Структурная амплитуда и координаты атомов

В принципе важно было бы учесть в атомных амплитудах и перераспределение электронной плотности. Эту задачу решить нелегко прежде всего потому, что определение распределения р(г) в ячейке, а значит, и области, относящейся к каждому атому, само является конечной целью структурного исследования. Итерационный процесс применить здесь крайне трудно, так как поправки к fj каждого атома пришлось бы на каждом шаге итерации находить в численном виде. Приближенный метод, получающий все более широкое распространение, заключается в так называемом мультипольном представлении распределения электронной плотности по атому, т. е. в виде суммы подходящих функций, содержащих не только радиальные, но и азимутальные множители с численными параметрами, подлежащими уточнению. Фурье-преобразование мультипольного представления р/ (г) дает атомную амплитуду / (Н) также в виде суммы функций, в которые входят те же численные параметры. Ути параметры уточняются вместе с координатами атомов и другими константами в общей схеме МНК, описанной выше . [c.183]

В зависимости от симметрии кристаллов этот процесс может быть сложнее или проще. Если кристаллы обладают центром симметрии, а это значит, что каждому атому с коор динатами х, у, z в реальной структуре соответствует атом о координатами — х,— у,— z, то определение начальной фазы существенно облегчается. Ряд несложных вычислений приводит к тому, что в этом случае фазы могут равняться либо 0 2я), либо я ( os 0 = 1, os л ——1). Становится ясно, что для центросимметричных кристаллов проблема фаз переходит в проблему знаков, а именно, структурные амплитуды могут иметь значения +F или —F. [c.75]

На элементарную ячейку пространства межатомных векторов приходится атомов . Из них N помещается непосредственно в начале координат ячейки они находятся в конце векторов нулевой длины (случай 5 /) остальные Л (Л —1) связаны попарно центром инверсии в начале координат. Это понятно если в структуре кристалла существует вектор соединяющий й атом с 5-ым, то имеется и обратный вектор проведенный из 5-го атома в й. Пространство межатомных векторов всегда обладает центрами инверсии. В полном соответствии с этим структурные амплитуды отражений от векторной системы (т. е. структурные факторы) являются вещественными величинами. [c.421]

Если расчет произведен правильно, координаты самых высоких максимумов распределения будут соответствовать найденному ранее расположению наиболее тяжелых атомов . Остальные максимумы должны определять приблизительное расположение других атомов—всех или, чаще, только тех из них, которые имеют сравнительно большие атомные номера. Чем меньше атомный номер атома, т. е. меньше его рассеивающая способность, тем менее точно атом фиксируется в распределении электронной плотности, в особенности в распределении первого приближения. Некоторые наиболее легкие атомы могут вовсе не создавать максимумов. Некоторые максимумы могут быть ложными, связанными с ошибками, допущенными при расчете фаз (знаков). Во всяком случае, если по построенной картине удается разумно идентифицировать часть максимумов распределения с некоторыми атомами структуры в добавление к первоначально использованным тяжелым атомам , вся процедура может быть повторена на новой, более совершенной основе. При пересчете фаз или знаков структурных амплитуд в суммах может быть учтено уже большее число атомов. Соответственно фазы определяются более точно, а при наличии центра симметрии еще меньшему числу отражений приписываются ошибочные знаки структурных амплитуд. Последующий повторный расчет ряда Фурье дает распределение электронной плотности, несколько лучше отображающее действительное расположение атомов, чем первоначальный ряд. Анализ этого распределения позволит выяснить расположение еще некоторых атомов, ранее не обнаруженных, и уточнить координаты атомов, представленных в первом распределении. Расчет может быть повторен несколько [c.503]

Кристаллы 8-метил-Ь-цистеин сульфоксида были выращены из водноспиртового раствора, имели пространственную группу P2i2i2i и размеры элементарной ячейки а = 5,214 А Ь = 7,410 А с = = 16,548 А Ризм = 1,56 г/см Z = 4 ррент = 1,57 г/см . Для определения модели структуры были исиользованы знаковые соотношения F(Okl) структурных амплитуд и XZ — проекция функции Паттерсона. Уточнение структуры проведено но проекциям электронной плотности, а также двумерными и трехмерными расчетами по методу наименьших квадратов. Положения некоторых атомов водорода найдены из кристаллохи-мических соображений. Минимальное значение фактора расходимости R hkl) равно 12,8%. Точность определения межатомных расстояний 0,02—0,03 А валентных углов 1—2°. Координаты базисных атомов приведены в табл. 36. Межатомные расстояния и валентные углы в молекуле 8-метнл-Ь-цистеин-сульфоксида показаны на рис. 56. Атомы карбоксильной группы и атом [c.94]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология