Апуриновая кислота

Так, при действии минеральных кислот или меркаптоуксусной кислоты получается так называемая апуриновая кислота, а при действии гидразина — апиримидиповая кислота. Естественно, что эти продукты деструкции, в цепи которых имеются моносахаридные остатки, содержащие свободный гликозидный гидроксил, могут далее быть расщеплены каким-либо известным в химии углеводов способом по местам таких освобожденных от оснований остатков моносахаридов. Однако достигаемая таким способом деструкция полимерной цепи НК недостаточно специфична, так как приводит к разрыву около 50% всех связей в полимере. Очевидно следует найти другие методы, позволяющие более избирательно разрывать связи в полимерной цепи. [c.252]

Нуклеиновые кислоты тоже гидролизуют сильной кислотой. Например, нагревания в течение 1 ч при 100 °С в 12 н. хлорной кислоте достаточно для расщепления молекулы до составляющих ее оснований. В ДНК Ы-гликозидные связи более лабильны, чем в РНК, связи с пуринами более лабильны, чем с пиримидинами. Последнее обстоятельство позволяет провести весьма полезную операцию если оставить ДНК на ночь на холоду при pH 2, произойдет полная ее апуринизация. Образующийся полимер известен как апуриновая кислота (табл. 2-11). [c.166]

Дезоксирибонуклеиновая кислота также образует с соляной кислотой при pH 1,6 аденин и гуанин, однако в большом количестве образуется высокомолекулярный остаток нуклеиновой кислоты. Не содержащий пурина высокомолекулярный продукт, называемый тиминовой кислотой , имеет молекулярный вес около 15 ООО и может быть очищен диализом против раствора соляной кислоты при pH 1,6 и выделен в виде апуриновой кислоты [86]. [c.441]

При нагревании в течение 3—5 чае с метанолом, насыщенным НС1, при 50° из апуриновой кислоты или непосредственно из дезоксирибонуклеиновой кислоты можно получить цитозин- и тиминдезоксирибодифосфорные кислоты [53]. [c.441]

Получение апуриновой кислоты и новый метод количественного определения содержания пурина в дезоксирибонуклеиновых кислотах [369]. [c.225]

Иногда возможен переход части ДНК во фракцию рибонук-леотидов. Причиной этого может быть аиуринизация ДНК в процессе обработки растительной ткани горячими липидорас-творителями, а также хлорной кислотой, если концентрация последней выше, чем 0,2 н. Апуриновая кислота гидролизуется щелочью подобно РНК- [c.26]

Гидролиз. На реакцию Фельгена влияет продолжительность гидролиза препарата. Гидролиз вызывает два процесса отщепление пуринов с образованием апуриновой кислоты, способной вступать в реакцию с фуксинсернистой кислотой, и удаление из яд ра гистонов, РНК и ДНК. Соответственно, по мере увеличения срока гидролиза в 1 н. НС1 при 60° реакция сначала усиливается, достигает максимума, после чего неуклонно надает. [c.141]

Методы разрушения ДНК, необходимые для определения последовательности нуклеотидов, были разработаны Чаргаффом и его сотрудниками [22, 72, 73], Бартоном [48, 74, 75, 82] и некоторыми другими авторами [76, 85]. При этом оказалось, что расщепление ДНК в кислой среде дает лучшие результаты по сравнению с регулируемым разрушением ДНК дезоксирибонуклеазой. Под действием разбавленной минеральной кислоты из молекулы Д]ЗК удаляются пуриновые основания. Полученный в результате полимер представляет собой исходный полинуклеотид, в котором на месте пуриновых нуклеотидов находятся дезоксирпбозные остатки, а ниримидиновые нуклеотиды расположены так же, как в исходной ДНК. Это соединение получило название апуриновой кислоты. В ходе ее образования удаление пуринов высвобождает реактивные альдегидные группы дезоксисахара со свободными гидроксильными группами при С-4. Таким образом полимер приобретает значительную чувствительность к щелочам и к слабо щелочным буферам, содержащим первичные аминогруппы. Подобного рода разрушение ДНК достигается при использовании дифениламина в кислой среде. [c.80]

Слабое нагревание полидезоксирибонуклеотидов при низких значениях pH (>60° pH 3) приводит к интересным последствиям. Первичная структура в основном сохраняется (т. е. расщепляется лишь относительно небольшое число фосфодиэфирных связей полинуклеотидной нити), но ири этом разрываются все связи между сахаром и пуринами, в результате чего образуются апуриновые кислоты. Аналогичным образом обработка ДНК гидразином приводит к образованию апиримидиновых кислот. [c.131]

Освобожденные от пуринов продукты, полученные путем обработки дезоксинуклеиновой кислоты разбавленной минеральной кислотой, впервые описаны около 70 лет назад и названы тимино-вой кислотой [390]. Впоследствии было обнаружено присутствие наряду с тимином цитозина [391], но, несмотря на это, неправильное название продолжало существовать до тех пор, пока не было заменено термином апуриновая кислота [392]. Образование подобных продуктов является результатом исключительной неустойчивости в кислом растворе пурин-дезоксигликозидных связей по сравнению с ниримидин-гликозидными и фосфодиэфирными связями. [c.428]

Хотя в настоящее время применяются достаточно мягкие условия получения апуриновых кислот (такие, как гидролиз [392] при 37° и pH 1,6 или обработка [393] ионообменными смолами), все же при этом имеет место также расщепление фосфодиэфирных связей, продукты получаются с гораздо меньшей длиной цепи и имеют молекулярный вес [394, 395] от 3500 до 15000 по сравнению с молекулярным весом в несколько миллионов, характерным для исходных полимеров. Как и при гидролизе в нейтральных растворах, главной причиной расщепления цепи является легкое отщепление фосфата из негликозидных звеньев дезоксирибозы. [c.428]

Апуриновые кислоты проявляют восстанавливающие свойства, характерные для негликозидных углеводов, а также реагируют с такими типичными реагентами, как гидроксиламин, 2,4-динитро-фенилгидразин, меркаптаны и реактив Шиффа [395]. Полярографический анализ показал присутствие некоторого количества свободных альдегидных групп [396], как можно было ожидать на основании общих свойств 2-дезоксирибозы. Восстановление боргидридом натрия превращает остатки дезоксирибозофосфата в эфиры [c.428]

ЩЕЛОЧНОЙ ГИДРОЛИЗ АПУРИНОВЫХ кислот [c.437]

Хотя при поверхностном рассмотрении щелочного гидролиза апуриновых кислот в качестве основного механизма гидролиза можно предположить промежуточное образование циклического фосфата при участии С4-гидроксильной группы в ациклической форме дезоксирибозных звеньев [422, 423], распад в значительной степени аналогичен распаду, происходящему при кислотном гидролизе [18, 424]. В соответствии с известными свойствами эфиров [c.437]

Апуриновая кислота распадается также при нагревании нейтральных незабуференных растворов ее натриевой соли [426]. При этом происходит быстрая потеря свободных альдегидных групп (но не потеря восстанавливающих свойств), за которой следует более медленное освобождение неорганического фосфата и свободного основания — цитозина (через 20 час при 100° до 95% от общего содержания цитозина). Образуются также тимидиловая кислота и тими-диновые олигонуклеотиды с эквимолекулярным отношением тимина к фосфату они содержат, по-видимому, исключительно концевой 5 -фосфат (отщепление фосфата от атома Сз смежного дезоксири- [c.438]

Для определения распределения пуриновых звеньев может иметь значение гидразинолиз ДНК с последующим щелочным гидролизом апиримидиновых кислот. Процесс, по-видимому, аналогичен щелочному гидролизу апуриновых кислот. [c.439]

Значительный интерес представляет тот факт, что реагент (который может быть использован для синтеза нуклеозидов и мононуклеотидов) является эффективным и для замещения гетероциклических оснований в апуриновой кислоте. Так, при обработке апуриновой кислоты из ДНК зобной железы теленка этим полифосфатом в присутствии аденина образуется вещество, в котором все удаленные пуриновые основания оказались замещенными на аденин, причем свободные альдегидные группы отсутствовали. Реконструированная [c.516]

При изучении кристаллической структуры пуринов и пиримидинов пришли к выводу, что цитозип и гуанин должны образовывать три водородные связи, причем третья водородная связь связывает 2-аминогруппу гуанина с 2-кетогруппой цитозина [250]. Это подтверждается в известной степени большей стабильностью водородных связей между гуанином и цитозином по сравнению со связями между аденином и тимином, но изучение реакции азотистой кислоты с нативной и денатурированной ДНК с последующим гидролизом получепиых продуктов до свободных оснований приводит к иному выводу [251 [. По сравнению с полимером, депатури-рованным нагреванием, в нативной ДНК из зобной железы наблюдалось ингибирование реакции 6-аминогрупп цитозина и аденина с азотистой кислотой, что, по-видимому, является результатом наличия водородных связей (хотя определенное значение могут иметь и стереохимические факторы) в то же время в случае аминогруппы гуанина подобного эффекта не наблюдалось. Результаты титрования ДНК также позволяют предположить, что аминогруппа аденина не участвует в образовании водородной связи, но и это доказательство не является убедительным [197, 202]. Осцилло-графическая полярография высокополимерной ДНК указывает на то, что 2-аминогруппа гуанина, а не цитозиновый остаток, участвует в реакции [252]. Однако в апуриновой кислоте цитозин дает осциллополярографическую волну. [c.579]

Менее известные аналоги апуриновых кислот — апиримидиновые, образующиеся в реакции ДНК с гидразином. Под влиянием гидразина пиримидиновые основания отщепляются, а пуриновые остаются на своих прежних местах. Апиримидиновые кислоты используются для определения пуриновых изоплит. [c.38]

Апуриновая кислота — см. Анализ нуклеотидной последовательности ДНК. [c.38]

Нативная ДНК для панкреатической ДНК-азы служит более пригодным субстратом, чем денатурированная. Она действует на двухцепочечную ДНК,вызывая разрывы фосфодиэфирных связей в одной из полинуклеотидных цепей. Панкреатическая ДНКаза совершенно не чувствительна к малым олигонуклеотидам, апуриновым кислотам и к дезаминированным одноцепочечным ДНК. Под ее влиянием частично разрушаются некоторые биосинтетические полимеры. [c.65]

ПОЛУЧЕНИЕ АПУРИНОВОЙ КИСЛОТЫ И ОЛИГОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДОВ ПУТЕМ ГИДРОЛИЗА ДНК МУРАВЬИНОЙ КИСЛОТОЙ и ДИФЕНИЛАМИНОМ [c.10]

Деградацию ДНК можно изучать отдельно от цветной реакции в менее кислой среде, например в 66%-ной муравьиной кислоте, содержащей 2% дрфениламина (вес/объем) нри 30° [1—5]. Предполагается, что образующаяся в отсутствие дифениламина апуриновая кислота [5] является промежуточным продуктом деградации ДНК, поскольку дифениламин высвобождает неорганический ортофосфат из апурииовой кислоты быстрее, чем из ДНК [2]. Схематически эти реакции показаны на фиг. 1. [c.10]

ПОЛУЧЕНИЕ АПУРИНОВОЙ КИСЛОТЫ II ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ИЗ ДНК II [c.11]

Для удаления солей водный раствор ДНК диализуют против воды и смешивают затем с двумя объемами 987о-ной или 2,8 объема 90%-ной муравьиной кислоты. Этот раствор инкубируют 17 час при 30°, затем добавляют к нему 0,5 объема воды и 4 объема эфира, встряхивают и эфирный слой отбрасывают. Экстракцию эфиром повторяют дважды и водный раствор пропускают через колонку с дауэксом 50 (Н+) при 0° (для 0,5 г ДНК используют колонку длиной 12 см и диаметром 5 см). Свободные пурины адсорбируются на ионообменнике апуриновую кислоту выделяют, промывая колонку водой около 2 час, пока апуриновая кислота не перестанет обнаруживаться в элюате (поглощение при 260 ммк полностью отсутствует или очень незначительно). Для удаления муравьиной кислоты элюаты объединяют и высушивают путем лиофилизации до тех пор, пока не образуется густая влажная масса апуриновой кислоты (кислотная форма). Важно отметить, что концентрирование апуриновой кислоты следует прекращать, когда вода удалена не полностью и температура колбы не повысилась до комнатной. Апуриновую кислоту сразу же растворяют в холодной воде и тщательно нейтрализуют натриевой щелочью. Натриевую соль апуриновой кислоты можно выделить из раствора путем лиофилизации. Средневесовой молекулярный вес такой апуриновой кислоты равен 57 ООО [5]. Это значение намного выше того, которое найдено для апуриновой кислоты, полученной нри диализе ДНК против минеральных кислот [6, 7]. [c.11]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология