Сайленсер

Названные выше гены в хромосомной ДНК обладают специфическими функциями (средний размер гена оценивают в 1300 пн) Ген-регулятор определяет синтез белка-репрессора, способного связываться с оператором (см ) на ДНК или с РНК, предотвращая соответственно транскрипцию или трансляцию Ген-оператор — участок ДНК, связываясь с которым белок-репрессор предотвращает инициацию (начало) транскрипции на прилежащем промоторе, ответственном за связывание фермента РНК-полимеразы, инициирующей транскрипцию гена На промоторе гена эукариотической клетки имеется специфический локус (участок), в десятки—сотни тысяч раз повышающий число посадок РНК-полимера-зы на промотор ближайшего гена Этот локус называется энхан-сером, или усилителем (от англ enhan er — усилитель) Энхансеры тканеспецифичны Они представляют собой большую разнообразную группу регуляторных элементов клетки Другими словами это элементы позитивного контроля К элементам негативного контроля относятся сайленсеры (от англ silen er — глушитель), угнетающие транскрипцию Энхансеры и сайленсеры обладают только цис-действием, влияя на гены, локализующиеся на той же молекуле [c.159]

Рис. 39.8. Схема организации регуляторных блоков типичного эукариотического гена. В функциональном гене можно выделить регуляторную и структурную области, разделенные сайтом инициации транскрипции (показан стрелкой). Регуляторная область состоит из двух элементов, определяющих базовый уровень экспрессии. Проксимальный элемент, ТАТА-бокс, направляет РНК-полимеразу к сайту инициации транскрипции и, следовательно, определяет точность начала синтеза РНК. Другой регуляторный элемент (upstream) контролирует частоту, с которой происходит инициация транскрипции. Наиболее изученным регуляторным элементом этого класса является так называемый СААТ-бокс, однако в других генах могут использоваться и иные элементы. В регуляции экспрессии участвуют также энхансеры и сайленсеры— элементы, усиливающие или ослабляющие базовый уровень транскрипции, и элементы, регулирующие экспрессию определенных генов в ответ на различные сигналы (включая гормоны, тепловой шок, ионы металлов, некоторые химические препараты). Сюда же относятся и функционально подобные элементы, обусловливающие тканевую специфичность экспрессии генов. Возможно, что два последних блока регуляторных элементов функционально перекрываются (показано соединяющей линией). Зависимость функции элемента данного типа от ориентации указана стрелками. Так, проксимальный элемент обязательно должен быть в ориентации 5 - У. СААТ-бокс и аналогичные ему элементы наиболее эффективно работают в ориентации 5 - 3, но некоторые функционируют в обеих ориентациях. Разорванные линии между квадратами указывают на то, что положения данных элементов относительно сайта инициации транскрипции строго не фиксированы. В действительности элементы регуляции экспрессии могут быть расположены также и правее (т. е. ближе к З -концу) сайта

Сайленсер, вероятно, закрывает участок хроматина у дрожжей [23, 24] [c.203]

Г ены, содержащие гомеобокс, как правило, кодируют белки, локализованные в клеточных ядрах, что нреднолагает их прямое участие в контроле экспрессии генов. Кроме того, последовательность аминокислот, образующая гомеобокс, вероятно, позволяет белкам дрозофилы, которые ее содержат, связываться со специфическими участками ДНК, функционирующими как энхансеры и сайленсеры (разд. 10.2.7) генной экснрессии, в том числе экспрессии других содержащих гомеобокс геиов. [c.131]

Сайленсеры, или ослабители транскрипции [81—83]. Вскоре после энхансеров обнаружили последовательности, по своим свойствам весьма напоминающие энхансеры, но имеющие, так сказать, обратный знак. Это сайленсеры — элементы, угнетающие транскрипцию, элементы негативного контроля. [c.75]

Сайленсеры выявляются по активации транскрипции, после того как из клонированного сегмента генома удаляют определенную последовательность. В настоящее время описан целый ряд последовательностей такого типа. Например, сайленсер перед геном овальбумина кур содержит участок связывания глюкокортикоидного рецептора. В присутствии гормона достигается высокий уровень [c.75]

Сайленсеры обладают многими общими свойствами с энхансерами. Они могут действовать на большом расстоянии от гена. Их ориентацию можно менять, не меняя при этом их действие. Как и энхансеры, они обладают только цис-действием, влияя на гены, находящиеся в той же молекуле ДНК, что и сайленсер. [c.76]

Механизм действия как сайленсеров, так и энхансеров пока не известен. Ряд возможностей рассматривается в гл. 4. [c.76]

Итак, из предыдущих разделов явствует, что в состав типичного гена входят область транскрипции, состоящая из экзонов, интронов и зоны терминации транскрипции, а также различные регуляторные последовательности (энхансеры, сайленсеры и др.), которые чаще всего концентри- [c.77]

О механизме действия энхансеров и сайленсеров [c.191]

Приведенная в настоящей главе информация позволяет высказать предположение о механизме работы энхансеров и сайленсеров, хотя до решения этого вопроса еще далеко. Любые гипотезы должны учитывать, естественно, тот твердо установленный факт, что действие энхансеров и сайленсеров реализуется через их взаимодействие со специфическими регуляторными белками. [c.191]

Одной из первых гипотез было предположение, что энхансеры (для краткости не буду упоминать сайленсеры, но механизм действия для них, очевидно, сходен) являются местами вхождения РНК-полимеразы или факторов транскрипции, которые затем мигрируют по ДНК и находят промотор. Это предположение подкреплялось тем, что если между энхансером и промотором (ТАТА-блок) вставлен дополнительный ТАТА-блок, транскрипция начинает идти с нового ТАТА-блока, а старый выключается. Однако это оказалось далеко не общим правилом. Гипотеза входных ворот плохо объясняет действие энхансеров, расположенных внутри гена или за геном. [c.191]

Очевидно, что имеется много регуляторных белков, взаимодействующих с разными контрольными элементами генов, в том числе энхансерами, сайленсерами и промоторами. Возможно, они взаимодействуют и между собою. Однако остается во многом не ясно, каким образом они усиливают или ослабляют работу гена. [c.194]

По способу регуляции экспрессии генов различают два типа энхансеров. Индуцибельные энхансеры реагируют на изменения в окружающей среде (тепловой шок, вирусная инфекция, появление тяжелых металлов, ростовых факторов, стероидов и т. п.). Такие энхансеры есть у генов белков теплового шока, металлотионина, -интерферона, некоторых онкогенов и др. Т к а -неспецифичные и временные энхансеры активны только в определенных клетках или в определенное время развития организма (например, энхансеры генов иммуноглобулинов). Механизм работы энхансеров заключается в посадке на них специфичных белков, которые за счет образования петель в ДНК взаимодействуют с транскрипционными факторами, связанными с промотором ближайшего гена, увеличивая тем самым число посадок на него РНК-полимеразы П. По-видимому, так же работают и локусы с противоположным эффектом действия — сай-ленсеры (silen er — успокоитель), в присутствии которых транскрипционная активность РНК-полимеразы II уменьшается. У дрожжей аналогами энхансеров и сайленсеров являются последовательности URS и UAS (см. рис. 1.8,6). [c.31]

Корень термина геном отсылает нас только к генам, и геном какого-либо организма обычно рассматривается как полная последовательность нуклеотидов его ДНК, в которой записана информация обо всех генах. Действительно, геномы бактерий и дрожжей состоят преимущественно из кодирующих гены областей. Однако у многоклеточных эукариот гены составляют только малую часть генома. Мы еще далеки от детального знания о негенных элементах генома, определяющих функции гетерохроматина, тело-меры, центромеры, участвующих в процессах компактизации хромосомы, транскрипции, репликации, митоза, мейоза, репарации. В настоящее время наиболее важными задачами являются поиск и характеристика элементов генома, определяющих правильную временную и пространственную экспрессию генов, детальная идентификация энхансеров, сайленсеров, инсуляторов и других регуляторных элементов, а также анализ нуклеосомного и/или хроматинового кода, выявление мест связывания различных белковых факторов с ДНК и хроматином. В дальнейшем мы узнаем больше о таких элементах генома, как, например, гены, кодирующие РНК, которые не кодируют белков, участки начала репликации ДНК и генетические элемен- [c.58]

Комплекс гормон—рецептор взаимодействует со специфической нуклеотидной последовательностью в ДНК — энхансером или сайленсером. [c.109]

Увеличивается (при взаимодействии с энхансером) или уменьшается (при взаимодействии с сайленсером) сродство промотора к РНК-полимеразе. [c.109]

Б. Связывания энхансеров и сайленсеров с комплексами белков-регуляторов и метаболитов или гормонов. [c.361]

Последовательности, регулирующие частоту инициации транскрипции к ним относятся последовательности, ответственные за индуцибельность и репрессию транскрипции, а также клеточную, тканевую и временную специфичность транскрипции. Эти области так разнообразны по строению, положению и функциям, что для них трудно найти одно простое и емкое название. К их числу относятся энхансеры и сайленсеры-последовательности, которые оказывают дистанционное влияние на инициацию транскрипции независимо от своей ориентации относительно точки начала транскрипции (разд. 8.2.в и [c.24]

Чтобы идентифицировать мишени для SIR-белков, были сконструированы делеционные мутанты по клонированным сегментам HML и дрожжевые клетки, несущие различные SIR-мутации, трансформировали каждым из этих клонов (рис. 10.60). Все делеции, захватывающие сегмент длиной 130 п.н. (Е) слева от HML. приводили к блокированию SIR-репрессии. Сходные результаты были получены и для локуса HMR. Е-сегменты можно рассматривать как сайленсеры (разд. 8.3.д) последние обладают свойствами, характерными для энхансеров транскрипции, но они подавляют транскрипцию, а не стимулируют ее. Если Е-элемент инвертируется или перемещается в другой сайт в пределах 2,5 т.п.н. от генов, определяющих тип спаривания, то SIR-репрессия не снимается. Таким образом, Е-элементы, как и энхансеры транскрипции, функционируют в любой из двух ориентаций и могут находиться на значительном расстоянии от соответствующего гена. С помощью аналогичного делеционного анализа были выявлены и другие сегменты (I)-справа от HMLk HMR, также участвующие в SIR-репрессии. [c.282]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология