Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Модифицированные нуклеозиды

Рис. 16. Гипер-модифицированные нуклеозиды, встречающиеся в положении, непосредственно примыкающем к антикодону с З -стороны Рис. 16. Гипер-модифицированные нуклеозиды, встречающиеся в положении, непосредственно примыкающем к антикодону с З -стороны

    РНК являются лучшими источниками модифицированных нуклеозидов, особенно тРНК, где число модифицированных нуклеозидов, кажется, возрастает со скоростью равной или даже большей, чем количество тРНК, с известной последовательностью оснований [8, 20]. Самыми необычными из идентифицированных к на- [c.71]

Рис. 15. Модифицированные нуклеозиды, встречающиеся в первом положении антикодона тРНК Рис. 15. Модифицированные нуклеозиды, встречающиеся в <a href="/info/166543">первом положении антикодона</a> тРНК
    Уже из рассмотрения последовательности одной тРНК (рис. 12) видно, что, в дополнение к четырем главным типам нуклеотидных остатков (А, С, С, и), полинуклеотидная цепь тРНК характеризуется наличием разнообразных модифицированных нуклеозидов, часто называемых минорными . Они образуются в результате посттранскрипционной [c.30]

    Очевидно, что многие нуклеозиды являются интермедиатами в биосинтезе н расщеплении нуклеотидов и полинуклеотидов. В дополнение к так называемым спонгонуклеозидам (термин, применяемый к модифицированным пуриновым нуклеозидам, полученным из карибской губки ryptotethya rypta), которые являются производными арабинозы, многие антибиотики являются производными нуклеозидов, часто имеющих модифицированные углеводные остатки они будут детально обсуждаться позднее. Нуклеозиды сравнительно легко выделить из химических или ферментативных гидролизатов природных полинуклеотидов условия и практические детали этого процесса можно найти в общих учебниках по нуклеиновым кислотам [2, 7, 24]. Все коммерчески доступные образцы основных нуклеозидов получены этим путем. Для выделения больщих количеств таких нуклеозидов наиболее целесообразно применение относительно грубого фракционирования, основанного на различной растворимости, и методов ионного обмена. Для выделения малых количеств модифицированных нуклеозидов либо из природного источника, либо полученных в результате химического синтеза, пригодны многочисленные более эффективные методы, и они будут обсуждаться отдельно. Наконец, следует помнить, что выделение нуклеозидов часто осуществляют дефосфорилированием нуклеотидов [25], выделение и разделение которых не будет рассматриваться в настоящей главе. [c.72]

    Основные направления исследований в области нуклеозидов с годами существенно изменились. Первоначально основное внимание уделялось доказательству структуры природных соединений, получаемых из гидролизатов нуклеиновых кислот. И хотя этим вопросам еще уделяется определенное внимание в связи с изучением многочисленных модифицированных нуклеозидов, найденных в тРНК, чаще целью исследования является синтез некоторых потенциальных антибиотиков или аналогов нуклеозидов, которые предположительно будут иметь медицинское применение. Констатируя это изменение в направленности работ на недавно состоявшемся Симпозиуме по химии, биологии и клиническому использованию аналогов нуклеозидов было отмечено, что в последующие 25 лет достижения в области нуклеозидов и нуклеотидов внесут существенный вклад в основные разделы медицины. [c.70]


    Недостаточно обоснованные выводы о встречаемости нуклеозидов могут оказаться некорректными. Так, помимо восьми основных нуклеозидов (1) — (8), большинство классов нуклеиновых кислот, столь сильно различающихся между собой, содержат, как было показано, в большем или меньшем процентном отношении модифицированные нуклеозиды. Длительное время было известно, что 5-метилдезоксицитидин образуется в гидролизатах ДНК растений и животных [7] полагают, что каждая система ферментов рестрикции бактерий содержит метилазу, которая метилирует специфические остатки оснований ДНК хозяина в последовательности, узнаваемой рестрикционной эндонуклеазой [7], давая таким образом появление модифицированных нуклеозидов из бактериальной ДНК. Фаговые ДНК часто содержат большие количества модифицированных нуклеозидов и очень возможно, что нас еще ожидает много неожиданностей по мере определения состава нуклеи новых кислот других фагов [7]. [c.70]

    Продуктом реакции является левулиновая кислота и, вероятно, альдегидные группы дезоксирибозных остатков, которые освобождаются в результате апуринизации, реагируют с дифениламином, образуя основания Шиффа. Последние отщепляют затем фосфо-рильный остаток из положения 5. Деградация апуриновой ДНК щелочью ведет к разрыву цепи, но этот метод менее удовлетворителен, чем кислотно-катализируемая реакция, описанная выше, поскольку при этом наблюдаются побочные реакции. Терминальное основание можно отщепить из молекулы РНК после ее катализируемой амином реакции с последующим повторным периодат-ным окислением схема (12) . Амин катализирует удаление модифицированного нуклеозида с З -конца РНК дальнейшее окисление [c.146]

    Если в 5 -положении антикодона находится I или какой-либо другой модифицированный нуклеозид, то такая тРНК может узнавать три разных кодона, причем все они образуют качающиеся пары в З -положении. [c.951]

    Два других модифицированных нуклеозида, способных образовывать пары с тремя основаниями, находящимися в третьем положении кодона,-это уридин-5-ок-сиуксусная кислота и 5-метоксиуридин. Они эффективно узнают А и G и менее эффективно U. [c.97]

Рис. 4-68. Метод секвенирования нуклеиновых кислот, основанный на энзиматическом введении нуклеотида, терминирующего цепь. Ключевым для этого метода является использование дидезоксирибонуклеозидтрифосфатов, в которых дезоксирибоза-З -ОН, представленная в нормальных нуклеотидах, в данном случае отсутствует внедряясь в цепь ДНК, такой модифицированный нуклеозид блокирует присоединение следующего нуклеозида. А. Синтез in vitro молекулы ДНК в присутствии затравки, а также небольшого количества одного из таких модифицированных нуклеозидов приводит к образованию лесенки фрагментов ДНК, представленных на рис. 4-66. Если для получения таких фрагментов применяют радиоактивную ДНК, проводят четыре различные реакции синтеза, каждая из которых использует различные нуклеозиды, терминирующие цепь, а электрофоретический анализ проводят на четырех параллельных дорожках геля, можно определить последовательность нуклеотидов в ДНК (см. рис. 4-67, а также рис. 4-64, AJ. Б. Более современная модификация метода, в которой четыре набора фрагментов, меченные различным образом, Рис. 4-68. <a href="/info/1386425">Метод секвенирования</a> <a href="/info/548">нуклеиновых кислот</a>, основанный на энзиматическом введении нуклеотида, терминирующего цепь. Ключевым для этого <a href="/info/1887795">метода является</a> использование дидезоксирибонуклеозидтрифосфатов, в которых дезоксирибоза-З -ОН, представленная в нормальных нуклеотидах, в данном случае отсутствует внедряясь в цепь ДНК, <a href="/info/1892183">такой модифицированный</a> нуклеозид блокирует присоединение следующего нуклеозида. А. Синтез in vitro молекулы ДНК в присутствии затравки, а также <a href="/info/748834">небольшого количества</a> одного из <a href="/info/1892183">таких модифицированных</a> нуклеозидов приводит к образованию лесенки фрагментов ДНК, представленных на рис. 4-66. Если для получения таких фрагментов <a href="/info/1707896">применяют радиоактивную</a> ДНК, проводят четыре <a href="/info/1709633">различные реакции синтеза</a>, каждая из <a href="/info/1768031">которых использует</a> различные нуклеозиды, терминирующие цепь, а <a href="/info/822862">электрофоретический анализ</a> проводят на четырех параллельных дорожках геля, можно <a href="/info/1683685">определить последовательность</a> нуклеотидов в ДНК (см. рис. 4-67, а также рис. 4-64, AJ. Б. Более современная <a href="/info/139040">модификация метода</a>, в которой четыре набора фрагментов, меченные различным образом,

Смотреть страницы где упоминается термин Модифицированные нуклеозиды: [c.11]    [c.31]    [c.71]    [c.72]    [c.72]    [c.207]    [c.930]    [c.63]    [c.165]    [c.89]    [c.236]   
Молекулярная биология Структура рибосомы и биосинтез белка (1986) -- [ c.0 ]




ПОИСК







© 2024 chem21.info Реклама на сайте