Маркуша структуры

Строки таблицы связей могут содержать и дополнительную информацию, например о чередующихся связях, циклических и нециклических структурах, стереохимии, о положении различных заместителей. Для описания положения заместителей применяют структурные формулы Маркуша. [c.586]

Нередко структуры Маркуша приводятся и в статьях, в которых в целях экономии места указывается общий фрагмент и затем перечисляются его конкретные реализации. Структуры Маркуша прочно вошли в графический язык структурных формул современной органической химии. Естественно, что в крупномасштабной ИПС для органической химии необходимо предусмотреть языки и алгоритмы, предназначенные для оперирования со структурами Маркуша. Однако графический язык структур Маркуша богаче языка обычных индивидуальных структурных формул. Это различие в выразительности графических языков обусловливает и различное отношение их к технологической схеме автоматизированной ИПС для органической химии. Если индивидуальные структурные формулы служат лишь объектом поиска, то структуры Маркуша помимо этого могут также использоваться в самой технологической схеме ИПС. Язык записи структур Маркуша может выполнять четыре функции [86], используясь в автоматизированной ИПС в качестве входного языка (языка для ввода в ЭВМ структур Маркуша из патентов, статей, монографий и т. д.) языка запросов языка сжатого хранения структурной информации языка поиска. [c.137]

Пример отображения структур Маркуша [c.139]

Несмотря па обширные исследования в области полных систем кодирования, интерес к фрагментарным неполным системам кодирования сохраняется, что объясняется рядом причин [56] использованием в неполных фрагментарных системах естественного языка химика (членение на фрагменты и регистрация вхождения тех или иных фрагментов привычна для химика) высокой приспособленностью к решению специальных задач в относительно узких областях органической химии возможностью использования простого оборудования (например, перфокарт) высокой приспособленностью к обработке информации о структурных классах, в частности структур Маркуша, часто встречающихся в химических патентах. [c.84]

ЯЗЫК для ЗАПИСИ ОБОБЩЕННЫХ СТРУКТУРНЫХ ФОРМУЛ ОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ С ВОЗМОЖНОЙ ДЕЛОКАЛИЗАЦИЕЙ АЛЬТЕРНАТИВНЫХ ФРАГМЕНТОВ (СТРУКТУР МАРКУША) [c.137]

Использование языка структур Маркуша в качестве языка запросов позволяет сформулировать запрос химика в компактной графической форме. Помимо этого структуры Маркуша могут использоваться в системе внутримашинной организации массива структурной химической информации. [c.137]

Запись ациклических фрагментов (правило А). При кодировании структур Маркуша с ациклическими альтернативными фрагментами последние записываются в квадратных скобках после номера кольца, к которому они относятся, причем индивидуальные группы разделяются знаком V, а после символа ) ставится помер вершины г,. .., ч , к которому относится ациклический фрагмент (правило А, структура а) [c.141]

Одним из основных вопросов, связанных со структурами Маркуша, является вопрос о степени их неопределенности. Этот вопрос неоднократно привлекал внимание химиков, патентоведов, юристов, связанных с патентным правом, и т. д. [c.137]

Общеизвестно, что многие химики скептически относятся к информационной ценности структур Маркуша, приводимых в патентах, считая их виртуальными , умозрительными структурами. Многие химики полагают, что из патентов следует отбирать в качестве структурной информации лишь конкретные реализации. Обычно химики склонны относиться с доверием к таким структурным реализациям, для которых приводится какая-либо характеристика, например точка плавления, цвет, подтверждающая, подчеркивающая сам факт существования данной конкретной структуры. Подобное априорное сужение объекта интереса химика-синтетика можно понять. [c.138]

При разработке языка для линейной записи структур Маркуша необходимо выбрать некоторую модель этих структур. [c.138]

Примем простую модель [86] структуры Маркуша, позволяющую реализовать язык с несложной грамматикой. Условно обобщенную структурную формулу Ь можно рассматривать как результат преобразования некоторой исходной обычной структурной формулы Ь с помощью оператора вариации Ь = Рг Ь (аь Ь , где Р — оператор вариации Ь (аь 1) [c.139]

При этом разработка языка сводится к нахождению простых грамматических средств, отображающих вариацию содержания и локализации четырех основных классов фрагментов — гетероатомов, заместителей, кольцевых систем и связок. Будучи ориентированным на основные типы структур Маркуша, рассматриваемая модель, не претендует на охват всех мыслимых типов изображений структур Маркуша. Более того, подобная постановка задачи была бы некорректной, поскольку химики не ограничены какими-либо жесткими правилами графической записи структур Маркуша. По этому поводу не существует каких-либо международных соглашений, что приводит к большому многообразию форм записи. Анализ патентов показывает, что в целом ряде случаев структуру Маркуша можно записать гораздо проще способа, которым она бывает записана. Из теоретико-графовых соображений очевидно, что должен существовать некоторый минимальный базовый набор лексических средств и грамматических правил, позволяющий с максимальной экономностью изображать в графической форме практически любые определения структурных классов. В этом смысле разнообразие используемых в патентах графических изображений (в особенности излишняя многоступенчатость типа — А — [c.139]

Для отображения подавляющего большинства типов структур Маркуша достаточно использовать 81 значений функции делокализации = Ь] . [c.139]

В ходе поиска среди структурных формул часто требуется найти не индивидуальное вещество, а целый класс родственных структур. Описание таких (так назьшаемых родовых) классов легко осуществить с помощью структурных формул Маркуша (пример на рис. 13.2-5). Такая формула содержит ядро , в котором природа и расположение атомов четко определены, и по крайней мере один из заместителей, природа которого может быть дополнительно конкретизирована. Результатом поиска являются целые классы соединений. Такая процедура бывает особенно важна в патентном деле, поскольку в патентной заявке часто содержатся лишь общие указания о природе вещества. Впервые в 1923 г. целый класс химических соединений был запатентован Юджином А. Марку-шем, в честь которого и назван этот тип структурных формул. [c.586]

Значение Ь1 (условно назовем его левым предельным значением ) соответствует нулевой делокализации фрагмента. При отсутствии вариации самих фрагментов в этом случае реализуются обычные структурные формулы, как частный предельный случай структур Маркуша. [c.140]

Описание языка для записи структур Маркуша на основе системы ПИК [c.141]

Хотя описанный язык разрабатывался для специализированной автоматической ИПС для класса ароматических соединений, приведенная классификация структур Маркуша и общий подход к их записи приложим и к языкам для универсальной ИПС. [c.144]

В структурном поиске используют названия соединений и их фрагментов, молекулярные формулы и фрагменты, молекулярную массу, содержание элементов, класс соединения, группу периодической систе.мы. Эти текстовые элементы могут в ходе поиска комбинироваться с чисто структурными элементами, что облегчает поиск определенной части молекулярной структуры. Структурные индексные файлы позволяют также вести патентный поиск по формулам Маркуша. Поиск можно проводить с использованием графического или текстового терминала, так же как и в случае телесистемы DAR . [c.326]

Химические формулы кодируются в настоящее время главным образом с помощью линейной индексации Висвессера. Недостатки этой системы заключаются в том, что участки структурных формул обозначаются неоднозначно и неудовлетворительно описываются формулы Маркуша. (Формулы Маркуша-это структурные формулы органических соединений, в которых определенные детали, например вид и место функциональных групп, строго не фиксируются. Из-за этого их охотно используют в патентной литературе.) В системе Гремас, разработанной в ФРГ (фабрика красок Хохст ), атомы углерода цепи обозначаются иначе, чем атомы углерода, связанные с функциональной группой, причем используются трехбуквенные символы (троичные термы). Таким образом, по этому коду можно осуществить поиск и частичных структур, и отдельных участков структурных формул. Эффективность информационного поиска с помощью указанных кодов довольно высока в среднем на каждые десять публикаций приходится одна, в которой не затрагивается конкретно интересующая проблема. Если все же требуются дополнительные уточнения, то помощь в этом может оказать топологический код. В нем детально фиксируются все атомы, входящие в структуру, а также все связи между атомами, т.е. каждая структура описывается совершенно однозначно. Однако для этого потребуется больше машинного времени, и, следовательно, информационный поиск обойдется дороже. Поэтому такой код применяют не ко всему информационному массиву, [c.107]

Если достаточно отразить только класс соединения, то часто используют сокращенные обозначения, в которых выделяется лищь функциональная группа, а остальная часть записывается в виде условной буквы или группы букв, например Alkyl—NHj, R—NH2. Это и есть частичные структуры-разновидность формул Маркуша. [c.107]

Структуры Маркуша получили свое наименование по фамилии химика Маркуша, составившего в 1925 г. заявку на патент, в которой использовалось выражение соединение, выбранное из группы, включаюш ей ана-лин и гомологи анилина . Позднее были выработаны различные приемы графического обозначения семейства соединений в виде одной структурной формулы с указанием альтернативных фрагментов, а также делокализации этих фрагментов. Особенно широкое распространение получили структуры Маркуша в патентах США, ФРГ, Англии и т. д. [c.137]

Сущность вопроса заключается в том, что одна структура Маркунш в том виде, в котором она обычно приводится в патентах, может охватывать очень большое число соединений. Рассмотрим, например, структуру Маркуша (рис. 56), где R = Н, О — Alk, О — Alk, — О — Alk, N (А1к)а, Alk ОСОСНз циклоалкилокси, фенил, причем эти группы могут содержать [c.137]

Однако отношение информатора к структурам Маркуша должно быть иным. При наличии хотя бы теоретической возможности соответствия данного объекта запросу указанный объект должен быгь рассмотрен ИПС и информация о нем должна быть выдана потребителю. [c.138]

В явных списках перечисляются конкретные фрагменты (например, X = СНз или С2Н5 или...). Очевидно, что при отсутствии делокализации и при использовании явных списков мы получаем обычно применяемый в статьях вариант сжатой записи структур. В этом случае структура Маркуша не содержит никакой неопределенности и является лишь средством компактного графического изображения структурного класса. [c.140]

Обозначения В1. Если в определение структуры Маркуша входят частично недетерминированные словесные обозначения групп, то наиболее распространенным понятиям ставятся в соответствие двухбуквеи-ные символы, составленные но ассоциативному принципу — по буквам русских слов, в частности гт (гетероциклический), ар (ароматический), нс (насыщенный), зм (замещенный), ал (алкил), аф (алифатический), вр (водорастворимый), кр (кислоторастворимый), ви (водонерастворимый), ки (кислотонерастворимый), эд (электронодонорный), эа (электроноакцепторный). [c.143]

Если в структуре Маркуша обобщенный частично не детерминированный фрагмент указан в виде перемычки, соединяющей две последовательно расноло/кенные в цикле вершины, то после записи других фрагментов кольца ставится символ К и далее онределение обобщенной группы записывается в соответствии с указанным выше правилом в виде формального заместителя (см. пример на правило В1, структуру б). [c.144]

В общем по сравнению с основными правилами кодирования обычных структур по системе Висвессера правила кодирования структур Маркуша следует признать несложными. [c.146]

В некоторых случаях при углубленном исследовании отдельного соединения не вся биологическая информация запоминается. Это наблюдается, в частности, в ситуациях, когда имеется семейство родственных соединений, испытанных с помощью одной и той же стандартной методики. В систему вводятся структурные формулы всех новых соедипений, которые синтезировались в фирме с целью биологического испытания. Кроме того, в систему вводится структурная информация из литературных источников, представляющая интерес для фирмы. При этом рассматриваются только однозначно определенные соединения (структуры Маркуша не вводятся). В BF применяется поатомная система кодирования тппа описанной Горовитцем и Крайнем [34], Вальдо [33] и др. Скорость кодирования в среднем 40 соединений в час. Специальная программа выявляет ошибки кодирования. Для автоматического вывода структурных формул па печать используется высокоскоростное печатающее устройство IBM1403A N1, в котором применены некоторые дополнительные специальные химические символы. [c.188]

А. Гейвандов. Язык для записи обобщенных структурных формул органических соединении, содержащих альтернативные долокализованные фрагменты (структур Маркуша).— НТИ, сор. 2, 1972, № 10. [c.303]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология