Неоднозначное соответствие

Поскольку матрица смежности неоднозначно соответствует структуре и при перенумерации атомов скелета соответствующие столбцы и строки матрицы меняются местами, то для устранения этой неоднозначности используется лексикографический порядок в построении матрицы. [c.50]

Точка X обозначает Г углеродный атом рибозы, а пунктирная линия — связь, соединяющую этот атом с атомом азота в кольце основания антикодона. Остальные точки со сплошными линиями обозначают положения первых углеродных атомов и их связей с азотом в кольце основания кодона для различных пар оснований, перечисленных внизу справа. (Для простоты пары, содержащие в кодоне И, опущены.) Гипотеза неоднозначного соответствия предполагает, что при взаимодействии третьего положения кодона с антикодоном допустимы три отдаленных нестандартных положения, отклоняющихся от стандартной пары Уотсона -- Крика вверх, вниз и вправо. Три приближенных нестандартных положения, отклоняющихся от стандартного положения влево, недопустимы. [c.448]

Кодон-антикодоновое узнавание и гипотеза неоднозначного соответствия [c.94]

Рис. 7.10. Неоднозначное соответствие при образовании кодон-антикодоновой пары позволяет некоторым основаниям в первом положении антикодона узнавать более чем одно основание в третьем положении кодона.

Информация, заложенная в ДНК и РНК, реализуется в процессе синтеза белка. Механизмы передачи информации от ДНК на РНК понятны и очевидны, так как цепь нуклеотидов характерна для обеих структур, а матричный синтез предусматривает полную идентичность их последовательностей. Но каким же образом передается информация от РНК, содержащей всего четыре нуклеотида, на белок, содержащий 20 различных аминоьсислот Если бы каждый нуклеотид передавал информацию на синтез одной аминокислоты, то всего кодировалось бы 4 аминокислоты. Не может код состоять из двух нуклеотидов, так как в этом случае можно было бы охватить не более 16 аминокислот (4 = 16). Работами М. Ниренберга и соавторов было установлено, что для кодирования одной аминокислоты требуется не менее трех последовательно расположенных нуклеотидов, называемых триплетами или кодонами. При этом между отдельными кодонами нет промежутков, и информация записана слитно, без знаков препинания. Число сочетаний 4 дает основание полагать, что 20 аминокислот кодируются 64 кодонами. Экспериментально установлено, что таких кодонов меньше, всего 61. Оставшиеся три кодона не несут в себе информации, однако два из них используются в качестве сигналов терминации. Выявлена также интересная особенность взаимодействия кодона с антикодоном. Оказалось, что первое и второе азотистые основания кодона образуют более прочные связи с комплементарными основаниями антикодона. Что же касается третьего основания, то эта связь менее прочная, более того, основание кодона может спариваться с другим, не комплементарным основанием антикодона. Этот феномен называют механизмом неоднозначного соответствия или качания. В соответствии с этим урацил антикодона может взаимодействовать не только с аденином, но и с гуанином кодона. Гуанин антикодона способен связываться не только с цитозином, но и с урацилом кодона. Это указывает на возможность нескольких кодонов кодировать одну и ту же аминокислоту. И действительно, было установлено, что ряд аминокислот кодируется двумя и более антикодонами (табл. 29.1). Из таблицы видно, что только две аминокислоты — метионин и триптофан — кодируются при помощи одного кодона. Число кодонов для остальных аминокислот варьирует от двух (для аргинина, цистеина и др.) до шести (для лейцина и серина). Тот факт, что одной и той же аминокислоте соответствует несколько кодонов, называется вырожденностью [c.462]

Неоднозначность соответствия между электрическими и механическими релаксационными процессами является следствием Toil [c.117]

Из табл. 23.2 ясно, что статистическое распределение металлов между биомассой и осадком неоднозначно соответствует токсическому действию металлов в среде метантенка. Если исключить цинк, соответствие улучшается. Это не удивительно, так как указанные в литературе пределы токсичности цинка более чем на порядок превосходят значения для других металлов [13, 19]. [c.298]

Между тем при взаимодействии между третьими основаниями кодона и антикодона в силу неоднозначного соответствия возможно образование пары между третьим нуклеотидом кодона и более чем одним типом основания антикодона. И ходя из анализа молекулярной структуры оснований с помощью молекулярных моделей. Крик заключил, что неоднозначное соответствие в третьем положении допускает образование нестандартных пар оснований между Г и У, И и У и между И и А (фиг. 222). Следовательно, третье азотистое основание в антикодоне тРНК может узнавать определенный спектр оснований в третьем положении кодона мРНК такие спектры для пяти азотистых оснований антикодона выглядят следующим образом [c.448]

Гипотеза неоднозначного соответствия объясняет, почему кодоны-синонимы находятся в одном квадрате кодовой таблицы. Согласно этой гипотезе, не может быть такой тРНК, которая узнавала бы только кодон, имеющий в третьем положении Ц или А. В соответствии с этим кодон типа ХУЦ должен быть синонимом кодона ХУУ. Поэтому, даже несмотря на то, что эта гипотеза допускает исключительное соответствие антикодона с V в третьем положении кодону с У в третьем положении, т. е. допускает существование тРНК, способной узнавать только кодон ХУУ, этот кодон не может определять аминокислоту, отличную от той, которая определяется кодоном ХУЦ. Аналогично кодон типа XYA должен иметь одно значение либо с ХУГ, либо с ХУУ и с ХУЦ. В этом случае, однако, исключительное соответствие антикодона с Ц в третьем положении кодону с Г в третьем положении указывает на существование тРНК, способной узнавать только кодон типа ХУГ следовательно, вполне возможно, что ХУГ может быть единственным кодоном для какой-нибудь аминокислоты. [c.449]

В таком случае кодон XYA должен быть синонимом кодонов ХУУ и ХУЦ и будет узнаваться тРНК, у которой в третьем положении антикодона находится И, а не .Эти следствия, вытекающие из гипотезы неоднозначного соответствия, согласуются с данными о том, что АУГ и УГГ являются единственными кодонами для метионина и триптофана. Поскольку, однако, подобные рассуждения не могут быть применены к бессмысленным кодонам, то обстоятельство, что Non3 (кодон УГА) не является синонимом цистеинового кодона УГ и триптофанового кодона УГГ, ие противоречит гипотезе неоднозначного соответствия. [c.449]

Правила, согласно которым происходит взаимодействие кодон-антикодон, суммированы в гипотезе неоднозначного соответствия (гипотеза качаний, Wobble-гипотеза). [c.95]

Эта гипотеза постулирует, что образование пары кодон-антикодон в двух первых положениях кодона всегда происходит по каноническим правилам, но в третьем положении возможно качание (неоднозначное соответствие). Объясняется это тем, что конформация антикодоновой петли тРНК допускает значительную подвижность первого основания антикодона. Некоторые пары оснований, предусмотренные гипотезой неоднозначного соответствия, приведены на рис. 7.10. [c.95]

Другой пример неоднозначного соответствия обнаруживается в ряду квеуозина и его производных. Это модифицированное основание G сохраняет способность узнавать как С, так и U, но предпочтительно взаимодействует с и. [c.97]

Ограничение, не достигаемое при использовании обычных правил, возможно при наличии в антикодоне 2-тиоуридина. Эта модификация не нарушает способности основания образовывать пару с А, но не допускает его участия во взаимодействии с G, возможном по правилам гипотезы неоднозначного соответствия. [c.97]

Почти для всех тРНК предсказания гипотезы неоднозначного соответствия хорошо согласуются с имеющимися данными. Но существует ряд исключений, при которых тРНК образует пары, не предусмотренные правилами гипотезы, или же когда невозможно спаривание с одним из кодонов, хотя гипотезой это разрешено. Вероятно, эти эффекты обусловлены влиянием соседних оснований или (и) конформационными изменениями в антикодоновой петле. Действительно, самой идее, заложенной в основу гипотезы неоднозначного соответствия, присуще представление о важности структуры антикодоновой петли. Дальнейшее исследование этого вопроса подтвердило и то, что ближайшее окружение влияет на способность антикодона узнавать кодоны. Были получены спонтанные мутанты, несущие замены оснований в других, не антико- [c.97]

Согласно гипотезе неоднозначного соответствия, для узнавания всех существующих 61 кодона необходимо минимум 31 тРНК (без учета инициаторных тРНК). Эту цифру получают, исходя из того, что по крайней мере, [c.97]

Оставшиеся кодоны распределяются по парам, в которых кодоны, заканчивающиеся пиримидинами, прочитываются основанием G, находящимся в антикодоне, а все кодоны, заканчивающиеся пуринами, прочитываются основанием U в антикодоне, согласно предсказаниям гипотезы неоднозначного соответствия. Сложность с уникальными кодонами UGG и AUG в митохондриях млекопитающих полностью устраняется в результате изменений в генетическом коде, обусловленных действующими там правилами считывания кодон UAG прочитывается наряду с UGG как триптофан, тогда как AUA больше не кодирует изолейцина и узнается наряду с AUG как метионин (см. гл. 4). В результате все не вошедшие в семейства кодоны подразделяются на 14 пар по способности взаимодействовать с молекулами тРНК. [c.97]

Аналогичное кодон-антикодоновое взаимодействие обнаруживается в случае одной из эукариотических тРНК. Бычья печень содержит тРНК, аминоацилирован-ную серином. Ее антикодоном является триплет ""ССА, который, согласно гипотезе неоднозначного соответствия, может отвечать на триптофановый кодон UGG. Но фактически он узнает только терминирующий кодон UGA. Таким образом, ""С специфически взаимодействует с А. Поэтому в рассмотренном случае использование триплета UGA в качестве терминирующего кодона, возможно, является определенным видом супрессии. [c.99]

Митохондриальный генетический код Мутация со сдвигом рамки nonsense-Мутация Перекрывающиеся кодирующие последовательности Правила неоднозначного соответствия Терминаторный кодон [c.101]

Таблица 15.4. Правила неоднозначного соответствия кодонов и антикодонов

Взаимодействия одного класса тРНК с несколькими кодонами обнаружены в бесклеточных системах, а также путем генетических экспериментов. Сопоставление данных табл. 15.3 и рис. 15.16 с данными табл. 15.4 показывает, что такое неоднозначное соответствие опять же не искажает смысла кодонов. [c.397]

Обнаружение генов-супрессоров, осмысливающих нонсенс-аллели разных генов, указывает на то, что трансляция генетического кода может меняться. Характер специфичности нонсенс-супрессоров Е. соИ по отношению к нонсенс-кодонам, представленный в табл. 15.5, подчиняется правилам неоднозначного соответствия кодонов иРНК и антикодонов тРНК, как если бы охра-супрессоры — супрессоры нонсенса UAA — кодировали тРНК с антикодоном AUU (см. табл. 15.4), который может считывать UAA и UAG. [c.401]

Для 20 природных аминокислот существует 61 значаищй кодон. По правилу неоднозначного соответствия Крика, для их транслирования достаточно около 30 антикодонов. Однако в клетках значительно больше тРНК (для некоторых аминокислот по 3— [c.89]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология