Отрицательная маркеры

При разделении нуклеиновых кислот используют те же методы, что и при фракционировании белков, однако имеются ограничения, обусловленные большим диапазоном величин молекулярной массы (2-10 —Ы0 ° Да), отклонениями от глобулярной формы, различиями в четвертичной структуре (двухнитевые, однонитевые, кольцевые), значительным отрицательным зарядом в нейтральной области pH. Поэтому методы гель-фильтрации и ионообменной хроматографии не получили широкого распространения при фракционировании нуклеиновых кислот и значительно уступают ультрацентрифугированию и электрофоретическому разделению в геле агарозы, полиакриламидном геле или их смеси. Поскольку величина отрицательного заряда нуклеиновых кислот и продуктов их расщепления мало зависит от pH, а отношение заряда к молекулярной массе сохраняется практически неизменным, разделение нуклеиновых кислот при электрофорезе определяется не их зарядом, а размером молекул. При наличии маркеров с известной молекулярной массой возможно определение молекулярной массы препаратов нуклеиновых кислот и их фрагментов. [c.171]

Результаты испытаний представлены на рис. 8 и 9. Благодаря этим измерениям было четко показано, что ЭОП увеличивается по мере уменьшения концентрации буфера и поэтому подходит для анализа сильно отрицательно заряженных, мигрирующих против ЭОП проб. При постоянном напряжении (10 кВ) и концентрации буфера 5 мМ бензолтрикарбоновая кислота еще может быть обнаружена, однако при том же самом времени анализа и концентрации буфера 50 мМ можно детектировать только бензойную кислоту При этом ток повышается с 10 до 130 мА. Аналогичное поведение можно наблюдать для веществ, подвергаемых разделению при постоянном токе (100 мА). Работая с буфером 10 мМ при 26 кВ, в течение 8 минут можно обнаружить все четыре тестовых вещества, в то время как в буфере 50 мМ удается детектировать только нейтральный маркер (бензиловый спирт). В этом буфере при [c.13]

Электрофорез в присутствии додецилсульфата натрия (ДДС-N3). В этой системе суммарный заряд белка маскируется добавлением ДДС-Ыа, который окутывает белки облаком отрицательных зарядов. Предполагается, что все комплексы ДДС-белков имеют заряды одинаковой плотности, процесс разделения происходит только по одному параметру — размеру молекулы. Эта система позволяет в то же время определять молекулярную массу изучаемых белков с помощью маркеров — набора белков с заранее известными значениями молекулярной массы. [c.40]

Достаточно наивная и, как стало ясно впоследствии, неверная интерпретация этих наблюдений сводилась к предположению, что на небольщих участках ДНК двойные перекресты возникают чаще, чем можно ожидать на основании данных о частоте кроссинговера для каждой пары генетических маркеров. Сегодня мы понимаем, что явление высокой отрицательной интерференции в действительности связано не с возникновением множественных кроссинговеров на небольших участках хромосомы, как можно было бы полагать, исходя из определения интерференции. Напротив, в основе этого явления лежат процессы, затрагивающие область единичного перекреста. Механизмы, обусловливающие высокую отрицательную интерференцию, наблюдавшуюся при фаговом скрещивании, оставались неясными до тех пор, пока аналогич- [c.140]

Гетерогенность — это настоящий кошмар для генетика, поскольку в разных семьях можно найти свидетельства как в пользу сцепления, так и против него. Даже небольшая степень гетерогенности может сказаться на стандартном лод-балле, приводя к отрицательным значениям, даже если маркер тесно сцеплен с одним из локусов, контролирующих признак. (Вследствие этого необходимо быть очень осторожным при исключении локуса из кандидатов на ген болезни во всех случаях, когда возможна гетерогенность, а она встречается почти всегда.) [c.225]

Мутации lear фага Неселективный маркер Низкая отрицательная интерференция Одиночный цикл развития фага Профаг [c.222]

Анализ частот возникновения рекомбинантных генотипов при трехфакторном скрещивании дает дополнительное (хотя и косвенное) подтверждение тому, что процесс рекомбинации сопровождается образованием гетеродуплексных участков ДНК. Впервые это было отмечено при изучении явления высокой отрицательной интерференции при скрещиваниях с участием очень тесно сцепленных генетических маркеров. Понятие интерференция (I), введенное нами в гл. 5, определяется формулой I = — с, где с коэффициент совпадения (коинциденции), т.е. отношение числа наблюдаемых двойных перекрестов к числу ожидаемых, при трехфакторном скрещивании. В большинстве случаев при скрещиваниях с участием маркеров в трех различных сцепленных генах (х — у — г) оказывается, что образование перекреста между х и у снижает вероятность образования второго перекреста в интервале между у и г. То есть в таких скрещиваниях величина с меньше 1, а / соответственно положительное число, отражающее наблюдаемую величину интерференции (см. гл. 5). [c.139]

В первом приближении это предположение нашло подтверждение в рассмотренных опытах по изучению генной конверсии. Напомним, что половина всех наблюдаемых генно-конверсионных событий в локусе агд4 сопровождалась рекомбинацией фланкирующих маркеров. Это можно рассматривать, как генетическое подтверждение процесса изомеризации структур Холлидея (рис. 14.1, Ж, 3) и дополнительное указание на то, что структуры этого типа выступают в качестве интермедиатов при генетической рекомбинации у эукариот. В действительности горизонтальное расщепление структуры Холлидея, не сопровождающееся рекомбинацией фланкирующих маркеров, но приводящее к закреплению гетеродуплексных участков в дочерних молекулах ДНК, проявляется подобно двойному кроссинговеру и характеризуется высокой отрицательной интерференцией даже в отсутствие репарации неправильных пар нуклеотидов (см. первую диаграмму на рис. 14.9, Б). [c.146]

В табл. 9.9 приведены частоты гена серповидноклеточности среди населения различных мест Карибского бассейна. Обратите внимание на то, что она варьирует от 23% (что равно частоте гена в Африке) до 7%. Интересно, что высокие частоты гена обнаружены в Гондурасе и Суринаме — областях, где малярия очень распространена, а низкие—на островах Кюрасао и Барбадос, где малярии нет В США путем изучения 15 удобных генетических маркеров в популяциях черной расы было установлено, что миграция генов белой расы в эти популяции была порядка т —0,1—0,2. Однако вычисленное значение т для гена серповидноклеточности составило 0,46—0,69. Поскольку это значение слишком велико по сравнению со значениями для других генов, был сделан вывод, что среди американских популящй черной расы происходил значительный отрицательный отбор против гена серповидноклеточности. [c.246]

Другой, по-видимому чаще используемый, подход основывается на количественном исследовании ферментативной активности в случаях с хромосомными аномалиями. Большинство ферментов характеризуются четко различимым эффектом дозы гена, т.е. гетерозиготы по ферментативной недостаточности обнаруживают примерно 50%-ную ферментативную активность. Сходный эффект дозы гена можно ожидать и в том случае, когда ген теряется вследствие делеции. Такой подход к картированию использовался для большого числа генетических маркеров. Чаще всего результат оказывался отрицательным, но такого рода исключающее картирование полезно тем, что может сузить область вероятной локализации генов-маркеров. Следует, правда, учесть, что на основе этого подхода были сделаны и неправильные выводы, поскольку наличие молчащего (нулевого) аллеля, т.е. непроявляющейся мутации, может имитировать эффект делеции. [c.199]

При увеличении числа локусов, которые можно включить в анализ сцепления, шансы установления сцепления возрастают. Например, если локусы равномерно распределены по геному и если анализ сцепления указывает на 0 = 0,4 как на максимальное значение частоты рекомбинащш, вероятность выявления по крайней мере одного сцепления равна 0,35 при 20 маркерах и 0,5 при 30 маркерах. Дополнительную информацию дает знание о принадлежности маркеров конкретным хромосомам. Например, обнаружение сцепления с редкой кожной аномалией (акрокератоэластоидоз) дает положительные, но статистические незначимые логарифмические шансы для двух маркеров остальные маркеры дают отрицательные шансы. Обычно больше никаких выводов сделать нельзя. Однако, поскольку ранее для этих двух локусов бьша установлена принадлежность хромосоме 2, то главный локус также можно приписать этой хромосоме и предположить сцепление с маркерным локусом [688 а]. [c.245]

Пусть N индивидуумов протипировано по двум маркерам А и В, контролируемым двумя генами, каждый из которых имеет два аллеля, т. е. Л, а и В, Ь. Строчная буква обозначает рецессивный, или немой (отрицательный), аллель. На нижеследующей четырехпольной таблице дано распределение фенотипов [c.463]

В тимусе происходит положительная и отрицательная селекция развивающихся Т-клеток Положительная селекция Т-клетки распознают антигенные пептиды только представленными в контексте собственных молекул МНС на поверхности АПК (см. гл. 7 и 9). В действительности Т-клетки осуществляют двойное распознавание - и антигенных пептидов, и полиморфной части молекул МНС. (Маркер С04, присутствующий на поверхности Т-клеток одной из субпопуляций, распознает неполиморфную часть молекул класса II.) Положительная селекция (называемая также обучением в тимусе ) заключается в том, что дальнейшей дифференцировке подвергаются только те клетки, ТкР которых обладают невысокой аффинностью к собственным молекулам МНС. По имеющимся данным, положительную селекцию осуществляют эпителиальные клетки тимуса, выступающие в роли АПК рис. 12.8). Т-клетки, рецепторы которых обладают очень высокой или очень низкой аффинностью к собственным молекулам МНС, подвергаются в корковой зоне тимуса апоптозу и погибают. Апоптоз — это запрограммированное самоубийство клетки, осуществляемое активированными эндогенными нуклеазами путем расщепления ДНК на фрагменты рис. 12.9). [c.224]

Электрофореграммы продуктов RT-P R-фрагмепта, содержащего HERV-K LTR, и последовательностей, фланкирующих собственно LTR-элемент. Дорожки 1 - семинома 6S 2 - семинома 30S 3 - нормальная ткань 30N 4 - отрицательный контроль 5 - ДНК человека 6 - М-маркер мол. веса pU mix. RT-P R-продукт (рис. справа) для нормальных клеток паренхимы - 1437 п.н. (дорожка 3) помимо транскриптов одинакового размера для семином 6S (дорожка 1) и 30S (дорожка 2) имеет дополнительный транскрипт меньшего размера (дорожка 3) [c.83]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология