Пуромицин

Рис. 104. Шаро-стержневая скелетная модель пуромицина (без водородов), основанная на данных рентгеноструктурного анализа (по М. Sundaralingam et al. J. Mol. Biol., 1972, v. 71, p. 49-70)

Пуромицин- сравните его строение со строением аминоацил-тРНК [c.241]

Анизомицин. Этот антибиотик ингибирует транспептидацию только на эукариотических рибосомах. Он связывается с 60S субчастицей и является конкурентным ингибитором пуромицина. Очевидно, он, как и вышеперечисленные антибиотики, мешает взаимодействию акцепторного субстрата с пептидилтрансферазным центром эукариотической рибосомы. Анизомицин—сильный инги- [c.190]

В отношении акцепторного субстрата реакции некоторые сведения могло бы дать изучение пуромицина и его аналогов. Так, известна конформация пуромицина в кристалле, определенная рентгеноструктурным анализом (рис. 104). Она подтверждается исследованиями пуромицина в растворе. Так как пуромицин — хороший акцепторный субстрат в реакции транспептидации, знание его структуры может навести на некоторые суждения о стереохимии аминоацильного и аденозинЬвого остатков в пептидилтрансферазном центре. Далее, известно, что аналог с более фиксированной конформацией, типа изображенного на рис. 105, тоже может служить в качестве акцепторного субстрата в реакции транспептидации, и даже более активен, чем пуромицин. Здесь фиксирована ориентация пуринового кольца относительно рибозы (так называемая анти -ориентация), и это позволяет думать, что именно она [c.191]

Иммуноэлектронно-микроскопические наблюдения, где использовались антитела против пуромицина, ковалентно фиксированного в пептидилтрансферазном центре/ также указывали на его положение у головки (центрального протуберанца) 50S субчастицы, но скорее с другой стороны, а именно со стороны L1 ребра (хотя нельзя исключать, что последнее могло бы быть артефактом вследствие искажения положения антитела при специфической ориентации 50S субчастицы —контактирующей стороной к подложке). В целом можно утверждать, что пептидилтрансферазный центр на 50S субчастице должен быть расположен на ее контактирующей (вогнутой) поверхности, где-то совсем рядом с головкой (центральным протуберанцем), скорее всего в районе желобка, отделяющего головку от остального тела. [c.152]

Идея о том, что синтез белков на мембраносвязанных рибосомах сопряжен с трансмембранным транспортом белков, возникла из наблюдений по тесной ассоциации растущих полипептидных цепей с мембраной шероховатого эндоплазматического ретикулума в эукариотических клетках или с внутренней цитоплазматической мембраной бактерий. Транслирующие рибосомы оказались прочно заякоренными на мембране растущим пептидом, и лишь обработка пуромицином, приводящая к аборту пептида из рибосомы, позволяла диссоциировать комплекс на интактные рибосомы и мембраны, оставляя пептид в мембране. Таким образом, стало ясно, что существенный вклад в ассоциацию транслирующей рибосомы с мембраной вносит сам растущий пептид. В бактериях разрыв этого якоря пуромицином приводит к немедленному освобождению рибосом от мембраны, откуда делается вывод, что растущие пептиды являются единственным прочным соединением полирибосом с цитоплазматической мембраной. [c.275]

Этот же принцип недавно был использован для разделения 40S и 60S субъединиц рибосом на колонках сефарозы 4В или биогеля А-15ш в солевом растворе неизменной концентрации (0,5 М KG1) с помощью изменения температуры. При 4° и указанной концентрации КС1 40S субъединицы очень слабо задерживаются агарозой и выходят четким пиком. Объем элюции лежит примерно посередине между свободным и полным объемами колонки. Затем при той же температуре вымывается пуромицин, использованный для диссоциации рибосом. Для снятия с колонки 60S субъединиц оказывается достаточным повысить температуру элюента до 35° — субъединицы выходят четким пиком [К. Man hester, J. Man hester, 1980]. [c.179]

Целый ряд экспериментальных данных подтверждает существование химической основы памяти. Например, введение животным небольших доз стрихнина облегчает обучение [131]. Другие вещества, например пуромицин (рис. 15-18), оказывают противоположное действие [129, 132]. Процесс обучения у животных связан с увеличением синтеза в нейронах мРНК и белков. Существенно важно, что синтез полипептидов и нуклеиновых кислот протекает в основном в теле нервной клетки, а не в окончаниях аксонов или в дендритах. Тело нервных клеток покрыто обычно синаптическими пуговками, и вполне вероятно, что-кменно стимуляция поверхности мембран тела клетки индуцирует синтез макромолекул. [c.351]

Говоря о нуклеотидах, нельзя не упомянуть также и о том, что в самое последнее время мононуклеотиды и очень близкие к ним соединения выделены, как таковые, из различных природных объектов. Биологическая роль таких нуклеотидов далеко не всегда известна. Они являются продуктами обмена, возникающими, по-видимому, по крайней мере в некоторых случаях как результат распада нуклеиновьгх кислот. Не исключено также, что они могут возникать как продукты некоторых патологических процессов, протекающих в живом организме. Некоторые мононуклеотиды и родственные им вещества проявляют сильное антибиотическое действие и подробно исследованы с этой стороны, как, например, антибиотик пуромицин. [c.176]

На специфическом подавлении отдельных стадий биосинтеза белка основано действие ряда антибиотиков (разд. 2.3.5). Так, актиномицин интер-коляцией и рифамицин селективным подавлением РНК-полимеразы нарушают процесс транскрипции. Хлорамфеникол нарушает трансляцию, блокируя реакцию переноса пептидила в рибосоме. Стрептомицин ассоциирует с 30 8-субъединицей рибосомы и ведет к ошибкам в переносе, а очень похожий на аминоацильный конец тРНК пуромицин вызывает преждевременный обрыв синтезируемой цепи. [c.398]

К другим примерам относятся синтез аналога пуромицина [761 К-анизилиден-о-глЮкозамина и синтез циклосерина [77] и Ы,К-диметилциклосерина [78] из оксима бензофенона, причем защищенный атом азота представляет собой КН-группу в изооксазолидоно- [c.204]

Предшественники нуклеотидов - нуклеозиды иногда выступают в роли антибиотиков, например пуромицин является ингибитором биосинтеза белка. Другие нуклеозиды (арабинозиладенин и арабинозилцитозин) ингибируют биосинтез ДНК и являются антивирусными и антигриб-ковыми веществами. [c.48]

Уже отмечалось, что вместо аминоацил-тРНК в качестве акцепторного (нуклеофильного) субстрата в реакции с пептидил-тРНК могут участвовать 3 -концевые фрагменты аминоацил-тРНК, аминоацильные эфиры аденозина или пуромицин. [c.184]

Хлорамфеникол связывается с 70S рибосомой или с ее изолированной 50S субчастицей довольно нестабильно и легко может быть отмыт. Соответственно, действие антибиотика обратимо. По-видимому, он связывается с участком пептидилтрансферазного центра, ответственным за взаимодействие с акцепторным субстратом во всяком случае, пуромицин и 3 -концевые фрагменты [c.189]

В соответствии с вышесказанным, имеются четыре способа измерения транслокации, основанных на одном из следующих критериев 1) реакция транспептидации с низкомолекулярным акцепторным субстратом —пуромицином 2) связывание аминоацил-тРНК 3) освобождение деацилированной тРНК 4) передвижение матричного полинуклеотида. [c.196]

Пуромициновая реакция — наиболее простой и распространенный тест. Как уже говорилось, пуромицин представляет собой низкомолекулярный аналог аминоацил-тРНК (см. рис. 89), служащий акцеп- [c.196]

Перемещение матричного полинуклеотида как тест транслокации наиболее сложен в техническом отношении. Он может быть или непрямым, когда основан на появлении компетентности к связыванию аминоацил-тРНК, специфической к кодону, следующему за ранее фиксированным в рибосоме, или прямым, если анализируется непосредственно изменение закрытого (защищаемого) рибосомой отрезка матрицы. В прямом тесте было показано, что сдвиг полинуклеотидной матрицы относительно рибосомы на один триплет нуклеотидов сопровождает появление компетентности к пуромицину и к связыванию аминоацил-тРНК. [c.198]

Однако в эукариотах рибосомы после разрыва пептидного якоря еще обнаруживают существенное сродство к мембране эндоплазматического ретикулума. В опытах in vitro полная диссоциация рибосом от мембран эндоплазматического ретикулума достигается лишь путем совместной обработки микросом пуромицином и высокой ионной силой. Можно показать также определенное сродство нетранслирующих рибосом или рибосом, только начав- [c.275]

Один из мощных ингибиторов белкового синтеза—пуромицин. Он представляет собой аналог концевого участка аминоацил-тРНК адениловой [c.540]

Пептидил-пуромицин не несет на себе триплета антикодона и поэтому тормозит элонгацию пептидной цепи, вызывая обрыв реакции, т.е. преждевременную терминацию синтеза белка. При помощи пуромицина было доказано, например, что гормональный эффект в ряде случаев зависит от синтеза белка de novo. Укажем также, что пуромицин оказывает тормозящее действие на синтез белка как у прокариот, так и у эукариот. [c.541]

Пуромицин является структурным аналогом тирозинил-тРНК. Связываясь с аминоацильным центром рибосомы, он тормозит связывание новой аа-тРНК на стадии элонгации синтеза белка. [c.541]

Молекулярная биология Структура рибосомы и биосинтез белка (1986) -- [ c.149 , c.152 , c.184 , c.189 , c.191 , c.196 , c.198 , c.200 , c.269 , c.275 ]

Биологическая химия Изд.3 (1998) -- [ c.434 , c.540 , c.541 ]

Справочник биохимии (1991) -- [ c.229 ]

Химия углеводов (1967) -- [ c.269 , c.615 ]

Нейрохимия Основы и принципы (1990) -- [ c.341 ]

Биоорганическая химия (1991) -- [ c.438 ]

Биоорганическая химия (1987) -- [ c.402 , c.403 , c.736 ]

Жидкостная колоночная хроматография том 3 (1978) -- [ c.3 , c.226 ]

Общая органическая химия Том 8 (1985) -- [ c.588 , c.619 , c.620 , c.642 ]

Промышленная органическая химия (1977) -- [ c.433 ]

Молекулярная биология клетки Том5 (1987) -- [ c.21 , c.144 ]

Введение в химическую экологию (1978) -- [ c.53 , c.193 ]

Основы биохимии Т 1,2,3 (1985) -- [ c.946 ]

Биохимия нуклеиновых кислот (1968) -- [ c.270 ]

Биохимия аминокислот (1961) -- [ c.76 ]

Основы биологической химии (1970) -- [ c.533 , c.534 ]

общая органическая химия Том 8 (1985) -- [ c.588 , c.619 , c.620 , c.642 ]

Химия нуклеозидов и нуклеотидов (1966) -- [ c.57 , c.145 ]

Бумажная хроматография антибиотиков (1970) -- [ c.83 , c.84 , c.89 , c.101 , c.104 , c.105 , c.215 ]

Начала органической химии Кн 2 Издание 2 (1974) -- [ c.692 ]

Начала органической химии Книга 2 (1970) -- [ c.765 ]

Хроматография на бумаге (1962) -- [ c.647 ]

Химия биологически активных природных соединений (1970) -- [ c.331 , c.336 ]

Биохимия человека Т.2 (1993) -- [ c.107 , c.266 , c.267 ]

Основы учения об антибиотиках (2004) -- [ c.33 , c.43 , c.208 , c.408 , c.418 , c.438 , c.445 , c.446 ]

Биохимия человека Том 2 (1993) -- [ c.107 , c.266 , c.267 ]

Гены и геномы Т 2 (1998) -- [ c.163 ]

Основы биохимии (1999) -- [ c.175 ]

Регуляция цветения высших растений (1988) -- [ c.368 , c.369 ]

Биохимия Т.3 Изд.2 (1985) -- [ c.102 , c.107 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология