Квазиэквивалентность

Квазиэквивалентность конформации субъединиц [c.291]

Многие вирусы обладают белковым чехлом, близким по форме к сфере внутри него содержится ДНК или РНК (дополнение 4-В)- Чехол состоит обычно из большого числа идентичных субъединиц — факт, который можно понять, исходя из соображений экономии генетического материала. Действительно, для формирования специфической структуры из большого числа идентичных субъединиц достаточно одного гена [48]. Электронно-микроскопические данные показывают, что вирусные частицы часто имеют форму икосаэдров (рис. 4-11), а согласно химическим исследованиям, число белковых субъединиц в вирусной частице кратно 60. Например, чехол РНК-содержащего вируса хлоротической пятнистости коровьего гороха диаметром 25 нм состоит из 180 белковых субъединиц с мол. весом 19 600 каждая из субъединиц содержит 183 аминокислотных остатка [49]. Небольшой РНК-содержащий бактериофаг 2 имеет чехол из 180 субъединиц [50] с мол. весом 13 750, в который заключена молекула РНК с мол. весом 1,1-10 . Чехол вируса кустистой карликовости томатов диаметром 33 нм также состоит из 180 субъединиц, тогда как у вируса бородавок человека диаметром 56 нм их 420, что в семь раз превышает число частиц в правильном икосаэдре. Согласно концепции квазиэквивалентности субъ- [c.289]

Как мы уже отмечали, субъединицы оболочек икосаэдрических вирусов и некоторых ферментов могут быть квазиэквивалентньши. Эта особенность ответственна за спирализацию жгутиков бактерий, она же лежит в основе некоторых интересных структурных особенностей вируса табачной мозаики. Белковые субъединицы вируса могут быть уложены либо в спираль с числом субъединиц на один виток, равным 16,3 (рис. 4-7), либо в плоские кольца из 17 субъединиц каждое [36а]. При этом конформационные различия очень малы. Кольца способны диме-ризоваться, однако крупных агрегатов они не образуют. Удивительно, что димерные кольца не обладают диэдрической симметрией. Все субъединицы в них ориентированы одинаково, но находятся в двух разных конформациях. Есть предположение, что такие диски являются промежуточной структурой при сборке вирусной частицы. Согласно рентгеноструктурным данным, внутренние участки нвазиэквивалентных субъединиц диска играют роль своего рода ловушек, ожидающих момента, когда в состав вируса включится РНК. После этого диски меняют конформацию и образуют завиток , инициируя рост спиральных вирусных частиц [36а]. Эти и многие другие интересные данные позволили предположить, что квазиэквивалентность белковых субъединиц в сочетании с их способностью менять свою конформацию лежит в основе многих биологических явлений. [c.295]

Представление о квазиэквивалентности, введенное в вирусологию Каспаром и Клугом [67], допускает образование оболочек из 60 и более строительных блоков концепция эта наилучшим образом объясняет геометрическую укладку капсомеров у большинства изометрических вирусов. Основой этого геометрического построения является сосуществование капсомеров, состоящих из 6 субъединиц и образующих поверхности и (или) ребра треугольных граней, и капсомеров, состоящих из 5 субъединиц и образующих вершины икосаэдра. Таким образом, не все капсомеры имеют одинаковое окружение, т. е. они квязаэквивалеитны. Пептамерпые и гексамерные субъединицы либо состоят из одинаковых структурных субъединиц (что характерно для вируса желтой мозаики турнепса, РНК-содержащих фагов и некоторых других вирусов), либо их капсомеры содержат различные белки, что наблюдается у аденовирусов (см. гл. V, разд. В). Треугольные грани икосаэдра в свою очередь состоят из еще более мелких равносторонних треугольных граней, [c.151]

Следует отметить, что принцип квазиэквивалентности допускает известные колебания формы, чем, по-видимому, и можно объяснить существование различных форм в общей популяции частиц одного вируса. Так, например, при самых различных условиях вирусной инфекции изо-лгетрическим частицам могут сопутствовать продолговатые тельца и палочки [47, 204]. [c.153]

Как объяснить квазиэквивалентность с физической точки зрения Рентгеноструктурный анализ показал, что каждая субъединица состоит из S-домена, образующего часть поверхности оболочки Р-домена, выступающего наружу N-концевого участка, направленного внутрь. Р- и S-домены всех субъединиц имеют примерно одинаковое строение. В то же время угол между Р- и S-доменами в субъединицах фуппы С сильно отличается от угла в субъединицах А и В. Р-и S-домены соединены шарниром, обеспечивающим поворот на угол до 20°. Еще одно отличие состоит в том, что N-концевая часть в субъединицах фуппы С упорядочена, а в субъединицах А и В находится в беспорядочной конформации. Благодаря такой гибкости структурной организации субъединицы, принадлежащей к различным групгиш, могут взаимодействовать друг с другом почти идентичным образом, что необходимо для самосборки. С другой стороны, РНК внутри частицы, по-видимому, не находится в какой-нибудь определенной конформации. Гибкие N-концевые участки субъединиц оболочки проникают внутрь и взаимодействуют с РНК. [c.176]

Рис. 30.16. Икосаэдрическая поверхностная решетка, демонстрирующая упаковку 60 совершенно одинаковых субъединиц А) и 180 квазиэквивалентных субъединиц (Б). Обратите внимание, что все контакты типа хвост к хвосту на рис. А образуются кольцевыми группами по пять субъединиц, а на рис. Б некоторью такие контакты образуются группами по пять, а другие —по шесть субъединиц. [Harrison S. ., Trends Bio hem. Sei., 3,4 (1978).]

В результате получено два набора, содержащих одинаковое количество опытных частот (224) первый соответствовал отнесению I, а второй - отнесению П. По этим наборам опытных частот было проведено масштабирование квантовомеханического силового поля в независимых естественных координатах. Естественные координаты разделены на 6 квазиэквивалентных по масштабированию совокупностей, каждой из которых ставился в соответствие один масштабирующий множитель. Масштабирую-пще множители и квазиэквивалентные совокупности для указанных вьш1е двух наборов опытных частот приведены ниже [c.122]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология