Вырожденность третьего основания

Другой особенностью кода является тенденция к группировке кодонов, соответствующих одной аминокислоте. Часто основание в третьем положении кодона оказывается несущественным для его специфичности. Одна аминокислота может быть представлена четырьмя кодонами, различающимися только по третьему основанию. Иногда различие состоит в предпочтении пурина пиримидину в этом положении. Меньшую специфичность этого положения в кодоне называют вырожденностью третьего основания. [c.60]

Код представлен в виде прямоугольников, содержащих группы кодонов, среди которых вырожденность основания в третьем положении обеспечивает их одинаковое значение. Возможно выделить четыре класса. Третье основание не играет роли в определении смысла кодона. [c.95]

ВЫРОЖДЕННОСТЬ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА. Соответствие нескольких кодонов одной аминокислоте. Замена в третьем основании кодона не всегда приводит к замене аминокислоты. [c.520]

Таким образом и в случае окисления ацетилена характер изменения давления не может служить основанием для установления вырожденного разветвления в качестве кинетического механизма реакции. Ценной ее характер, однако, доказывается сильной зависимостью скорости реакции окисления во-первых, от набивки сосуда, во-вторых, от величины диаметра и, в-третьих, от добавок двуокиси азота. [c.77]

Если при абсолютном нуле — 1, то С — О на основании третьего закона термодинамики. Остается лишь трудность в определении постоянной которую необходимо знать, чтобы рассчитать величину ТУ. Допустим, что П[ молекул системы заняли энергетический уровень который имеет вырождение со . Число способов осуществления этого состояния [c.85]

Генетический код является вырожденным данная аминокислота может кодироваться более чем одним кодоном. Вырожден-ность кода обусловлена тем, что у кодонов, определяющих одну и ту же аминокислоту, первые два основания фиксированы, а третье положение может занимать другое основание. Исключение составляют метионин и триптофан, которые кодируются только одним триплетом. Триплет, соответствующий метионину (АУГ), инициирует считывание и не кодирует аминокислоту, если стоит в начале цепи ДНК. [c.69]

Информация, заложенная в ДНК и РНК, реализуется в процессе синтеза белка. Механизмы передачи информации от ДНК на РНК понятны и очевидны, так как цепь нуклеотидов характерна для обеих структур, а матричный синтез предусматривает полную идентичность их последовательностей. Но каким же образом передается информация от РНК, содержащей всего четыре нуклеотида, на белок, содержащий 20 различных аминоьсислот Если бы каждый нуклеотид передавал информацию на синтез одной аминокислоты, то всего кодировалось бы 4 аминокислоты. Не может код состоять из двух нуклеотидов, так как в этом случае можно было бы охватить не более 16 аминокислот (4 = 16). Работами М. Ниренберга и соавторов было установлено, что для кодирования одной аминокислоты требуется не менее трех последовательно расположенных нуклеотидов, называемых триплетами или кодонами. При этом между отдельными кодонами нет промежутков, и информация записана слитно, без знаков препинания. Число сочетаний 4 дает основание полагать, что 20 аминокислот кодируются 64 кодонами. Экспериментально установлено, что таких кодонов меньше, всего 61. Оставшиеся три кодона не несут в себе информации, однако два из них используются в качестве сигналов терминации. Выявлена также интересная особенность взаимодействия кодона с антикодоном. Оказалось, что первое и второе азотистые основания кодона образуют более прочные связи с комплементарными основаниями антикодона. Что же касается третьего основания, то эта связь менее прочная, более того, основание кодона может спариваться с другим, не комплементарным основанием антикодона. Этот феномен называют механизмом неоднозначного соответствия или качания. В соответствии с этим урацил антикодона может взаимодействовать не только с аденином, но и с гуанином кодона. Гуанин антикодона способен связываться не только с цитозином, но и с урацилом кодона. Это указывает на возможность нескольких кодонов кодировать одну и ту же аминокислоту. И действительно, было установлено, что ряд аминокислот кодируется двумя и более антикодонами (табл. 29.1). Из таблицы видно, что только две аминокислоты — метионин и триптофан — кодируются при помощи одного кодона. Число кодонов для остальных аминокислот варьирует от двух (для аргинина, цистеина и др.) до шести (для лейцина и серина). Тот факт, что одной и той же аминокислоте соответствует несколько кодонов, называется вырожденностью [c.462]

Молчащие мутации. Если под мутацией в традиционном смысле понимают внезапное изменение признака, т. е. изменение генотипа, проявляющееся в фенотипе, то на молекулярном уровне любое стабильное наследуемое изменение ДНК рассматривают как мутацию. Однако ввиду вырожденности генетического кода понятно, что не всякая мутация такого рода будет проявляться в фенотипе. Во многих триплетах изме- нение третьего основания остается без последствий ( молчапще мутации). Даже замена первого или второго основания триплета не всегда приводит к серьезным последствиям. Хотя структуры высшего порядка (третичная и четвертичная) определяются первичной структурой белка (т.е. последовательностью аминокислот), разные аминокислоты играют в этой структуре не одинаково важную роль. Например, мутация АиС->ОиС ведет к замене изолейцина валином, т.е. к замене одной липофильной группы на другую. Однако мутация Сии- ССи приведет к замене лейцина пролином, и последствием такой замены будет отклонение от нормальной пространственной конфигурадии полипептидной цепи, что может сильно изменить структуру высшего порядка. Из этого понятно, что различные мутации в одном и том же структурном гене определенного фермента могут по-разному сказываться на его активности возможны любые изменения-от едва заметного снижения каталитического действия до полной инактивации. [c.442]

Так, X и X должны быть либо А и U (или и и А), либо G и С (или С и G). Из этой модели следует, что каждый антикодон может узнавать только один кодон. Однако факты, которыми мы располагаем, противоречат этому. Некоторые выделенные в чистом виде молекулы тРНК могут узнавать более одного кодона. Например, дрожжевая алани-новая тРНК, изученная Холли, связывается с тремя кодонами G U, G и G A. Только первые два основания этих кодонов одинаковы, третье различается. Может быть, узнавание третьего основания кодона иногда менее избирательно, чем узнавание двух других Общая картина вырожденно-сти генетического кода показывает, что дело может обстоять именно так. XYU и XY все а кодируют одну и ту же аминокислоту, а XYA и XYG обычно имеют одинаковый смысл. Исходя из этих данных, Крик предположил, что на спфивание третьего основания должны накладываться менее строгие стерические ограничения, чем нас пари вание двух других. Были построены модели различных вариантов спаривания оснований, чтобы определить, какие из них сходны со стандартными А—U- и G—С-парами в отношении расстояния и угла между глико-зидными связями. В это исследование был включен инозин, так как он встречается в некоторых антикодонах. Если предположить, что в спаривании третьего основания кодона допустима некоторая стерическая свобода ( качание , или неоднозначное соответствие), то комбинации, приведенные в табл. 272, кажутся вполне возможными. [c.94]

Первое основание антикодона определяет, считывает ли данная молекула тРНК один, два или три типа кодонов С и А узнают по одному кодону, и и О - по два кодона, I - три кодона. Итак, одна из причин вырожденности генетического кода заключается в неточности, или неоднозначности, спаривания ( качании ) третьего основания кодона. Именно в этом мы усматриваем основную причину распространенности необычного нуклеозида инозина в антикодонах. Инозин увеличивает число кодонов, которые способна считывать данная молекула тРНК (рис. 27.8). [c.95]

Радикал циклопропенила интересен с точки зрения теории. Третий электрон с равным основанием может быть помещен на любую из двух вырожденных антисвязывающих МО, и, согласяо теореме Яна— Теллера (см. гл. 5), симметрия ядерной конфигурации молекулы должна быть нарушена. [c.258]

Радикал циклопропенила представляет дополнительный теоретический интерес. Третий электрон с равным основанием может быть помещен на любую из двух вырожденных антисвязывающих МО и согласно теореме Яна — Теллера (гл. 6) симметрия ядерной конфигурации молекулы должна быть нарушена. Однако легко показать (см. ниже задачу 8.2), что искажение центросимметричной конфигурации атомов циклопропенильного кольца приведет к дополнительному увеличению электронной энергии. [c.214]

В других случаях использование вырожденности кода более однородно. Вполне возможно, что свобода выбора, так часто доступная в третьей позиции кода (см. табл. 22.5.1), умело используется вирусными мРНК для достижения максимальной компли-ыентарности спаривания оснований в петлях шпилек и тем самым повышения стабильности вторичной и/или третичной структуры [10, 11]. [c.211]

И заметим, что при фиксированном х (г ) система может быть приведена к (п — 1) переменной. Исходя из анализа устойчивости, можно исключить из рассмотрения последнюю строку и столбец матрицы А. Это не следует использовать как основание для исключения третьей коллокационной точки, поскольку каждый элемент матриц N0 и N2 вносит свой вклад в результат до упрощения. Более того, такое уменьшение размерности следует рассматривать, как вырожденный случай более широкой проблемы, возникающей для частного постоянного условия при = 1. Если же, например, второе граничное условие состояло бы в том, что при 2 = 1 производная постоянна, то необходима была бы полная матрица п X п. [c.168]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология