Фактор ро и терминатор

Терминация в отсутствие факторов, по-видимому, не полностью моделирует этот процесс а то.м виде, как он протекает в живой клетке. Действительно, на ряде терминаторов очищенная РНК-полимераза завершает синтез молекул РНК. отступя на несколько нуклеотидов от того места, где она завершает его в живой клетке, и с меньшей эффективностью. Недавно обнаружен белковый фактор, названный тау(т), который улучшает эффективность и точность [c.155]

Фактор р присоединяется к РНК-продукту до того, как РНК-полимераза достигает терминатора. Присоединение происходит к определенным участкам РНК, в нуклеотидной последовательности которых пока не обнаружено каких-либо характерных особенностей. Ясно лишь, что эти участки не склонны к образованию протяженных двуспиральных структур. [c.157]

Характеристика матрицы. Отрезок ДНК, подвергающийся транскрипции, называют транскриптоном (у прокариот — опероном). В составе транскриптона по функциональному признаку выделяют четыре области промотор — место инициации транскрипции акцепторную зону, или оператор, — место связывания регуляторных факторов, например белка-репрессора у прокариот структурные гены, включающие информативные участки (экзоны) и неинформативные (интроны) терминатор — область для заверщения транскрипции. Следовательно, при транскрипции на матрице отмечены начало и конец синтеза РНК. [c.305]

Терминатор, не зависящий от фактора р [c.165]

На рис. 13.3 показано, что остановка РНК-полимеразы на терминаторе благоприятствует тому, чтобы фактор р смог догнать ее. Затем фактор р взаимодействует с РНК-полимеразой, вызывая освобождение РНК и отделение полимеразы и самого фактора от матрицы. Эта модель предполагает, что основное свойство терминатора-это его способность заставлять РНК-полимеразу делать паузу. Исходя из этого, различная эффективность [c.166]

Полимераза приостанавливается на терминаторе, и фактор р догоняет ее [c.166]

На рис. 13.6 изображена генетическая карта ранней области фага лямбда. Два предранних гена N и его транскрибируются РНК-полимеразой Е. соИ соответственно влево и вправо от промоторов, обозначенных Pl и Pr. Это означает, что при левосторонней и правосторонней транскрипции в качестве матрицы используются разные цепи ДНК. На рис. 13.7 показано, что транскрипция, осуществляемая РНК-полимеразой Е. соН, останавливается в конце генов N и его соответственно на терминаторах ILi и tR . Оба этих терминатора являются р-зависимыми. (Первоначально фактор р был обнаружен благодаря функционированию именно этих терминаторов.) [c.169]

Р-НЕЗАВИСИМЫЕ ТЕРМИНАТОРЫ. Последовательности ДНК, на которых РНК-полимераза прекращает транскрипцию в отсутствие р-фактора. [c.526]

Связыванию р-фактора с РНК мешают также рибосомы, транслирующие РНК, поэтому на р-зависимых терминаторах, встречающихся внутри структурных генов, р-фактор не обеспечивает терминации, если мРНК эффективно транслируется. Наличие таких терминаторов внутри генов, по-видимому, не случайно. Когда синтез белка по каким-либо причинам подавлен, они сигнализируют РНК-поли.меразе о том. что мРНК не транслируется и синтез ее Осмыслен. [c.157]

Терм1шация Т., как правило, происходит в строго определенных участках матрицы-терминаторах, в к-рых от матрицы отделяются РНК и РНК-полимераза последняя, объединившись со свободной ст-субъединицей, может вступить в следующий цикл Т. В терминаторах, для узнавания к-рых РНК-полимеразе не требуется фактора р, нуклеотидная последовательность характеризуется двумя особенностями по ходу Т. перед точкой терминации расположен участок, богатый парами dG-d (дезоксигуанозин- 1езоксицити-двш), а затем участок, состоящий из 4-8 расположенных подряд остатков дезоксиадениловой к-ты. Предполагают, что после прохождения РНК-полимеразой участка, богатого dG-d , в РНК возникает шпилька, к-рая препятствует продвижению фермента и разрушает часть спирали РНК-ДНК [c.619]

Мн. терминаторы узнаются РНК-полимеразой только с помощью белковых факторов терминации. Из них наиб, изучен фактор р Е. oli-олигомерный белок с мол. м. 46 тыс. Фактор р присоединяется к определенным участкам синтезируемой РНК (не имеющим протяженных двухспиральных структур) до того, как РНК-полимераза достигает терминатора. Предполагается, что фактор р передвигается вдоль РНК вслед за РНК-полимеразой, используя для этого энергшо гидролиза нуклеозидтрифосфатов, и способствует диссоциации гибрида РНК с матричной нитью ДНК. [c.620]

Истинно-ранние гены (а) считываются только со своих промоторов (Pje)- а отсроченно-ранние (б)— либо со своих промоторов (P g). либо прн наличии антитермииирующих факторов — с промоторов истинно-ранних генов] tj и ta — терминаторы [c.297]

Это становится возможным, поскольку вирус-специфический антитерминирующий фактор позволяет РНК-полимеразе преодолевать терминаторы, разделяющие соседние гены при этом естественно образуются полицистронные мРНК, кодирующие как истинно-ранние, так и отсроченно-ранние белки. [c.297]

РНК-полимераза Е. oli изучена наиболее подробно. Это олигомерный фермент, состоящий из двух одинаковых а-субъединиц (мол. масса 36000), двух разных ( j и Р,)-субъединиц (мол. масса соответственно 151000 и 155000), (D-субъединицы (мол. масса 11000) и а-субъединицы общая мол. масса фермента около 390000. Считают, что функция а-субъединицы (а-фактор)—узнавание определенного участка на матрице ДНК, названного промотором, к которому присоединяется РНК-полимераза. В результате образуется так называемый открытый комплекс фермента с ДНК двухцепочечная структура ДНК раскрывается ( плавится ). Далее на одной из нитей ДНК, как на матрице, синтезируется мРНК синтез заканчивается в определенной точке в конце гена или прерывается под действием особых белков. Другим субъединицам фермента приписывают функцию инициации биосинтеза РНК (а-субъединицам) и основную каталитическую функцию (связывание субстратов и элонгация синтеза) — -субъединицам. Кроме того, открыт ряд белков, принимающих участие в механизме синтеза РНК в клетке. В частности, исследуется природа репрессорных белков и белка-терминатора (р-фактора). Последний обладает способностью обратимо связываться с терминирующими участками ДНК (так называемые стоп-сигналы транскрипции), выключая действие РНК-иолимеразы. При отсутствии этого белка образуются исключительно длинные цепи РНК. [c.489]

Так, соединения, меченые изотопом трития, включают фармацевтические препараты, относящиеся к классам физиологически активных веществ — витамины, антибиотики, ростовые факторы, пептиды, терминаторы синтеза ДНК, агонисты и антогонисты рецепторов. Полученные соединения используются для проведения различных исследований в области молекулярной биологии и генетики, фармакологии, экспериментальной медицины. [c.560]

За прекращение (терминацию) синтеза мРНК у конца оперона или отдельного гена, по-видимому, также ответственна специфическая область ДНК-терминатор. Какую роль играет фактор термин ации [c.481]

Терминация синтеза РНК наступает при достижении РНК-по-лимеразой терминатора. При этом отделяется вновь синтезированная цепь РНК и с помощью специальных белковых факторов — кор-фермент. Кор-фермент соединяется с а-субъединицей, и цикл транскрипции повторяется. Таким образом, на матрице ДНК синтезируется много молекул идентичных РНК. [c.307]

Элонгация заканчивается тогда, когда в рибосому на мРНК приходят сигналы окончания синтеза белка. Ими являются один или несколько кодонов-терминаторов УАА, УАГ и УГА. Наличие их в любом участке мРНК приводит к окончанию белкового синтеза. В терминации участвуют различные белковые факторы. [c.370]

Ни для одного из кодонов-терминаторов не найдено соответствующей тРНК. Это исключает возможность механизма терминации с участием специальной тРНК, которая узнает нонсенс-сигнал для прекращения белкового синтеза. Вместо этого существуют сигнальные белковые факторы, которые вступают в действие как раз в тот момент, когда рибосома доходит до кодона-терминатора. Таким образом, терминирующие кодоны являются знаками пунктуации, механизм действия которых отличается от механизма действия кодонов, детерминирующих аминокислоты. [c.61]

Антитерминация представляет собой особый регуляторный механизм. Различные белки (факторы антитер-минации) позволяют РНК-полимеразе проскакивать определенные терминирующие последовательности. Таким образом, контролируется способность фермента транскрибировать гены, расположенные за терминатором. Данный механизм характерен для регуляторных систем фагов. [c.162]

Фактор р был описан как белок, добавление которого в систему транскрипции, полученную из Е. oli, приводит к образованию дискретных молекул РНК с уникальными концами. Из этого, очевидно, следует, что соответствующие терминаторы на ДНК-матрице могут функционировать только в присутствии фактора р. Их называют р-за-висимыми терминаторами. Фактор р in vitro оказывает свое действие только в среде с относительно низкой ионной силой. [c.163]

Степень зависимости от фактора р варьирует. Для некоторых терминаторов необходима относительно высокая концентрация фактора р, тогда как другие хорощо функционируют при более низких его концентрациях. Эти вариации отражают истинные различия в эффективности терминации, обнаруживаемые in vivo. [c.163]

Существуют ли терминаторы полностью независимые от фактора р Некоторые терминаторы in vitro при встрече с минимальным ферментом, по видимому, способны в одиночку осуществлять весь комплекс термина-ционных реакций. Это так называемые р-независимые терминаторы. Однако мы должны с осторожностью трактовать эти данные, так как возможно, что в действительности в бактериальной клетке фактор р также необходим для узнавания таких сигналов терминации. In vitro в отсутствие фактора р эти терминаторы проявляют свое действие только тогда, когда транскрипция происходит в условиях относительно высокой ионной силы. При этом, возможно, истинная (при низкой ионной силе) зависимость от фактора р не тестируется. [c.163]

Результаты, получаемые in vitro, не вносят в этот вопрос окончательной ясности, поскольку р-зависимые и р-независимые терминаторы необходимо исследовать в различных условиях. Какую информацию можно получить in vivo Существуют бактериальные мутации, нарушающие активность фактора р. Хотя такие мутации по-разному влияют на различные р-зависимые терминаторы, как правило, они не сказываются на процессе терминации в сайтах, которые in vitro были охарактеризованы как р-независимые. [c.163]

Идея о том, что фактор р передвигается вдоль РНК, позволила высказать важное предположение о взаимосвязи процессов транскрипции и трансляции. Для того чтобы фактор р мог осуществлять свое действие, ему необходимо, во-первых, связаться с 5 -концом мРНК и, во-вторых, передвигаться вдоль молекулы. Рибосомы, транслирующие мРНК, препятствуют реализации каждого из этих условий. Поэтому достигнет ли фактор р терминатора, на котором сделала тузу РНК-полимераза, во многом зависит от событий, происходящих во время трансляции. [c.166]

Предположим, что внутри транскрипционной единицы могут существовать р-зависимые терминаторы, располагающиеся перед основным терминатором. Тогда явление полярности можно объяснить как на рис. 13.4. Обычно терминаторы, находящиеся внутри транскрипционной единицы, не работают, так как из-за присутствия рибосом фактор р на этих терминаторах никогда не взаимодействует с РНК-полимеразой, хотя она делает здесь паузу. Нонсенс-мутации приводят к освобождению мРНК от рибосом, и поэтому у фактора р появляется возможность свободно передвигаться вдоль мРНК. В результате он может провзаимодействовать с полимеразой, остановившейся на терминаторе. Это приведет к терминации и освобождению РНК-полимеразы. Следовательно, дистальная часть транскрипционной единицы не сможет экспрессироваться. (Для чего существуют внутренние терминаторы Возможно, что они являются просто шпильками, похожими на те, которые возникают на обычных терминаторах. Терминация с участием этих структур может происходить только в необычных условиях полярности). [c.167]

Мутации в гене rho в разной степени сказываются на процессе терминации. Общий эффект этих мутаций заключается в нарушении терминации. Но степень повреждения, если ее оценивать по проценту случаев прочитывания терминатора in vivo, зависит от конкретного терминатора. По-видимому, это отражает тот факт, что большинство мутаций, влияющих на активность фактора р, являются leaky, поэтому у них сохраняется вполне определенная терминирующая активность. Если для работы различных терминаторов необходимо разное количество фактора р, то оставшаяся в мутантных клетках активность может обеспечить работу некоторых терминаторов, для функционирования которых требуется низкая концентрация р, тогда как другие не смогут функционировать в этих условиях и РНК-полимераза сможет преодолевать их. [c.167]

Способность мутаций suA супрессировать полярность объясняется тем, что они понижают вероятность взаимодействия фактора р с внутренними терминаторами, следующими за нонсенс-кодонами. Благодаря этому остановка трансляции не вызовет терминирования транскрипции и область мРНК, расположенная за мутантным кодоном, сможет транслироваться вновь прикрепившимися рибосомами. [c.167]

Как же осуществляется антитерминация Когда белок pN узнает сайт nut, он должен провзаимодействовать с РНК-полимеразой в этом сайте, модифицировав ее таким образом, что она в дальнейшем, находясь на терминаторе, уже не отвечает на фактор р. Различная локализация сайтов nut указывает на то, что это событие не связано ни с инициацией, ни с терминацией, а осуществляется под действием РНК-полимеразы в момент элонгации РНК в сайте nut. [c.170]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология