Дактилоскопия геномная

Что такое геномная дактилоскопия и как ее используют для характеристики следовых количеств ДНК в судебной медицине [c.203]

П.А. Геномная дактилоскопия гипер- льные локусы и генетическое марки-г // Молекулярная биология, 1989. — [c.13]

Таким образом, используя один зонд, можно одновременно наблюдать за наследованием большого количества аллелей. Эволюционная нестабильность, вследствие которой эти последовательности гипервариабельны, не настолько велика, чтобы затруднить сегрегационный анализ, поэтому метод геномной дактилоскопии может быть применен при изучении генетического сцепления [16]. Индивидуальный характер гибридизационной картины позволяет использовать метод в судебной медицине и применять его в качестве инструмента, с помощью которого с высокой степенью достоверности могут быть уточнены структуры родословных. [c.192]

Гибридизационные зонды для геномной дактилоскопии [c.192]

С обзором методов гель-электрофореза можно познакомиться в работе [19]. Однако полезно все же вкратце выделить специфические условия, повышающие эффективность анализа методом геномной дактилоскопии. [c.199]

Метод геномной дактилоскопии с использованием М13 [c.203]

Использование метода геномной дактилоскопии в анализе генетического сцепления [c.204]

Недостаток больших родословных для рецессивно наследуемых признаков, конечно, ограничивает применение метода геномной дактилоскопии, но не исключает полезность его использования для анализа рецессивных болезней. Если в родословной имеются близкородственные браки, возможно также картирование по гомозиготности [27]. Суть этого метода в следующем если оба родственных индивида несут редкий рецессивный ген то вероятнее всего они унаследовали его от единого предка [28]. Если индивиды находятся в достаточно далеком родстве, то общие для них последовательности будут составлять лишь малую долю генома. К тому же поскольку аллельные частоты фрагментов, образующих полосы в отпечатках (особенно боль-. ших фрагментов), очень малы, то маловероятно, что в геноме родственников эти фрагменты совпадут, если они произошли от разных предков. Если при близкородственном скрещивании больные дети имеют общую для их геномных отпечатков полосу в удвоенном количестве, а здоровые дети наследуют одинарную дозу или вовсе не имеют этой полосы, то тем самым подтверждается гипотеза о физическом сцеплении между участком, ответственным за признак, и данной полосой. Условившись об аллелизме, можно подсчитать шансы на сцепление, но, как уже отмечалось, для подтверждения или опровержения наличия сцепления фрагмент необходимо клонировать. [c.206]

Метод геномной дактилоскопии представляет собой удобный инструмент для быстрого анализа генома на предмет идентификации в нем соматических изменений. Этот подход нашел применение при сравнении лейкоцитарной и конституционной ДНК после пересадки костного мозга, а также три анализе ДНК опухолевой и нормальной тканей [34, 35]. [c.212]

Метод геномной дактилоскопии (ДНК-типиро-вание) часто используется в судебной медицине для идентификации биологических образцов. С его помощью можно доказать, что подозреваемый действительно совершил преступление, или, напротив, что он невиновен. Для проведе- [c.192]

ДНК-отпечаток данного индивида представляет собой набор различающихся по длине фрагментов, соответствующих минисателлит-пым последовательностям его генома. Ввиду большого разнообразия этих повторов вероятность того, что в популяции найдется два человека с идентичными ДНК-отпечатками , равна 10 -10 . Другими словами, характер расположения полос минисателлитных ДНК почти столь же индивидуален, как и отпечатки пальцев. Геномную дактилоскопию применяют также при установлении отцовства. Часть полос [c.193]

В судебной медицине все более широкое применение находит метод геномной дактилоскопии, основанный на том, что ДНК каждого человека образует уникальный набор гибриди-зационных полос. При этом в качестве зондов обычно используют минисателлитные ДНК человека, которые не кодируют никаких белков и отличаются высокой вариабельностью. [c.202]

Более удобными для генетических исследований и широкомасштабного секвенирования часто оказываются контиги из небольших фрагментов ДНК, чем из крупных. Для построения контигов определенных районов хромосом или целых хромосом нередко используют космидные библиотеки. Обычно перекрывающиеся космидные клоны идентифицируют методом геномной дактилоскопии. Для этого из каждого клона экстрагируют ДНК и обрабатывают ее рестриктазой. Полученные фрагменты метят, разделяют при помоши электрофореза и визуализируют радиоавтографическими методами. Каждый клон порождает специфический набор фрагментов - уникальный отпечаток его ДНК у перекрывающихся клонов один или несколько фрагментов совпадают. [c.463]

ПЦР. Разработаны тест-системы для ПЦР, позволяющие выявлять до 40 видов грибов, включая все клинически важные виды. Например, тест-системы для выявления ДНК andida albi ans позволяют обнаружить 10—100 клеток возбудителя на 100 мкл биологического материала. С помощью геномной дактилоскопии ДНК в ПЦР проводят также типирование штаммов С. albi ans. [c.318]

В 1980-х годах наблюдштся взрыв интереса к генной инженерии. Промышленные компании начали вкладывать миллиарды долларов не в теоретическую молекулярную биологию, а в решение прикладных задач. Родилась новая индустрия — биотехнология. В данной главе и в гл. 12 рассматриваются некоторые примеры применения биотехнологии в сельском хозяйстве, медицине, промышленности, а также при переработке отходов в конце данной главы обсуждаются такие важные аспекты биотехнологии, как генная терапия и геномная дактилоскопия. [c.240]

Классические методы идентификации личности, основанные на сравнительном анализе морфологических признаков, изучении минерального состава костей скелета и применение других специальных технологий, имеют предел идентификационных возможностей. С развитием методов молекулярной генетики появилась перспектива существенно расширить возможности судебно-медицинской идентификации посредством использования методов ДНК-анализа. В 1985 году Джеффрисом был предложен первый метод, позволяющий проводить генетическую идентификацию биологических объектов судебной экспертизы, получивший название геномная дактилоскопия по аналогии с классической дактилоскопией [1, 2]. Этот подход основан на существовании в геноме человека ги-первариабельных районов (ГВР) ДНК, обладающих свойствами структурного полиморфизма и [c.8]

Предлагаемый вниманию читателей сборник Анализ генома ПОД редакцией К. Дейвиса — еще одна книга из прекрасно зарекомендовавшей себя серии А Pra ti al Approa h . В ней описаны новейшие молекулярно-биологические методы переноса генов в клетках млекопитающих, рестрикционного картирования, конструирования библиотек прыжков , полимеразной цепной реакции и др. Иными словами, в эту книгу включены те методы, которые позволяют существенно продвинуться в понимании структуры и функционирования генома, разобраться в механизмах наследственных болезней человека. Особого внимания заслуживает материал, изложенный в двух последних главах. Одна из них (гл. 7) посвящена геномной дактилоскопии, методу, перевернувшему представления о возможностях судебно-медицинской экспертизы в другой (гл. 8) речь идет о картировании генов, ответственных за некоторые наследственные болезни человека, с помощью анализа ПДРФ-маркеров. Как всегда в книгах этой серии непосредственному описанию каждой методики предшествует краткое теоретическое введение, делающее ее понятной и начинающему аспиранту, и опытному исследователю. [c.5]

ДНК, получаемая обычным способом [20], обладает достаточно хорошим качеством для проведения анализа методом геномной дактилоскопии. Наилучшие результаты получают, если на дорол<ку приходится 1—5 мкг ДНК. Поскольку имеет значение не только присутствие, но и интенсивность отдельной полосы, важно достичь равномерного распределения материала между всеми дорожками геля. Хорошо известно, что измерения оптической плотности растворов ДНК дают ненадежные значения концентраций, которые могут рассматриваться только как грубые оценки. Для проверки полноты рестрикции и правильности нанесения необходимо поставить контрольный форез с аликвотами гидролизата ДНК и на основе этого подобрать оптимальное количество наносимой пробы. [c.200]

Оптимальные условия электрофореза для геля, используемого при геномной дактилоскопии, определяются требованиями к информативности получаемых отпечатков ДНК. Если данные необходимы для подтверждения структуры родословной или для окончательного уточнения картины в случае неудачно прошедшей гибридизации, или для сравнения образцов ДНК из разных тканей индивида, то желательно получить информацию о возможно большем числе полос, поддающихся разрешению. Для этих случаев наиболее удобно использовать 1%-ный агарозный гель и вести форез при 2 В/см в течение 48 ч с двумя сменами форезного буфера. Такие условия обеспечивают разрешение полос в диапазоне 2—25 т.п.н. Для сегрегационного йнализа более важно достичь хорошего разделения наиболее высокомолекулярных гиперполиморфных фрагментов. В этом случае следует вести форез в 0,8%-ном геле при 1,5 В/см в течение 72 ч с [c.200]

Рис. 5. Применение метода геномной дактилоскопии для сравнения ДНК из нормальной и неопластической тканей. На автографе представлены образцы ДНК, выделенной из периферической крови (В), нормальной слизистой (М) и опухолевой ткани (Т), полученных от трех больных с злокачественными опухолями желудочно-кишечного тракта. ДНК (Ю мкг) была гидролизована Hinll и разделена электрофорезом в 1,0 /о-ном агарозном геле при 2 В/см в течение 48 ч, после чего перенесена на найлоновую мембрану и гибридизо-вана с пробой на основе минисателлита 33.15. У первого пациента в отпечатке опухолевой ДНК наблюдается отклонение от нормы в виде двух новых полос (а, Ь). У второго пациента полоса (с) присутствует в ДНК лейкоцитов периферической крови и в ДНК нормальной слизистой толстой кишки, но отсутствует в ДНК, выделенной из клеток опухоли толстой кишки. У третьего пациента новая полоса (d) появилась в отпечатке ДНК, выделенной из клеток опухоли желудка. Как и ожидалось, отпечатки ДНК нормальных лейкоцитов и ДНК клеток нормальной слизистой не отличаются, В трех случаях появление новой полосы сопровождалось падением интенсивности высокомолекулярной полосы, следовательно, механизм появления новой полосы в субпопуляции опухолевых клеток может заключаться в неравном кроссинговере, приводящем к потере родительским аллелем нескольких копий повтора и, следовательно,

Справочник химика 21

Химия и химическая технология