Вирусы с негативным геномом

Один из основных путей адаптации организмов к изменяющимся условиям окружающей среды — регуля щя экспрессии генов. Этот процесс, детально изученный для бактерий и вирусов, заключается в специфическом взаимодействии определенных белков с различными участками ДНК, расположенными рядом с сайтами инициации транскрипции. Такие взаимодействия могут характеризоваться как позитивным (положительным), так и негативным (отрицательным) влиянием на уровень транскрипции. В эукариотических клетках используются и другие механизмы регуляции транскрипции. В контроле экспрессии генов могут участвовать амплификация, генные перестройки, переключение классов и посттранскрипционные модификации. [c.109]

В. Вирусы с негативным геномом не содержат генов, кодирующих [c.34]

Механизм транскрипции у вируса гриппа уникален, поскольку предусматривает специфическую кооперацию вирусных и клеточных факторов. Здесь мы имеем дело с вирусом, содержащим негативный РНК-геном, транскрипция которого осуществляется вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразой, функционально сходной с РНК-транскриптазами других вирусов с негативной РНК, в том числе и парамиксовирусов. Однако в отличие от них [c.458]

Недавно обнаружено еще одно различие между представителями двух семейств вирусов с негативным несегментированным геномом. Оказалось, что в гене, кодирующем Р-белок, ассоциированный с полимеразной активностью вируса Сендай, присутст- [c.476]

Репликация геномов РНК-вирусов точно так же, как и репликация ДНК, связана с образованием комплементарных полинуклеотидных цепей. У большинства РНК-вирусов этот процесс катализируют РНК-зависимые РНК-полимеразы (репликазы), кодируемые РНК-хромосомой вируса. Эти ферменты часто включаются в дочерние вирусные частицы, и тогда при вирусной инфекции они уже сразу имеются в наличии, т.е. могут немедленно начинать репликацию вирусной РНК. У так называемых вирусов с негативным геномом, к которым принадлежа , в частности, вирусы гриппа и везикулярного стоматита, репликазы всегда включаются в капсид. Вирусы этой группы называются так потому, что > них инфицирующая цепь не кодирует никаких белков только комплементарная ей цепь несет необходимые для этого нуклеотидные последовательности. Таким образом, инфицирующая цепь не может индуцировать размножение вируса без предобразованной репликазы. У РНК-вирусов с позитивным геномом, например у вируса полиомиелита, дело обстоит иначе здесь вирусная РНК может выступать в роли мРНК, и у этих вирусов голый геном инфекционен. [c.317]

Как мы уже отмечали, говоря о репликации РНК вируса гриппа, механизм, переключающий транскрипцию минус-цепей на их репликацию, принципиально важен, но до сих пор плохо изучен. В разделе, посвященном вирусу гриппа, мы упоминали о том, что транскрипция сегментов РНК заканчивается на рас-стоянии> 10 нуклеотидов от конца матрицы. Поэтому в ходе репликативного синтеза ключевую роль играет антитерминация, позволяющая РНК-полимеразе копировать oligo (U)-сигнал инициации полиаденилирования и последующие нуклеотиды. Для РНК-содержащих вирусов с несегментированным негативным геном антитерминация в ходе репликативного синтеза представляет собой еще более серьезную проблему. Дело в том, что для синтеза промежуточной матрицы — позитивного антигенома — РНК-полимераза не должна обращать внимания на сигнальные последовательности на границе лидер — ген NP , а кроме того, на границе всех последующих вирусных генов (рис. 24.15). Мы уже отмечали, что эволюционная консервативность сигналов терминации транскрипции у VSV и вируса Сендай указывает на важность этих нуклеотидных последовательностей для обеих РНК-полимераз. Правда, чтобы понять механизмы взаимодействия сигнальных последовательностей с комплексом полимераз- [c.477]

Вектор для позитивно-негативной селекции обычно содержит следующие элементы 1) два блока последовательностей (НВ1 и НВ2), гомологичных отдельным участкам сайта-мишени 2) трансген (ТО), кодирующий новую функцию реципиента 3) последовательность, кодирующую устойчивость к соединению 0-418 (КеоО 4) два разных гена тимидинкиназы 1к1 и 1к2) вируса простого герпеса типов 1 и 2 (Н8У-Г / и Н8У-/ 2) (рис. 19.5, А). Ключевым для позитивно-негативной селекции является взаимное расположение этих элементов. Трансген и ген устойчивости к 0-418 (МеоО должны находиться между двумя участками ДНК, гомологичными сайту-мишени, а гены Н8У- А / и НБУ-(к2 - по бокам этой конструкции. Если встраивание происходит в случайный сайт (не в НВ1 и НВ2), то с высокой вероятностью вместе с другими последовательностями интегрируют один или оба гена Н8У-/ (рис. 19.5, А). Напротив, если интеграция происходит в результате гомологичной рекомбинации путем двойного кроссинговера в нужный сайт, то в геном встроятся только трансген и ген N60 а гены Н5У-/Л - нет (рис. 19.5, Б). При выращивании трансфицированных клеток в присутствии 0-418 клетки, не несущие ген Neo расти не будут. Выживут только клетки, в которых произошла интеграция -иными словами, осуществляется позитивная селекция. Если одновременно с 0-418 в среду [c.422]

На начальном этапе наших исследований основной интерес был обращен на два регуляторных гена HIV- tat и nef. Эти гены по существовавшим на то время данным имели разнонаправленное влияние на экспрессию и репликацию HIV в клетках. Ген tat рассматривался как трансактиватор транскрипции HIV, а ген ие/как негативный фактор экспрессии вирусных генов и репликации вируса. При этом весьма мало было известно относительно влияния этих генов на клеточные гены. Однако уже первые исследования по влиянию продуктов регуляторных генов на клеточный метаболизм показали, что существует тесная взаимосвязь между этими процессами. Постепен- [c.150]

B. Неправильно. Негативные геномы РНК-содержащих вирусов действительно не служат непосредственно в качестве мРНК, но комплементарные им РНК могут выполнять эту роль таким образом, негативные геномы содержат гены. [c.301]

Подобно большинству других РНК, выполняющих функцию мРНК, геном пикорнавирусов содержит на З -конце участок poly (А) варьирующей длины. Эта вариабельность сохраняется и после очистки вируса клонированием из бляшки (негативной колонии). Тем не менее средний размер варьирующего участка генетически обусловлен и изменяется от 35 для вируса ЕМС до 100 у афтовирусов (табл. 18.3). [c.195]

Об этапах и процессах, участвующих в репликации флебовирусов, пока ничего не известно. Клонирование ДНК и определение аминокислотной последовательности [122] позволили установить, что белок N вируса РТ кодируется комплементарной последовательностью S-сегмента РНК (в З -концевой половине). Другой белок (неструк1урный белок NS ) кодируется 5 -концевой половиной сегмента S [122]. Таким образом, вирус имеет амбиполярную РНК, т. е. одновременно и позитивную и негативную. Межгенная область богата последовательностями как уридиловых, так и адениловых остатков [122]. Гибридизационный анализ позволил обнаружить дискретные субгеномные мРНК в экстрактах зараженных клеток, которые соответствуют двум генам S-сегмента [122]. [c.386]

К рабдовирусам относится ряд важных в экономическом отношении (патогенных для животных и растений) вирусов, а также летальный вирус бешенства [44]. Их геном представлен одноцепочечной РНК с мол. массой (4—5)-10 , которая кодирует небольшое число белков, обычно пять. В ранних работах показано, что депротеинизированная геномная РНК не инфекционна. Как мы теперь знаем, это наблюдение отражает тот факт, что вирусная РНК имеет негативную полярность (т. е. комплементарна мРНК), и, следовательно, для синтеза мРНК вирус, заражающий клетку, должен содержать вирус-специфи-ческую РНК-зависимую РНК-полимеразу. [c.418]

НЫХ И инкапсидированных генных сегментов выходят из вирионов вируса гриппа (рис. 24.2) или выявляются внутри них с помощью негативного контрастирования (рис. 24.1,Л). Эти комплексы образуют большие спирали, плотно уложенные внутри вириона (рис. 24.1, Л) или же более растянутые (рис. 24.2). Они существенно отличаются от узких спиралей собственно нуклеокапсидных сегментов [30]. Последние довольно трудно рассмотреть на фотографиях, приводимых в большинстве статей, поскольку их контуры менее отчетливы, чем у жуклеокапсндных спиралей парамиксовирусов (рис. 24.3,5). Структурные единицы нуклеокапсида вируса гриппа, состоящие из главного белка [c.450]

Для удобства мы выбрали вирус гриппа А как прототип ортомиксовирусов и вирус Сендай как прототип парамиксовирусов. Подробнее о вирусах гриппа В и С, а также о других парамиксовирусах см. соответствующие обзоры. Геном вируса гриппа А содержит 10 генов, распределенных по восьми сегментам РНК (табл. 24.2). Несмотря на столь явные отличия от вируса Сендай с его несегментированным геномом, оба они относятся к вирусам с негативным РНК-геномом, а их белковые продукты имеют много общего. Генетическая информация закодирована в негативном PH К-геноме в форме, комплементарной таковой для вирусной информационной РНК (мРНК). [c.451]

Поэтому геном негативной полярности должен транскрибироваться РНК-полимеразой с образованием позитивной мРНК. По некоторым данным клетки растений содержат РНК-зависимую РНК-полимеразу [65] в то же время в клетках животных, где размножаются интересующие нас вирусы, такая фермента- [c.452]

Для вирусов гриппа описана также внутрисегментная (генная) рекомбинация [58], однако частота ее столь низка, что роль этого процесса в природной изменчивости минимальна. Тем не менее полученные данные указывают на то, что репликативный аппарат вируса гриппа способен в ряде случаев отсоединяться от матрицы, с которой он был связан. Очевидно, в этих случаях происходит преждевременная терминация на исходной матрице и комплекс репликативных белков (репликаза) возобновляет синтез на другой, гомологичной цепи (механизм смены матрицы). Такая преждевременная терминация приводит к появлению различного рода мутантов. Например, возобновление синтеза может произойти не точно в сайте терминации, а на несколько нуклеотидов дальше. При этом независимо от того, используется ли для возобновления репликации исходная цепь или гомологичная ей, образуются делеционные мутанты. Делеционные мутанты, сохраняющие концевые последовательности, служащие сигналами инициации синтеза РНК, часто образуются у вирусов с негативным РНК-геномом. Они называются дефектными интерферирующими частицами (ДИ-частицами) (гл. 7). Их дефектность обусловлена утратой генетической информации для синтеза необходимых белков, а способность интерферировать с полноценным вирусом объясняется высоким сродством к ферментативному аппарату репликации. Пока для вируса гриппа описаны ДИ-РНК, являющиеся производными сегментов РНК с 1-го по 3-й. Однако нет оснований считать, что другие сегменты устойчивы к накоплению делеций. Примером того, насколько резкие изменения может претерпевать репликативный комплекс вируса гриппа, служит рекомбинантная ДИ-РНК, описанная Филдсом и Уинтером [17]. Она содержит пять разных участков из третьего сегмента и, кроме того, область длиной 60 нуклеотидов из первого сегмента. Несмотря на измененную внутреннюю структуру, такая РНК поддерживается в популяции, поскольку содержит на обоих концах последовательности стандартного вируса. Недавно было показано [И]. что наиболее распространенные ДИ-РНК вирусов гриппа с одной внутренней делецией мо- [c.468]

Вирусы с несегментированным негативным геномом характеризуются гораздо меньшей изменчивостью, чем вирус гриппа. Одна из причин этого довольно очевидна несегментированность генома делает невозможными пересортировки и перегруппировки, приводящие у вируса гриппа к появлению новых, доступных для тестирования и отбора генных комбинаций. Конечно, рекомбинация, основанная на механизме смены матрицы, по-прежнему возможна, и не только внутригенная, но и межгенная. Тем не менее, за исключением данных о существовании у негативных не-сегментированных вирусов ДИ-форм (см. ниже), все попытки обнаружить у парамиксовируса NDV классическую рекомбинацию не привели к успеху [23]. [c.478]

Инфицированные клетки в монослое можно обнаружить по образующимся бляшкам. Отметим, что отличить бляшки, содержащие смещанное потомство, от тех, которые содержат только 8У40 дикого типа, довольно трудно. Для этого нужно провести дополнительный анализ вирионов, полученных из отдельных бляшек, и идентифицировать те из них, которые содержат рекомбинантную ДНК. Однако эту проблему легко решить, если использовать вектор, сохраняющий по крайней мере один функциональный вирусный ген, и вирус-помощник, дефектный в отношении гена, поставляемого векторной молекулой. В этом случае негативные колонии будут образовываться только теми клетками, которые трансфицированы обеими ДНК. Например, если встроенный сегмент ДНК замещает участок, кодирующий поздние белки УР1, УР2 и УРЗ, то соответствующий вирус-помощник должен иметь мутацию в гене больщого Т-антигена. Рекомбинант обеспечивает синтез больщого Т-ан-тигена, а вирус-помощник отвечает за синтез белков УР1, УР2 и УРЗ (рис. 5.36). И наоборот, если встроенный сегмент ДНК замещает раштюю область 5У40, то вирус-помощник должен обеспечивать синтез функционального больщого Т-антигена, но не капсидных белков. В отличие от трансфекции с использованием в качестве помощника вируса дикого типа каждая бляшка, образующаяся после трансфекции векторной и дефектной вирусными ДНК, содержит смешанное потомство. [c.262]

Смотреть страницы где упоминается термин Вирусы с негативным геномом: [c.401] [c.317] [c.314] [c.116] [c.31] [c.203] [c.116] [c.199] [c.131] [c.188] [c.31] [c.203] [c.402] [c.405] [c.151] [c.294] [c.80] [c.194] [c.51] [c.61] [c.178] [c.370] [c.417] [c.422] [c.314]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология