специфичность, гидролиз

Принцип метода. Папаин, не обладающий выраженной специфичностью, гидролизует елки и пептиды до мелких фрагментов. [c.170]

Дезоксирибонуклеазы (К-Ф.3.1.4.5) — собирательное название многих с различной степенью специфичности гидролизующих ДНК ферментов. Их можно разделить на две группы эндонуклеазы и экзонуклеазы. Эндонуклеазы весьма условно также делятся на две группы — ДНК-аза I и ДНК-аза П. Действие ферментов первой группы приводит к образованию из ДНК дезоксинуклеозид-5 -фосфатов. Действие второй группы заканчивается образованием дезоксинуклеозид-З -фосфатов. Со временем все очевиднее становится условность такого разделения, поскольку между этими двумя крайними случаями обнаруживается большая часть других ферментов этого класса. В настоящее время описано много ДНК-специфических эндонуклеаз различного биологического происхождения. Большой теоретический и практический интерес среди них представляют так называемые рестриктазы — эндонуклеазы, которые весьма специфически, в зависимости от нуклеотидной последовательности расщепляют ДНК- Такими являются, например, бактериальные эндонуклеазы, способные расщеплять вирусную ДНК, отличающуюся от ДНК хозяина характером структурной модификации. [c.48]

Уреаза специфично гидролизует мочевину с образованием аммиака и углекислого газа. Выделенный аммиак определяют фотометрически по окрашенному продукту химической реакции. [c.269]

Интересные данные были получены [2014] в отношении вторичной специфичности гидролиза химотрипсином эфиров и амидов трипептидов. Оказалось, что уменьшение гидрофобности остатка в-положении увеличивает скорость гидролиза эфиров и уменьшает скорость гидролиза амидов (рис.64). [c.185]

Полный гидролиз фосфатидиловых эфиров легко осущ,ествляется в кислой среде. В щелочных условиях быстро удаляются ацильные группы и образующийся, например, глицерофосфорилхолин медленно превращается в холин и смесь а- и р-глицерофосфорных кислот. Ферменты специфично гидролизуют большинство фосфоглицеридов, избирательно расщепляя одну из четырех сложноэфирных связей [см. (26)]. [c.76]

Выше уже упоминалось о незначительных скоростях гидролиза дисахаридов эндоферментами по-видимому, этот факт объясняется как раз отсутствием нужного заместителя у невосстанавливающего остатка дисахарида, что нарушает специфичность гидролиза. [c.513]

Для расщепления полипептидной цепи на отдельные фрагменты можно использовать несколько методов. Один из широко распространенных методов-это частичный ферментативный гидролиз полипептида под воздействием пищеварительного фермента шрнисмка. Каталитическое действие этого фермента отличается высокой специфичностью гидролизу подвергаются только те пептидные связи, в образовании которых участвовала карбоксильная группа остатка лизина или аргинина независимо от длины и аминокислотной последовательности полипептидной цепи (табл. 6-6). Число более мелких пептидов, образующихся под действием трипсина, можно, следовательно, предсказать, исходя из общего числа остатков лизина и аргинина в исходном полипептиде. Полипептид, в котором содержатся пять остатков лизйна и (или) аргинина, при расщеплении трипсином обычно дает шесть более мелких [c.148]

Клотц считает, что R и Я (см. схему выше), определяющие специфичность гидролизующего фермента, связаны не хелатной связью с металлом, а непосредственно с белком. Металлы, которые легко образуют комплексы, не могут иметь открытых координационных мест в условиях проведения реакции (pH 8—9). Большинство двухвалентных катионов, имеющих открытые координационные места при рН>7, будут прочно связывать ОН -ионы. Можно было бы предположить, что группы — ЫН (в составе Я) могут вытеснять 0Н из координационной сферы металла однако трудно представить, что очень слабо комплексирующие группы амида —С=0 или —НН— могут конкурировать при образовании хелата с прочно удерживаемыми металлом группами ОН . Эти соображения позволяют понять, почему Мп2+ и M.g + являются универсальными активаторами в этих реакциях. Будучи наиболее слабыми координаторами, они сохраняют еще доступные координационные связи и даже при pH 8—9 их взаимодействие с ОН -ионами очень слабое. В результате оба элемента находятся в состоянии, обеспечивающем их участие в стабилизации промежуточного комплекса путем образования связи с отрицательно заряженной группой СО . [c.42]

Вторая группа ферментов включает протеазы с химотрипсиновой специфичностью. Сюда также входят ферменты с разной позиционной специфичностью - аминопептидазы [985,1769,18231, карбоксипептидазы [250,252,18241 и эндопептидазы - химотрипсины из разных источников 11715,1825-18271, мышечные протеиназы [1827-18291, пищеварительные ферменты - пепсин [1749,1750,1830-18331 и гастриксин [1832,18331, микробные протеиназы, например входящие в комплекс "проназа" [369,18341, и др. Эти ферменты, как правило, обладают довольно ш1фокой специфичностью, гидролизуя связи, образованные не только ароматическими, но и различными алифатическими аминокислотными остатками. К этой же группе относятся АТР-зависимые протеиназы Es heri hia oll - протеиназы La и Т1, а также, по-видимому, некоторые мышечные высокомолекулярные проте- [c.164]

Специфичность. Гидролиз тромбином проходит по С-концевой пептидной связи остатков аргинина типа -Arg-X-. В нативном субстрате фибриногене этой связью является -Arg-Gly-, в других белках в качестве остатка X может быть аланин, aprii-нин, аспарагиновая кислота, цистеин, валин [64]. Наблюдаетс51 также гидролиз по связи -Arg-His- в кальмодулине [108]. Обработка тромбином приводит к расщеплению только очень ограниченного числа пептидных связей аргинина, и, следовательно, этот метод можно считать идеальным для получения крупных фрагментов белка, предназначенных для автоматического секвенирования. В некоторых случаях тромбин даже в жестких условиях гидролизует в белке только одну пептидную связь, в других случаях степень гидролиза зависит от продолжительности ])еакции и температуры. Соответствующие примеры приведены в работе [106]. [c.150]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология