ТАТА-бокс

Несмотря на индивидуальность набора регуляторных элементов у структурных генов эукариот, каждый из них имеет промоторный участок (ТАТА-бокс, или бокс Хогнесса) из восьми нуклеотидов, включающий последовательность ТАТА последовательность ССААТ (САТ-бокс) участок из повторяющихся динуклеотидов G (ОС-бокс). Эти элементы находятся на расстоянии 25, 75 и 90 п.н. от сайта инициации соответственно (рис. 3.23). Транскрипция структурного гена эукариот начинается со связывания с ТАТА-боксом фактора транскрипции ПО (TFIID), который представляет собой комплекс по крайней мере из 14 белков. Затем с TF1ID и участками ДНК, примыкающими к ТАТА-бок-су, связываются другие факторы транскрипции, [c.46]

Рис. 3.22. Изменение скорости транскрипции. Активатор (A t) связан с участком между ТАТА-боксом и сайтом инициации транскрипции, скорость транскрипции повышена. Эффектор (Е) связывается с активатором и препятствует его соединению с ДНК скорость транскрипции уменьшается.

ТАТА-бокс и последовательность TTGA расположены за 10 (область -10) и 35 (область -35) нуклеотидов до сайта ишщиации транскрипции соответственно (нуклеотид +1) (рис, 3.19). Обычно от участка между ТАТА-боксом и нуклеотидом +1 во многом зависит, будет ли происходить транскрипция данного оперона. В зависимости от способа регуляции транскрипции оперона этот участок называется оператором или активатором. [c.42]

Что такое ТАТА-бокс [c.49]

ТАТА-бокс (ТАТА box) Участок, располагающийся в промоторной области генов эукариот за 25 нуклеотидов до сайта инициации транскрипции, с которым связывается РНК-полимераза. Другое название — бокс Хогнесса. Аналогом у прокариот служит бокс Прибнова. [c.561]

ТАТА бокс Свит качала транскрипции РНК / [c.147]

Регуляция транскрипции с помошью репрессора назьшается отрицательной. Если же система регуляции направлена на повышение скорости транскрипции, то она называется положительной. Рассмотрим вкратце этот процесс. Белок-активатор связывается с участком между ТАТА-боксом и сайтом инициации транскрипции. При этом он не [c.44]

Рис. 39.8. Схема организации регуляторных блоков типичного эукариотического гена. В функциональном гене можно выделить регуляторную и структурную области, разделенные сайтом инициации транскрипции (показан стрелкой). Регуляторная область состоит из двух элементов, определяющих базовый уровень экспрессии. Проксимальный элемент, ТАТА-бокс, направляет РНК-полимеразу к сайту инициации транскрипции и, следовательно, определяет точность начала синтеза РНК. Другой регуляторный элемент (upstream) контролирует частоту, с которой происходит инициация транскрипции. Наиболее изученным регуляторным элементом этого класса является так называемый СААТ-бокс, однако в других генах могут использоваться и иные элементы. В регуляции экспрессии участвуют также энхансеры и сайленсеры— элементы, усиливающие или ослабляющие базовый уровень транскрипции, и элементы, регулирующие экспрессию определенных генов в ответ на различные сигналы (включая гормоны, тепловой шок, ионы металлов, некоторые химические препараты). Сюда же относятся и функционально подобные элементы, обусловливающие тканевую специфичность экспрессии генов. Возможно, что два последних блока регуляторных элементов функционально перекрываются (показано соединяющей линией). Зависимость функции элемента данного типа от ориентации указана стрелками. Так, проксимальный элемент обязательно должен быть в ориентации 5 - У. СААТ-бокс и аналогичные ему элементы наиболее эффективно работают в ориентации 5 - 3, но некоторые функционируют в обеих ориентациях. Разорванные линии между квадратами указывают на то, что положения данных элементов относительно сайта инициации транскрипции строго не фиксированы. В действительности элементы регуляции экспрессии могут быть расположены также и правее (т. е. ближе к З -концу) сайта

Рис. 3.24. Инициация транскрипции структурного гена эукариот. Сначала фактор транскрипции ТИГО связывается с ТАТА-боксом, затем происходит присоединение других факторов транскрипции и РНК-полимеразы П и, наконец, вспомогательных факторов, запускающих транскрипцию. Стрелка — направление транскрипции.

Старт- Левая Правая Стоп- тельный Энхансер ЦААТ-бокс ТАТА-бокс Кэп-сайт сигнал область область сигнал сигнал [c.459]

Важным фактором транскрипции для многих промоторов РНК-полимеразы II служит TFI1D. Он представляет собой большой белковый комплекс, который обычно называют ТАТА-фактор, так как он может связываться с консервативной АТ-богатой последовательностью, называемой ТАТА-бокс, которая расположена примерно за 25 нуклеотидов до сайта начала транскрипции. Механизм действия ТАТА-фактора, стимулируюшего транскрипцию полимеразой IL представлен на рис. 9-69 [c.147]

Рис. 6.7. Челночный прокариотически-эукариотический вектор pSEM atR. Если смотреть против часовой стрелки, этот вектор включает ген, кодирующий устойчивость к ампициллину, участок начала репликации pBR322, промотор области ранних генов SV-40, содержащий ТАТА-бокс Голдберга — Хогнесса, промоторную область гена AT (хлорамфеникол-ацетилтрансферазы), содержащую сайт начала транскрипции (этот ген кодирует устойчивость к антибиотику хлорамфениколу), интрон малого t-антигена и сайт полиаденилирования области ранних генов вируса SV-40.

Базовая часть промотора состоит из двух элементов (рис. 1.8,о). )дин из них — инициатор — включает первый транскрибируемый нуклеотид (обычно это А, его координата +1) и предшеству-. эщий ему нуклеотид (обычно это С, его координата -1), а также окружающие их пиримидины (Ру) общая формула инициатора — P j APy, Другой элемент — ТАТА-бокс — расположен на отметке -25 его консенсус — ТАТАААА. РНК-полимераза II и набор транскрипционных факторов, работающих на базовой части промотора, образуют базовый транскрипционный аппарат клетки, который обеспечивает минимальный уровень транскрипции любого [c.29]

ТАТА-фактор остветсп связанным с ТАТА боксом г синтеза РНК, что о6легч< ет использование Tt трр многими молекулами РНК полимеразы [c.147]

Рис. 9-69. Минимальные условия для узнавания промотора молекулой эукариотической РНК-полимеразы II. Чтобы промотор был узнан полимеразой, необходимо, чтобы фактор связывания с ТАТА-боксом (TFIID) образовал стабильный транскрипционный комплекс Консенсусная последовательность ТАТА-бокса следующая T82AQ7T93A85 (А или Т)8з числа указывают на вероятность (в процентах) присутствия указанного

Использование всех этих методик позволило идентифицировать регуляторные области эукариотических генов даже в отсутствие каких-либо прямых данных о связывающихся с ними белках-регуляторах. Оказалось, что участок ДНК вблизи сайта инициации синтеза РНК чрезвычайно важен для успешной транскрипции (элемент, расположенный перед промотором). Обычно он насчитывает в длину около 100 нуклеотидных пар и включает в себя ТАТА-бокс. Еще большее удивление вызвал тот факт, что для эффективной транскрипции нужны последовательности, довольно значительно удаленные от промотора (энхансеры). Как и в случае сайта связывания белка п1гС у бактерий, энхансеры у эукариот воздействуют на транскрипцию, находясь на расстоянии. [c.192]

У многггх эукариотических генов, кодирующих белки и транскрибируемых РНК-полимеразой II, непосредственно перед сайтом инициации транскрипции находится последовательность, называемая ТАТА-бокс . [c.198]

Рис. 39.7. Транскрипция гена тимидинкиназы. ДНК-зависимая РНК-полимераза II связывается с областью, комплементарной ТАТА-боксу, и начинает транскрипцию кодирующей цепи с остатка Т, окруженного пуринами и отстоящего от ТАТА-бокса примерно на 32 нуклеотида. Первый 5 -остаток пурина в первичном транскрипте быстро модифицируется

ЦИИ. Точная транскрипция с этого сайта определяется прилежащей 5 -последовательностью, расположенной на участке 32—16 нуклеотидов от точки инициации. Этот участок содержит последовательность ТАТААААС, которая отчетливо гомологична функционально родственному Прибнов-боксу (ТАТААТ), расположенному обычно на расстоянии около 10 пар оснований от точки начала синтеза прокариотических мРНК. РНК-полимераза II, вероятно, связывается с ДНК в области ТАТА-бокса и начинает синтез РНК примерно через 32 нуклеотида — у остатка тимидина, находящегося в окружении пуриновых нуклеотидов (рис. 39.7). Таким образом, ТАТА-бокс, вероятно, является именно тем сигналом, который указывает, где должна начаться транскрипция. [c.86]

СААТ-бокс ТАТА-бокс транскрипции терминации [c.161]

Элементы промотора гена тимидинкиназы вируса герпеса I ТАТА-бокс, два GС-гексануклеотида с взаимно противоположной ориентацией (стрелки) и ССААТ-бокс. Сайты связывания Sp1 отмечены двумя стрелками. [c.60]

Элементы регуляции транскрипции с промоторов U-PHK. А. Транскрипцию генов, находящихся под контролем промоторов U1-, U2-, U4- и U5-PHK, катализирует РНК-полимераза II. ТАТА-бокс в зтих промоторах отсутствует, зато есть важные проксимальный (PSE) и дистальный (DSE) элементы. Последний содержит G -богатый сайт связывания Spl и октамерный элемент [c.89]

Весьма интересной особенностью левых областей генов U6- и 7SK-PHK является то, что они содержат последовательности, характерные для многих генов класса II (рис. 8.65). Так, у обоих генов между парами оснований —29 и —24 находится ТАТА-бокс, необходимый для эффективной инициации транскрипции. Более того, промоторы генов U6- и 7SK-PHK и промоторы генов других U-PHK содержат сходные элементы между парами —40 и — 50. Кроме того, в пределах нескольких сотен пар оснований левее промоторов генов U6- и 7SK-PHK встречаются элементы, характерные для промоторов и энхансеров генов класса II (разд. 8.3.з) в качестве примера можно привести G -бокс (5 -GGG GG-3 ) и октамер (5 -ATG AAAT-3 ). Насколько необходимы проксимальные и дистальные элементы промоторов и какова их физиологическая роль-неизвестно. Непонятно также, имеет ли какое-либо значение удивительное сходство между левыми регуляторными последовательностями промоторов генов U6- и 7SK-PHK. Вызывает интерес и высокая гомологичность между регуляторными последовательностями, находящимися левее гена U6-PHK, который относится к классу III, и регуляторными последовательностями генов, кодирующих РНК от U1 до U5 и относящихся к генам класса II [c.94]

Связывание нескольких белковых молекул с дистальными знхансерами индуцирует сборку комплексов транскрипции вблизи ТАТА-бокса. При зтом взаимодействие дистальных белков, которые на рисунке расположены справа от сайта инициации транскрипции, с белками, находящимися слева от зтого сайта, становится возможным благодаря изгибанию молекулы ДНК. [c.134]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология