генов. Такие белки, способные к диффузии [c.195]

Рис. 3.19. Транскрипция в бактериальной клетке. А. Структурные гены (А, В, С и О) оперона находятся под транскрипционным контролем оператора (о) и промотора (р). РНК-полимераза связывается с участками, находящимися на расстоянии 10 (—10) и 35 (—35) пар оснований от сайта инициации транскрипции (+1). 1 — Стоп-сигнал, ответственный за остановку транскрипции, а, Р, у и 5 — белки, продукты генов А, В, С, О. Б. То же, что и на рис. А, но показано связывание РНК-полимеразы с промоторной областью.

Для ограничения длины матричного фрагмента можно использовать любую рестриктазу. Необходимо соблюдать лишь одно условие выбранный фермент не должен вносить разрыв между промоторным сайтом инициации транскрипции и встроенной ДНК. Не имеет значения, образуется ли под действием рестриктазы один фрагмент или несколько — транскрибироваться будет только фрагмент, содержащий промотор. [c.18]

Иллюстрацией современных представлений о механизме действия стероидных гормонов может служить краткое описание того, как глюкокортикоиды влияют на транскрипцию ДНК вируса рака молочной железы мыши. Система этого онкогенного вируса удобна тем, что эффект стероида проявляется на ней быстро и сильно, а молекулярная биология вируса подробно изучена. Комплекс глюкокортикоидный гормон-рецептор связывается с высокой избирательностью и специфичностью с областью ДНК вируса—глюкокортикоидным регуляторным элементом, расположенным на несколько сотен пар оснований выше сайта инициации транскрипции. В состав глюкокортикоидного регуляторного элемента входят последовательности, очень сходные с консенсусной последовательностью АСА ) САС , обнаруженной в регуляторных элементах целого ряда генов, регулируемых глюкокортикоидами. Нагруженный рецептором глюкокортикоидный регуляторный элемент стимулирует инициацию транскрипции вируса рака молочной железы мыши и, кроме того, активирует гетерологичные промоторы. Этот цис-действующий элемент работает при перемещении от одной области к другой по ходу или против хода [c.217]

У прокариот регуляторные белки обычно связываются со специфическими последовательностями ДНК вблизи сайта инициации транскрипции и либо подавляют, либо активируют транскрипцию соседних генов. Благодаря гибкости ДНК ее молекула может образовывать петли, что позволяет белкам, присоединившимся на некотором расстоянии от промотора, влиять на РНК-полимеразу. Воздействие на расстоянии весьма распространено в клетках эукариот, ще экспрессию генов часто контролируют энхансеры, удаленные от промотора на тысячи нуклеотидных пар. [c.198]

Швсть генов млекопитающих со сходной локалиэацией и размерами СС-островков. На рисунке показаны промоторы, сайты инициации транскрипции (волнистые стрелки), экэоны (цветные полосы) и интроны (выделены точками). Цветным прямоугольником указаны области, в которых СС-динуклеотиды обычно не метили-рованы-так называемые СС-островки. Метилирован- [c.146]

Промоторные элементы генов одноклеточных эукариот — дрожжей — содержат сайты инициации (И), нуклеотидную последовательность ТАТА (обычно ТАТААА), а также другие элементы — активирующие последовательности (АП, UAS, англ. upstream a tivating sequen es), находящиеся перед сайтом инициации транскрипции (рис. 111, а). Кроме того, промотор может содержать элементы оператора О, участвующего в репрессии транскрипции. Расстояние между ТАТА-элементом и сайтом инициации может варьировать от 40 до 120 п. н., и в отличие, например, от промоторов позвоночных в промоторах дрожжей правильная точная инициация транскрипции сохраняется при изменении расстояния между сайтом инициации и ТАТА-элементом. Инициаторный элемент представляет собой особый участок, включающий нуклеотидную последовательность [c.196]

Один нз способов перемещения требует прежде всего образования РНК-матрицы, которая копируется при участии обратной траискриптазы (рис. 118). Эго было экспериментально доказано для ретротранспозонов дрожжей и дрозофилы. Ретротранспозоны транскрибируются с помощью РНК-полимеразы I. В составе ДКП имеются сайты инициации транскрипции и сигналы полиа-Деннлирования. ДКП могут служить активными промоторами, ванскрипция начинается в одном ДКП (условно левом, 5 -ДКП) [c.227]

Рис. 3.11. Схематическое изображение эукариотического структурного гена. Указаны промотор (р), сайт инициации транскрипции и ее направление (горизонтальная стрелка), область терминации транскрипции, узнаваемая РНК-полимеразой (1). 1-5 - экзоны, а-с1 - интро-ны. Первичный транскрипт содержит ро1у(А)- хвост на 3 -конце и метилированный нуклеотид С ( кэп ) на 5 -конце. После транскрипции интроны из первичного транскрипта вырезаются (процессинг), и на образовавшейся функциональной РНК синтезируется белковая молекула (трансляция).

Регулируемые промоторы Наиболее широко используются следующие сильные регулируемые промоторы промоторы la - и //-/)-оперонов Е. olv, специально сконструированный ia -npoMOTop, включающий -Ю-об-ласть /ас-промотора и -35-область Г/-/ -промото-ра (участки, находящиеся на расстоянии 10 и 35 п. н. до сайта инициации транскрипции) левый, или р , промотор бактериофага X промотор гена 10 бактериофага Т7. С каждым из них связываются соответствующие репрессоры, которые опосредуют включение и выключение транскрипции специфических генов. Кроме то- [c.107]

На участке ДНК, соответствующем оперону, находятся три структурных гена (z, у и а). Эти гены кодируют р-галактозидазу, гидролизующую лактозу до глюкозы и галактозы, галактозидпермеазу, переносящую лактозу через клеточную мембрану, а также галактозидтрансацетилазу, переносящую ацетильный остаток с ацетил-КоА на галактозу. Кроме структурньгх генов, оперон содержит регуляторные последовательности ген-оператор, примыкающий к З -по-следовательности структурного гена, и ген-регулятор, кодирующий белок-реп-рессор. К гену-оператору примыкает промотор — начальный сайт инициации транскрипции. Белок-репрессор, взаимодействуя с геном-оператором, частично блокирует область промотора. Это препятствует присоединению РНК-поли- [c.471]

Глюкокортикоиды — это класс стероидных гормонов, регулирующих экспрессию генов (см. гл. 44). При попадании молекул глюкокортикоидов в клетку млекопитающих они связываются со стероидч пе-цифичным рецептором, который претерпевает при этом конформационные изменения в цитоплазме и проникает в ядро. Комплекс глюкокортикоид— рецептор взаимодействует со специфическим рецеп-тор-связывающим сайтом ДНК в 5 -регуляторной области стероид-зависимых генов, например гена вируса рака молочной железы мыши, на расстоянии в несколько сот пар оснований от сайта инициации транскрипции. Посадка комплекса на рецептор-свя-зывающий сайт, судя по всему, приводит к более эффективному использованию промотора РНК-полимеразой, усиливая таким образом экспрессию стероид-зависимых генов. Область ДНК, связывающаяся с гормон-рецепторным комплексом, также может быть клонирована и присоединена к другому структурному гену. После встраивания таких химерных конструкций в геном культивируемых клеток млекопитающих репортерные структурные гены приобретают способность контролироваться содержанием глюкокортикоидов в среде, т.е. становятся стероид-индуцибельными генами. Постепенно укорачивая нуклеазной обработкой концы клонируемого фрагмента и вводя в него мутации, можно идентифицировать районы ДНК, которые непосредственно участвуют в связывании с гормон-рецепторным комплексом. Создается впечатление, что связывание гор-мон-рецепторного комплекса с определенным участком ДНК превращает его в активный энхансерный элемент. В ближайшем будущем мы, вероятно, сможем разобраться в молекулярном механизме точной регуляции экспрессии эукариотических генов, в частности на примере стероид-зависимых генов. [c.124]

Сравнение регуляторных злементов, ответственных за специфичность промотора альбуминового гена млекопитающих в отношении клеток печени. Элементы расположены так, чтобы совпали их сайты инициации транскрипции, служащие точкой отсчета. Пунктиром выде- [c.66]

Итак, экспрессия гена ALB регулируется относительно небольшой последовательностью в пределах участка из 150 п.н., непосредственно примыкающего к сайту начала транскрипции. Эта область содержит множество сайтов связывания специфических белков одни из них обусловливают тканеспецифичность экспрессии промотора, а другие регулируют уровень экспрессии. Как именно этот комплекс связанных белков влияет на скорость транскрипции, неизвестно. Неясно также, каким образом энхансеры, находящиеся примерно на 10 т. п. н. левее и более чем на 30 т. п. н. правее сайта инициации транскрипции, активируют базальный промотор. [c.68]

Активаци.ч трипскритши на расстоянии за счет изгибания ДНК. Описывая различные эукариотические промоторы (разд. 8.2 8.4), мы подчеркивали, что транскрипция чаще всего регулируется при участии 1/1 -последовательностей, расположенных на значительных расстояниях от сайтов инициации транскрипции. Поскольку мы предположили также, что транскрипция регулируется белками, связывающимися с этими удаленными сайтами, нам следует разобраться, как регуляторные домены этих белков влияют на активность комплекса транскрипции. Имеется множество экспериментальных данных, указывающих на наличие белок-белковых взаимодействий между регуляторными доменами факторов транскрипции и компонентами комплекса транскрипции (рис. 8.106). Такие взаимодействия между белками, связанными с участками ДНК, находящимися на значительном расстоянии друг от друга, могут реализоваться, если молекула ДНК образует петлю, сближающую сайты связывания. Возможно, регуляция работы сложных промоторов, с которыми могут связываться разные белки, осуществляется за счет самых разнообразных взаимодействий между этими белками. [c.133]

Распределение метилированных и неметилированных динуклеотидов СрС в модельном гене позвоночных. Такой ген содержит зкзоны (выделены цветом), интроны (выделены точками) и промотор слева от сайта инициации транскрипции (верхняя часть рисунка). Вертикальные линии под изображением гвна указывают положение СрС в самом гене и во фланкирующих его последовательностях. Метилированным СрС соотввтст-вуют цветные пинии, а неметилированным черные. [c.146]

Смотреть страницы где упоминается термин Промоторы сайты инициации транскрипции: [c.153] [c.198] [c.205] [c.208] [c.196] [c.197] [c.198] [c.205] [c.208] [c.148] [c.312] [c.191] [c.16] [c.124] [c.124] [c.102] [c.366] [c.66] [c.71] [c.191]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология