Доля полиморфных локусов

Шимпанзе в локусе Рдт-1 частота аллеля 96 равна 0,13, аллеля 100 -0,87. Ожидаемая гетерозиготность составляет 0,227. По всем двадцати двум локусам ожидаемая гетерозиготность равна значению, наблюдаемому для локуса Рдт-1 (6/23 = 0,261), деленному на общее число локусов, т.е. 0,261/22 = 0,012 ожидаемая гетерозиготность равна 0,227/22 = = 0,010 доля полиморфных локусов составляет 1/22 = 0,045. [c.296]

Для горилл наблюдаемая гетерозиготность равна 0,055, ожидаемая гетерозиготность-0,047, доля полиморфных локусов 0,136. [c.296]

Какова доля полиморфных локусов у человека Сколько у человека полиморфных генов Составляют ли полиморфные локусы небольшую часть генома человека или их доля высока Группы крови могут быть идентифицированы только в том случае, если к определенным антигенам обнаружены антитела. Серологическое выявление генного локуса обычно заранее предполагает существование генетической изменчивости по данному локусу-наличия полиморфизма или редких вариантов. Выявление генетической изменчивости ферментов [c.281]

Доля полиморфных локусов I средним % гетерозигот [c.285]

Рис. 19. Отношение между долей полиморфных локусов Р и средней гетерозиготностью на локус Я по данным табл. 22 по сравнению с кривой, выведенной на основании нейтральной гипотезы (если считать локус полиморфным на 1%-ном уровне).

Популяция Доля ПОЛИМОрфнЫ> локусов Доля гетерозиготности генома иа особь [c.122]

J — ЧИСЛО известных локусов II — доля гетерозиготности III — доля полиморфных локусов. [c.136]

По самой низкой оценке гетерозиготность на локус равна 10%, а доля полиморфных локусов — 30%. Если принять умеренную оценку величины генома у дрозофилы, которой придерживается балансовая гипотеза, то получится, что ферменты и белки дрозофилы кодируются 10 000 генов. Итак, имеется 3000 расщепляющихся локусов со средней гетерозиготностью на локус 0,10/0,30 — 33% на каждый. Если разные локусы влияют на приспособленность независимо, то средняя приспособленность популяции будет произведением приспособленностей в отдельных локусах, и для генома в целом [c.206]

Одно предсказание, основанное на нейтральности аллельных вариантов, которое нельзя сделать, исходя из балансовой гипотезы, касается отношения между средней гетерозиготностью в популяции и долей полиморфных локусов. Если q — минимальная частота альтернативного аллеля, причем такая, которая позволила бы нам классифицировать локус как полиморфный, то зависимость доли полиморфных локусов Р от гетерозиготности на локус выражается формулой [c.215]

Число выявляемых полиморфных локусов зависит от числа изученных организмов в выборке. Предположим, например, что выборка, использованная при исследовании первой популяции Phoronopsis, состояла из 100 особей. Если бы выборка включала большее число особей, то могла бы обнаружиться изменчивость по некоторым из 12 локусов, оказавшихся мономорфными по нашим данным. Наоборот, если бы было обследовано меньшее число животных, то полиморфизм по некоторым из 18 локусов мог бы не обнаружиться. Для того чтобы исключить влияние объема выборки, необходимо ввести какой-то критерий полиморфности. Один из таких часто используемых критериев состоит в том, что локус считается полиморфным только тогда, когда частота наиболее распространенного аллеля этого локуса не превышает 0,95. Хотя при исследовании большего числа особей могут быть выявлены новые аллели, доля полиморфных локусов в среднем изменяться не будет. Однако выбор критерия полиморфности несколько произволен. При использовании разных критериев получаются различные значения полиморфности. Например, если мы используем критерий полиморфности, по которому частота наиболее распространенного аллеля не должна превышать 98%, то полиморфными оказываются некоторые [c.90]

Ранее в этой главе мы ввели две меры генетической изменчивости Р, доля полиморфных локусов в популяции, или полиморфность и Н, средняя доля гетерозиготных локусов особи, или гетерозиготность. Еще один параметр, используемый для оценки генетической изменчивости, называется эффективным числом аллелей и связан с Я простой зависимостью = 1/(1 - Я). [c.99]

Скрининг многих ферментов, проведенный аналогичными методами, позволяет получить несмещенную оценку доли полиморфных локусов. Такая оценка была получена Харрисом и Хопкинсоном в 1972 г. Эти авторы объединили данные электрофоретических исследований населения Европы примерно по 70 различным локусам, кодирующим ферменты. Число исследованных ферментов было меньше, поскольку один фермент может состоять более чем из одной полипептидной цепи и, следовательно, кодироваться более чем одним геном. Считается, что ген полиморфен, если частота [c.283]

Полиморфизм (Р) популяции оценивается долей полиморфных локусов из всех исследованных. Так, из 30 локусов, изученных у калифорнийского морского червя Phoronopsis viridis, в 18 обнаружены аллельные варианты, а в 12 вариаций не зарегистрировано. В этом случае Р= 18 30= 0,60. [c.464]

Крайне важный аспект, выявленный при генетическом анализе данных, представленных в табл. 19, заключается в том, что изменчивость линий во всех случаях оказалась генотипической и монофакториальной. Иными словами, изменчивость каждого белка и фермента была обусловлена расщеплением аллелей в одном локусе. Этот факт — краеугольный камень метода. Он позволяет нам вычислить частоты аллелей в каждом локусе, а отсюда — гетерозиготность популяции и, что еще более важно, приравнять в первом приближении каждый неизменяющийся белок к какому-либо неизменяющемуся локусу. Если мы не сможем установить такую связь, то вся процедура становится бесполезной для оценки доли полиморфных локусов и величины существующей в популяции гетерозиготности на один локус, так как число моноглорфных локусов останется неизвестным. Поэтому необходимо проводить генетический анализ, особенно принимая во внимание тот факт, что в экспериментальных условиях незначительные вариации в некоторых случаях могут вызвать изменение электрофоретической подвижности и таким образом скрыть или имитировать генотипическую изменчивость (Джонсон, 1971). [c.119]

Доля полиморфных локусов из 18 наученных и доля гетерозиготности генома, рассчитанная в среднем иа особь, в 5 популяциях D. pseudoobs ura (Левонтин и Хэбби, 1966) [c.122]

В табл. 22 суммированы результаты известных мне исследований по аллоферментам, которые, как мне кажется, наиболее полно удовлетворяют требованиям об адекватности и непредвзятости. Ни одно из этих исследований нельзя считать безупречным, и существует много других данных, не включенных в таблицу, которые почти так же хороши. Я произвольно включил только исследования, охватывающие по крайней мере 18 локусов, В таблице дана доля полиморфных локусов, определенная как доля локусов, в которых частота наиболее обычного аллеля не превышает 0,99, и расчетная гетерозиготность на локус на особь в данной популяции. Так как доля полиморфных локусов определялась несколько произвольно и имеет высокую дисперсию (из-за небольшого числа изученных локусов), гетерозиготность на особь — величина более информативная, и те обследования, которые не дают возможности вычислить эту величину, в таблицу включены не были. [c.126]

Первоначальные данные, полученные Левонтином и Хэбби и Харрисом, полностью подтвердились. У десяти с лишним видов, перечисленных в табл. 22, в отдельных популяциях расщепляется от 20 до 86% локусов и гетерозиготность на особь колеблется в относительно узких пределах, между 5,6 и 18,4%. Усредненная доля полиморфных локусов составляет 30%, а усредненная гетерозиготность на особь—10,6%. Эти значения для человека лежат несколько ниже, а для D. pseudoobs ura — несколько выше усредненной изменчивости. Таким образом, мы не слишком далеко уйдем от истины, если охарактеризуем виды [c.126]

Вид Число изученных популяций Число локусов Доля полиморфных локусов на популяцию Гетероз-чгот-ность на локус Стандартная ошибка гетерозигот- ности Источник данных [c.127]

Наиболее убедительны три сообщения о низкой гетерозиготности. Выборка по всему географическому ареалу лягушки-сверчка A ris repitans) в США показала, что это политииич-ный вид, не обладающий, однако, значительной гетерозиготностью (Дессауэр и Нево, 1969). Так, из 20 изученных белков и ферментов 12 были изменчивы у вида в целом, хотя в большинстве из 27 популяций закрепился или почти закрепился ка-кой-либо один аллель. Доля полиморфных локусов на популяцию составляла в среднем только 12%, а 4 локуса были полностью гомозиготны в отдельных популяциях, но различались у разных популяций. На основании распространения [c.131]

Ни по одному из рассмотренных видов, за возможным исключением A ris repitans, имеющиеся данные не достаточны для того, чтобы можно было достоверно считать его более гомозиготным, чем виды, перечисленные в табл. 22. Вспомним, что D. simulans на основании ранних менее обширных исследований можно было бы считать мономорфным видом. Я снова должен подчеркнуть, что мы еще не можем сравнивать уровни гетерозиготности у разных видов, будучи вполне уверены в реальности наблюдаемых различий. Столь разные в физиологическом, эволюционном и экологическом отношениях виды как человек, мышь и филогенетический реликт — мечехвост Ыти-lus), действительно идентичны как по доле полиморфных локусов, так и по средней гетерозиготности на особь. [c.132]

Вид Число локусов Доля полиморфных локусов г етерози-готность Источник данных [c.135]

Полиморфность — средняя доля полиморфных локусов. Следует подчеркнуть, что конкретные значения этих показателей зависят от методов выявления генетической изменчивости. [c.177]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология