Эукариоты регуляция транскрипции

РЕГУЛЯТОРНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ ГЕНОВ И РЕГУЛЯЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ У ЭУКАРИОТ [c.195]

Инициация и регуляция транскрипции ДНК у эукариот с участием РНК-полимеразы в большей степени, чем у прокариот, зависит от множества других белков — факторов транскрипции, взаимодействующих с дискретными участками ДНК, образующих сложный эукариотический про.мотор. В районе промотора, прилегающего к сайту инициации транскрипции (кзп-сайту), обнаружены участки с характерными нуклеотидными последовательностями (мотивами), которые оказывают цис-действие на экспрессию близлежащего гена. Эти элементы могут взаимодействовать с РНК-полимеразой и другими белками-факторами транскрипции. Разные ядерные белковые факторы транскрипции, представляющие собой регуляторные белки, способны связываться с теми или иными нуклеотидными последовательностями ДНК, оказывая тем самым влияние На экспрессию разных генов. Такие белки, способные к диффузии [c.195]

Общие принципы регуляции транскрипции у прокариот хорошо известны (см. гл, 10). Однако многолетние поиски регуляторных белков эукариотической транскрипции пока привели к скромным успехам. У эукариот (за исключением дрожжей) не обнаружено Простых регуляторных генетических систем, доступных для биохимического исследования. Поэтому при поиске регуляторных ДИК-связывающих белков эукариот обычно используют различные варианты методов суррогатной генетики. [c.249]

Регуляция транскрипции ДНК-геномов вирусов эукариот [c.299]

Регуляция транскрипции у эукариот [c.45]

Итак, регуляция транскрипции у эукариот -это очень сложный процесс. Структурный ген может иметь множество регуляторных элементов, которые активируются специфическими сигналами в клетках разного типа в разное время клеточного цикла. Однако некоторые структурные гены находятся под контролем уникального фактора транскрипции. Специфические белки могут взаимодействовать с определенными регуляторными элементами и блокировать транскрипцию или связываться со всем транскрипционным комплексом еще до инициации транскрипции или во время элонгации. [c.47]

Таблица 29.2. Факторы, влияющие на регуляцию транскрипции эукариот

У эукариот аттенуация транскрипции участвует в регуляции небольшого числа генов. Так как в клеточном ядре функционально активные рибосомы отсутствуют, возможно, что с определенными последовательностями РНК связываются регуляторные молекулы, однако механизм аттенуации в клетках эукариот не изучен. [c.223]

Циклический АМР используется в метаболизме бактерий для многих целей, в частности для регуляции транскрипции. У высших эукариот, в том числе у человека, он имеет еще одну важную функцию служит эффектором, опосредующим действие гормонов. Большинство гормонов высших организмов не способно проникать внутрь клетки. Эти гормоны взаимодействуют с соответствующими рецепторами на поверхности клетки, и в результате контакта лиганда и рецептора в клеточной мембране происходят изменения, влияющие на синтез и катаболизм сАМР, который, в свою очередь регулирует транскрипцию. [c.130]

Методы изучения регуляции транскрипции. Прежде всего следует остановиться на основных методических подходах для изучения регуляции транскрипции у эукариот. В работе, как правило, используются клонированные гены, в которые вносят те или иные структурные изменения. В простейшем случае, о котором речь щла выще, можно вырезать какой-либо фрагмент ДНК с помощью подходящих рестриктаз и лигировать (сшить) между собой концы с помощью другого фермента, ДНК-лигазы. Можно, наоборот, встроить в то или иное место клонированной ДНК другие последовательности, разрезая ДНК в этом месте рестриктазой и затем вшивая туда вставку лигазой. Для вырезания более коротких блоков [c.68]

Сигналы регуляции транскрипции у эукариот [c.423]

Регуляция транскрипции по типу оперона характерна для прокариот и их вирусов-бактериофагов. Важной особенностью оперонов бактерий и фагов являются последовательности, состоящие из оператора и следующих за ним структурных генов, транскрибируемых как одно целое. У эукариот такие системы не найдены, хотя у них есть промоторные области. Для генов дрожжей, например, обычна ТАТА — последовательность Хогнесса, необходимая для инициации транскрипции. Терминаторы транскрипции — также обязательные элементы эукариотических генов. [c.423]

Единый механизм регуляции транскрипции у эукариот и прокариот [c.143]

Таким образом, механизм регуляции транскрипции у эукариот более гибкий, чем у прокариот. Фиксированная химическая структура прокариотических промоторов более приспособлена для ре- [c.31]

Больщинство данных, указывающих на влияние топоизомераз на топологию ДНК в процессе регуляции транскрипции у эукариот, носят косвенный характер и неполны. Прямые доказательства того, что изменения в плотности сверхвитков в хромосомных петлях влияют на активность транскрипции целой области или генов, расположенных в этой области, фактически отсутствуют. [c.139]

Основа регуляции транскрипции в случае ДНК-содержащих вирусов эукариот та же, что и у ДНК-содержащих фагов,— взаимное расположение и сила промоторов и терминаторов. Но в эукариотных системах встречаются новые регуляторные элементы, прежде всего энхансеры (см. гл. IX). Кроме того, образование зрелых молекул мРНК у ДНК-содержащих вирусов эукариот обычно связано с разнообразными посттранскрипционными изменениями (процессингом) первичных транскриптов. Это обстоятельство вносит важный вклад в регуляцию экспрессии генов. [c.299]

Характер образующихся транскриптов и способ регуляции транскрипции сильно зависят от того, имеем ли мы дело с вирусом прокариот или вирусом эукариот. Дело в том, что в клетках прокариот возможна множественная внутренняя инициация трансляции на полицистронных матрицах, тогда как в эукариотных молекулах РНК обычно реализуется единственная точка инициации грансляции и эти молекулы, как правило, функционально моноцистронны. [c.290]

Университетское руководство по молекулярной генетике, написанное вьщающимися американскими учеными. Книга содержит подробные сведения о структуре и функциях ДНК, РНК и белков репликации и функционировании генома, о транскрипции и трансляции в клетках про- и эукариот регуляции экспрессии генов, технологии рекомбинантных ДНК и др. С помощью схем, рисунков и таблиц авторы самые сложные вопросы излагают ясно и просто. [c.591]

Огромную роль в иерархии регуляторных механизмов играет регуляция на уровне транскрипции, рассмотрению которой посвящен 10.3. Этот механизм довольно хорошо изучен на ряде примеров у прокариот. Например, наличие в питательной среде для бактерий триптофана, который синтезируется специальной системой ферментов (см. 9.5), делает нецелесообразным синтез этих ферментов, и соответствующий промотор для транскрипции генов, программирующих структуру этих белков, выключается с помощью комплекса специального белка, триптофанового апорепрессора, с триптофаном. Особенно большое значение регуляция транскрипции имеет у эукариот, особенно у многоклеточных организмов, поскольку даже на разных фазах клеточного цикла, а тем более на стадиях мно- [c.420]

Еще более усложняется механизм регуляции транскрипции у эукариотов в связи с активацией фосфорилирующего фермента второй системой матричной регуляции, зависимой от цАМФ, с одной стороны, и стимуляцией метилирующего фермента АМФ, ббразующимся из цАМФ при участии цАМФ-фосфодиэстеразы,— е другой. Именно среди негистоновых белков и обнаружен этот фермент. [c.72]

В последнее время ситуация в корне изменилась. Благодаря новым методам генной инженерии для биохимического и генетического анализа стало доступным большое число белков-регуляторов эукариот Кроме того, у бактерий были выявлены белки-регуляторы, осушествляюшие свое действие на расстоянии. Данный раздел посвящен тому общему, что объединяет механизмы регуляции транскрипции генов у прокариот и у эукариот. Процессы, которые могут оказаться характерными только для эукариот, мы обсудим позднее в связи с проблемой дифференцировки клеток (см. разд. 10.3.8). [c.184]

У эукариот собственно гены, или транскрибируемые отрезки ДНК, разделены между собою протяженными отрезками молчащей, нетранскрибируемой ДНК, которые были названы спейсерами, или разделителями. Однако из того, что эти участки не транскрибируются, отнюдь не следует, что они не играют никакой роли в транскрипции. Напротив, накапливается все более данных, что именно преимущественно в спейсерах располагаются те сегменты ДНК, которым принадлежит решающая роль в регуляции работы генов, т. е. в регуляции транскрипции. [c.62]

Гетерохроматизация определенных участков хромосом часто сопровождается подавлением транскрипции расположенных в них генов [36]. В процесс гетерохроматизации могут быть вовлечены протяженные участки хромосом и даже целые хромосомы. В соответствии с этим считается, что регуляция транскрипции генов эукариот в основном происходит на двух уровнях. На первом [c.27]

У высших эукариот взаимосвязь регуляции транскрипции и репликации сложнее и ее анализ находится в настоящее время на стадии становления. Такое положение сложилось из-за того, что сами ori значительно больше по размеру и более сложно устроены (см. обзор De Pamphilis, 1993). Важной особенностью ori высших эукариот, также усложняющей их анализ, является то, что большинство известных ori локализованы в регуляторных районах генов (De Pamphilis, 1999). Присутствие сайтов связывания с различными транскрипционными факторами является неотъемлемой характеристикой этих районов. Однако функциональная значимость присутствия этих сайтов в огг-содержащих районах генома в настоящее время мало изучена. На данном этапе большое значение приобретают модельные исследования, в ходе которых функционирование различных генетических элементов и их комбинаций исследуется на автономных (эписомных) рекомбинантных конструкциях (см. обзор Murakami, Ito, 1999). [c.240]

Таким образом, вирусный геном содержит две противоположно ориентированные и регулируемые во времени единицы транскрипции, на каждую из которых приходится примерно половина последовательности ДНК. Мы подробно рассмотрим участок длиной примерно 300 п.н., разделяющий два сайта начала транскрипции. Внутри его рассеяны ис-действующие сигнальные последовательности, которые ответственны за регуляцию транскрипции ранней и поздней областей, а также репликации. Они были идентифицированы при изучении влияния разнообразных модификаций (например, делений, инсерций, замен пар оснований и перестроек) участка длиной 300 п. н. на транскрипцию и репликацию как in vitro, так и in vivo. Эти опыты, в которых исследовались взаимодействия между факторами транскрипции, репликации и специфическими последовательностями ДНК, помогли прояснить некоторые тонкие детали процесса размножения SV40, а также основные свойства регуляции транскрипции у эукариот. [c.49]

Изучение факторов транскрипции эукариот еще только начинается. Тем не менее уже определены некоторые структурные домены, создающие пространственный каркас, который обеспечивает специфические взаимодействия аминокислот с парами оснований. В каждом белке имеются два домена, один из которых отвечает за связывание ДНК, а второй-за регуляцию транскрипции. Домены не являются взаимозависимыми можно соединить домен связывания ДНК и регуляторный домен из разных белков и образовать факторы транскрипции со свойствами, характерными для каждого домена. Более того, если связывающаяся с белком последовательность располагается вблизи ТАТА-блока, то такие химерные белки могут присоединяться к ДНК и регулировать транскрипцию у целого ряда эукариот (например, дрожжей. Drosophila, лягушек и млекопитающих). [c.125]

Как указывалось в разд. 8.7.а, у эукариот хроматин представляет собой систему пегель разной длины, прикрепленных к белковому матриксу (рис. 8.107). Возможно, такая конфигурация обеспечивает независимость плотности сверхвитков в каждой петле от торсионного состояния соседних петель. Итересно, что ДНК-топоизомераза 11. фермент, ответственный за релаксацию сверхспиральной ДНК (разд. 2.1.е),-это один из основных белков хромосомного остова, к которому и прикреплены петли. Более того, сайты гиперчувствительности к ДНКазе I, сходные с участками регуляции транскрипции, часто проявляют чувствительность к нуклеазам, специфически расщепляющим одноцепочечные ДНК это наводит на мысль, что данные области находятся в доменах с отрицательной сверхспирализацией. Далее, топоизомераза 1, по-видимому, связывается с сайтами гиперчувствительности к нуклеазам. Влияние на транскрипцию (как положительное, так и отрицательное) соединений, интеркалирующих в ДНК или ингибирующих активность топоизомераз и в обоих случаях изменяющих степень сверхспиральности ДНК, тоже го- [c.139]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология