Процессы трансляции

МОДЕЛЬ ПРОЦЕССА ТРАНСЛЯЦИИ мРНК С УЧЕТОМ ВЛИЯНИЯ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ [c.156]

Элонгация - продолжение процесса трансляции, последовательное включение остатков АК в состав растущей полипептидной цепи. Каждый акт элонгации состоит из трех ступеней [c.58]

В процессе трансляции на печать выводится следующая информация. [c.478]

Команды на машинном языке, полученные в результате процесса трансляции, передавались обратно в машину уже для непосредственного счета. [c.40]

В процессе трансляции выполняется анализ конструкций входного языка и их разложение на элементарные единицы. Каждой такой единице однозначно ставится в соответствие группа машинных команд (элементарный участок). [c.67]

КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПРОЦЕССА ТРАНСЛЯЦИИ [c.155]

Все синтезируемые в процессе трансляции белки построены из остатков 20 аминокислот (т. наз. кодируемых). Какой именно кодон ответствен за включение той или иной аминокислоты, можно определить по таблице, в к-рой буквы А, Г, У, Ц обозначают основания, входящие в нуклеотиды (соотв. аденин, гуанин, урацил, цитозин) в вертикальном ряду слева-в первый нуклеотид кодона, в горизонтальном ряду сверху-во второй, в вертикальном ряду справа-в третий. Трехбуквенные сочетания, напр, фен, сер, лей,-сокращенные назв. аминокислот. Прочерки в таблице означают, что три кодона-УАА, УАГ и УГА в нормальных условиях не кодируют к.-л. аминокислоты. Такие кодоны наз. бессмысленными , или нонсенс-кодонами. Оии являются сигналами остановки синтеза полипептидной цепи. [c.518]

Во всяком случае, чересчур большая строгость кодирования в процессе трансляции, по-видимому, сильно ограничила бы жизненную гибкость и потенции клетки. [c.174]

Остатки аминокислот, включаемых в состав белков в процессе биосинтеза в рибосомах, ограничены, естественно, остатками, закодированными последовательностью оснований в информационной РНК они переносятся специфическими молекулами транспортных РНК. Только в процессе трансляции происходит включение 19 остатков аминокислот и иминокислоты пролина (табл. 23.2.1). [c.225]

Таким образом, генератор конечного детерминированного автомата можно рассматривать как транслятор метаязыка модифицированной формы Бэкуса—Наура. Этот транслятор использует упомянутые выше лексический и синтаксический анализаторы на основе разработанного исходного конечного автомата, который соответствует грамматике Бэкуса—Наура. Следует отметить, что данный генератор обладает свойством самопорождения, т. е. может генерировать конечный автомат, с помощью которого осуществляется сам процесс трансляции грамматик, написанных на метаязыке модифицированной формы Бэкуса—Наура. Итак, конечный детерминированный автомат с магазинной памятью, соответствующий грамматике проблемно-ориентированного языка общения пользователя с ЭВМ на определенном этапе диалога, с.ледует рассматривать в качестве самостоятельной части этого этапа, которая управляет процессом разбора и выполнения сформированного запроса пользователя с помощью универсальных блоков лексического и синтаксического анализов. [c.270]

Служебная информация транслятора. К моменту ввода программы транслятор должен находиться в запоминающем устройстве машины, а именно, на магнитной ленте. Собственно ввод исходной программы осуществляет транслятор, для чего часть его по специальному обращению (обращение состоит из команды чтения с ленты) вызывается в МОЗУ. Весь транслятор не может поместиться в МОЗУ (его объем превышает 20000 слов), поэтому в процессе трансляции он вызывается отдельными частями. [c.478]

В молекулярных системах сохранение определенной последовательности нуклеотидов (информации / ,ах) зависит прежде всего от химической стабильности молекулы ДНК. Информационная емкость определяется числом определенных комбинаций нуклеотидов, а не числом микросостояний, включающих колебания всех атомов цепочки ДНК. Само образование макроинформации здесь сопряжено с работой и затратой энергии в процессе биосинтеза молекулы ДНК. Точно так же реализация этой информации возможна при затрате энергии в процессах трансляции информации и синтеза белковой цепи. [c.404]

В последние годы возрастает интерес к теоретическому исследовании процесса трансляции на основе компыэтерного моделирования. Это обусловленно не только тем, что трансляция наряду с репликацией и транскрипцией относится к числу фундаментальных генетических процессов, но также и требованиями генно -инженерных исследований, направленных на разработку методов конструирования искусственных молекулярно-генетических систем с заданными свойствами. [c.155]

В рамках нашей работы внимание сосредоточено на моделировании процесса трансляции с детальным описанием влияния вторичной структуры мРНК на элонгацию рибосом. Построенная имитационная модель позволяет оценивать эффективность процесса трансляции мРНК с учетом параметров ее вторичной структуры I энергетическая стабильность шпилек, количество комплементарных пар [c.155]

Константа плавления является тем параметром, который характеризует степень влияния вторичной структуры на процесс трансляции. Процедура определения этого параметра описана ниже. В качестве третьей группы параметров модели рассматривались длина мРНК и линейный размер рибосомы (т.е. количество кодонов МРНК, покрываемых одной рибосомой, принятое равным 26 110 ). [c.162]

У нек-рых РНК-содержащих вирусов эукариот в РНК закодирювано большое число белков, которые в процессе трансляции синтезируются в виде гигантской единой полипептидной цепн (полипротеина), расчленяемой затем специфич. протеазами на отдельные белковые молекулы. [c.666]

Т.г. вырабатывается и секретируется в кровь специализир. клетками передней доли гипофиза. Синтез и секреция гормона контролируется тиролиберином. а-Субъединицы Т.г. и трех др. родственных гормонов кодируются одним геном, Рч убъединицы-разными. Каждая субъединица вначале синтезируется на отдельной матричной РНК. Синтез углеводных цепей происходит в процессе трансляции или после ее завершения. [c.589]

Последовательность оснований длиной 6 — 8 нуклеотидов, расположенная непосредственно перед инициирующим кодоном АУГ у Е. соИ, определяет эффективность процесса трансляции. Эта последовательность представляет собой участок связывания мРНК с рибосомой, и его сдвиг в ту или иную сторону способен уменьшать эффективность трансляции мРНК. По имени исследователей, идентифицировавших этот участок, он был назван последовательностью Шайн-Дальгарно. Обычно эту последовательность включают в состав самого вектора вместе с инициирующим кодоном на нужном расстоянии. При экспрессии векторов такого типа образуется гибридный белок, в котором несколько N-концевых аминокислотных остатков происходят от источника регуляторных элементов и инициирующего кодона прокариотического гена. Такие гибридные белки часто более стабильны обработка их химическим или ферментативным способом приводит к вьщелению эукариотической части белка. [c.123]

В процессе трансляции возможны ошибки в специфичности аминоацил-тРНК-синтетаз, которые присоединяют другие аминокислоты. Присутствие орнитина в некоторых арабиногалакто-протеинах может обусловливаться явлением именно этого типа. Кроме того, ошибочное аминоацилирование наблюдалось как результат структурных видоизменений аминоацил-тРНК-синтетаз или транспортных РНК [53]. [c.42]

Схема всех стадий процесса трансляции приведена на рис. 24. Показаны условия, необходимые для начала инициации, формирование инициирующего комплекса, появление участков (сайтов) Р и А и протекание элонгации, затем - перемещение рибосомы вдоль мРНК (транслокация), действие пеп-тидил-трансферазы, катализирующей образование пептидной связи, и, наконец, терминация процесса. После окончания биосинтеза полипептидной [c.58]

По-видимому, стабилизация двуспирального участка с участием инициаторного триплета либо за счет третичной структуры РНК, либо в результате специфического присоединения РНК-связьшающего белка, может полностью блокировать инициацию в данном участке. Так, очень похоже, что в MS2 РНК, а также в РНК родственных фагов R17, Г2 и др. третичной структурой заблокированы инициаторные триплеты как А-цистрона, так и S-цистрона. Инициация на А-цистроне происходит, вероятно, лишь в процессе синтеза РНК, когда полная пространственная структура еще не сформирована. Инициация на S-цистроне имеет место в процессе трансляции предшествующего С-цистрона рибосомы, считывая С-цистрон, расплетают РНК, освобождая участок с инициаторным триплетом S-цистрона из какого-то более стабильно свернутого состояния. Когда появляются готовые молекулы белка оболочки фага, снова происходит выключение инициации S-цистрона белок оболочки фага имеет специфическое сродство к нестабильной спирали, содержащей инициаторный AUG триплет (рис. 11), и, связываясь с ним, стабилизирует спираль. [c.24]

Очевидно, что для обеспечения однозначности, с которой мРНК кодирует белки в процессе трансляции, аминоацил-тРНК-синтетазы должны обладать исключительно высокой специфичностью в выборе Как аминокислоты, так и тРНК в качестве субстратов. В случае выбора аминокислоты ферменту приходится дискриминировать между субстратами, иногда очень близкими по структуре— например. [c.45]

То, что рибонуклеопротеидные гранулы (рибосомы) не равномерно диспергированы в цитоплазме животных клеток или в препарате частиц, полученных из микросом, а часто собраны в группы (цепи или кластеры), было отмечено еще в ранних электронно-микроскопических наблюдениях Дж. Паладе и др. Доказательство того, что такие агрегаты рибосом представляют собой частицы, соединенные цепью мРНК и находящиеся в процессе трансляции, были представлены одновременно несколькими группами в 1963 г. [c.55]

Таким образом, из рассмотрения рабочего цикла видно, что рибосома 4 процессе трансляции вьшолняет следующие функции 1) связьшание и Удержание мРНК 2) удержание пептидил-тРНК 3) связьшание амино- [c.135]

После завершения процесса трансляции на рибосомах белки могут претерпевать дальнейшие модификации. Последние различаются по степени сложности от образования дисульфидных мостиков в результате окисления близко расположенных пар тиольных групп и введения в молекулу белка малых групп, таких как гидроксил,. метил, ацетил, карбоксил и фосфат, до присоединения достаточно больших олигосахаридных звеньев. Многие белки, напротив, синтезируются и хранятся в виде биологически неактивных молекул, из которых в результате ограниченной и контролируемой протеолитической деградации образуются ферменты или полииептидные гормоны, [c.543]

Белковый синтез, или процесс трансляции, может быть условно разделен на 5 стадий, из которых две считаются подготовительными и завершающимися, в частности активирование аминокислот и постсинтетическая модификация белковой молекулы, и 3 стадии составляют собственно трансляцию. [c.523]

Следует отметить, однако, что до сих пор не раскрыты молекулярные механизмы, при помощи которых интерфероны тормозят размножение вирусов. Известно только, что интерфероны ингибируют биосинтез всех белков (и хозяйских, и вирусных), вероятнее всего, на уровне процесса трансляции. Возможно, что интерферон индуцирует синтез особого бел-ка-ингибитора, который затем связывается с рибосомами и блокирует трансляцию, или интерферон переводит один из активных эукариотических белковых факторов инициации в неактивный фактор путем фосфорилиро-вания. [c.93]

Роль кэпирования и полиаденилирования мРНК в белковом синтезе окончательно не выяснена. Предполагают, что кэп необходим для специфического узнавания в процессе трансляции, в то время как поли-А отводится роль фактора стабилизации всей молекулы мРНК. [c.107]

Независимо от типа РНК синтезированный в клетке продукт транскрипции (см. главу 13) всегда представлен единственной цепью, упакованной во вторичную структуру не случайно, а в соответствии с программой ДНК. Поскольку в составе РНК имеются свободные 2 -оксигруппы рибозы, не связанные со стандартным крик-уотсоновским спариванием азотистых оснований, появляются дополнительные возможности образования вторичной и третичной структур, содержащих выпуклости, щпильки, или крестообразные структуры. Особенности структуры тРНК имеют прямое отнощение к процессу трансляции, поэтому более подробно они рассмотрены в разделе биосинтеза белка (глава 14). [c.111]

Непосредственное отношение к механизмам передачи наследственной информации, или экспрессии генов, имеет процесс трансляции, означающий перевод четырехбуквенного языка нуклеиновьЕХ кислот на двадцатибуквенную речь белков . Другими словами, трансляция сводится к синтезу белка в рибосомах. В этом процессе только последовательность расположения нуклеотидов в мРНК определяет первичную структуру белка, т.е. строго упорядоченную последовательность расположения отдельных аминокислотных остатков в молекуле синтезируемого белка. [c.511]

Существует еще одно предположение, что на ДНК клетки синтезируются все мыслимые, возможные мРНК, которые поступают в цитоплазму, и процесс трансляции регулируется путем специфического и избирательного взаимодействия рибосом с определенными молекулами мРНК. [c.540]

Широко применяемые в клинике тетрациклины также оказались ингибиторами синтеза белка в 70S рибосоме (меньше тормозится синтез в 80S рибосоме). Они легко проникают через клеточную мембрану. Считают, что тетрациклины тормозят связывание аминоацил-тРНК с аминоацильным центром в 50S рибосоме. Возможно, что тетрациклины химически связываются с этим центром, выключая тем самым одну из ведущих стадий процесса трансляции. [c.543]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология