Поиск структурных формул

Прежде чем начать поиск конкретных методик получения того или иного препарата, являющегося полупродуктом в многостадийном синтезе, необходимо составить схему синтеза. Обычно при составлении схем рекомендуется записывать структурные формулы исходных и промежуточных продуктов. В схеме следует обозначать только главный продукт (после стрелки) и исходный (перед стрелкой). Побочные продукты в генеральной схеме записывать не следует. Реагенты, катализатор и условия указывают над и под стрелкой. В тех случаях, когда реакция сопровождается окислением или восстановлением, но окислитель или восстановитель еще не известны или это не принципиально, то окисление принято обозначать символом атома кислорода в квадратных скобках [01, восстановление—символом атома водорода 1Н1. Обычно такие обозначения приводятся в схеме синтеза над стрелкой. Для обозначения повышенной температуры принято ставить латинскую букву ( или греческую А (дельта) если синтез проводится при повышенном давлении, то рядом с условным обозначением температуры ставят символ р. Если катализатором реакции является металл или молекула определенного химического вещества, то, как правило, над стрелкой пишется химический символ этого металла или формула катализатора, при кислотном катализе — символ Н при щелочном — ОН . [c.85]

С 1861 г., т. е. с момента опубликования А. М. Бутлеровым статьи О химическом строении тел , начались непрерывные поиски изображения структурных формул молекул. Оказалось, что для изображения молекул алканов, алкенов, алкинов, алленов не существует проблем. Здесь достаточно эффективны классические формулы строения — плоскостные формулы Бутлерова, пространственные формулы Вант-Гоффа, конформащгонные проек-щш Ньюмена, зеркально-симметричные проекционные формулы Фишера для оптических изомеров. Перечисленные способы изображения геометрического и электронного строения молекул пригодны также для всех функциональных производных вышеперечисленных углеводородов, если только функциональные группы не дают сопряженных химических связей. [c.76]

Информационно-поисковые системы предназначены прежде-всего для помощи в проведении анализа и описания элементов, содержащихся в устройстве, запоминающем информацию, а также для поиска среди совокупности элементов и их выборки в ответ на запрос пользователя. В общем случае поисковая система осуществляет четыре основных типа деятельности информационный анализ, организацию информации и ее поиск, формулирование запроса и выборку (или распространение) информации. Введение в основные принципы хранения информации и поисковых систем содержится в работе [1], а один из первых примеров простой поисковой системы химической информации описан в работе [2]. Такая система, основанная на использовании списков структур, допускала четыре основных типа запроса молекулярная формула, структурная формула,, структурные фрагменты и различные описательные ключи. После появления этой работы в литературе был описан ряд хи- [c.408]

Итак, органическая химия почти не использует традиционный математический аппарат, во-первых, за ненадобностью, а во-вторых, потому, что взамен она сумела создать свой собственный, специализированный аппарат — символику структурных формул и правил манипулирования с ними, и этот аппарат адекватен задачам нашей науки, гарантируя точность и строгость обработки информации и получения безукоризненных выводов. Между прочим, разборка связей, поиск подходящих синтонов и весь ретросинтетический анализ представляет собой дальнейшее специализированное развитие этого аппарата, подчиненное нуждам синтеза. Тот факт, что формализованные рассуждения в рамках такого аппарата удается перевести на машинный язык, как это сделано в разобранной выше системе Л)6 СА, наглядно свидетельствует о математической строгости примененной здесь логики, ибо мутных , нестрогих соображений компьютер не понимает . [c.550]

Телесистема DAR дает возможность организовать поиск химического соединения в массивах СА с 1967 г., используя чисто структурный подход. В химические словари структурные элементы вводят с помощью таких дескрипторов, как название соединения, название фрагмента, кольцо, фрагмент молекулярной формулы и т. д. В этом массиве используют только структурные формулы или их фрагменты [9, 10]. [c.323]

В тех случаях, когда идентифицировать необходимо неизвестное вещество, информационно-поисковые системы оказываются непригодными. Для решения таких задач в институте развивается идеология так называемых систем искусственного интеллекта. В этих системах спектр вещества не хранится в памяти ЭВМ с самого начала, но генерируется и анализируется в самом процессе поиска ответа. Создана и находится в опытной эксплуатации система искусственного интеллекта, способная по данным об ИК-, УФ-, СКР-, ЯМР Н и ЯМР С спектрах индивидуального вещества опознать его и выдать ответ в виде структурной формулы, записанной в привычном для химика виде. В последнем варианте системы предусматривается и выдача пространственного изображения молекулы. Система может оперировать с молекулами, содержащими большой набор гетероатомов с общим числом атомов до 50 в основном скелете. Программное обеспечение, также допускающее диалоговый режим, реализовано на языке ФОРТРАН для ЭВМ ЕС 1035. При использовании нескольких спектров одновременно в подавляющем большинстве случаев получается единственный ответ. [c.11]

В основе иерархического представления спектров или структурных формул лежит группировка объектов с помощью некоторой меры подобия. Теоретические основы этой процедуры изложены в разд. 12.5.2 применительно к кластерному анализу. При поиске в базах данных основная проблема состоит в выборе метрики, подходящей для описания сходства спектров или структурных формул. [c.588]

На первый взгляд кажется удивительным, что прогнозировать некоторые свойства вещества можно с помощью таких простых математических моделей, которые были описаны в этом разделе. Однако опыт показывает, что свойства многих химических соединений, молекулы которых имеют схожие структурные фрагменты, оказываются близкими. Это открывает неограниченное поле деятельности для поиска закономерностей между изменениями свойств вещества и различными характеристиками структуры молекул. Среди методов, используемых при решении этой задачи, особое место занимают методы теории графов, так как в них используется наиболее привычный для химиков язык структурных формул. [c.62]

Изучить принципы кодирования спектров и структурных формул в базах аналитических данных, методов поиска в базах данных и моделирования спектров. [c.569]

Брутто-формула. Использовать при поиске подходящих структурных формул. [c.185]

Последние из названных систем являются результатом интересных-попыток предпринять перевод научных обозначений рассматриваемых соединений в новый однозначный тип обозначений. Эти обозначения химической молекулы вписываются в. запоминающее устройство вместе с соответствующей литературной ссылкой, которая и может быть выдана по требованию. Интерес химиков-практиков к подобного рода системам, однако, относительно мал, так как они допускают исключительно отыскание узко определенной структурной формулы, тем более, что= такая задача может быть проще разрешена с помощью известных устройств для регистрации формул без особых затрат за короткое время. Отыскание четко сформулированного соединения в литературе с помощью подобных устройств не представляет никаких трудностей. Напротив, существует потребность, в системе документации, которая допускала бы отыскание групп химических веществ. При постановке таких вопросов требуется наличие известного числа химических признаков в молекуле,. Другие химические группировки рассматриваются как побочные— их может быть неограниченное число. Очевидно, для разрешения подобных вопросов обычный формульный регистр непригоден, поскольку родственные вещества одной и той же группы веществ распределяются по всему регистру. Следующий шаг приводит к различным регистрирующим устройствам, однако и здесь необходимо примириться с частичным решением, так как технически невозможно регистрировать вещество по каждому признаку, который когда-либо мог бы служить условием поиска.-Более глубокая причина неприменимости формульного регистратора и других систем документации, построенных по чисто формальному принципу, при ответе на общие вопросы состоит в том,, что здесь при формировании группы играют главную роль относительно второстепенные признаки, например число атомов, углерода между тем имеются признаки, по которым химик-практик по интуиции проводит формирование групп. [c.372]

Система химической информации непрерывно развивается и модифицируется с целью соверщенствования и расширения возможностей, которые эта система предоставляет. Улучшение алгоритмов поиска, например, может быть использовано для уменьшения машинного времени, расходуемого на поиск и тем самым для минимизации затрат на поиск. Аналогично совершенствование терминальных устройств графического отображения информации позволит осуществить более простой ввод и вывод структурных формул, молекул и т. п. [c.432]

Подробно рассматривается применение различных систем перфорированных карт для механизации многоаспектных информационных поисков в разных областях науки и техники. Больщое внимание уделяется применению перфокарт для аналитических целей (оптическая сне троскопия, масс-спектроскония, рентгеноструктурный анализ). Подробно рассматривается вопрос о кодировании химических структурных формул, Библиография — с 277 по 677 наименований. (Библиография первых 277 наименований дана в первом издании этой книги.) [c.423]

Другое направление работ в области поисков новых стабилизаторов полимеров, которое развивается за последнее время,— использование в качестве антиоксидантов полных эфиров борной кислоты, не содержаш,их слабо связанного водорода. Ряд таких эфиров описан в работе [89]. Структурные формулы некоторых наиболее эффективных антиоксидантов из числа испытанных эфиров приведены ниже [c.36]

Химики-органики при поисках более совершенной структурной теории предвидели многие черты теории резонанса. Уже во второй половине прошлого века было обнаружено, что для ряда веществ, например для бензола, нельзя предложить вполне удовлетворительную структурную формулу обычного типа, и постепенно пришли к выводу, что, может быть, эти вещества удастся изобразить не одной, а одновременно дву- [c.11]

Такая фундаментальная система кодирования представляет собой по необходимости некоторый компромисс. Преимущества при дальнейшем усовершенствовании постоянно должны очень тщательно оцениваться по отношению к возрастающей затрате рабочей силы и неравноценно возрастающей сложности обработки. На свой запрос химик, во всяком случае, может (при нашей системе) получить ответ, что искомая литература находится в тесной связи с соответствующей областью. Общие ограничения запроса литературы на одно химическое соединение, например при поиске по одной вполне определенной структурной формуле, вызываются неоправданно более высокой затратой труда. Дальнейшее развитие нашей системы в этом направлении принципиально возможно. Однако ожидаемая польза, вероятно, будет незначительной, так как эта цель достигается обычными вспомогательными средствами простым способом. Скорость и надежность попадания в поисках литературы по четко определенной структурной формуле с помощью известного регистрирующего формулы устройства является удовлетворительной и не требует, по-видимому, новой обработки, за исключением случая, рассмотренного в разделе Система кодирования , на стр. 373 (пункт 3). [c.376]

Каждому соединению присваивается определенный регистрационный номер. Эти номера должны облегчить поиск соединений и групп соединений с определенными структурными признаками, а также поиск названий по структурным формулам и рещение обратной задачи — составление структурных формул по названиям. Подробнее о системе регистрации химических соединений см. [2]. [c.135]

В начале каждой статьи приведена брутто-формула вещества, его название и дана структурная формула. Поиск необходимого вещества в справочнике производится по известной брутто-формуле и формульному указателю или по известному названию и алфавитному указателю, расположенным в конце справочника. [c.7]

В ходе поиска среди структурных формул часто требуется найти не индивидуальное вещество, а целый класс родственных структур. Описание таких (так назьшаемых родовых) классов легко осуществить с помощью структурных формул Маркуша (пример на рис. 13.2-5). Такая формула содержит ядро , в котором природа и расположение атомов четко определены, и по крайней мере один из заместителей, природа которого может быть дополнительно конкретизирована. Результатом поиска являются целые классы соединений. Такая процедура бывает особенно важна в патентном деле, поскольку в патентной заявке часто содержатся лишь общие указания о природе вещества. Впервые в 1923 г. целый класс химических соединений был запатентован Юджином А. Марку-шем, в честь которого и назван этот тип структурных формул. [c.586]

Наконец, наиболее естественный для химика (во всяком случае для органика) способ описать химическую структуру — нарисовать структурную формулу, которая полно и точно отражает топологию требуемых соединений. При этом в поисковом массиве должны присутствовать столь же полные и точные описания структур. Массивы подобных описаний химических соединений накапливались в регистрационных системах уже в течение длительного времени стало быть, имелись и соответствующие средства ввода. Однако диалоговый поиск с заданием структурной формулы непосредственно на экране терминала стал технически осуществимым сравнительно недавно. Первые промышленные системы вступили в действие в начале 80-х гг. их создание потребовало использования самых современных технических решений и весьма мощных компьютеров, объединенных в вычислительные сети. Эксплуатация, а значит, и использование таких поисковых систем до сих пор остаются весьма дорогостоящими. [c.48]

Таким образом, для поиска информации по химии нужно иметь средства описания требуемых химических структур. Среди способов, позволяющих сделать это, основными являются три использование фрагментов систематических названий соединений и их сочетаний с учетом расположения использование фрагментарного кода использование структурных формул. Все эти три способа, не исключая и последнего, имеют свои достоинства и свои недостатки. Поэтому наиболее развитые поисковые системы по химии не отказываются ни от одного из них, представляя пользователю возможность вести поиск по конкретному запросу так, как ему в данном случае удобно. [c.48]

Если говорить о средствах работы с химической информацией, то они заметно различаются в политематических службах, использующих в качестве базовой стандартную схему поиска, и в специализированных службах, связанных с регистрационными системами и оперирующих совершенно иным образом. В первых системах основной вид поиска по структуре — это поиск по названиям и их фрагментам во вторых — по структурным формулам и фрагментарным кодам. [c.49]

По всем представленным в книге общим вопросам и по ка кдому отдельному препарату тщательно подобрана литература, даны структурные формулы препаратов, значения их относительных молекулярных касс, основные синонимы. Наряду с препаратами, получившими практическое применение, дается информация об иссле-доваииых зарубежными авторами соединениях, известных пока под шифрами, что позволяет проследить за направлением поисков новых адреномиметиков и адрено-блокаторов, ближе подойти к проблеме структура — действие в каждом конкретном химическом ряду. [c.4]

Разумеется, что по мере усовершенствования технологии создания ЭВМ и их миниатюризации будет снижаться стоимость АСУТП. Кстати, возможность применения ЭВМ в химической технологии не исчерпывается автоматизированными системами управления. Грандиозные перспективы открываются в связи с развитием информатики и созданием автоматизированных информационных систем. Минули времена, когда источником информации для химиков служили личные контакты или сообщения, опубликованные в немногих научных журналах. В последнее время выпуск химической литературы ежегодно увеличивается на 8%, каждую минуту в мире публикуется по меньшей мере одна химическая работа, а общее число статей, включенных в американский реферативный журнал hemi al Abstra ts за последнюю четверть века, превышает 10 миллионов. Чтобы эффективно использовать эту информацию, во многих странах созданы химические информационные системы, широко использующие ЭВМ для хранения и быстрого поиска необходимой химической информации. Первая такая система, организованная Американским химическим обществом 20 лет назад и хранящая сведения о 3,5 миллионах химических соединений, позволяет быстро получать информацию о любом участке структурной формулы химического соединения и определить по названию соединения его структурную формулу или наоборот, [c.220]

Использование весьма мощных поисковых возможностей, предоставляемых этими системами, предъявляет высокие требования к пользователю. Даже если работать со средствами графического построения структур, наиболее естественными для химиков, надо владеть сложными системами команд. Бесспорно, поиск по фрагментам структурных формул обеспечивает наибольшую комфортность диалога и эффективность поиска точно определенных классических органических структур. Однако в существенной доле случаев поиск по номенклатуре, фрагментарному коду и учет элементов брутто-формулы позволяет получить такой же результат с меньшими затратами. Сюда относятся случаи, в которых множество структурных формул, описывающих требуемый класс соединений, слишком велико или размыто. Например, AS Online рекомендует пользоваться фрагментарным кодом в следующих случаях 1) описывается фрагмент структуры, недостаточный для автоматической генерации набора фильтров, обеспечивающего приемлемый уровень отсева 2) класс соединений не может быть эффективно задан в виде одного или нескольких фрагментов структурной формулы (например, требуются только алкильные производные заданной структуры) 3) требуется учесть интегральные либо нетопологические характерист-ики структуры (полимеры, стереохимия и др.). Можно отметить, что графические средства эффективны для большинства (но не для всех) достаточно специфичных запросов на конкретные фрагменты классических органических соединений. [c.57]

Постоянный рост числа научных публикаций делает необходимой разработку способов их удобного хранения и поиска. Целесообразно поручить это ЭВМ. Для ввода такой информации в машину прежде всего надо изобразить структурные формулы органических соединений в виде линейной комбинации знаков. Однако с помощью брутто-формул, из-за явления изомерии, это можно сделать только для простых молекул, таких как СН4 или С2Нб- [c.25]

Общее количество протонов в соединении. Привлечь при интерпретации интегральной кривой. Использовать при поиске пред-по.чожительных структурных формул. [c.185]

В структурном поиске используют названия соединений и их фрагментов, молекулярные формулы и фрагменты, молекулярную массу, содержание элементов, класс соединения, группу периодической систе.мы. Эти текстовые элементы могут в ходе поиска комбинироваться с чисто структурными элементами, что облегчает поиск определенной части молекулярной структуры. Структурные индексные файлы позволяют также вести патентный поиск по формулам Маркуша. Поиск можно проводить с использованием графического или текстового терминала, так же как и в случае телесистемы DAR . [c.326]

Ежегодно база данных увеличивается примерно на 200 ООО новых соединений, описанных в 20 ООО новых статей. Поиск можно проводить по структурной формуле, используя программное обеспечение телесистемы DAR , поскольку предусмотрена возможность перехода от структурного поиска к библиографическим данным. Примеры, приведенные на рис. 8.18 и 8.19, предоставленные 1S1, показывают оба типа искомых сведений. Чтобы помочь исследователю, используют сигнальные обозначения, включаемые в описание статьи. Эти обозначения помогают повысить эффективность поиска, фокусируя его на непосредственно необходимых статьях. Вот вопросы, для которых имеются сигнальные обозначения [c.338]

Что же реально содержится в справочнике Бейльштейна Размер статей, посвященных разным веществам, может быть самым различным, но для каждого описываемого вещества приводятся эмпирическая и структурная формулы, названия вещества (обычно несколько особенно много вариантов названий в третьем дополнении). Названия построены по разным номенклатурам женевской, рациональной, льежской, а в новых томах и по правилам ШРАС это очень полезно для дальнейших поисков по другим источникам. Затем указывается один или несколько путей образования вещества перед этими сведениями ставится прописное латинское В (от немецкого слова—Bildung). Если для этого вещества есть хороший способ получения, то он описывается несколько подробнее под обозначением Darst. ( Darstellung ). В некоторых случаях такого способа получения может и не быть, иногда вся статья содержит 2—3 строки. Хорошо известным веществам посвящено несколько, а иногда и десятки страниц. Большие статьи всегда составлены по единому плану методы получения, физические свойства, химические свойства, аналитические сведения. [c.36]

Химические формулы кодируются в настоящее время главным образом с помощью линейной индексации Висвессера. Недостатки этой системы заключаются в том, что участки структурных формул обозначаются неоднозначно и неудовлетворительно описываются формулы Маркуша. (Формулы Маркуша-это структурные формулы органических соединений, в которых определенные детали, например вид и место функциональных групп, строго не фиксируются. Из-за этого их охотно используют в патентной литературе.) В системе Гремас, разработанной в ФРГ (фабрика красок Хохст ), атомы углерода цепи обозначаются иначе, чем атомы углерода, связанные с функциональной группой, причем используются трехбуквенные символы (троичные термы). Таким образом, по этому коду можно осуществить поиск и частичных структур, и отдельных участков структурных формул. Эффективность информационного поиска с помощью указанных кодов довольно высока в среднем на каждые десять публикаций приходится одна, в которой не затрагивается конкретно интересующая проблема. Если все же требуются дополнительные уточнения, то помощь в этом может оказать топологический код. В нем детально фиксируются все атомы, входящие в структуру, а также все связи между атомами, т.е. каждая структура описывается совершенно однозначно. Однако для этого потребуется больше машинного времени, и, следовательно, информационный поиск обойдется дороже. Поэтому такой код применяют не ко всему информационному массиву, [c.107]

Центральное место занимает автоматизированная подсистема Химия и химическая технология , созданная на основе совместной работы Центрального института информации и документалистики (ZIID, ГДР) и Всесоюзного научно-исследовательского института научно-технической информации (ВИНИТИ, СССР). Действенность этой системы проявляется в выпуске сигнальной (титульной) информации. В 39 сериях резюмируются работы, опубликованные в 30-дневный период в более чем 12000 журналов. В качестве основы для поиска информации с помощью ЭВМ разработан двуязычный химический тезаурус и создана автоматизированная система SPRESI (накопление и поиск структурно-химической информации). Система содержит сведения о свойствах, реакциях и областях применения химических соединений и промышленных изделий. В запоминающее устройство компьютера ежедневно должно вводиться около 1600 литературных источников с указанными данными и-насколько требуется-топологически закодированных структурных формул примерно 2000 соединений. Готовятся программы и магнитные записи для селективного распространения информации и ретроспективного поиска. Для материалов Реферативного журнала Химия и информационной службы органической химии ГДР в 1976 г. изготовлен реестр по методу SPRESI. Таким образом, просмотр огромного числа опубликованных рефератов можно поручить автомату. [c.110]

В качестве конкретного примера решим задачу поиска фенилгидразона метил-(5-бромтиенил-2)-кетона (формула 1). Для поиска по формульному указателю структурную формулу надо преобразовать в молекулярную, записанную в системе Рихтера (формула 2) [c.11]

Основные методы поиска структурно-родственных соединений в базах Data-Star опираются на использование систематических названий и их фрагментов. Помимо этого, можно применять и другие элементы данных, например молекулярные формулы, но они являются скорее вспомогательными. Результаты поиска соединений в соответствующих базах данных — это описания соединений с их регистрационными номерами. Конкретная информация об этих соединениях ищется в документальных базах данных, имена, которых начинаются с СН. В этих базах имеются специальные поля, содержащие регистрационные номера соединений вместе с текстами, уточняющими аспекты рассмотрения соответствующих соединений в данном документе. Таким образом, если требуется найти, скажем, сведения об определенных видах биологической активности веществ класса X, то следует сначала отыскать их регистрационные номера в базе NAM, а затем перейти в базу СНЕМ (или другую, в зависимости от необходимой глубины ретроспективы) и составить запрос, во-первых, из. найденных номеров, а во-вторых — из слов, отражающих требуемые виды биологической активности. Итак, регистрационные номера используются для связывания описаний соединений, содержащихся в одних базах данных, со сведениями о них, содержащимися в других базах данных. [c.106]