Кодирующий участок

Функциональная роль отдельных экзонов при рассмотрении случаев альтернативного сплайсинга, возможно, прояснится на примере гена позвоночных, кодирующего полипептидные компоненты целой серии гликопротеидов — фибронектинов, секретируемых клеткой. Некоторые типы фибронектинов, являясь компонентами внеклеточного матрикса, связываются с клеткой и определяют свойства ее поверхности, другие находятся в плазме крови. Разные типы фибронектинов образуются путем альтернативного сплайсинга. Фибронектин плазмы, который не связан с клеточной поверхностью, синтезируется на мРИК, не содержащей одного из экзонов, возможно как раз того, который кодирует участок молекулы белка, отвечающий за связывание с клеткой. [c.183]

Следующие пары олигонуклеотидов - один достраивающий ген слева, другой справа -последовательно добавляют в смесь до тех пор, пока не будет синтезирован весь ген. Длина этих олигонуклеотидов обычно бывает равна 50 звеньям. Каждый блок ПЦР состоит из двадцати 4-минутных раундов. Для синтеза гена длиной 1000 п. н. нужно 10 блоков , так что ген можно получить в течение одного дня. При этом, как и в случае синтеза генов другими методами, последнюю пару нуклеотидов (т. е. 5"- и 3 "-концы) можно снабдить дополнительными последовательностями, фланкирующими кодирующий участок и облегчающими последующее встраивание гена в вектор. [c.102]

Этап поиска и клонирования генов (их выделение и сборка в одну конструкцию) уже отлажен. Гены, кодирующие белки, состоят, как правило, из трех основных участков промотора (определяющего экспрессию данного гена, с чего начинается транскрипция) кодирующей части (где содержится информация о структуре белка — продукта этого гена) и поли-А-области (цепочки адениновых нуклеотидов, ответственной за окончание транскрипции). В генной инженерии из частей разных генов получают рекомбинантные (химерные) гены. Например, кодирующий участок в таком гене может быть позаимствован у любого организма. Возможность свободно обращаться с генетическим материалом — основное преимущество молекулярной селекции перед традиционной, где перенос генов происходит лишь между близкородственными видами. Кроме того, используя подходящие промоторы, можно добиться, чтобы экспрессия гена происходила в нужных органах или тканях (корнях, клубнях, листьях, зернах) и в нужное время (скажем, при дневном освещении). [c.101]

Второй кодирующий участок имеет такую же структуру, что и первый [c.118]

Поскольку внедрения в правом сегменте полностью не блокируют его функции, можно предположить, что вставки не прерывают кодирующий участок, а вмешиваются в осуществление какой-то другой функции, контролируемой смежной регуляторной областью. Вставки картируются в нескольких дискретных сайтах. Один из них w , который находится на границе потенциально кодирующей области. Следующим является сайт w , включающий серию вставок определенных последовательностей и их производных. В сайте локализуется несколько вставок, делеций. Вставка -самая удаленная в правом конце, возможно, именно она служит границей локуса. Весьма вероятно, что такие сайты внедрений идентифицируют отдельные регуляторные области внедрения в другие сайты правого сегмента не вызывают появления мутантного фенотипа, доступного определению. Все мутации, которые повреждают потенциально регуляторные функции, такие, как синхронность исчезновения пигментов или их исчезновение в определенном порядке, дозовую компенсацию, картируются в правом сегменте. [c.479]

Повторяя эту процедуру, удалось в конце концов правильно расшифровать весь кодирующий участок и на основе триплетного кода определить первичную аминокислотную последовательность субъединиц белка ацетилхолинового рецептора. [c.133]

Кодирующий участок гена не должен прерываться промежуточными последовательностями. [c.163]

Открытый участок рамки считывания -Ь2 может кодировать 195 аминокислот, которые перекрывают кодирующий участок для белка М1 по 86 аминокислотам. Возможно, вторая кодирующая [c.279]

Кодирующий участок гена сох /// [c.99]

Обнаруженные структурные особенности привели к созданию следующей гипотезы дегидрогеназы появились в ходе эволюции в результате слияния гена, который кодировал участок фермента, связывающий динуклеотид, с рядом генов, каждый из которых кодировал отдельный каталитический домен . Такой механизм дает весьма простой способ получения семейства ферментов с разной специфичностью. [c.33]

Слияние белков программируется на уровне ДНК лигированием кодирующих участков соответствующих генов. В самом простом виде векторная система слияния предусматривает включение гена-мишени или его сегмента в кодирующий участок клонированного гена-хо-зяина. Очень важно, чтобы РНК, транскрибируемая с клонированного гена-мишени, имела правильную нуклеотидную последовательность, [c.112]

Экзоны во много раз меньше (1000 пн) интронов Интрон представляет собой транскрибируемый (но не кодирующий) участок ДНК, который удаляется из состава транскрипта при сплайсинге (от англ spli ing — сплетение, сшивание) Сплайсинг протекает в ядре, и он заканчивается объединением экзонов в зрелую мРНК (рис 53) Участок ДНК между правым концом интрона и левым концом экзона называется акцепторной точкой сплайсинга В ДНК митохондрий интроны кодируют синтез отдельных белков, [c.161]

Возможен и другой подход к оптимизации экспрессии чужеродных генов в клетках В. subtilis. Изучаемый структурный ген соединяют с синтетическим сегментом ДНК, кодирующим участок связывания рибосом, специфичный для бацилл. Такую конструкцию затем можно помещать под контроль разнообразных промоторов. В частности, используя различные синтетические сегменты ДНК, содержащие SD-последо-вательности, Дж. Флок с соавторами (1984 г.) получили гибридные плазмиды, которые в клетках В. subtilis направляли синтез поли-пептидного гормона человека урогастрона в свободном виде. Данный прием является достаточно общим и может быть использован при клонировании в клетках бацилл любых генов. [c.267]

Фиг. 165 и 169 поясняют все эти взаимоотношения. Поступающая молекула аминоацил-s-PHK устанавливается сначала на 503-субчастице рибосомы в таком положении, чтобы ее кодирующий участок (антикодон) мог по возможности точно опознать комплементарный кодирующий участок (кодон) т--РНК, соответствующий N-концевой аминокислоте синтезируемого полипептида. Затем эта аминоацил-s-PHK перемещается к тому участку рибосомы, где происходит ноликонденсация участок поликонденсации). Одновременно Ш.-РНК перемещается на один триплет вдоль рибосомы. Необходимая для этих перемещений энергия поставляется за счет гидролиза одной молекулы ГТФ (известно, что в ретикулоцитах для этого гидролиза требуется фермент — трансферный фактор 1). В результате перемещения освобождается первый из участков рибосомы участок опознавания), так что теперь к нему может присоединиться аминоацил-s-PHK, несущая аминокислоту 2. Затем остаток аминокислоты 1 присоединяется к свободной NHg-rpynne aминoaцил-s-PHK2 с образованием пептидной связи [c.530]

В конечном итоге сравнение нуклеотидных последовательностей гена и клона кДНК точно выявляет местоположение и размер промежуточных последовательностей. Такой анализ на уровне последовательностей необходим, прежде чем мы сможем быть уверенными в том, что выявлены все участки гена. Действительно, в ряде случаев было неожиданно обнаружено, что геномная нуклеотидная последовательность содержит дополнительный короткий кодирующий участок. Когда кодирующий участок имеет длину менее 50 п. н., он может не гибридизоваться с кДНК-зондом и поэтому, попадая внутрь находящейся справа или слева от гена промежуточной последовательности, остаться незамеченным. [c.252]

В генах гемоглобина средний экзон кодирует домен белка, содержащий сайты, ответственные за связывание тема. Этот домен может быть предком мини-глобина, служившего переносчиком тема. Два фланговых экзона кодируют участки полипептидной цепи, окружающие продукт центрального экзона (рис. 26.28). Ген, кодирующий ADH Drosophila melanogaster, также состоит из трех экзонов, разделенных двумя интро-нами длиной 65 и 70 п. н. Один экзон кодирует участок из 140 аминокислотных остатков, ответственный за связь с коэнзимом. Более длинный интрон отделяет этот участок от элементов, детерминирующих каталитическую активность. [c.249]

У D. melanogaster примерно 160 генов 5S-pPHK собраны в тандемный повтор в хромосоме 2. Каждая повторяющаяся единица содержит упомянутый выше кодирующий участок длиной 120 п.н., транскрибируемый спейсер длиной примерно 15 п.н. на З -конце транскрипционной единицы и нетранскри-бируемый спейсер длиной 250 п.н. (рис. 9.7). По-видимому, все 160 повторяющихся единиц образуют единый, ничем не прерываемый кластер. Свыще 20 тандемных повторов было клонировано в виде одного сегмента длиной более 8 т. п. н. АТ-богатый участок в спейсере содержит внутренний повтор и имеет разную длину (примерно + 5 п. н.). [c.166]

Множественные гены и псевдогены мяРНК. В геноме многоклеточных организмов присутствует множество сегментов ДНК, которые гибридизуются с иЬ, и2-, из-, и4-, и5-, иб- и и7-мяРНК или с соответствующими кДНК (табл. 9.4). Одни такие сегменты диспергированы, а другие сгруппированы (обычно в тандемные повторы). Как и в случае генов 58-рРНК, соответствующий кодирующий участок может входить в состав длинного сегмента ДНК, который образует повторяющуюся единицу. Как правило (хотя и не всегда), функциональные гены организованы в кластеры, а псевдогены диспергированы. Кодирующие последовательности функциональных генов комплементарны последовательностям соответствующих мяРНК. Функциональные гены данной мяРНК обычно имеют сходные последовательности, фланкирующие кодирующий участок и содержащие регуляторы транскрипции (разд. [c.169]

Связь между встраиванием мобильных элементов и. щ таци.чми. Нередко встраивание мобильного элемента в регуляторный или кодирующий участок приводит к подавлению экспрессии соответствующего гена, но, как правило, последствия оказываются более сложными (рис. 10.12). В некоторых случаях промотор, расположенный внутри самого элемента, индуцирует экспрессию соседнего, ранее молчавшего гена. Например, в модуле IS10-R транс- [c.236]

I почти вся центральная часть занята открытыми рамками считывания. Ближайший к LTR-L кодирующий участок детерминирует синтез белка, который связывается с нуклеиновой кислотой этот участок аналогичен гену дад ретровирусов. Следующий кодирующий участок, pol, детерминирует синтез обратной транскриптазы, а также, вероятно, белки, гомологичные протеазе (pro), интегразе (int) и РНКазе Н ретровирусов. Ближе к З -концу геном ретровируса содержит третий кодирующий участок (env), который кодирует белок оболочки вириона. У большинства ретротранспозонов функциональный участок env, по-видимому, отсутствует возможно, именно с этим связана их неспособность продуцировать инфекционные частицы. ДНК 1АР, [c.260]

Каждый V -сегмент содержит три функциональные части промотор и два экзона, и (рис. 10,67). Экзон Lj( кодирует сигнальную последовательность, которая направляет образующийся полипептид в эндоплазматический ретикулум, а кодирует участок длиной примерно 80 аминокислот V-области х-цепи. Остальные 30 аминокислот У-области кодируются присоединенным J -сегментом. Перестроенный функциональный ген х-цепи содержит промотор, три экзона и два интрона. Один интрон разделяет экзоны Lj< и V -J , а второй находится между экзонами V -Jx и С . Один из DR-сегментов L-цепей- DR3- кодируется последовательностью, образующейся при соединении и J . [c.287]

Изменения нуклеотидной последовате.аьности. Амплифицированная единица содержит помимо самого гена еще и другие последовательности Обычно амплифицированные сегменты содержат регуляторные последовательности, которые фланкируют транскрипционную единицу, кодирующий участок, интроны, а также другие протяженные последовательности. Повторяющиеся единицы образуют тандем, а некоторые из них содержат инвертиро- [c.308]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология