Выявление редких вариантов

Какова доля полиморфных локусов у человека Сколько у человека полиморфных генов Составляют ли полиморфные локусы небольшую часть генома человека или их доля высока Группы крови могут быть идентифицированы только в том случае, если к определенным антигенам обнаружены антитела. Серологическое выявление генного локуса обычно заранее предполагает существование генетической изменчивости по данному локусу-наличия полиморфизма или редких вариантов. Выявление генетической изменчивости ферментов [c.281]

Это смещение исчезло бы, однако, если бы можно было обследовать достаточное число лиц, потому что любой локус, контролирующий группу крови, предположительно может мутировать и в конце концов будет обнаружен как редкий вариант. Сначала, когда реакции перекрестной агглютинации проводились только у небольшого числа людей, выявлялись лишь наиболее полиморфные локусы, но по мере увеличения числа тестов и выявления все большего числа относительно инвариантных локусов кумулятивная оценка генотипической изменчивости должна понижаться. [c.135]

Мы всегда пытаемся правильно оценивать значение теории в химии. В принципе химия представляет собой экспериментальную науку, поэтому задачей теоретической химии является, с одной стороны, интерпретация проведенных экспериментов, а с другой — выявление новых направлений в практических исследованиях. Мы считаем, что заслуживают рассмотрения те квантовомеханические методы, которые соответствуют изучаемой проблеме, при этом редко приходится обращаться к самым совершенным из известных методов — как правило, достаточно ограничиться менее трудоемкими. По этой причине в данной книге сделана попытка познакомить читателей-химиков с различными вариантами методов, которыми располагает современная теория. [c.7]

Анализ кривых распада, полученных в режиме интегрального счета без какой-либо дискриминации излучения (счетчик Гейгера— Мюллера, сцинтилляционные счетчики и т. д.), теперь используется довольно редко. В таком варианте он полезен только при определениях основных компонентов пробы (прн содержании более 0,01%), и лишь в особо благоприятных случаях граница сдвигается в область более низких концентраций. Иногда метод анализа кривых распада применяют для контроля радиохимической чистоты выделенных препаратов. Ири этом метод довольно чувствителен к посторонним радиоактивным примесям с отличающимся периодом полураспада, присутствие которых нарушает линейный ход кривой распада, изображенной в полулогарифмическом масштабе. Однако, если облучение какого-либо элемента приводит к образованию двух или более радиоизотопов, то способность метода к выявлению слабых посторонних радиоактивных примесей падает. [c.202]

Существуют различные возможные варианты отбора признаков, которые будут выявляться в ходе такого мониторинга. Можно, например, проводить скрининг на некоторые сторожевые мутации-доминантные мутации, дающие специфические фенотипы, для которых довольно хорошо известны частоты спонтанных мутаций (табл. 5.8). Однако число индивидов, которых необходимо обследовать, составляет несколько миллионов мутации, приводящие к специфическому фенотипу, редки и их выявление вызывает трудности, связанные с диагностикой. Необходима высококвалифицированная медицинская экспертиза, чтобы исключить фенокопии. Хотя у нас есть возможность получить надежную оценку порядка величины частоты мутаций, получение достоверной оценки ее увеличения представляет большие трудности. Возможная альтернатива заключается в проведении скрининга на геномные и хромосомные мутации. Технически такая задача была бы намного проще, поскольку мутации указанных типов встречаются чаще, но этот подход не дает информации о генных мутациях. [c.273]

Редкие варианты. В работе Харриса [1787] лимитирующая частота наиболее распространенного аллеля, определяющая условие генетического полиморфизма, была принята равной 0,99. Однако для мно1 их ферментов известны редкие варианты. Зачастую редкие варианты присутствуют в популяции наряду с распространенными аллелями, однако для многих локусов известны только редкие варианты, а распространенные аллели отсутствуют. Частота и распространение редких вариантов в европейских популяциях исследованы Харрисом [1788]. Вероятность выявления редких вариантов зависит от величины выборки для этой цели необходимо проанализировать выборку из нескольких сотен особей. Такие выборки были исследованы для 43 локусов, кодирующих ферменты. Редкими считались варианты, частота которых не превышала [c.285]

Выявление биохимических вариантов позволит увеличить число информативных семей. Для выявления биохимических вариантов можно использовать маркеры, принадлежащие к любым полиморфным системам. Как было показано выше, в случае Х-хромосомы учитывали полиморфизм по цветовой слепоте и по группе крови Xg. Описанный подход имеет то преимущество, что он основан на данных о точно идентифицированных аллелях, частоты которых известны. Недавно был получен ДНК-зонд, специфичный для 21-й хромосомы и пригодный для выявления полиморфизма по сайтам рестрикции (ПДРФ). При изучении 25 человек из популяции Лондона частота более редкого аллеля оказалась равной 0,38, а частота гетерозигот-0,47 [1433]. [c.152]

Большинство мутантных типов нельзя выявить методами прямого отбора, описанными в предыдущем разделе. Для любой мутации, связанной с потерей генетической функции, требуются такие методы выявления, которые позволили бы идентифицировать очень редко возникающий тип мутанта на большом фоне немутантных клеток. В эту группу входят ауксотрофные мутанты, мутанты с изменениями в системе сбраживания углеводов, морфологические варианты различных типов и другие условно летальные мутанты. [c.35]

Характеристика различных вариантов G6PD. В популяциях человека выявлен целый ряд редких типов G6PB. В связи с этим встал вопрос о необходимости стандартизации приемов их классификации Рекомендации группы специалистов в этой области были опубликованы Всемирной организацией здравоохранения в 1967 г. [c.24]

Характер расщепления фрагментов ДНК в методе секвенирования путем химической деградации таков, что для чтения последовательности с радиоавтографа геля наиболее оптимальным вариантом является такой, когда при нанесении на гель одна дорожка (обычно первая) соответствует гуанину, вторая - пуринам, третья - пиримидинам и четвертая - цитозину (рис. 6.1). Таким образом, две средние дорожки содержат большее (кроме потенциально возможных частных случаев) число полос, чем крайние дорожки, поскольку в них видны фрагменты ДНК, ограниченные нуклеотидам и О, А и С, Т соответственно. Таким образом, эти две средние дорожки (О + А и С + Т) вместе содержат все полосы частичного расщепления меченой по одному из концов молекулы ДНК, Правильное прочтение полос, видимых на радиоавтографе геля, заключается, во-первых, в определении вертикальной позиции каждой конкретной полосы, соответствующей тому или иному нуклеотиду, относительно полос в соседних дорожках, относящихся к одному и тому же образцу ДНК, и, во-вторых, в выявлении типа нуклеотидов, к которому принадлежит данная полоса. Так, например, если полоса имеется только во второй дорожке - то это аденин, поскольку для другого пуринового основания - гуанина будет характерно наличие двух полос в первой О-дорожке и совпадающей с ней полосой во второй О + А-до-рожке. Аналогично проводится и чтение пиримидиновых оснований, где полоса только в третьей дорожке указывает, что это тимин, а если эта же полоса имеется и в четвертой дорожке, то тогда это цитозин. Что касается более редко используемых реакций, приводящих к выявлению полос ДНК по типу А > С, А > О, 6 > А, С > Т, то в таких случаях требуется более сложное сопоставление наличия или отсутствия полос в соседних треках. Анализируя таким образом полосы одну за другой и поднимаясь вверх по радиоавтографу, необходимо достигнуть места, где полосы в соседних дорожках расположены так близко друг к другу, что уже невозможно различить их вертикальную последовательность. После этого чтение нуклеотидной последовательности фрагмента ДНК с данного радиоавтографа можно считать законченным. Если же этот образец был нанесен на гель дважды, то для ранее нанесенного препарата на радиоавтографе будут видны фрагменты ДНК большего размера. В таком случае надо найти перекрывающиеся участки (что гораздо легче сделать, если в секвенируемой последовательности ДНК содержатся какие-нибудь характерные участки как, например, ААААОСАААА или им подобные, хорошо заметные глазом) и продолжить чтение данного образца ДНК, пока позволяет достигну- [c.199]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология