Кодоны взаимодействие с антикодонами, гипотеза

Однако оказалось, что такое строгое каноническое спаривание оснований не является об им правилом для взаимодействия первого остатка антикодона с третьим остатком кодона. Прежде всего было замечено, что если аминокислота кодируется двумя, тремя или четырьмя кодонами, то первые два нуклеотидных остатка кодонов всегда идентичны, а третий различается (см. рис. 3). Следовательно, аминокислота строго кодируется двумя первыми буквами кодона и менее строго — третьей. С другой стороны, было обнаружено, что рибосомы, программированные разными кодонами для одной и той же аминокислоты, могут связывать одну и ту же тРНК, т. е. тРНК может узнавать более чем один кодон. Например, одна и та же фенилаланиновая тРНК узнает как UUU, так и UU . Анализируя эти и некоторые другие факты, Ф. Крик вьщвинул гипотезу о неоднозначном спаривании первого нуклеотида антикодона с третьим остатком кодона он предположил возможность нестрогого соответствия [c.155]

Правила, согласно которым происходит взаимодействие кодон-антикодон, суммированы в гипотезе неоднозначного соответствия (гипотеза качаний, Wobble-гипотеза). [c.95]

Точка X обозначает Г углеродный атом рибозы, а пунктирная линия — связь, соединяющую этот атом с атомом азота в кольце основания антикодона. Остальные точки со сплошными линиями обозначают положения первых углеродных атомов и их связей с азотом в кольце основания кодона для различных пар оснований, перечисленных внизу справа. (Для простоты пары, содержащие в кодоне И, опущены.) Гипотеза неоднозначного соответствия предполагает, что при взаимодействии третьего положения кодона с антикодоном допустимы три отдаленных нестандартных положения, отклоняющихся от стандартной пары Уотсона -- Крика вверх, вниз и вправо. Три приближенных нестандартных положения, отклоняющихся от стандартного положения влево, недопустимы. [c.448]

Узнавание кодоном антикодона весьма точно —ошибки составляют сотые доли процента [123]. Точное спаривание не может обеспечиваться термодинамическими факторами — разностями энергий различных пар. Исходя из квантовомеханических расчетов горизонтальных и вертикальных взаимодействий между триплетами кодона и антикодона, Нинио пришел к вы воду о неизбежности большой неоднозначности узнавания [124]. Неоднозначность должна увеличиваться и за счет виляний . Ошибочные антикодоны часто мало отличаются от правильных по энергии взаимодействия. Энергии взаимодействия ГУГ и ЦАЦ и ЦЦЦ разнятся лишь на 2,1 ккал/моль. Пытаясь преодолеть эту трудность, Нинио предложил гипотезу существования лишних триплетов — антикодоны, приводящие к большой неоднозначности (например, АЦГ, АЦЦ, ИЦЦ), просто не существуют. [c.595]

Другой пример взаимодействия, не предсказанный гипотезой, заключается в том, что бактериальная инициаторная fMet-тРНК способна узнавать как кодон AUG, так и кодон GUG. Это вынуждает третье основание антикодона взаимодействовать не по правилам. [c.97]

Оставшиеся кодоны распределяются по парам, в которых кодоны, заканчивающиеся пиримидинами, прочитываются основанием G, находящимся в антикодоне, а все кодоны, заканчивающиеся пуринами, прочитываются основанием U в антикодоне, согласно предсказаниям гипотезы неоднозначного соответствия. Сложность с уникальными кодонами UGG и AUG в митохондриях млекопитающих полностью устраняется в результате изменений в генетическом коде, обусловленных действующими там правилами считывания кодон UAG прочитывается наряду с UGG как триптофан, тогда как AUA больше не кодирует изолейцина и узнается наряду с AUG как метионин (см. гл. 4). В результате все не вошедшие в семейства кодоны подразделяются на 14 пар по способности взаимодействовать с молекулами тРНК. [c.97]

Аналогичное кодон-антикодоновое взаимодействие обнаруживается в случае одной из эукариотических тРНК. Бычья печень содержит тРНК, аминоацилирован-ную серином. Ее антикодоном является триплет ""ССА, который, согласно гипотезе неоднозначного соответствия, может отвечать на триптофановый кодон UGG. Но фактически он узнает только терминирующий кодон UGA. Таким образом, ""С специфически взаимодействует с А. Поэтому в рассмотренном случае использование триплета UGA в качестве терминирующего кодона, возможно, является определенным видом супрессии. [c.99]

Таким образом, можно отметить, что, помимо обычных актикодон-кодоновых взаимодействий, существует еще целый ряд факторов, влияющих на процесс считывания кодонов с мРНК. Точность образования пары антикодон—кодон зависит от структуры участков молекулы тРНК, расположенных за пределами антикодоновой петли, и от структуры определенных участков рибосомы. Кроме того, в соответствии с гипотезой Крика образование системы водородных связей между антикодонами и кодонами не является строго однозначным, т.е. допускает определенное разнообразие структур соответствующих элементов. На все эти факторы могут влиять мутации, возникающие в генах, кодирующих структуру любых компонентов трансляционного аппарата. [c.95]

Достаточно убедительно выглядит и "энергетическая" гипотеза (Gro-sjean,Fiers,1982), отражающая тот факт, что наиболее часто встречающимися являются кодоны со средним значением энергии кодон-анти-кодонового взаимодействия, а кодоны, сильно или слабо взаимодействующие со своими антикодонами, дискриминируются. По мнению авторов, такая стратегия использования кодонов позволяет клетке создать наилучшие условия для элонгации белковых пеней. [c.44]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология