Кодон словарь

Таблица 2.2. Генетический код (словарь кодонов)

Аминокислотные последовательности пептидов можно объяснить, исходя из словаря генетического кода, предположив указанные па рисунке изменения кодонов, делецию и вставку. [c.211]

От 20 до 50 ( ) различных видов молекул s-PHK — по числу смысловых кодонов или групп эквивалентных кодонов синонимов), соответствующих отдельным аминокислотам. Такой фонд молекул s-PHK представляет собой, по существу, генетический словарь , обеспечивающий переход от полинуклеотида к полипептиду в соответствии с кодом. [c.521]

Имеет ли генетический словарь физический, молекулярный смысл или корреляция между кодонами и аминокислотами совершенно случайна Что можно сказать об эволюции кода в этой связи Какие факторы влияют на чтение кода, на процессы транскрипции и трансляции Что и как искажает код Каковы физико-химические причины мутаций [c.589]

Представим словарь кодонов, обозначаемых xyz, квадрат- ной таблицей (рис. 9.13). На рисунке заштрихованы гидрофобные остатки. Характерно, что при У на втором месте кодона (у = У) остаток всегда гидрофобен. При замене одного из нуклеотидов в кодоне xyz получается следующее распределение правильных и неправильных мутаций [c.590]

В 1965 году Ниренберг заменил в своих опытах полинуклеотиды тримерами с известной последовательностью нуклеотидов. Эти опыты независимым образом подтвердили триплетный характер кода и установили последовательности нуклеотидов в кодонах. В дальнейшем Корана реализовал тонкий способ синтеза длинных полинуклеотидов с известной последовательностью звеньев и применил их в качестве заместителей м-РНК- В результате этих прекрасных работ был получен полный кодовый словарь. А совсем недавно Корана впервые синтезировал ген — участок ДНК, ответственный за синтез одной из т-РНК. [c.283]

Очевидно, что генетический код возник в ходе длительной биохимической эволюции. Спрашивается, имеется ли какая-нибудь внутренняя логика в генетическом словаре или соответствие кодонов аминокислотам совершенно случайно Естественно думать, что код должен выражать логику эволюции, логику естественного отбора и, следовательно, обладать внутренним смыслом. Смысл этот нужно открыть. Здесь приходит на помощь молекулярная физика. [c.285]

Кодовый словарь далеко не случаен. Имеется определенная корреляция между строением кодонов и природой аминокислотных остатков. Генетически закодирована пространственная структура белковой молекулы, находящейся в водном окружении, и тем самым ее биологическая функция. Природа генов непосредственно связана со специфическими свойствами жидкой воды [c.296]

Трансляция на рибосомах, как и все матричные процессы, состоит из трех этапов инициации, элонгации и терминации. Все эти этапы осуществляются в соответствии с сигналами, закодированными в иРНК в виде последовательностей нуклеотидов — кодонов, составляющих словарь генетического кода. [c.388]

Итак, ни Шампольон, ни Конан Дойль нам не помогут. Некоторая косвенная информация о кодовом словаре была получена в результате изучения направленных химических мутаций. Однако установить код удалось лишь в ходе прямых экспериментальных исследований. В 1961 году Крик с сотрудниками сделал работу, в которой посредством изучения мутантов фага Т4 было доказано, что число нуклеотидов в кодоне (последовательность, кодирующая одну аминокислоту) действительно равно или кратно трем. В том же году на V Международном биохимическом конгрессе в Москве американский ученый Ниренберг впервые рассказал о найденном им красивом методе расшифровки кода. [c.282]

Генетический словарь содержит 64 кодона, каждый из которых образован тремя последовательными нуклеотидами (триплетами). 61 из 64 кодонов детерминируют 20 аминокислот, обнаруженных в белках, один определяет начало большинства последовательностей, кодирующих белки, и три обозначают окончания этих последовательностей. [c.116]

Универсален ли генетический код Действуют ли аналогичным образом одинаковые кодоны в различных организмах Ответ на этот вопрос положителен. Поли-У стимулирует включение Фен в полипептидную цепь в бесклеточных системах, полученных из клеток млекопитающих и водорослей. То же относится к другим синтетическим полинуклеотидам (см. [5]). Три-нуклеотидная техника Ниренберга была применена к бесклеточ-ным системам, полученным из клеток амфибии Xenopus laevis и морской свинки, и привела к тем же результатам [110]. Меняется, по-видимому, лишь относительное участие различных кодонов для одной и той же аминокислоты, но кодовый словарь остается тем же, что и для Е. oli. [c.587]

Приведем установленный Ниренбергом с сотрудниками и Ко-раной с сотрудниками кодонно-аминокислотный словарь (табл. 9.3), а также обратный аминокислотно-кодонный словарь (та0л. 9.4). [c.585]

На рис. 3 дан полный кодовый словарь. Из 64 триплетов, получивших название кодонов, 61 являются значащими (смысловыми) в том смысле, что кодируют аминокислоты. Только 3 кодона —UAG ( янтарь ), UAА ( охра ) и UGA ( опал ) — не кодируют никакой аминокислоты и потому иногда называются бессмысленными . Роль бессмысленных триплетов в трансляции очень важна, так как в мРНК они служат сигналом терминации синтеза полипептидной цепи белка в настоящее время их обычно называют терминаторными кодонами. [c.15]

Кроме того, по ложному включению одной аминокислоты нельзя судить о возможностях ложного включения других. В частности, можно думать, что ложное кодирование в пределах одной кодоновой группы (т. е. кодонов, различающихся только по третьему нуклеотиду) должно быть более вероятным, чем другие замены. Как следует из кодового словаря (см. рис. 3), к таким наиболее вероятным аминокислотным заменам в результате ложного кодирования должны относиться Phe<->Leu, yS f- Trp, HiS t- Gln, Ile<- Met, Asn<- Lys, Ser<- Arg и Asp <- Glu, причем замены слева направо (ложное спаривание с U или С в третьем положении кодона) должны быть более вероятны, чем замены справа налево (ложное спаривание с А или G в третьем положении кодона). Действительно, замены аспарагина на лизин являются гораздо более частыми, чем замены лизина точно так же гистидин часто заменяется на глютамин, в то время как замены глютамина редки. [c.172]

Вскоре в лабораториях М. Ниренберга, С. Очоа и Г. Хорана, пользуясь этими искусственно синтезированными мРНК, были представлены доказательства не только состава, но и последовательности триплетов всех кодонов, ответственных за включение каждой из 20 аминокислот в белковую молекулу. Приводим полный кодовый словарь , т.е. все 64 кодона [c.521]

Отличительной особенностью генетического кода является то, что каждый кодон кодирует только одну аминокислоту, т.е. код однозначен. Следовательно, зная словарь и правила пользования им, можно перевести нуклеотидную последовательность мРНК в определенную аминокислотную последовательность. Но генетический код является вырожденным. Это означает, что одной аминокислоте могут соответствовать несколько кодонов. Вырож-денность генетического кода приводит к тому, что нельзя однозначно перевести аминокислотную последовательность данного белка в нуклеотидную последовательность соответствующей мРНК. [c.116]

Эта закономерность выражает физический смысл кодового словаря. Преимущество правильных мутаций определяетсл пространственным строением белка в водном окружений и, тем самым, особыми физическими свойствами воды. Таким образом, корреляция кодонов с аминокислотами продиктована физикой воды. Код обладает высокой, хотя и не абсолютной, надежностью по отношению к неправильным мутациям. [c.591]

Генетический словарь состоит из 64 кодонов. Три из них — это стоп-кодоны, а один (AUG) — старт-кодон (табл. 3.2), кодирующий еще и аминокислоту метионин. Когда кодон AUG находится не на 5 -конце молекулы мРНК, а в ее внутренней области, то он распознается другой тРНК (Met-TPHK ), к которой присоединен немоди- [c.40]

Транспортные РНК. Большое внимание, которое привлекают к себе в последние годы транспортные РНК, обусловлено тем, что они представляют собой, по существу, отдельные элементы, составляющие генетический словарь. Интерес к ним особенно усилился после выдающейся работы Холли, которому в 1965 г. удалось полностью расшифровать первичную структуру (т. е. нуклеотидную последовательность) одной из аланиновых s-PHK дрожжей Суммируя вкратце некоторые наиболее важные структурные характеристики молекул s-PHK (см. гл. V), можно сказать, что эти сравнительно небольшие и поэтому легко растворимые в воде полирибонуклеотиды весьма однородны по своим размерам (приблизительно 70—80 нуклеотидных остатков). Помимо четырех обычных оснований они содержат такн е в относительно большом количестве редкие, или минорные, основания, в частности различные метилированные основания и псевдоуридии. Модификация обычных оснований происходит, по-видимому, уже после их включения в полимерную структуру. Несмотря на присутствие редких оснований, для молекул S-PHK характерны высокая степень комплементарности и выраженная вторичная структура, особенно в присутствии ионов Mg +. Возможно, что число различных видов s-PHK совпадает с числом смысловых кодонов. В некоторых случаях (нанример, в случае лейцина) оказалось возможным приписать те или иные фракции s-PHK к отдельным кодонам выяснилось, что данная фракция s-PHK поставляет активированную аминокислоту только в ответ на совершенно определенный кодон и ни на какой другой. [c.522]

В табл. 1 и 2 приведены прямой и обратный словари кодонно-аминокислотный и аминокислотно-кодонный. Составлены они, как положено, по алфавиту. В табл. I в первой строке указан кодон м-РНК, во второй — обозначение аминокислотного остатка, в третьей — название соответствующей аминокислоты. [c.283]

Кодоны 10. АУГ и 26. ГУГ отмечены звездочками. Эти триплеты оказались особыми. Они кодируют указанные в словаре аминокислоты в середине белковой цепи, но, вообще говоря, служат для инициирования, для начала построения цепи. Кодоны 33. УАА и 34. УАГ имеют условные наименования янтарь и охра . Эти названия возникли забавным способом. Мутанты, связанные с появлением обрывающего цепь кодона УАА, впервые наблюдались Бернштейном. Слово Bernstein по-немецки означает янтарь. Его перевели на английский язык (amber), а затем на русский. Кодону УАГ, имеющему аналогичную функцию, решили дать наименование также чего-нибудь желтого и назвали его охрой. (Примечание к вопросу о юморе в науке, стр. 202.) Это названия мутантов, возникающих вследствие обрыва белковой цепи на этих кодонах. Кодон 37 УГУ также, по-видимому, обрывающий цепь, является бессмысленным . [c.283]

Мы не можем исследовать первую возможность. Но исследование второй возможности не составляет труда. Оно сводится к анализу кодонно-аминокислотного словаря. [c.293]

Каждый кодон хуг можно уподобить слову, состоя-шему из префикса х, корня у и флексии г — из первого, второго и третьего нуклеотида. Уже первый взгляд на табл. 2 раскрывает своеобразную закономерность кода замена флексии г при неизменных префиксе и корне ху в ряде случаев вообще не влияет на кодируемую аминокислоту (например, ЦЦА, ЦЦГ, ЦЦУ, ЦЦЦ — псе кодируют про). В других случаях 2 == АГ, кодируют одну аминокислоту, а 2 — У, Ц другую (например, ЦАА, ТТЛ Г кодируют глун, а ЦАУ, ЦАЦ — гис). Удобно представить генетический словарь в виде квадратной табл. 5, где п-остатки отмечены жирным шрифтом. [c.294]

Редкие исключения в стандартном словаре кодонов обнаружены у инфузорий и в митохондриальных генах. Например, в митохондриях млекопитающих кодон UGA читается как триптофан и митохондриальная ДНК кодирует тРНК , чей антикодон иСА спаривается с UGA почти так же прочно, как с нормальным триптофановым кодоном UGG. В митохондриях млекопитающих кодоны AGA и AGG прочитываются как сигналы терминации. AUU, AU , AUA и AUG служат инициирующими кодонами, а AUA кодирует метионин вместо изолейцина. В митохондриях дрожжей триплеты UU, СиС, UA и UG кодируют треонин, а не лейцин. [c.137]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология