Конформация нуклеозидов и нуклеотидов

КОНФОРМАЦИЯ НУКЛЕОЗИДОВ И НУКЛЕОТИДОВ [c.121]

Важнейший параметр пространственной структуры нуклеотидного звена — взаимное расположение остатков основания и углевода. Теоретический анализ конформации нуклеозидов и нуклеотидов и рентгеноструктурные исследования показали, что здесь существуют две области разрешенных конформаций, называемых син- и акти-конформациями. У пиримидиновых нуклеозидов в случае аяти-конформации ближе всего к атому С2 расположен атом водорода при Сб, а в случае син-конформации — атом кислорода при С2. У пуриновых нуклеозидов в акти-конформации с атомом С5 сближен атом водорода при С8, а в сия-конформации атом N3 находится над плоскостью углеводного остатка (рис. 10). [c.23]

Наконец, следует упомянуть метод дисперсии оптического вращения [108], который широко используется для определения конфигурации и конформации стероидов [109], кетонов [1101 и других органических соединений, а также для определения знака спирали полипептидов [111], для исследования конформаций нуклеозидов и нуклеотидов [112, 113] и т. д. [c.52]

Для определения конформации нуклеозидов и нуклеотидов, которые являются довольно сложными молекулами, имеют значение данные рентгеноструктурного анализа, ядерного магнитного резонанса и дисперсии оптического вращения. [c.121]

Представленные здесь сведения указывают на большую важность изучения конформации нуклеозидов и нуклеотидов, дающей возможность не только объяснять, но и предвидеть поведение этих соединений в химических и биохимических процессах. [c.368]

В приведенном выше обсуждении теоретически возможных конформаций нуклеозидов (см. стр. 129) мы принимали во внимание в качестве главных факторов, определяющих конформацию, лишь ван-дер-ваальсовы силы отталкивания. Между тем в молекулах нуклеозидов и нуклеотидов имеется достаточное количество функциональных групп, между которыми могут возникать взаимодействия. Такие внутримолекулярные взаимодействия могут оказывать существенное влияние на конформацию нуклеозидов и нуклеотидов в разбавленных растворах. Хотя детальное рассмотрение этого вопроса в настоящее время невозможно, краткое обсуждение имеющихся данных о внутримолекулярных взаимодействиях в нуклеозидах и нуклеотидах кажется целесообразным. [c.140]

Ограниченность рассмотренных квантовохимических подходов состоит в том, что они не учитывают многих чрезвычайно важных факторов, зачастую определяющих и направление, и скорость реакции. Таковыми, например, являются влияние растворителя, пространственные эффекты заместителей и др. О пространственных эффектах заместителей мы уже говорили при рассмотрении кислотно-основных свойств оснований. Отметим еще несколько примеров подобного влияния. Из данных по конформации нуклеозидов и нуклеотидов (см. гл. 2) следует, в частности, что для этих соединений в обычных условиях предпочтительной является антиконформация, при которой в пиримидиновых нуклеозидах и нуклеотидах остаток рибозы и карбонильная группа находятся по разные стороны от К-гликозидной связи. Если эта конформация сохраняет свое преимущество и в растворе, то можно ожидать, что остаток сахара будет пространственно затруднять нуклеофильное присоединение по двойной связи, вследствие чего реакции подобного рода с объемистыми реагентами могут стать даже невозможными. Не исключено, например, что такие реагенты, как семи-карбазид или реактив Жирара (см. стр. 350), не присоединяются по двойной связи именно в силу пространственных затруднений. Более трудная фотохимическая гидратация двойной связи в ури-дин-5 -фосфате по сравнению с уридин-З -фосфатом, возможно, также связана с пространственными эффектами (см. гл. 12). Несмотря на эти довольно многочисленные факты, детального исследования пространственного влияния остатка сахара на реакционную способность оснований до сих пор еще нет. [c.203]